KEGG   ORTHOLOGY: K01571
Entry
K01571                      KO                                     

Name
oadA
Definition
oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha [EC:7.2.4.2]
Pathway
ko00620  Pyruvate metabolism
ko01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00620 Pyruvate metabolism
    K01571  oadA; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K01571  oadA; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha
Enzymes [BR:ko01000]
 7. Translocases
  7.2  Catalysing the translocation of inorganic cations
   7.2.4  Linked to decarboxylation
    7.2.4.2  oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding)
     K01571  oadA; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Primary active transporters
   K01571  oadA; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha
Other DBs
RN: R12212
COG: COG3632
GO: 0008948
TC: 3.B.1.1.1 3.B.1.1.6
Genes
EFE: EFER_0029(oadA)
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SEE: SNSL254_A0060(oadA) SNSL254_A0831(oadA) SNSL254_A3615(oadA)
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SSE: Ssed_1321
SPL: Spea_1199
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PTN: PTRA_a0611(oadA)
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PTU: PTUN_a1101(oadA)
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AMAO: I634_05595
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AMAG: I533_05185
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CATE: C2869_17155(oadA)
SALH: HMF8227_02230(oadA)
SALM: D0Y50_05040(oadA)
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CYY: CPC19_09080(oadA)
HCH: HCH_05202(oadA1)
HAHE: ENC22_07040(oadA)
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HEL: HELO_3735(oadA)
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HBE: BEI_3146(oadA)
HAF: C8233_13295(oadA)
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NCU: F0U83_02970(oadA)
NIK: F5I99_14910(oadA)
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TAU: Tola_0401
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BPET: B1917_2940
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STX: MGAS1882_0887(oadA.1) MGAS1882_0902(oadA.2)
SMU: SMU_1023(pycB)
SMC: SmuNN2025_1000(pycB)
SMJ: SMULJ23_1009(pycB)
SMUA: SMUFR_0892(oadA)
SEQ: SZO_09720
SEZO: SeseC_01300(pycB)
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SEU: SEQ_1197
SUB: SUB1584
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SDC: SDSE_1011(oadA) SDSE_1028
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THX: Thet_1320
TIT: Thit_1131
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TOC: Toce_1193
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TSH: Tsac_1885
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VPR: Vpar_0396
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AIN: Acin_0943(oadA)
ERH: ERH_0755(oadA)
MTHN: 4412656_00709(cfiA)
CGV: CGLAU_03210(cfiA)
ROP: ROP_29690
BSD: BLASA_1293(xccA)
RXY: Rxyl_1571
ELE: Elen_2542
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AEQ: AEQU_0607
CBAC: JI75_08470
GVI: gll0879
GLJ: GKIL_2432(pycB)
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TPW: TPANIC_0056(oadA)
TPP: TPASS_0056(oadA)
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TPH: TPChic_0056(oadA)
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TPC: TPECDC2_0056(oadA)
TPG: TPEGAU_0056(oadA)
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TPL: TPCCA_0056(oadA)
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TPHG: FUT81_06570(oadA)
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FNU: FN1376
LBA: Lebu_2280
TAI: Taci_1435
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PDI: BDI_1670
TMA: TM0128
TMW: THMA_0124
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TMX: THMC_0124
TPT: Tpet_0796
TRQ: TRQ2_0819
TNA: CTN_0561
TNP: Tnap_0758
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TME: Tmel_1864
TAF: THA_159
THER: Y592_00870
FNO: Fnod_1755
PMO: Pmob_1439
MARN: LN42_05285
DTN: DTL3_1286(pycB)
KOL: Kole_1395
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Reference
PMID:1331067
  Authors
Woehlke G, Wifling K, Dimroth P
  Title
Sequence of the sodium ion pump oxaloacetate decarboxylase from Salmonella typhimurium.
  Journal
J Biol Chem 267:22798-803 (1992)
  Sequence

KEGG   ORTHOLOGY: K20509
Entry
K20509                      KO                                     

Name
madB, oadB, gcdB, mmdB
Definition
carboxybiotin decarboxylase [EC:7.2.4.1]
Pathway
ko00362  Benzoate degradation
ko00620  Pyruvate metabolism
ko00650  Butanoate metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00620 Pyruvate metabolism
    K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
   00650 Butanoate metabolism
    K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
  09111 Xenobiotics biodegradation and metabolism
   00362 Benzoate degradation
    K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
Enzymes [BR:ko01000]
 7. Translocases
  7.2  Catalysing the translocation of inorganic cations
   7.2.4  Linked to decarboxylation
    7.2.4.1  carboxybiotin decarboxylase
     K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Primary active transporters
   K20509  madB, oadB, gcdB, mmdB; carboxybiotin decarboxylase
Other DBs
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TC: 3.B.1.1
Genes
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RPB: RPB_3300
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SEZO: SeseC_01292(oadB)
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PPAC: PAP_07985
SMR: Smar_1504
AG: AAC45399(madB) CAA05140(mmdB)
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Reference
PMID:9128730
  Authors
Berg M, Hilbi H, Dimroth P
  Title
Sequence of a gene cluster from Malonomonas rubra encoding components of the malonate decarboxylase Na+ pump and evidence for their function.
  Journal
Eur J Biochem 245:103-15 (1997)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.00103.x
  Sequence
Reference
PMID:1331067
  Authors
Woehlke G, Wifling K, Dimroth P
  Title
Sequence of the sodium ion pump oxaloacetate decarboxylase from Salmonella typhimurium.
  Journal
J Biol Chem 267:22798-803 (1992)
  Sequence
[stm:STM3351]
Reference
PMID:9428714
  Authors
Bott M, Pfister K, Burda P, Kalbermatter O, Woehlke G, Dimroth P
  Title
Methylmalonyl-CoA decarboxylase from Propionigenium modestum--cloning and sequencing of the structural genes and purification of the enzyme complex.
  Journal
Eur J Biochem 250:590-9 (1997)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.0590a.x
  Sequence
Reference
  Authors
Braune A, Bendrat K, Rospert S, Buckel W
  Title
The sodium ion translocating glutaconyl-CoA decarboxylase from Acidaminococcus fermentans: cloning and function of the genes forming a second operon.
  Journal
Mol Microbiol 31:473-87 (1999)
DOI:10.1046/j.1365-2958.1999.01189.x
  Sequence

KEGG   ORTHOLOGY: K01573
Entry
K01573                      KO                                     

Name
oadG
Definition
oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit gamma
Pathway
ko00620  Pyruvate metabolism
ko01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00620 Pyruvate metabolism
    K01573  oadG; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit gamma
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K01573  oadG; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit gamma
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Primary active transporters
   K01573  oadG; oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit gamma
Other DBs
RN: R12212
COG: COG3630
TC: 3.B.1.1.1 3.B.1.1.6
Genes
EFE: EFER_0030(oadG)
STY: STY0065(oadG) STY3533(oadG)
STT: t0058(oadG) t3268(oadG)
SEX: STBHUCCB_34560 STBHUCCB_670
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PAA: Paes_0915
 » show all
Reference
PMID:1331067
  Authors
Woehlke G, Wifling K, Dimroth P
  Title
Sequence of the sodium ion pump oxaloacetate decarboxylase from Salmonella typhimurium.
  Journal
J Biol Chem 267:22798-803 (1992)
  Sequence
[stm:STM3353]

KEGG   ENZYME: 7.2.4.2
Entry
EC 7.2.4.2                  Enzyme                                 

Name
oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding);
oxaloacetate beta-decarboxylase (ambiguous);
oxalacetic acid decarboxylase (ambiguous);
oxalate beta-decarboxylase (ambiguous);
oxaloacetate carboxy-lyase (ambiguous)
Class
Translocases;
Catalysing the translocation of inorganic cations;
Linked to decarboxylation
Sysname
oxaloacetate carboxy-lyase (pyruvate-forming; Na+-extruding)
Reaction(IUBMB)
oxaloacetate + 2 Na+[side 1] = pyruvate + CO2 + 2 Na+[side 2] [RN:R12212]
Reaction(KEGG)
R12212
Substrate
oxaloacetate [CPD:C00036];
Na+[side 1]
Product
pyruvate [CPD:C00022];
CO2 [CPD:C00011];
Na+[side 2]
Comment
The enzyme from the bacterium Klebsiella aerogenes is a biotinyl protein and also decarboxylates glutaconyl-CoA and methylmalonyl-CoA. The process is accompanied by the extrusion of two sodium ions from cells. Some animal enzymes require Mn2+. Differs from EC 4.1.1.112 (oxaloacetate decarboxylase) for which there is no evidence for involvement in Na+ transport.
History
EC 7.2.4.2 created 1961 as EC 4.1.1.3, modified 1986, modified 2000, transferred 2018 to EC 7.2.4.2
Pathway
ec00620  Pyruvate metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K01571  oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha
Genes
EFE: EFER_0029(oadA)
STY: STY0064(oadA) STY3532(oadA)
STT: t0057(oadA) t3267(oadA)
SEX: STBHUCCB_34550 STBHUCCB_660
SENT: TY21A_00295 TY21A_16570
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SEO: STM14_0065 STM14_4044(oadA)
SEV: STMMW_00561 STMMW_08191 STMMW_33511
SEY: SL1344_0056 SL1344_0744(dcoA) SL1344_3324(oadA2)
SEM: STMDT12_C00560 STMDT12_C08200 STMDT12_C34100
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SEK: SSPA0052(oadA) SSPA3006
SEI: SPC_0059(oadA) SPC_0763(oadA) SPC_3422(oadA)
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KOL: Kole_1395
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Reference
1  [PMID:7016536]
  Authors
Dimroth P.
  Title
Characterization of a membrane-bound biotin-containing enzyme: oxaloacetate decarboxylase from Klebsiella aerogenes.
  Journal
Eur J Biochem 115:353-8 (1981)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1981.tb05245.x
Reference
2  [PMID:7037395]
  Authors
Dimroth P.
  Title
The role of biotin and sodium in the decarboxylation of oxaloacetate by the membrane-bound oxaloacetate decarboxylase from Klebsiella aerogenes.
  Journal
Eur J Biochem 121:435-41 (1982)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1982.tb05806.x
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 7.2.4.2
IUBMB Enzyme Nomenclature: 7.2.4.2
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 7.2.4.2
BRENDA, the Enzyme Database: 7.2.4.2
CAS: 9024-98-0

KEGG   REACTION: R12212
Entry
R12212                      Reaction                               

Name
oxaloacetate carboxy-lyase (pyruvate-forming; Na+-extruding)
Definition
Oxaloacetate + 2 Sodium cation <=> Pyruvate + CO2 + 2 Sodium cation
Equation
Reaction class
RC00040  C00022_C00036
Enzyme
Pathway
rn00620  Pyruvate metabolism
rn01100  Metabolic pathways
Orthology
K01571  oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit alpha [EC:7.2.4.2]
K01573  oxaloacetate decarboxylase (Na+ extruding) subunit gamma
K20509  carboxybiotin decarboxylase [EC:7.2.4.1]

DBGET integrated database retrieval system