ID C7IYK4_ORYSJ Unreviewed; 573 AA.
AC C7IYK4;
DT 13-OCT-2009, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 13-OCT-2009, sequence version 1.
DT 28-JUN-2023, entry version 48.
DE SubName: Full=Os02g0305200 protein {ECO:0000313|EMBL:BAH91641.1};
GN OrderedLocusNames=Os02g0305200 {ECO:0000313|EMBL:BAH91641.1};
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAH91641.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RN [1] {ECO:0000313|EMBL:BAH91641.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [2] {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP GENOME REANNOTATION.
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
RG The rice annotation project (RAP);
RT "The rice annotation project database (RAP-DB): 2008 update.";
RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
CC ---------------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC ---------------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AP008208; BAH91641.1; -; Genomic_DNA.
DR AlphaFoldDB; C7IYK4; -.
DR Proteomes; UP000000763; Chromosome 2.
DR CDD; cd09272; RNase_HI_RT_Ty1; 1.
DR InterPro; IPR043502; DNA/RNA_pol_sf.
DR InterPro; IPR013103; RVT_2.
DR PANTHER; PTHR11439; GAG-POL-RELATED RETROTRANSPOSON; 1.
DR PANTHER; PTHR11439:SF436; RETROTRANSPOSON PROTEIN-RELATED; 1.
DR Pfam; PF07727; RVT_2; 1.
DR SUPFAM; SSF56672; DNA/RNA polymerases; 1.
PE 4: Predicted;
KW Coiled coil {ECO:0000256|SAM:Coils}.
FT DOMAIN 333..407
FT /note="Reverse transcriptase Ty1/copia-type"
FT /evidence="ECO:0000259|Pfam:PF07727"
FT REGION 1..28
FT /note="Disordered"
FT /evidence="ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite"
FT REGION 112..163
FT /note="Disordered"
FT /evidence="ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite"
FT REGION 247..275
FT /note="Disordered"
FT /evidence="ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite"
FT COILED 40..79
FT /evidence="ECO:0000256|SAM:Coils"
SQ SEQUENCE 573 AA; 62679 MW; CB6E004A4B34AA34 CRC64;
MSDARSRRSV ASSTRRQQDA ELAAAEERRR ATAQTAAAAA RAARLAAAEL AAARAEAEAE
AAEDAARAAE VEVETLRSSI NGSIAGDITA DRELEELARG RARERAERWA AAHLHGGGGG
PRDRAPADGN PDGRGRAGGS PEPARGPRRR HGSLSPDRRH GHHGVQTVKM VQYGDDTYDE
ERAVEKLFRC VPEKYRQIAR SIESLLDLST MSIEEALGRL KVVDGDEPRP LSGPITIGGK
LHLTREQWEA SQGDGRKGES SSPTGGHKPR KARGGVQLRP VEFVTPLSHD GERIDAYHDG
EQLRYRTMED LLGDQPVPGL VPRNLEAQLH LACDDVITGT KDAEVAAFKE EMKATFQMSD
LGPLSFYLGI EVHQDNSGIT LRQTAYAKRV VELAGLTDCN PALTPMEERL KLSRDSTAEE
VDATQYRRLV GSLRYLTHTR PDLAFSVGYV VALSSCEAEY MAASAASTQA LWLARLLSDL
LGRDTGAVEL RVDSKSALAL AKNPVFHERS KHIRVRYHFI RSYLEEGSIK ASYINTKDQL
ADLLTKPLGR IKFLELCSRI GMAQLSHKTA HKT
//