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Database: UniProt
Entry: Q0IQP0_ORYSJ
LinkDB: Q0IQP0_ORYSJ
Original site: Q0IQP0_ORYSJ 
ID   Q0IQP0_ORYSJ            Unreviewed;       645 AA.
AC   Q0IQP0; A3CE95;
DT   03-OCT-2006, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   03-OCT-2006, sequence version 1.
DT   27-MAR-2024, entry version 108.
DE   SubName: Full=Os12g0109300 protein {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1};
GN   OrderedLocusNames=Os12g0109300 {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1};
GN   ORFNames=OsJ_34963 {ECO:0000313|EMBL:EAZ19408.1};
OS   Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC   Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX   NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:EAZ19408.1};
RN   [1] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX   PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG   International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA   Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA   Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA   Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA   Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA   Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA   Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA   Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA   Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA   Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA   Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA   Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA   Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA   Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA   Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA   Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA   Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA   Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA   Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA   Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA   Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA   Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA   Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA   Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA   Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA   Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA   Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA   Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA   Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA   Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA   Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA   Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA   Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT   "The map-based sequence of the rice genome.";
RL   Nature 436:793-800(2005).
RN   [2] {ECO:0000313|EMBL:EAZ19408.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RX   PubMed=15685292; DOI=10.1371/journal.pbio.0030038;
RA   Yu J., Wang J., Lin W., Li S., Li H., Zhou J., Ni P., Dong W., Hu S.,
RA   Zeng C., Zhang J., Zhang Y., Li R., Xu Z., Li S., Li X., Zheng H., Cong L.,
RA   Lin L., Yin J., Geng J., Li G., Shi J., Liu J., Lv H., Li J., Wang J.,
RA   Deng Y., Ran L., Shi X., Wang X., Wu Q., Li C., Ren X., Wang J., Wang X.,
RA   Li D., Liu D., Zhang X., Ji Z., Zhao W., Sun Y., Zhang Z., Bao J., Han Y.,
RA   Dong L., Ji J., Chen P., Wu S., Liu J., Xiao Y., Bu D., Tan J., Yang L.,
RA   Ye C., Zhang J., Xu J., Zhou Y., Yu Y., Zhang B., Zhuang S., Wei H.,
RA   Liu B., Lei M., Yu H., Li Y., Xu H., Wei S., He X., Fang L., Zhang Z.,
RA   Zhang Y., Huang X., Su Z., Tong W., Li J., Tong Z., Li S., Ye J., Wang L.,
RA   Fang L., Lei T., Chen C., Chen H., Xu Z., Li H., Huang H., Zhang F., Xu H.,
RA   Li N., Zhao C., Li S., Dong L., Huang Y., Li L., Xi Y., Qi Q., Li W.,
RA   Zhang B., Hu W., Zhang Y., Tian X., Jiao Y., Liang X., Jin J., Gao L.,
RA   Zheng W., Hao B., Liu S., Wang W., Yuan L., Cao M., McDermott J.,
RA   Samudrala R., Wang J., Wong G.K., Yang H.;
RT   "The genomes of Oryza sativa: a history of duplications.";
RL   PLoS Biol. 3:266-281(2005).
RN   [3] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX   PubMed=16381971; DOI=10.1093/nar/gkj094;
RA   Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K., Habara T.,
RA   Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K., Itoh T.,
RA   Gojobori T., Sasaki T.;
RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa ssp.
RT   japonica genome information.";
RL   Nucleic Acids Res. 34:D741-D744(2006).
RN   [4] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG   The Rice Annotation Project (RAP);
RA   Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B.,
RA   Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T., Burr F.,
RA   Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B., Harada E.,
RA   Hiraki A.T., Hirochika H., Hoen D., Hokari H., Hosokawa S., Hsing Y.,
RA   Ikawa H., Ikeo K., Imanishi T., Ito Y., Jaiswal P., Kanno M., Kawahara Y.,
RA   Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P., Kikuchi S., Komatsu S.,
RA   Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D., Lin Y.C., Lonsdale D.,
RA   Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R., Messing J., Miyao A., Mulder N.,
RA   Nagamura Y., Nam J., Namiki N., Numa H., Nurimoto S., O'donovan C.,
RA   Ohyanagi H., Okido T., Oota S., Osato N., Palmer L.E., Quetier F.,
RA   Raghuvanshi S., Saichi N., Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T.,
RA   Sato F., Sato Y., Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K.,
RA   Shinso Y., Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T.,
RA   Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A., Wang A.,
RA   Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y., Zhang H.,
RA   Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.;
RT   "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and Comparative
RT   Genome Analysis with Arabidopsis thaliana.";
RL   Genome Res. 17:175-183(2007).
RN   [5] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG   The Rice Annotation Project (RAP);
RA   Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y., Numa H.,
RA   Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y., Habara T.,
RA   Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H., Matsuya A.,
RA   Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y., Suzuki M.,
RA   Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K., Yamamoto N., Yamasaki C.,
RA   Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K., Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C.,
RA   Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q., Han B., Kramer M.R., McCombie R.W.,
RA   Lonsdale D., O'Donovan C.C., Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O.,
RA   Khurana J.P., Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G.,
RA   Fujisawa M., Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M.,
RA   Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H., Sakai Y.,
RA   Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A.,
RA   Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G., Messing J.,
RA   Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A., Wing R.A., Nobuta K.,
RA   Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C., Piegu B., Panaud O.,
RA   Echeverria M.;
RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update.";
RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
RN   [6] {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763}
RP   GENOME REANNOTATION.
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000000763};
RX   PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
RG   The rice annotation project (RAP);
RT   "The rice annotation project database (RAP-DB): 2008 update.";
RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
RN   [7] {ECO:0000313|EMBL:EAZ19408.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Wang J., Li R., Fan W., Huang Q., Zhang J., Zhou Y., Hu Y., Zi S., Li J.,
RA   Ni P., Zheng H., Zhang Y., Zhao M., Hao Q., McDermott J., Samudrala R.,
RA   Kristiansen K., Wong G.K.-S.;
RT   "Improved gene annotation of the rice (Oryza sativa) genomes.";
RL   Submitted (DEC-2008) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [8] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG   IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project);
RT   "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 12.";
RL   Submitted (AUG-2012) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [9] {ECO:0000313|EMBL:BAF28975.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG   The Rice Annotation Project (RAP);
RT   "The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2).";
RL   Submitted (AUG-2012) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AP008218; BAF28975.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; CM000149; EAZ19408.1; -; Genomic_DNA.
DR   RefSeq; XP_015618301.1; XM_015762815.1.
DR   AlphaFoldDB; Q0IQP0; -.
DR   GeneID; 4351284; -.
DR   KEGG; osa:4351284; -.
DR   HOGENOM; CLU_002706_37_8_1; -.
DR   OrthoDB; 371752at2759; -.
DR   Proteomes; UP000000763; Chromosome 12.
DR   Proteomes; UP000007752; Chromosome 12.
DR   GO; GO:0003723; F:RNA binding; IEA:InterPro.
DR   GO; GO:0008270; F:zinc ion binding; IEA:InterPro.
DR   GO; GO:0009451; P:RNA modification; IEA:InterPro.
DR   Gene3D; 1.25.40.10; Tetratricopeptide repeat domain; 3.
DR   InterPro; IPR032867; DYW_dom.
DR   InterPro; IPR046848; E_motif.
DR   InterPro; IPR046849; Eplus_motif.
DR   InterPro; IPR002885; Pentatricopeptide_rpt.
DR   InterPro; IPR045215; PPR_prot_At1g15510.
DR   InterPro; IPR011990; TPR-like_helical_dom_sf.
DR   NCBIfam; TIGR00756; PPR; 4.
DR   PANTHER; PTHR24015:SF553; DYW DOMAIN-CONTAINING PROTEIN; 1.
DR   PANTHER; PTHR24015; OS07G0578800 PROTEIN-RELATED; 1.
DR   Pfam; PF14432; DYW_deaminase; 1.
DR   Pfam; PF20431; E_motif; 1.
DR   Pfam; PF20430; Eplus_motif; 1.
DR   Pfam; PF01535; PPR; 7.
DR   PROSITE; PS51375; PPR; 4.
PE   4: Predicted;
KW   Repeat {ECO:0000256|ARBA:ARBA00022737};
KW   Transit peptide {ECO:0000256|ARBA:ARBA00022946}.
FT   REPEAT          136..170
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FT   REPEAT          237..271
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FT   REPEAT          307..341
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FT   REPEAT          475..509
FT                   /note="PPR"
FT                   /evidence="ECO:0000256|PROSITE-ProRule:PRU00708"
FT   DOMAIN          553..645
FT                   /note="DYW"
FT                   /evidence="ECO:0000259|Pfam:PF14432"
SQ   SEQUENCE   645 AA;  71676 MW;  04A073C133199858 CRC64;
     MSGDAIRRLL LAGVAPSNRP PPLTVKLLHA RLLRLDLLAA LSPLLLRALS SSALHLHALR
     LHCLLPNPSH LTFPIALKSA SRLPHPLRAG EQLHARSLKL PSHTNPHVLT SLLTLYARCG
     LLHRAQRVFD EMPHPSTVSW TALITAYMDA GDLREAVHVA RNAFANGMRP DSFTAVRVLT
     ACARVADLAT GETVWRAAEQ EGIAQSVFVA TAAVDLYVKC GEMAKAREVF DKMRDKDAVA
     WGAMVGGYAS NGHPREALDL FLAMQAEGVR PDCYAVAGAL SACTRLGALD LGRQAIRMVD
     WDEFLDNPVL GTALIDMYAK CGSTAEAWVV FQQMRKKDII VWNAMILGLG MTGHEKTAFT
     LIGQMEKSGV KLNDNTFIGL LCSCTHTGLI QDGRRYFHNM TKLYHISPRI EHYGCIVDLL
     SRAGLLQEAH QLIDDMPMPA NAVILGALLG GCKIHRNAEL AEHVLTQLIR LEPWNSGNYV
     MLSNIYSNRG RWEDAAKLRL DMKEKGVEKV PACSWVEFEG KVHEFRVGDK SHPLSDQIYK
     KLDELGLEMK TMGYEPTTEV VMFDVEDEEK EHTLVHHSEK LAIAFNLLVT GPGETIRVTK
     NLRVCSDCHT AIKLISRITH REIIVRDNNR FHCFRDGSCS CNDYW
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