KEGG   Thermodesulfobacterium sp. OPB45: TOPB45_0939Help
Entry
TOPB45_0939       CDS       T01547                                 

Definition
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase (EC:6.3.2.13)
Orthology
K01928  
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase [EC:6.3.2.13]
Organism
top  Thermodesulfobacterium sp. OPB45
Pathway
Lysine biosynthesis
Peptidoglycan biosynthesis
Class
Metabolism; Amino acid metabolism; Lysine biosynthesis [PATH:top00300]
Metabolism; Glycan biosynthesis and metabolism; Peptidoglycan biosynthesis [PATH:top00550]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
JGI: 
UniProt: 
Position
923682..925175
Genome map
AA seq 497 aa AA seqDB search
MKPLGELIKNLEIIKAYYGSQPIENFAPYKYLKIRGISENSKEIEDGFIFVARKGTNFNG
EAFIEEAINNGALIIIRESDINSKETYPGTIQIQVKDIKKALSTLSLNFFENPQEKIFLI
GVTGTNGKTSVSYFTKNILNFLGVKCGYIGTLFYETDRIIPALETTPSILKISSLLKEMV
DKNFKACVIEVSSHALHQDRLLGLFFDIAAFTNLSRDHLDYHKDMEDYYQAKKKLFKEYL
KENSKIVISLESEYGKRLAEELKDFSPLLVNNEEIKSEILRKKNKLSLKIKIKDKEYEIS
TQLLGDYQAKNLTTTLGILLAMGYKIEDLLEPIKKLKNPVGRLELVTEYKGAKIFVDYAH
TPEALAEALKSLSSIKENRLIVLFGCGGNRDKGKRPLMGKVASMLADGIILTSDNPRFED
PLKIIEDIEKGINSSKPYKIIPDRRSALEFAIKNLQEGDVLLVAGKGHETYQEIEGKRYP
FSDQEEILKIISTLDLK
NT seq 1494 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacctttaggagaacttattaaaaatttagaaattataaaggcttattatggaagc
caacctatagaaaattttgcaccatataaatatttaaaaataaggggaatttctgaaaat
tctaaagagattgaagatggatttatctttgttgcaagaaagggaactaattttaatgga
gaagcttttatagaagaggctattaataatggagctttgataattattagagaaagtgat
attaattctaaggagacttacccaggaactattcagattcaagttaaagatattaaaaaa
gccttatctaccctttctttgaatttttttgaaaatcctcaagaaaaaatatttttaatt
ggtgttacaggaacaaatggaaaaacttcagtaagttatttcactaaaaacattttaaat
tttttaggtgttaaatgtggatatataggaactcttttttacgaaacagatagaattatt
cctgcccttgaaactacaccttccattttaaaaatttccagtctattaaaagaaatggta
gataaaaattttaaagcttgtgtaattgaagtttcctcacatgctttacatcaagataga
cttttggggcttttctttgacatagcagcttttactaatctttcaagagatcatttagat
tatcataaagatatggaagattattatcaagcaaagaaaaaactttttaaagaatattta
aaagaaaattctaaaatagttatttccttagaaagcgaatatggtaaaagattagctgaa
gaattaaaagatttttctccgcttttagttaacaatgaagaaattaaaagtgaaatatta
aggaaaaaaaacaaattaagccttaagattaaaattaaagacaaagaatatgaaatttca
acacaacttttaggagattatcaagctaaaaatctgaccaccactttaggaattctttta
gctatgggatataaaattgaagacctcttagaacccattaaaaaacttaaaaatcctgtt
ggaagactggaattggtaactgaatataaaggtgctaaaatattcgtagattatgcacat
acaccagaggcattagctgaagctttaaaaagtttaagttcgattaaagaaaatagatta
attgtgctttttggttgtggtggaaatagagacaaaggtaaaagacctcttatgggtaag
gtcgcaagtatgcttgctgatggaataattttaacttcagataatccaagatttgaagat
ccattaaaaattattgaagatattgaaaaaggtattaattcgtcaaagccttataaaatt
attcctgacagaagatctgctttagaatttgctattaaaaatttacaagagggggatgtt
cttttagttgccgggaaggggcacgaaacttatcaagagatagaaggtaaaagatatcct
ttttctgatcaggaagaaattttgaaaattataagtaccttagacttaaaatga

DBGET integrated database retrieval system