KEGG   Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815: UPA3_0609
Entry
UPA3_0609         CDS       T00680                                 
Name
(GenBank) metallo-beta-lactamase superfamily protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
upa  Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815
Pathway
upa03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:upa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    UPA3_0609
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:upa03019]
    UPA3_0609
Messenger RNA biogenesis [BR:upa03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     UPA3_0609
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C Lactamase_B RMMBL Lactamase_B_2 ODP
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACA32866
UniProt: A0A2C9DY90
Position
complement(709848..711638)
AA seq 596 aa
MENTKKSPTYVYALGGLEEIGKNTYVVEHEDEIILIDAGIKFANASLPGFDGTVANFDYL
IKNNHKIHSLVVTHGHEDHIGGIPHILRHVKIKTIYAPTLAAKLIERRLSEYKDIKPPRI
IVFEDESMYKTKYFEVDFYRVCHSIPDSFGICVKTPNGYIVTTGDFRFDFATAGDETNLA
KISQISNRGISVLMCESTSAEIPGFSESERYVIDNIRDYMVNIKGRTFISTFASNLGRVE
EIIAIAVGLNKKICIIGKSMEANIKTSRKLGYLNVPESSFITHKELPFYKDHEIVVILTG
SQGEKMAALNVMANNNHSKITLKPSDTIILSSNPIPGNYAQVEAMVNKLYKLGLTVYENS
PNKKIHASGHATRSEHQLMIKAINPSYLFPIHGEYKMFRALKQNAVDQGFDKDHVIIAPN
GQKLQLLDGVLSHTNIYVDAEPKFINGYEISSKISKLLSERVVLSSDGILNLVLNADFKK
AKLNSAVSISTRGCFFAKESTNLINKISNVAKSSLEEALAKKEFDEKKLKEIVSGNVKSI
VWKWRKKNPIINVTIINNDLVEQFRKDNNYVEFIKQAEVEEIEQEVDIDDLISNGL
NT seq 1791 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaataccaaaaaaagtcctacatatgtttatgctttaggggggctagaagaaatt
ggtaaaaacacttatgttgttgaacatgaagatgaaattattttaattgatgcgggcatt
aaatttgctaatgcatctttaccaggatttgatggaactgttgccaattttgattattta
ataaaaaacaatcataaaattcattcattagtagttactcatggtcatgaagaccatatt
ggggggattcctcacattttgcgacatgttaaaattaagactatctatgcaccaacatta
gcagcaaaattaattgaacgtcgtttaagtgaatataaagatattaaacctccgcgtatt
attgtctttgaagatgagtcaatgtataaaacaaaatattttgaagttgatttttatcgt
gtttgtcattcaattcctgattcatttggaatttgtgtaaaaacaccaaacggatacatt
gtaacaactggtgattttagatttgattttgctacagctggtgatgagactaatttagct
aagatttcacaaatttctaatcgtggaatctcagtattaatgtgcgaatcaacaagtgct
gaaattcctggatttagtgaaagtgaacgatatgttattgataacattcgtgattatatg
gtaaatattaaaggacgaacttttatttcaacatttgcttctaatttaggtcgtgttgaa
gaaattattgctatagctgttggtttaaataaaaaaatctgtatcattggtaaatcaatg
gaagctaatattaaaacaagtcgaaaattgggttatttaaatgttcctgaatcttcattt
atcacacataaagaattgccattttataaagatcatgaaattgttgtaattttaactggt
tcacaaggtgaaaaaatggcggctttaaatgttatggctaataataaccactcaaaaatt
actttaaaaccatcagatacaattatcttatcatcaaatccaatcccaggaaactatgct
caagtcgaagcaatggttaataaactttataaactcggattaacagtttatgaaaattca
cctaacaaaaagattcatgcttctggtcatgccacacggagtgaacaccaattaatgatt
aaagcaattaatccatcatatttatttccaatccatggggaatataaaatgtttcgtgct
ttaaaacaaaatgctgttgaccaaggttttgataaagaccatgtcattattgcaccaaat
ggccaaaaattacaattattagatggtgttttaagtcatactaatatttatgttgatgct
gaacctaaatttattaatggttatgaaattagttctaaaattagtaaattattaagtgaa
cgtgttgttttatccagtgatggtattttaaatctagttttaaatgctgattttaaaaaa
gctaagttaaactctgctgtaagtatttcaacacgaggatgtttttttgccaaagaatca
actaatttaattaataaaatttctaatgtagcaaaatcaagtttagaagaagcgttggca
aaaaaagaatttgatgaaaaaaaactaaaagaaatagttagtggaaatgttaaatcaatt
gtttgaaaatgacgtaagaaaaatccaattattaatgtcacaattattaataatgatttg
gtcgaacagtttagaaaagacaataattatgttgaatttatcaaacaagctgaagttgaa
gaaattgaacaagaagttgatattgatgatttaatttcaaacggtttataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (13)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system