| Entry |
|
| Gene name |
uvrB
|
| Definition |
excinuclease ABC subunit B
|
| Orthology |
| excinuclease ABC subunit B |
|
| Organism |
upa Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815
|
| Pathway |
| Nucleotide excision repair |
|
| Class |
Genetic Information Processing; Replication and repair; Nucleotide excision repair [PATH: upa03420]
 |
| SSDB |
    |
| Motif |
 |
| Other DBs |
NCBI-GI: NCBI-GeneID: JCVI-CMR: UniProt: |
| Position |
157441..159441
 |
| AA seq |
666 aa  
MDDFKKFELISDYKPAGDQQKAIDEMVNNINQGIQRQVLLGATGTGKTFSVANVIAKTQL
KTLVLAHNKTLAAQLFAELKEMFPHNKVEYFVSYFDYYQPEAYKPITDTYIEKDSVTNAE
IEMMRLSTINSLATRNDVIVVASVACIYASVSPIEFTKKNLYLHVGELIEFEQIKYKLVQ
LGYERKDYDLVPGTFRIRGDLIEIMSGYSDKFKIRISMFGNEVESIDLCDPITNNIISKE
QRFILRSASEYIFDDSRLAIAIENIKNELDERVKFFLKNNQLIEAQRIEQRTKQDLESIV
EFGFCSGVENYYRHLEHREPFQTPWTIFDFFSYNNQDWLLIVDESHISLPQVKGMHNTDR
SRKQTLVEYGFRLPSALDNRPLNYDEFNKKLSKTIYVSATPNDEEIALSDNHIVSQIVRP
TGLLDPIIEIRKTEHQIDDLINELMLLKNKNQRAFITVMTIRMAEDLTNYLNNTKIKAAY
LHNELKTLERSVIINKLRKGIYDCVVGINLLREGLDVPEVAGVFIFDADKPGFFRSDKSL
IQIIGRAARNADGKVIMYADVITQAMQTAINETKRRREIQLAFNLKHNIIPKTIIKPIHE
DLSGHDYKQNAELYAAKASKNEYNQKIKELKKKMEEAAKKREYEVAAQYRDMIVELEAIK
QSVKSK |
| NT seq |
2001 nt  +upstreamnt +downstreamnt
atggatgattttaaaaaatttgaattaataagcgattataaaccagctggtgaccaacaa
aaggcaattgatgaaatggttaataatattaatcaaggtattcaacgacaagtattatta
ggggcaacaggaacaggaaaaacatttagtgtggctaatgtaattgcaaaaacccaatta
aagactttagttcttgctcataataaaacattagctgcacaattatttgctgaacttaaa
gaaatgtttcctcataataaagttgaatattttgtttcatattttgattattatcaacca
gaagcttataaacctataactgatacttatattgaaaaagattcagtaacaaatgcagaa
attgagatgatgcgtttatcaactattaattcattggctacaagaaatgatgtcattgtt
gttgcttctgttgcatgtatttatgcatctgtttctcctatagaatttactaaaaagaat
ttatatttacatgttggtgaattaatcgaatttgaacaaattaaatataaattagttcaa
ttaggttatgaacgaaaagattatgatttagtgccaggaacatttaggattcgtggtgat
ttaattgaaattatgtctggatatagtgataaatttaaaataagaatatcaatgtttgga
aatgaagttgaatcaattgatctttgcgatccaattactaataatattatttctaaagaa
caaaggtttattttacgaagtgcaagtgaatatatttttgatgattcgcgtttagcaata
gcgattgaaaatattaaaaatgaactagatgaacgagttaaattttttctaaaaaacaat
caattaattgaggcgcaacggattgagcaacgaactaaacaagatcttgaaagtattgta
gagtttggtttttgtagtggagttgaaaattattatcgtcatcttgaacatcgtgaacct
tttcaaacaccatggacaatttttgattttttttcatataacaatcaagattgattatta
attgtagatgaatcacatatttcattaccacaagtgaaagggatgcataatacagaccgt
agtcgtaaacaaacattagttgaatacggatttcgtttacctagcgctttagataatcgg
cctttaaattatgatgaatttaataaaaaactttccaaaacgatttatgtttctgccaca
ccaaacgatgaagaaattgcgttatcagataatcatatagttagtcaaattgttcgtcct
acaggattattagatccaattattgaaattagaaaaacagaacaccaaattgatgattta
attaatgaattgatgcttttaaaaaacaagaatcaacgagcatttattactgttatgaca
attagaatggctgaggatttaacaaattatttaaataatacaaaaattaaagctgcttat
ttacataatgaattaaaaacactagagcgtagtgttattatcaataaattaagaaaagga
atttatgattgtgttgttggaattaatcttttaagagaaggattagatgttccagaagtt
gcaggtgtttttatttttgatgctgataaacctggtttttttagaagtgataaatcttta
attcaaattattggacgtgcagcacgtaatgctgatggtaaagtaattatgtatgctgat
gtaataacacaagccatgcaaaccgcaatcaatgaaacaaaacgacgacgtgaaattcaa
ttagcttttaatttaaaacataatattatccctaaaacaattattaaaccaattcacgaa
gatttaagtggccatgattataaacaaaatgcggaattatatgctgcaaaagcttcaaaa
aacgagtacaatcaaaaaatcaaagaattaaagaaaaaaatggaagaagctgcaaaaaaa
cgtgaatatgaagttgctgctcaatatcgcgatatgattgttgaattagaagccattaag
caaagtgtaaaaagcaaataa |