KEGG   ORTHOLOGY: K00804
Entry
K00804                      KO                                     
Symbol
GGPS1
Name
geranylgeranyl diphosphate synthase, type III [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00367  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, non-plant eukaryotes
Reaction
R01658  dimethylallyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate dimethylallyltranstransferase
R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
R02061  trans,trans-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase
Disease
H02798  Muscular dystrophy, congenital hearing loss, and ovarian insufficiency syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K00804  GGPS1; geranylgeranyl diphosphate synthase, type III
Other DBs
COG: COG0142
GO: 0004161 0004337 0004311
Genes
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SPAR: SPRG_06894
 » show all
Reference
PMID:7665600
  Authors
Jiang Y, Proteau P, Poulter D, Ferro-Novick S
  Title
BTS1 encodes a geranylgeranyl diphosphate synthase in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
J Biol Chem 270:21793-9 (1995)
DOI:10.1074/jbc.270.37.21793
  Sequence
[sce:YPL069C]
Reference
  Authors
Kainou T, Kawamura K, Tanaka K, Matsuda H, Kawamukai M
  Title
Identification of the GGPS1 genes encoding geranylgeranyl diphosphate synthases from mouse and human.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1437:333-40 (1999)
DOI:10.1016/S1388-1981(99)00028-1
  Sequence
[hsa:9453]
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9

KEGG   ORTHOLOGY: K13787
Entry
K13787                      KO                                     
Symbol
idsA
Name
geranylgeranyl diphosphate synthase, type I [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00365  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, archaea
M00921  Cyclooctatin biosynthesis, dimethylallyl-PP + isopentenyl-PP => cyclooctatin
Reaction
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R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
R02061  trans,trans-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Other DBs
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GO: 0004161 0004337 0004311
Genes
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Reference
PMID:8182085
  Authors
Ohnuma S, Suzuki M, Nishino T
  Title
Archaebacterial ether-linked lipid biosynthetic gene. Expression cloning, sequencing, and characterization of geranylgeranyl-diphosphate synthase.
  Journal
J Biol Chem 269:14792-7 (1994)
  Sequence
[sai:Saci_0092]
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9

KEGG   ORTHOLOGY: K13789
Entry
K13789                      KO                                     
Symbol
GGPS
Name
geranylgeranyl diphosphate synthase, type II [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
Reaction
R01658  dimethylallyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate dimethylallyltranstransferase
R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
R02061  trans,trans-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Other DBs
COG: COG0142
GO: 0004161 0004337 0004311
Genes
ATH: AT1G49530(GGPS6) AT2G18620 AT2G18640(GGPS4) AT2G23800(GGPS2) AT3G14510 AT3G14530 AT3G14550(GGPS3) AT3G20160 AT3G29430 AT3G32040 AT4G36810(GGPS1) AT4G38460(GGR)
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