ID Q8H5R6_ORYSJ Unreviewed; 266 AA.
AC Q8H5R6;
DT 01-MAR-2003, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 01-MAR-2003, sequence version 1.
DT 01-MAY-2013, entry version 54.
DE SubName: Full=Os07g0637400 protein;
DE SubName: Full=Vesicle soluble NSF attachment protein receptor-like protein;
DE SubName: Full=cDNA clone:J013108F08, full insert sequence;
GN Name=OJ1136_D11.130; OrderedLocusNames=Os07g0637400;
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade;
OC Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
OX NCBI_TaxID=39947;
RN [1]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Sasaki T., Matsumoto T., Yamamoto K.;
RT "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 7, BAC
RT clone:OJ1136_D11.";
RL Submitted (JUN-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [2]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K.,
RA Namiki T., Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K.,
RA Shishiki T., Otomo Y., Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T.,
RA Suzuki Y., Tsunoda Y., Kurosaki T., Kodama T., Masuda H.,
RA Kobayashi M., Xie Q., Lu M., Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K.,
RA Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R., Ishibiki J., Kawamata M.,
RA Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M., Ryu R., Ueda M.,
RA Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K., Arakawa T.,
RA Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K., Ishii Y.,
RA Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N., Ota Y.,
RA Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [3]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare;
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG International Rice Genome Sequencing Project;
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H.,
RA Kobayashi N., Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T.,
RA Mukai Y., Nagasaki H., Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y.,
RA Nakamichi Y., Nakamura M., Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T.,
RA Okamoto M., Ono N., Saji S., Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M.,
RA Shimokawa T., Song J., Takazaki Y., Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K.,
RA Ueda S., Waki K., Yamagata H., Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H.,
RA Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K., Zhong H., Yano M., Yuan Q.,
RA Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K., Moffat K., Hill J.,
RA Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M., Overton L., Reardon M.,
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RA Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S., Feldblyum T.,
RA Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R., Ying K.,
RA Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J., Weng Q.,
RA Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G.,
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RA Wincker P., D'Hont A., Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M.,
RA Quetier F., Yu Y., Kim H.R., Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M.,
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RA Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S., Kapur A., Khurana P.,
RA Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K., Singh A., Dalal V.,
RA Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A., Yadav M., Pandit A.,
RA Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R., Mohapatra T.,
RA Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S., Keizer G.,
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RA Fujii Y., Habara T., Sakai H., Sato Y., Wilson G., Kumar K.,
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RA Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T., Kadowaki K., Sugiura M.,
RA Burr B., Sasaki T.;
RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [5]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project);
RT "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 7.";
RL Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [6]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RT "The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2).";
RL Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [7]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=16381971; DOI=10.1093/nar/gkj094;
RA Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K.,
RA Habara T., Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K.,
RA Itoh T., Gojobori T., Sasaki T.;
RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa
RT ssp. japonica genome information.";
RL Nucleic Acids Res. 34:D741-D744(2006).
RN [8]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RA Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B.,
RA Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T.,
RA Burr F., Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B.,
RA Harada E., Hiraki A.T., Hirochika H., Hoen D., Hokari H., Hosokawa S.,
RA Hsing Y., Ikawa H., Ikeo K., Imanishi T., Ito Y., Jaiswal P.,
RA Kanno M., Kawahara Y., Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P.,
RA Kikuchi S., Komatsu S., Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D.,
RA Lin Y.C., Lonsdale D., Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R.,
RA Messing J., Miyao A., Mulder N., Nagamura Y., Nam J., Namiki N.,
RA Numa H., Nurimoto S., O'donovan C., Ohyanagi H., Okido T., Oota S.,
RA Osato N., Palmer L.E., Quetier F., Raghuvanshi S., Saichi N.,
RA Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T., Sato F., Sato Y.,
RA Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K., Shinso Y.,
RA Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T.,
RA Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A.,
RA Wang A., Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y.,
RA Zhang H., Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.;
RT "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and
RT Comparative Genome Analysis with Arabidopsis thaliana.";
RL Genome Res. 17:175-183(2007).
RN [9]
RP GENOME REANNOTATION.
RC STRAIN=cv. Nipponbare;
RX PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
RG The rice annotation project (RAP);
RT "The rice annotation project database (RAP-DB): 2008 update.";
RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
RN [10]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RA Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y.,
RA Numa H., Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y.,
RA Habara T., Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H.,
RA Matsuya A., Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y.,
RA Suzuki M., Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K.,
RA Yamamoto N., Yamasaki C., Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K.,
RA Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C., Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q.,
RA Han B., Kramer M.R., McCombie R.W., Lonsdale D., O'Donovan C.C.,
RA Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O., Khurana J.P.,
RA Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G., Fujisawa M.,
RA Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M.,
RA Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H.,
RA Sakai Y., Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A.,
RA Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G.,
RA Messing J., Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A.,
RA Wing R.A., Nobuta K., Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C.,
RA Piegu B., Panaud O., Echeverria M.;
RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update.";
RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
CC -----------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
CC -----------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AP003749; BAC16405.1; -; Genomic_DNA.
DR EMBL; AP008213; BAF22316.1; -; Genomic_DNA.
DR EMBL; AK067595; BAG90490.1; -; mRNA.
DR RefSeq; NP_001060402.1; NM_001066937.1.
DR UniGene; Os.7186; -.
DR EnsemblPlants; LOC_Os07g44350.1; LOC_Os07g44350.1; LOC_Os07g44350.
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DR ProtClustDB; CLSN2688488; -.
DR GO; GO:0005886; C:plasma membrane; IEA:EnsemblPlants/Gramene.
DR InterPro; IPR005606; Sec20.
DR InterPro; IPR000727; T_SNARE_dom.
DR Pfam; PF03908; Sec20; 1.
DR PROSITE; PS50192; T_SNARE; 1.
PE 2: Evidence at transcript level;
KW Complete proteome; Receptor; Reference proteome.
SQ SEQUENCE 266 AA; 30062 MW; 6DA11C919B38855F CRC64;
MASDVPMSPE LEQVDGEIQD IFRALQNGFQ KMDKIKDSNR QSKQLEDLTG KMRECKRLIK
EFDRILKEDE KKNSADVNKQ LNDKKQLMIK ELNSYVTLRK TYQSSLGNKR IELFDTGNDQ
VAEDNTVQMA SEMSNQQLMD AGRKQMDQTD QVIERSKKVV AQTVEVGSQT AAALSQQTEQ
MKRIGNELDS VHFSLKKASQ MVKEIGRQVA TDKCIMAFLF LIVCGVIAII VVKIVNPHNK
NIRDIPGLAP PAQNRKLLSI ESFGSL
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