 Eukaryotes (真核生物) (190)
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 Prokaryotes (原核生物) (2477)
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Bacteria (真正細菌) (2324)
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Gammaproteobacteria (ガンマプロテオバクテリア) (498)
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Betaproteobacteria (ベータプロテオバクテリア) (145)
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Neisseria (ナイセリア) (18)
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Chromobacterium (1)
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Laribacter (1)
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Pseudogulbenkiania (1)
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Ralstonia (ラルストニア) (6)
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Cupriavidus (5)
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Burkholderia (ブルクホルデリア) (36)
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Polynucleobacter (2)
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Bordetella (10)
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Achromobacter (1)
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Taylorella (5)
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Pusillimonas (1)
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Advenella (1)
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Rhodoferax (1)
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Polaromonas (2)
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Acidovorax (5)
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Verminephrobacter (1)
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Delftia (2)
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Variovorax (2)
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Comamonas (1)
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Alicycliphilus (2)
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Ramlibacter (1)
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Methylibium (1)
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Herminiimonas (1)
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Minibacterium (1)
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 mms Minibacterium massiliensis
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Herbaspirillum (1)
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Zinderia (1)
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Collimonas (1)
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Leptothrix (1)
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Thiomonas (2)
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Rubrivivax (1)
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Nitrosomonas (4)
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Nitrosospira (1)
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Aromatoleum (1)
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Azoarcus (2)
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Dechloromonas (1)
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Thauera (1)
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Azospira (1)
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Thiobacillus (1)
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Methylobacillus (1)
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Methylotenera (2)
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Methylovorus (2)
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Accumulibacter (1)
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Tremblaya (2)
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Sideroxydans (1)
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Gallionella (1)
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Kinetoplastibacterium (7)
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Unclassified Betaproteobacteria (1)
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Epsilonproteobacteria (イプシロンプロテオバクテリア) (90)
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Deltaproteobacteria (デルタプロテオバクテリア) (57)
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Alphaproteobacteria (アルファプロテオバクテリア) (238)
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Other proteobacteria (その他のプロテオバクテリア) (1)
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Chrysiogenetes (1)
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Firmicutes (グラム陽性菌) (523)
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Tenericutes (テネリキューテス) (71)
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Actinobacteria (アクチノバクテリア, 放線菌) (261)
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Chlamydiae (クラミジア) (89)
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Spirochaetes (スピロヘータ) (54)
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Acidobacteria (アシドバクテリア) (8)
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Bacteroidetes (バクテロイデス) (94)
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Fibrobacteres (フィブロバクテレス) (2)
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Fusobacteria (フソバクテリア) (5)
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Verrucomicrobia (ヴェルコミクロビア) (4)
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Gemmatimonadetes (ゲマティモナス) (1)
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Planctomycetes (プランクトミセス) (7)
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Elusimicrobia (エルシミクロビア) (2)
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Synergistetes (シネルギステス) (5)
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Cyanobacteria (シアノバクテリア) (73)
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Green sulfur bacteria (緑色硫黄細菌) (13)
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Green nonsulfur bacteria (緑色非硫黄細菌) (18)
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Deinococcus-Thermus (デイノコックス・テルムス) (20)
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Hyperthermophilic bacteria (超好熱細菌) (41)
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Unclassified (3)
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Archaea (古細菌) (153)
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KEGG 生物種