GenomeNet

Database: UniProt
Entry: Q0IQ71_ORYSJ
LinkDB: Q0IQ71_ORYSJ
Original site: Q0IQ71_ORYSJ 
ID   Q0IQ71_ORYSJ            Unreviewed;       657 AA.
AC   Q0IQ71;
DT   13-OCT-2009, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   13-OCT-2009, sequence version 1.
DT   27-MAR-2024, entry version 62.
DE   SubName: Full=Os12g0141000 protein {ECO:0000313|EMBL:BAF29144.2};
GN   OrderedLocusNames=Os12g0141000 {ECO:0000313|EMBL:BAF29144.2};
OS   Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC   Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX   NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAF29144.2, ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RN   [1] {ECO:0000313|EMBL:BAF29144.2, ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX   PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG   International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA   Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA   Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA   Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA   Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA   Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA   Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA   Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA   Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA   Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA   Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA   Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA   Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA   Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA   Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA   Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA   Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA   Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA   Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA   Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA   Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA   Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA   Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA   Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA   Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA   Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA   Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA   Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA   Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA   Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA   Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA   Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA   Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT   "The map-based sequence of the rice genome.";
RL   Nature 436:793-800(2005).
RN   [2] {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP   GENOME REANNOTATION.
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX   PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
RG   The rice annotation project (RAP);
RT   "The rice annotation project database (RAP-DB): 2008 update.";
RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AP008218; BAF29144.2; -; Genomic_DNA.
DR   AlphaFoldDB; Q0IQ71; -.
DR   Proteomes; UP000000763; Chromosome 12.
DR   GO; GO:0016020; C:membrane; IEA:UniProtKB-KW.
DR   InterPro; IPR026961; PGG_dom.
DR   PANTHER; PTHR24177; CASKIN; 1.
DR   PANTHER; PTHR24177:SF317; EXPRESSED PROTEIN; 1.
DR   Pfam; PF13962; PGG; 4.
PE   4: Predicted;
KW   Coiled coil {ECO:0000256|SAM:Coils}; Membrane {ECO:0000256|SAM:Phobius};
KW   Transmembrane {ECO:0000256|SAM:Phobius};
KW   Transmembrane helix {ECO:0000256|SAM:Phobius}.
FT   TRANSMEM        6..23
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FT   TRANSMEM        188..208
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FT   TRANSMEM        401..422
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FT   TRANSMEM        428..451
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FT   TRANSMEM        501..517
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FT   TRANSMEM        579..599
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FT   TRANSMEM        611..634
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FT   DOMAIN          2..57
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FT   DOMAIN          130..243
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FT   DOMAIN          314..424
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FT   DOMAIN          495..604
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FT   COILED          292..319
FT                   /evidence="ECO:0000256|SAM:Coils"
SQ   SEQUENCE   657 AA;  72684 MW;  E7B66266BAE711E9 CRC64;
     MVFFYFNTTA FVASLVTIML LMSRTVSRHG FRSSALWVCV GAAMVGLMGA FAAGSCRSFK
     TSIYVIALVG AVLLYIAIQF MVFISEPVKD WLHRAGETLQ KCLKLDELEQ RNQQQITLSN
     QGNGDAYLLL KKSRMYLLLL GILAASVTYQ AGLNPPGGFW QSDGTDGYRH YLAGDPVLHI
     TYHRRYMVFF YSNATAFIAS LVILILLLSN MISTQGIKYC ALQVAMILNL FGLIGAYAAG
     SCRQASKSVY VSVLVLPVFL YVGIHVLVFM LEVSPTWATW RVEVREKLKQ CMPEWLKNLL
     ELEKHVEEEE EEWKLEKRRK LLLLVAILAA SLTYEAGMNP PGGFWQEKKS GHVGDPVLNN
     DNYRHRYLAF FFCNTTAFVA SLAIIMLLVN RKLSARGIRS YALRVCVILV LVGLMGAFAA
     GSCRKVKTSI YVFVLVLAVL LCIAFQVALV VSGSLRRLVN SLLSKLGAPL EEDAGERLPH
     TAADGGDGEP RDLWDEKLPK YLLLLAALAA AVTYQAAMSP PGGLWDDGQT EHIVGDPVLL
     TNYARRYKVF FYCNATSFMA SLVIMVLLLI KRVSNTQPAL LALHAAMILD LFGLMGVYAA
     GSCRRVTTSA YILALLVGVS AYIVVLVVVS VGVARWMKKV MDKVGEKLTH CFSFEDL
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