KEGG T02235: TPHA

Tetrapisispora phaffii: TPHA_0D03380

Entry

TPHA_0D03380 CDS T02235

Gene name

TPHA0D03380

Definition

hypothetical protein

Orthology

K04646

clathrin heavy chain

Organism

tpf Tetrapisispora phaffii

Pathway

tpf04144

Endocytosis

Class

Cellular Processes; Transport and catabolism; Endocytosis [PATH:tpf04144]

SSDB

Motif

Pfam:

Clathrin Clathrin_H_link Clathrin_propel Clathrin-link

Other DBs

NCBI-GI:

367001346

NCBI-GeneID:

11534257

UniProt:

G8BT03

Position

4:709300..714243

AA seq 1647 aa
MSDLPIEFTELVDLTSLGISPQSLEFRSTTFESDHYVTVRESQDGNNSVAIVDLSNGNLV
TRKNMGGDSAIMHPSQMVISVRANGTIVQIFNLKTKSKLKSFTLDEPVLFWKWLNEETLG
FITARSILTSNVFDGNVNAAPTVLTQRHQTLNNTQIINIVSNKKMDWFAVVGILQDNGHI
AGKIQLFSKQRNISQAIDGHVAMFSDITLEGNSTPVQVFVTGNRNASSGTGELRIIEIDH
DANLPVQYQKKNVEVFFPPDATNDFPISVQVSEKYGIIYLLTKYGFIHLYELETGTNLFV
NRITAESVFTATSYDNKNGIACINKKGQVLAVEISTSQIVPYVINKLSNVSLALTMAKRG
GLPGADDLIQKQFDTLLAQSDYQGAAKVAASSQQLRNSNTINRLKTAQAEPGAISPLLLY
FSILLDTSKLNKEETIELARPVLQQDRKQLFEKWLKEDKLECSEELGDIVKPFDTTLALA
CYLRAECHPKVVASLAELQQFEKILPYCQKVNYQANFLVLLSTVMRSSPDRASEFATSLI
QNPETAAQLDIEKIADMFFSQNHIQQGTSLLLDALKSDTPDQGHLQTRVLEVNLLHAPQV
ADAILGNNIFSHYDKPVIASLAEKAGLYQRALENYVDIRDIKRCIIHTNVLPVDWLVSYF
GKLNVEQSMACLKALMDNDIKQNIQIVVQVATKYSELIGSTILIKLFEEYGATEGLYYYL
ASSVNLTEDKDLVYKYIEAAAKTKQYTEIERVVKDNNVYDPERVKNFLKDINLEDQLPLI
TVCDRFNFVNELVIYLYNQQNTKFIETYVQQVNPTKTPQVVGALLDVDCDENFIKSLLQS
VFGQVPIKELTEEVEKRNRLKLLLPYLEQCLTQGIQEQVIYNALAKIYIDSNNGPEKFLK
ENDQYDTLDVGRYCEKRDPFLAYIAYDKGNNDQDLIRITNDNSMYKYQARYLLKRSDSEL
WNSVLSSENVHRQQLIEAVNSVGIPELTDPQPVSVAVQAFMQNDLKLELIELLEKIVLEE
SAFSDNVALQGLLLLSAIKYEPNKVRRYIEKLENYDADEIASLCIEHDLKEEAFEIYDKH
EMYSKALKVIVEDIISLDRAQEYVEKINSKELWSQLGASQLAGLRVPEAIESYIKAEDSS
NFEAVIDTAAEAGNYEQLIPYLIMARKTLKESKIDGSLILAYAALDKINEVENIVSNSNA
ANLESVGDKLLASKSYKAAKLCFASISNYSKLASTLVFLGDYQNAVDTARKASNIKVWKQ
VNDVCIDKKEFRLAQICGLNLIIHAEELNELVHKYESNGYFEELISLFEAGLGLESAHMG
MFTELAILYSKYEPAKTFENLKLVWSRINIPKVIRAVEEAHLWNEAVFLYAHYDEWDNAT
LTMIEKSTKSFDHDYFKEIVVKVSNLEIYYKAINFYVKEHPMLLIDLLTVLTPRLDIPRT
VKIFTKSDNLPLIKPFLINVLPKNNSVVSEAYHDLMIEEEDYKALTIAVDSYDKFDQLGL
ASRLEQHDLIFFKKIAALLYRRNKKWAKSLTIFKQEKLWKDAIETAAISQDQKVVEDLLN
YFVEIDNKEALVALLYTAYSLVKFDFVLELAWINSLENYIKPFEISIKKEQATMIEKLSK
ELKSKGNVSNDDNNSDQPLMLTNGMGY

NT seq 4944 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagtgatttacctatcgaattcaccgaattggttgatttaacttcactagggatctct
cctcaatccttagaatttagatcaaccactttcgaaagtgatcactatgttacagttaga
gaatctcaggatggtaacaattctgttgcaattgtcgatttaagtaatggtaacctagtt
actagaaaaaatatgggtggtgattctgcgattatgcacccttcgcaaatggttatatct
gttagagcaaatggtacaattgttcaaatctttaacttaaagacaaaatcaaagttaaaa
tcattcactctagatgaacctgttttattctggaaatggttaaatgaagaaactttaggt
tttattacagcaagatccattttaacttctaatgtttttgatggtaacgttaatgcagct
ccaactgtattgactcaaagacatcaaactttaaacaacactcaaatcattaacattgtc
tctaataagaaaatggattggtttgcagttgttggtatcttacaagataatggccacatt
gccggtaagattcaattattttctaaacaacgtaatatctctcaagcaattgatggtcat
gttgctatgttttcggatatcactttagaaggtaacagtactccagttcaagtctttgtt
actggtaacagaaatgcttctagtggtacaggtgaattaagaattattgaaatcgatcat
gatgcaaacttacctgttcaataccaaaagaagaatgtcgaagttttctttccaccagat
gcaactaatgatttcccaatttctgttcaagtttcagaaaaatatggtatcatttatcta
ttaactaaatatggttttattcatctatatgaattagaaactggtactaatttatttgtt
aacagaatcactgctgaatcagtttttactgctacttcatatgataataagaatggtatt
gcatgtattaacaaaaagggtcaagttctagccgtcgaaatttccacttctcaaattgtt
ccatatgtcataaataaactatctaatgtttctttagctttaactatggctaagagaggt
ggattaccaggtgctgatgatttgattcaaaagcaattcgatactttattagctcaaagt
gattaccaaggcgctgctaaagtagctgcctcctctcaacaattgagaaattcaaatact
atcaacagattaaagactgctcaagctgaaccaggtgctatttcaccactattattgtac
ttttctattttattagacacaagcaaattaaacaaagaagaaactattgaattagcaaga
ccagtactacaacaagacagaaaacaattattcgaaaaatggttgaaagaagataaatta
gaatgttcagaagaattaggtgatattgttaagccttttgacactactttagctttagct
tgttatttaagagctgaatgtcatccaaaggttgttgctagtttagctgaattacaacag
tttgaaaagatcttgccatattgtcaaaaagttaactaccaagctaattttttggtttta
ctgtctaccgtaatgagaagttctccagacagagcctctgaatttgctactagtttaatt
caaaacccagaaactgctgctcaattagacattgaaaagattgctgatatgtttttctct
caaaatcacattcaacaaggtacctctttattattagatgctttaaagagtgacacccct
gatcaaggtcacttacagactcgtgtcttggaagttaacttattacatgcaccacaagtt
gctgacgccattttaggtaataacattttctctcattatgataagccggtcatcgcatct
ttagctgaaaaagctggtttatatcaaagagctctagaaaattatgttgatatcagggac
ataaagagatgtatcatccatacaaatgttttacctgtcgattggttagtctcatatttt
ggtaaattgaatgtcgaacaatctatggcatgtttaaaagctttaatggataatgacatc
aagcaaaacattcaaattgtagttcaagttgcaaccaaatattctgaattaatcggttct
acaattttaatcaaattatttgaagaatatggtgccaccgaaggtttatactattacttg
gcctcttcagtaaacttaacagaagacaaagatttggtttacaaatatattgaagccgct
gctaagacaaagcaatataccgagattgaaagagtcgttaaggacaataacgtttatgac
ccagaaagagttaagaacttcttgaaagatattaacttagaagatcaattgccattaata
actgtctgtgaccgtttcaactttgttaacgagttagttatatacctttacaatcaacaa
aacactaagtttattgaaacttacgtccaacaagttaacccaacaaagaccccacaagtt
gttggtgcattattggatgttgattgtgatgaaaactttatcaagtctttgttacagtct
gtatttggtcaagtcccaatcaaggaattaactgaagaagttgagaagagaaacagatta
aaattattattaccttatttggaacaatgtttaactcaaggcattcaagaacaagttatc
tacaatgctttagccaagatttacattgactcaaacaatggtcctgagaaatttttaaag
gaaaatgatcagtatgacactctagatgttggtcgttattgtgaaaagagagatccattc
ttagcttacattgcttacgataagggtaacaatgatcaagatttaatcagaattactaat
gacaatagtatgtacaaatatcaagctagatatttattaaaacgttctgactctgaatta
tggaattctgtcttatcttctgaaaatgttcacagacaacagttaatagaagccgttaac
tctgttggtattccagaattaactgacccacaaccagtttctgtcgctgtccaagccttc
atgcaaaatgacttgaaattagaattaattgaattattggaaaagattgttttagaagaa
tccgcttttagtgacaatgttgctcttcaaggtctattgttattgtctgctatcaaatac
gaaccaaataaggttagaagatacattgaaaagctagaaaattatgatgctgatgaaatc
gcttcattatgtatcgaacatgatttgaaagaagaagctttcgaaatttatgacaaacat
gaaatgtatagcaaggccttaaaggttatcgtcgaagatatcatttctttagacagggcc
caggaatatgttgaaaaaattaacagtaaggaattatggtctcaattaggtgcttctcag
ttagcaggtttacgtgttcctgaagctattgagtcatacatcaaagctgaagattcatct
aattttgaagcagttatcgatactgccgctgaagctggtaattatgagcagttaattcca
tatttaattatggctagaaaaacattgaaggaatctaagatcgacggttcattaatttta
gcctacgctgctttagataagattaatgaagttgaaaatatagtttcaaattcaaatgct
gccaatcttgaatctgttggtgacaaattattggccagcaagagctacaaggctgctaaa
ttatgtttcgctagtatttctaactattctaagttagcttcgaccttagtatttttgggt
gattatcaaaatgctgtcgacactgctagaaaagcatctaacattaaagtttggaaacaa
gtaaatgatgtctgtattgacaagaaggaattcagactagctcaaatttgtggtttgaat
ttaatcattcatgcagaagaactaaatgaattagtacataaatacgaatccaatggctac
tttgaagaattaatttcattattcgaagcaggtttaggtttagaaagcgcacacatgggt
atgtttaccgagttagcaatcctatacagtaagtatgaacctgcaaagacttttgaaaat
ttgaagttggtctggtctagaattaatattccaaaagttatcagagctgtcgaagaagct
catctatggaatgaagccgttttcttatacgctcattatgatgagtgggataacgctact
ttaacaatgattgaaaaatctaccaaatcttttgaccatgattactttaaagaaattgtt
gttaaggtttcaaatttggaaatatactacaaggctatcaacttttatgttaaagaacat
ccaatgttattaattgatttattaactgtcttaactccaagattggatattccaagaact
gtcaaaatctttaccaagtctgacaacctaccattaattaaaccattcttaattaacgtt
ttaccaaagaataactctgtagttagtgaagcatatcacgatttaatgatagaagaggaa
gactacaaagctttaactattgcagttgattcttatgataaatttgatcaattaggtcta
gcaagtcgtttagaacaacatgatttgatattttttaagaagatcgccgcattactatat
cgtagaaataagaaatgggctaagagtttaactattttcaagcaagaaaaattatggaag
gatgctatcgagacagcagctatttcacaagatcaaaaggtagttgaagatttattgaac
tactttgtcgaaatcgacaacaaagaagcattggttgcattattatacactgcttacagc
ctagttaaatttgactttgtcttagaattagcttggattaattctctggagaattacatc
aaaccattcgaaatttcaattaaaaaggaacaagctactatgattgaaaaactgtcaaag
gaattgaaatctaagggcaatgtttctaatgacgataataatagtgaccaaccattaatg
ttaaccaatggtatggggtattaa

All links

Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (13)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system