KEGG   Vibrio fischeri ES114: VF_0885Help
Entry
VF_0885           CDS       T00236                                 

Definition
ABC transporter permease
Orthology
K02004  
putative ABC transport system permease protein
Organism
vfi  Vibrio fischeri ES114
Module
Putative ABC transport system
Class
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif
Pfam: 
Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
UniProt: 
Position
I:970974..973427
Genome map
AA seq 817 aa AA seqDB search
MLFPVAKALLGHYRKHPLQIFLVWLGLTLGVALLVGVLAINHHAKVSYSEGEKLFSNPFP
NRIRSIQDNVVIPQAFYINLRRAGYTSCMPIQTLHLETNEKIDISMVGIDPIALMQISSG
NLANTDNMLSLMRPPFPVLISKPLASYFSLKDGDYIELKNQSNIGPVIVDKQNRLAGSRL
FSDIALTKMLGHKAGFNIILCGAMSEQKKERLERMLPRGLQLETHKESGLTALTNAFHTN
LLAMGMLSFIVGLFIFYQAMSLSFVQRQPLVGTLRQIGVSTKELILAMSLEVIIWIIIGW
ISGNFFGLLLANELMPTVSNSLYSLYNAEVDLLISWSWDWSYQSLLMAVLGCVLACGWPL
YRLLTIEPIRLTARLSLARFAGKEFEVQAIIACVIFVAAYLINLLPHSHRNGFMLIGFLM
ISIGLLTPFIIWKFFDWLSYTLPSAKARWFFSDSAASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNNWLEQRLAADIYIEPSKASAGRISYWLEKQPEVKSVWRQWKIDYQTEFGN
LEIISTGSTEGEKNALTMKVAIPDYWYSLHHGRNVLISESMSLKWDLKPGDYIDLPAPMG
NNWQISGVYYDYGNPYNQLLLSHGTWLKAFGGQGKTGIGVVLTDQAKRTELIGRVLKQYR
LSAEQVSDNNNIQIQAMRVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGEISRQRQTALL
RCLGLSGKELVLLGGLQLLVIGLFTILIALPLGLILSQLLIDIVMKYAFGWTMEIHYFPK
EYTITFLWTLLALTVAGAGTIWRVTKRQAITSLRESL
NT seq 2454 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgttatttccggtagctaaagcgcttcttggacactaccgtaaacatccgttgcaaatc
tttttagtgtggcttggtttaacactcggagttgctttacttgttggtgttctcgcgata
aaccatcacgctaaagtcagttatagcgaaggcgaaaagcttttctcaaatccttttcct
aaccgtattcgctctattcaagataatgttgttatccctcaggcgttttatattaactta
cgtcgggctggctacacctcttgcatgcctatacaaaccttgcatttagaaaccaatgaa
aagattgatatctctatggttggtatcgatcctattgcgttaatgcagatttcatcaggg
aacttagcaaacacggacaatatgttgtctttaatgcgtcctccgttcccggtattgatc
agtaagccgctagcttcgtattttagcttaaaagatggcgattatattgagttaaaaaac
caatccaatattggccctgttattgttgataaacaaaatcgcttggcgggctctcgactg
ttttcagatatcgcactgactaagatgctaggccataaagcgggctttaatatcatttta
tgcggagcaatgtcagagcaaaaaaaagagcgtttagagcgaatgcttcctcgtggattg
caacttgaaacgcataaagaatcgggcttaacggcgttaacgaatgcttttcacacgaat
ttacttgcgatgggaatgctctcttttatcgttggtctctttattttctatcaagctatg
tcgctctcttttgtgcagagacagccgttggttgggacgctacgtcaaattggcgtatcc
acaaaagagcttattttagccatgagcctcgaagtgatcatttggatcattattggctgg
ataagtggtaacttttttggcttattgttggcgaatgaattaatgccgacggtatcgaac
agtttgtattctttatataacgctgaagtggatttattaatctcatggagttgggattgg
agttatcaaagtctgctaatggccgtattagggtgtgtattagcttgtggttggccgttg
tatcgtcttttaaccattgagccaattcgcttaactgctcgtctatctttagcacgtttt
gcaggcaaagagtttgaagttcaagctatcatcgcttgtgtgattttcgttgcagcttat
ctgataaatttattacctcatagtcacagaaatgggtttatgttgattggcttcttaatg
ataagtattgggttgttaaccccgtttattatttggaagttttttgattggctctcttat
acattgccatcagcaaaagcacgttggttcttctctgattcagcagcaagcttaagttat
cgtggtgtggcggcaatggcctttatgcttgcgctagcatctaatattggcgtggaaacc
atggtgggcagttttagagcaaccactaacaattggttagagcaacgcttggctgctgat
atttatattgaaccaagtaaagcgtcggctggacgaatcagttattggttagaaaaacaa
cctgaagtgaaatctgtgtggcgtcagtggaagattgattatcaaacagaattcggcaat
ttagagatcatcagtactggttctactgagggtgagaaaaatgcgttaaccatgaaagtg
gcgattcctgattactggtattcacttcaccatggacgcaatgtattaatcagtgaatcc
atgtcattgaaatgggacttaaaaccgggtgattacatcgatcttcctgctcctatgggg
aacaattggcagatttctggtgtgtattatgattacggaaatccgtataaccaattgttg
ctctctcatgggacgtggttaaaggcgtttggcggtcagggtaaaaccgggattggggtt
gtgctaacggaccaagcaaaaagaaccgaattaattggacgagtattaaaacagtatcga
ttatctgcagagcaggttagcgataataataatattcaaatacaggcaatgcgtgtgttt
gatagaacatttattgttacgggaacccttggtaatctgacgttagttatcgctgttttt
ggtctgttttttgccacattggttggtgaaatatcacgacaaagacaaactgcattattg
cgatgtttaggactgtctggcaaagagttggtgctgcttggtggcttacagttgctggtt
attggcttatttaccattcttattgcattgccgttagggctgattttgtcacagctattg
attgatattgttatgaaatatgcttttggttggacaatggaaatccattacttccctaaa
gaatacaccattacgttcttatggactttactggctttaactgttgctggtgctggaacc
atttggagagtaacaaagcgacaagccattacttcattaagggaatctttgtaa

DBGET integrated database retrieval system