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Database: UniProt
Entry: Q5VPK3_ORYSJ
LinkDB: Q5VPK3_ORYSJ
Original site: Q5VPK3_ORYSJ 
ID   Q5VPK3_ORYSJ            Unreviewed;       393 AA.
AC   Q5VPK3;
DT   07-DEC-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   07-DEC-2004, sequence version 1.
DT   24-JAN-2024, entry version 113.
DE   SubName: Full=Os06g0148600 protein {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
DE   SubName: Full=cDNA clone:001-123-E10, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAG88928.1};
DE   SubName: Full=cDNA clone:J033094B14, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAH00656.1};
GN   OrderedLocusNames=Os06g0148600 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
GN   ORFNames=OSNPB_060148600 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1};
OS   Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC   Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX   NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN   [1] {ECO:0000313|EMBL:BAG88928.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA   Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA   Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA   Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA   Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA   Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA   Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA   Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA   Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA   Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA   Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA   Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT   "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT   japonica Rice.";
RL   Science 301:376-379(2003).
RN   [2] {ECO:0000313|EMBL:BAH00656.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA   Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., Hayashida K.,
RA   Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., Hori F., Hotta I.,
RA   Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., Ishibiki J., Ishii Y.,
RA   Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., Katoh H., Kawagashira N.,
RA   Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N.,
RA   Kobayashi M., Kodama T., Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H.,
RA   Kouda M., Koya S., Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M.,
RA   Masuda H., Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA   Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., Namiki T.,
RA   Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., Ohneda E.,
RA   Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., Otomo Y., Ryu R.,
RA   Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., Sato K.,
RA   Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., Shishiki T., Sogabe Y.,
RA   Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., Tagami M., Tagami-Takeda Y.,
RA   Tagawa A., Takahashi F., Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T.,
RA   Tsunoda Y., Ueda M., Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M.,
RA   Yasunishi A., Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT   "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones from
RT   japonica rice.";
RL   Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN   [3] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX   PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG   International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA   Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA   Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA   Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA   Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA   Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA   Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA   Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA   Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA   Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA   Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA   Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA   Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA   Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA   Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA   Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA   Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA   Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA   Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA   Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA   Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA   Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA   Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA   Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA   Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA   Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA   Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA   Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA   Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA   Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA   Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA   Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA   Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT   "The map-based sequence of the rice genome.";
RL   Nature 436:793-800(2005).
RN   [4] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX   PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA   Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
RA   Yang C.C., Iwamoto M., Abe T., Yamada Y., Muto A., Inokuchi H., Ikemura T.,
RA   Matsumoto T., Sasaki T., Itoh T.;
RT   "Rice Annotation Project Database (RAP-DB): an integrative and interactive
RT   database for rice genomics.";
RL   Plant Cell Physiol. 54:E6-E6(2013).
RN   [5] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX   PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA   Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
RA   Ouyang S., Schwartz D.C., Tanaka T., Wu J., Zhou S., Childs K.L.,
RA   Davidson R.M., Lin H., Quesada-Ocampo L., Vaillancourt B., Sakai H.,
RA   Lee S.S., Kim J., Numa H., Itoh T., Buell C.R., Matsumoto T.;
RT   "Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next
RT   generation sequence and optical map data.";
RL   Rice 6:4-4(2013).
RN   [6] {ECO:0000313|EMBL:BAS96164.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL   Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AK063946; BAG88928.1; -; mRNA.
DR   EMBL; AK121786; BAH00656.1; -; mRNA.
DR   EMBL; AP014962; BAS96164.1; -; Genomic_DNA.
DR   RefSeq; XP_015641296.1; XM_015785810.1.
DR   RefSeq; XP_015641297.1; XM_015785811.1.
DR   AlphaFoldDB; Q5VPK3; -.
DR   STRING; 39947.Q5VPK3; -.
DR   PaxDb; 39947-Q5VPK3; -.
DR   EnsemblPlants; Os06t0148600-01; Os06t0148600-01; Os06g0148600.
DR   GeneID; 4340131; -.
DR   Gramene; Os06t0148600-01; Os06t0148600-01; Os06g0148600.
DR   KEGG; osa:4340131; -.
DR   eggNOG; ENOG502R466; Eukaryota.
DR   HOGENOM; CLU_019286_9_1_1; -.
DR   OMA; RCHGSID; -.
DR   OrthoDB; 1121735at2759; -.
DR   Proteomes; UP000059680; Chromosome 6.
DR   Gene3D; 1.20.1280.50; -; 1.
DR   InterPro; IPR005174; DUF295.
DR   InterPro; IPR036047; F-box-like_dom_sf.
DR   PANTHER; PTHR33110; F-BOX/KELCH-REPEAT PROTEIN-RELATED; 1.
DR   PANTHER; PTHR33110:SF36; OS06G0148600 PROTEIN; 1.
DR   Pfam; PF03478; DUF295; 1.
DR   SUPFAM; SSF81383; F-box domain; 1.
PE   2: Evidence at transcript level;
KW   Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}.
FT   DOMAIN          54..357
FT                   /note="DUF295"
FT                   /evidence="ECO:0000259|Pfam:PF03478"
SQ   SEQUENCE   393 AA;  44314 MW;  5A67D3176E05F602 CRC64;
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