 Eukaryotes (真核生物) (190)
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 Prokaryotes (原核生物) (2477)
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Bacteria (真正細菌) (2324)
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Gammaproteobacteria (ガンマプロテオバクテリア) (498)
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Escherichia (エシェリキア, 大腸菌) (61)
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Salmonella (サルモネラ) (30)
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Yersinia (エルシニア) (19)
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Shigella (シゲラ, 赤痢菌) (9)
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Pectobacterium (ペクトバクテリウム) (5)
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Erwinia (エルウィニア) (7)
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Photorhabdus (フォトラブダス, 線虫共生菌) (2)
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Buchnera (ブフネラ, アブラムシ共生菌) (13)
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Wigglesworthia (ウィグルスウォーチア, ツェツェバエ共生菌) (2)
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Sodalis (ソダリス, ツェツェバエ共生菌) (1)
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Enterobacter (エンテロバクター) (10)
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Cronobacter (クロノバクター) (4)
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Klebsiella (クレブシェラ) (9)
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Citrobacter (シトロバクター) (2)
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Serratia (セラチア) (7)
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Proteus (プロテウス) (1)
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Edwardsiella (エドワージエラ) (4)
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Blochmannia (4)
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Hamiltonella (1)
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Dickeya (4)
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Xenorhabdus (2)
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Pantoea (6)
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Riesia (1)
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Rahnella (3)
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 rah Rahnella sp. Y9602
raq Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071
raa Rahnella aquatilis HX2
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Moranella (2)
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Providencia (1)
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Morganella (1)
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Raoultella (1)
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Other Enterobacteria (3)
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Haemophilus (ヘモフィルス) (12)
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Histophilus (2)
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Pasteurella (パスツレラ) (4)
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Mannheimia (マンヘミア) (4)
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Actinobacillus (アクチノバチルス) (5)
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Aggregatibacter (4)
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Gallibacterium (1)
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Bibersteinia (1)
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Xylella (キシレラ, 植物病原菌) (5)
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Xanthomonas (キサントモナス, 植物病原菌) (14)
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Stenotrophomonas (ステノトロホモナス) (4)
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Pseudoxanthomonas (2)
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Frateuria (1)
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Rhodanobacter (1)
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Vibrio (ビブリオ, コレラ菌, 腸炎ビブリオ菌) (18)
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Aliivibrio (3)
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Photobacterium (フォトバクテリウム) (1)
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Listonella (1)
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Pseudomonas (シュードモナス, 緑膿菌) (40)
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Cellvibrio (セルビブリオ) (1)
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Azotobacter (アゾトバクター) (3)
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Psychrobacter (サイクロバクター) (3)
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Acinetobacter (アシネトバクター) (15)
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Moraxella (1)
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Shewanella (シュワネラ) (24)
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Idiomarina (1)
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Colwellia (1)
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Pseudoalteromonas (3)
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Saccharophagus (1)
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Marinobacter (4)
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Alteromonas (アルテロモナス) (7)
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Glaciecola (3)
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Psychromonas (2)
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Teredinibacter (1)
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Ferrimonas (1)
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Coxiella (5)
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Legionella (レジオネラ, 在郷軍人病菌) (10)
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Methylococcus (1)
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Methylomonas (1)
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Methylomicrobium (1)
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Francisella (フランシセラ) (18)
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Thiomicrospira (1)
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Thioalkalimicrobium (1)
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Methylophaga (2)
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Cycloclasticus (1)
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Nitrosococcus (3)
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Allochromatium (1)
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Thiocystis (1)
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Thioflavicoccus (1)
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Alkalilimnicola (1)
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Halorhodospira (1)
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Thioalkalivibrio (3)
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Halothiobacillus (1)
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Hahella (1)
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Chromohalobacter (1)
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Halomonas (1)
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Portiera (5)
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Alcanivorax (2)
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Kangiella (1)
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Marinomonas (3)
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Thalassolituus (1)
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Aeromonas (3)
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Tolumonas (1)
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Oceanimonas (1)
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Dichelobacter (1)
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Acidithiobacillus (4)
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Baumannia (1)
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Carsonella (カルソネラ) (6)
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Simiduia (1)
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Ruthia (1)
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Vesicomyosocius (1)
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Unclassified Gammaproteobacteria (1)
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Betaproteobacteria (ベータプロテオバクテリア) (145)
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Epsilonproteobacteria (イプシロンプロテオバクテリア) (90)
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Deltaproteobacteria (デルタプロテオバクテリア) (57)
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Alphaproteobacteria (アルファプロテオバクテリア) (238)
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Other proteobacteria (その他のプロテオバクテリア) (1)
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Chrysiogenetes (1)
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Firmicutes (グラム陽性菌) (523)
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Tenericutes (テネリキューテス) (71)
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Actinobacteria (アクチノバクテリア, 放線菌) (261)
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Chlamydiae (クラミジア) (89)
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Spirochaetes (スピロヘータ) (54)
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Acidobacteria (アシドバクテリア) (8)
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Bacteroidetes (バクテロイデス) (94)
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Fibrobacteres (フィブロバクテレス) (2)
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Fusobacteria (フソバクテリア) (5)
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Verrucomicrobia (ヴェルコミクロビア) (4)
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Gemmatimonadetes (ゲマティモナス) (1)
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Planctomycetes (プランクトミセス) (7)
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Elusimicrobia (エルシミクロビア) (2)
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Synergistetes (シネルギステス) (5)
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Cyanobacteria (シアノバクテリア) (73)
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Green sulfur bacteria (緑色硫黄細菌) (13)
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Green nonsulfur bacteria (緑色非硫黄細菌) (18)
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Deinococcus-Thermus (デイノコックス・テルムス) (20)
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Hyperthermophilic bacteria (超好熱細菌) (41)
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Unclassified (3)
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Archaea (古細菌) (153)
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KEGG 生物種