ID Q5VPK3_ORYSJ Unreviewed; 393 AA.
AC Q5VPK3;
DT 07-DEC-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 07-DEC-2004, sequence version 1.
DT 24-JAN-2024, entry version 113.
DE SubName: Full=Os06g0148600 protein {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
DE SubName: Full=cDNA clone:001-123-E10, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAG88928.1};
DE SubName: Full=cDNA clone:J033094B14, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAH00656.1};
GN OrderedLocusNames=Os06g0148600 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
GN ORFNames=OSNPB_060148600 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN [1] {ECO:0000313|EMBL:BAG88928.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [2] {ECO:0000313|EMBL:BAH00656.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., Hayashida K.,
RA Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., Hori F., Hotta I.,
RA Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., Ishibiki J., Ishii Y.,
RA Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., Katoh H., Kawagashira N.,
RA Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N.,
RA Kobayashi M., Kodama T., Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H.,
RA Kouda M., Koya S., Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M.,
RA Masuda H., Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., Namiki T.,
RA Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., Ohneda E.,
RA Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., Otomo Y., Ryu R.,
RA Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., Sato K.,
RA Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., Shishiki T., Sogabe Y.,
RA Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., Tagami M., Tagami-Takeda Y.,
RA Tagawa A., Takahashi F., Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T.,
RA Tsunoda Y., Ueda M., Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M.,
RA Yasunishi A., Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones from
RT japonica rice.";
RL Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
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RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
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RN [5] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
RA Ouyang S., Schwartz D.C., Tanaka T., Wu J., Zhou S., Childs K.L.,
RA Davidson R.M., Lin H., Quesada-Ocampo L., Vaillancourt B., Sakai H.,
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RT "Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next
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RL Rice 6:4-4(2013).
RN [6] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC ---------------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC ---------------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AK063946; BAG88928.1; -; mRNA.
DR EMBL; AK121786; BAH00656.1; -; mRNA.
DR EMBL; AP014962; BAS96164.1; -; Genomic_DNA.
DR RefSeq; XP_015641296.1; XM_015785810.1.
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DR Gene3D; 1.20.1280.50; -; 1.
DR InterPro; IPR005174; DUF295.
DR InterPro; IPR036047; F-box-like_dom_sf.
DR PANTHER; PTHR33110; F-BOX/KELCH-REPEAT PROTEIN-RELATED; 1.
DR PANTHER; PTHR33110:SF36; OS06G0148600 PROTEIN; 1.
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KW Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}.
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GVITPLLQEN TAPRLHPTGE GHPTWFFPAD GAM
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