ID Q6ZAE3_ORYSJ Unreviewed; 142 AA.
AC Q6ZAE3;
DT 05-JUL-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 05-JUL-2004, sequence version 1.
DT 27-MAR-2024, entry version 137.
DE SubName: Full=Os08g0366100 protein {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1};
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DE SubName: Full=cDNA clone:J013060M10, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAG99973.1};
GN OrderedLocusNames=Os08g0366100 {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1};
GN ORFNames=OSNPB_080366100 {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1};
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN [1] {ECO:0000313|EMBL:BAG88163.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [2] {ECO:0000313|EMBL:BAG99973.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., Hayashida K.,
RA Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., Hori F., Hotta I.,
RA Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., Ishibiki J., Ishii Y.,
RA Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., Katoh H., Kawagashira N.,
RA Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N.,
RA Kobayashi M., Kodama T., Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H.,
RA Kouda M., Koya S., Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M.,
RA Masuda H., Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., Namiki T.,
RA Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., Ohneda E.,
RA Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., Otomo Y., Ryu R.,
RA Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., Sato K.,
RA Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., Shishiki T., Sogabe Y.,
RA Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., Tagami M., Tagami-Takeda Y.,
RA Tagawa A., Takahashi F., Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T.,
RA Tsunoda Y., Ueda M., Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M.,
RA Yasunishi A., Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones from
RT japonica rice.";
RL Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
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RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
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RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4] {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
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RN [5] {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
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RL Rice 6:4-4(2013).
RN [6] {ECO:0000313|EMBL:BAT05142.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC ---------------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC ---------------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AK061882; BAG88163.1; -; mRNA.
DR EMBL; AK120339; BAG99973.1; -; mRNA.
DR EMBL; AP014964; BAT05142.1; -; Genomic_DNA.
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DR GO; GO:0005634; C:nucleus; IBA:GO_Central.
DR GO; GO:0003677; F:DNA binding; IEA:UniProtKB-KW.
DR CDD; cd00093; HTH_XRE; 1.
DR Gene3D; 1.10.260.40; lambda repressor-like DNA-binding domains; 1.
DR InterPro; IPR001387; Cro/C1-type_HTH.
DR InterPro; IPR010982; Lambda_DNA-bd_dom_sf.
DR InterPro; IPR013729; MBF1_N.
DR PANTHER; PTHR10245; ENDOTHELIAL DIFFERENTIATION-RELATED FACTOR 1 MULTIPROTEIN BRIDGING FACTOR 1; 1.
DR PANTHER; PTHR10245:SF123; MULTIPROTEIN-BRIDGING FACTOR 1B; 1.
DR Pfam; PF01381; HTH_3; 1.
DR Pfam; PF08523; MBF1; 1.
DR SMART; SM00530; HTH_XRE; 1.
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PE 1: Evidence at protein level;
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IPNQQIIGKL ERALGTKLRG KK
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