KEGG U.urealyticum: UU187

cvi:CV4370 : No such data.

Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU187

Entry

UU187 CDS U.urealyticum

Gene name rpoB

Definition DNA-directed RNA polymerase subunit beta (EC:2.7.7.6)

Orthology K03043 DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]

Pathway uur00230 Purine metabolism
uur00240 Pyrimidine metabolism
uur01100 Metabolic pathways
uur03020 RNA polymerase

Class Metabolism; Nucleotide Metabolism; Purine metabolism [PATH:uur00230]
Metabolism; Nucleotide Metabolism; Pyrimidine metabolism
[PATH:uur00240]
Genetic Information Processing; Transcription; RNA polymerase
[PATH:uur03020]
Genetic Information Processing; Replication and Repair; DNA repair
and recombination proteins

SSDB

Motif Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_2
PROSITE: RNA_POL_BETA

Other DBs NCBI-GI: 13357745
NCBI-GeneID: 875829
UniProt: Q9PQV6

Position 225605..229909

AA seq 1434 aa
MQNNKNYTEKFITDKVMRRDYSKIKSNFEGPNLLEIQVESFKRFMEKDLKEVISSIFPLK
SPQGKYTLAFKGLKIKQPTKDESACRDEGKTFETPIYIDLELTDNYTGEVKRAQRNTKTG
EDGIYLGAIPKMTEKGTFVINGIEKFVISQIVRSPGIYVLGKSSIKLNGSRKRLFEGKIC
EIYPSKGTLMLGYIPKDRHNIQIVARDSSGDNAQTFSVTTLLKAFGLTSAEILKIFNNEK
EIRESLEIEKYAPEYIFENSQENEIIFKIYSDAHDIHEKADRRESNNKLKEEYIEQGSPL
LSKLKQLIFNYVEKNDEIDALLHENKDVEDASFIKNNKKLYDEREEIINCIISEKAAKDI
VELLGINIKNIETLRHLGKASYQIALQQHFFNKRLYDISSAGRYKFEKKLLLSERLYQKV
IANDIIDKKNNILIPKDTLITKEHIELIKKESRDKNIKWTKKINLLPTALESEIEQFLEY
ESIAVYKDNDLRDETTEIVGLASGCKLQTLTVADLVATTSYIYNLNYEIGEFDDIDHLGN
KRLKLIHELLRARIATSMARIEKFINEKLAISDGSSNNITNVNDKGIDTELDREIEESDM
SDEEKKKAISVKSIINTKQFQSLVKDFFNSHQLIQFIDQQNPLAELTNKRRISAMGPGGI
SREDPNLDIRDVHHSHSSRICPIETPEGMNIGLIMSLASLAKVDENGFIVAPYYVVEDGV
VKEDYKYLTAHEDDNYIIAESSVQLDENKRILDEQVVARYRGSTGLFSPNEVDFIDIVPK
QVVSIAASAIPFIENDDGARALMGSNMQRQATPLIKPYAPIVGTGTEFKIAHDSGMAVVA
KNDGVVEFVDSQKIIIRNDNDKLDDYKLIKYRKSNQDTCNNQIPIVKVGQRVHKSETIGD
GPAMQNGELALGRNILVGYTTWRGYNFEDAIIISERLVDQDVFTSIHIDEHTIQCMKTKN
GDEEITRDMPNVSDTAKRFLDNQGIVLVGAEVHEGDVLVGKTTPRGNVETAPEDRLLQTI
FGDKSKTVKDSSLKVKHGQEGIVAAVKRIKSSDENGSELPDDVIEIIKVYIVQKRKIQVG
DKMAGRHGNKGIVSKVVPIQDMPFLKDGTPLDIMLNPLGVPSRMNIGQILELHLGYAAAE
IGKKQLIQIAIDQLGYEKYISLFGINEIIAKKLYENISNLIKHKQAKQAKDIDLIDVTII
LKELGLSYDDIGIKISTPVFDGANHDDIVSIMNEANIDIENNKGKQVLYDGRTGEPFDGL
ISVGLTYMLKLDHMVDDKIHSRSVGPYSKITQQPLGGKSQNGGQRFGEMEVWALEAYGAA
YNLLEILTIKSDDVQGRNQAYNAIIKGHDVVADGMPESFKLLTKQMQGLGLCITVETKDD
RMVDINEYTLNQNRLNNDDDEVILDENLKEINDSNEEIFNTNFNNNDYDDEENF

NT seq 4305 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcaaaataataaaaattatactgagaaatttattactgataaagtaatgcgaagagat
tattcaaaaattaaatctaattttgaaggaccaaatctacttgaaattcaagttgaatct
tttaaacgctttatggagaaagatttaaaagaagttatttcaagtatttttccattaaaa
tctcctcagggtaagtatacgttagcatttaaaggtttaaaaattaagcagccaacaaaa
gatgaaagtgcttgtcgtgacgaaggtaaaacatttgaaacaccaatttatattgatttg
gaattaacagataactacacaggtgaagttaaacgtgcacaacgaaatactaaaacagga
gaagatggtatttatttaggagcaattcccaaaatgacagaaaaaggaacttttgttatt
aatggaattgaaaaatttgttatctcacaaattgttagatcaccaggaatttatgtactt
ggtaaatcaagcatcaaattgaacggttcacgtaagcgtttatttgaaggcaaaatttgt
gaaatttatccttctaagggtactttgatgcttggttatattcctaaggatcgtcataat
attcaaattgttgcacgtgattcatctggtgataatgcgcaaacattttcagtaactact
ttactaaaagcttttggtttaacaagtgctgaaatcttaaaaatttttaataatgaaaaa
gagattcgtgaatcattagaaattgaaaaatatgcgccagaatatatttttgaaaattca
caagaaaatgaaattatttttaaaatttatagtgatgctcatgatattcatgagaaagcc
gatcgtcgagaatcaaataataagttaaaagaagaatatatagaacaaggttcaccactt
ttatcaaagttaaaacaactaatttttaattatgttgaaaaaaacgatgaaattgatgca
ttattacatgaaaataaagatgttgaagatgctagtttcattaagaataataaaaaatta
tatgatgaaagagaagaaatcattaattgcatcattagtgaaaaagcagctaaggatatc
gttgaattattaggtattaatattaaaaatatagaaacactaagacatttaggcaaagct
tcttatcaaatagctttacaacaacatttttttaataagcgtttatatgatattagtagt
gctggacgctataaatttgaaaaaaaattattattaagtgaacgtttatatcaaaaagta
attgcgaatgatattattgataaaaaaaataatattctaattcctaaagatactttaatt
actaaagaacatatcgaactaataaaaaaagaatcacgtgataaaaacattaaatgaaca
aaaaaaattaatttattaccaacagcattagaatcagaaattgaacaatttttagaatat
gaaagtattgcagtttataaagataatgatttaagagatgaaacaacagagattgtcggt
ctagcatcaggttgcaaacttcaaactttaaccgtggctgacttagttgctacaacaagt
tatatttataacttgaattatgaaattggtgaatttgatgatatagatcatttaggtaat
aaaagacttaaattgattcatgaattattacgagcaagaattgctacaagtatggctcgt
attgagaagtttattaatgaaaagttggctatttctgatggttcaagcaataacattaca
aatgttaatgataaaggtattgatactgaacttgatcgtgaaattgaagaaagcgatatg
agtgatgaggaaaagaaaaaagcaattagtgttaaatcaattattaatacaaaacaattc
caaagtttagttaaagatttttttaattcacatcaattaattcaatttattgaccaacaa
aatccattagcagaattaactaataaacgtcgtatttcagcgatgggtccaggaggaatt
agtcgtgaagaccctaatttagatattcgtgatgttcatcactctcactcttcgcgtatt
tgcccgattgaaacaccagaaggaatgaatattgggttgattatgtctttagcatcactt
gcaaaagtagatgaaaatggttttattgtagcaccttattatgttgttgaggatggggtt
gtaaaagaagattataaatatttaacagcccatgaagatgataactatattattgctgaa
tcatcagtccaattagatgaaaataaacgaattttagatgaacaagttgttgctcgatat
cgtggctcaacaggtttatttagtcctaatgaagttgattttattgatattgttccaaaa
caagtagtatcaattgctgcatcagcaattccatttattgaaaatgacgatggggcacgt
gctttgatggggtcaaacatgcaacgtcaagcaacacctttaattaaaccatatgcccct
attgtagggacaggtacagaatttaaaattgcacacgattcaggaatggctgttgttgct
aaaaatgacggagtggttgaatttgttgatagtcaaaaaattatcattagaaatgataat
gataaattagatgattataaattaattaaatatcgtaaatcaaatcaagacacatgtaat
aaccaaattccaattgtaaaagtaggtcaaagagttcacaaatctgaaacaattggtgat
ggacctgcaatgcaaaatggtgaattagctttaggtcgtaatattctagttggttataca
acttgacgaggttataattttgaagatgctattattatttctgaacgtttagttgatcaa
gatgtatttacatcaattcatattgatgagcatacaattcaatgtatgaaaacaaaaaac
ggtgatgaagaaatcactcgtgacatgcctaatgtctctgatactgcaaaacgtttttta
gataatcaaggtatcgttttagttggcgctgaagttcatgaaggagatgttttagttgga
aaaacaactccacgaggtaatgttgaaactgctccagaagatcgtttattgcaaacaatt
tttggcgataaatcaaaaacagttaaagattcatcactaaaagtaaaacacggtcaagaa
ggaattgttgctgctgttaagcgaattaaatcaagtgatgaaaatggtagtgaattacca
gatgacgtaattgaaattatcaaagtttatattgttcaaaaacgtaaaattcaagttggt
gacaaaatggcagggcgtcatggaaataaaggaattgtatcaaaagttgttcctattcaa
gatatgccttttttaaaagacgggactccattagatattatgttaaatccattaggtgta
cctagtcgtatgaatattggtcaaattttagaattgcacttaggttatgctgcggctgaa
ataggtaaaaaacaattaattcaaattgcaattgatcaattaggttatgaaaaatatatt
tcattgtttggaatcaatgaaattattgctaaaaaactttatgaaaatattagtaattta
attaaacacaaacaagcaaaacaggcaaaagatatagatttaattgatgtgacaattatt
ctaaaagaattgggattatcatatgatgatattggaattaaaatttcaactcctgtattt
gatggtgcaaatcatgatgatattgtttctattatgaatgaagcaaacattgatattgaa
aataataagggtaaacaagttctatatgatggaagaactggtgaaccattcgatggttta
atttcagttggattaacatacatgttaaaactagatcatatggttgatgataaaattcac
agtcgttcggttggtccatatagtaaaattacacaacaaccattgggtggtaaatcacaa
aatggaggccaacgttttggtgaaatggaagtttgagctttagaagcttatggtgcagct
tataatttattagaaattttaacaattaaatccgatgatgttcaaggacgtaatcaagct
tacaatgctattataaaaggtcacgatgttgttgctgatggaatgccagaatcatttaaa
ttattaacaaaacaaatgcaaggtttagggttatgtattaccgttgaaacaaaagatgat
cgtatggtagatattaatgaatatacactaaatcaaaatcgtttaaataatgacgatgat
gaggttattttagatgaaaatctaaaagagatcaatgattctaatgaagaaatatttaat
acaaactttaataataatgactatgatgatgaagagaacttctaa

All links

Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (2)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (2)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (7)   
   Pfam (6)   
   PROSITE (1)   
All databases (21)

DBGET integrated database retrieval system