Eukaryotes (真核生物) (190)

 Prokaryotes (原核生物) (2477)

   Bacteria (真正細菌) (2324)

     Gammaproteobacteria (ガンマプロテオバクテリア) (498)

     Betaproteobacteria (ベータプロテオバクテリア) (145)

     Epsilonproteobacteria (イプシロンプロテオバクテリア) (90)

     Deltaproteobacteria (デルタプロテオバクテリア) (57)

     Alphaproteobacteria (アルファプロテオバクテリア) (238)

     Other proteobacteria (その他のプロテオバクテリア) (1)

     Chrysiogenetes (1)

     Firmicutes (グラム陽性菌) (523)

     Tenericutes (テネリキューテス) (71)

     Actinobacteria (アクチノバクテリア, 放線菌) (261)

     Chlamydiae (クラミジア) (89)

     Spirochaetes (スピロヘータ) (54)

     Acidobacteria (アシドバクテリア) (8)

     Bacteroidetes (バクテロイデス) (94)

     Fibrobacteres (フィブロバクテレス) (2)

     Fusobacteria (フソバクテリア) (5)

     Verrucomicrobia (ヴェルコミクロビア) (4)

     Gemmatimonadetes (ゲマティモナス) (1)

     Planctomycetes (プランクトミセス) (7)

     Elusimicrobia (エルシミクロビア) (2)

     Synergistetes (シネルギステス) (5)

     Cyanobacteria (シアノバクテリア) (73)

       Synechocystis (シネコシスティス) (6)

       Synechococcus (シネココッカス) (13)

       Thermosynechococcus (1)

       Microcystis (1)

       Cyanothece (6)

       Acaryochloris (1)

       Cyanobium (1)

       Cyanobacterium (2)

       Dactylococcopsis (1)

       Halothece (1)

       Gloeocapsa (1)

       Chamaesiphon (1)

       Unclassified Chroococcales (1)

       Gloeobacter (1)

       Nostoc (ノストック) (7)

       Trichormus (1)

       Cylindrospermum (1)

       Calothrix (2)

       Rivularia (1)

       Prochlorococcus (プロクロロコッカス) (12)

       Trichodesmium (1)

       Leptolyngbya (1)

       Geitlerinema (1)

       Oscillatoria (2)

       Pseudanabaena (1)

       Crinalium (1)

       Microcoleus (1)

       Arthrospira (1)

       Chroococcidiopsis (1)

       Pleurocapsa (1)

       Stanieria (1)

     Green sulfur bacteria (緑色硫黄細菌) (13)

     Green nonsulfur bacteria (緑色非硫黄細菌) (18)

     Deinococcus-Thermus (デイノコックス・テルムス) (20)

     Hyperthermophilic bacteria (超好熱細菌) (41)

     Unclassified (3)

   Archaea (古細菌) (153)