KEGG   ORTHOLOGY: K01979
Entry
K01979            RNA       KO                                     

Name
SSUrRNA
Definition
small subunit ribosomal RNA
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03010  Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03010 Ribosome
    K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03011 Ribosome
    K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
Ribosome [BR:ko03011]
 Ribosomal RNAs
  Eukaryotes
   K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Ribosomal RNA
  Small subunit rRNA
   K01979  SSUrRNA; small subunit ribosomal RNA
Genes
HSA: 4549(RNR1)
PTR: 12S_rRNA
PPS: s-rRNA
GGO: s-rRNA
PON: s-rRNA
NLE: 12S_rRNA
MCC: s-rRNA
MCF: SSU_rRNA
CSAB: s-rRNA
RRO: s-rRNA
CJC: 12S_rRNA
SBQ: s-rRNA
MMU: 17724(mt-Rnr1)
RNO: 100861533(Rn18s) 170602(Rnr1)
CGE: s-rRNA
NGI: s-rRNA
HGL: s-rRNA
OCU: 100328976(RN18S) 12S_rRNA
CFA: s-rRNA
AML: s-rRNA
UMR: 12S_rRNA
FCA: s-rRNA
BTA: s-rRNA
BOM: 12S_rRNA
CHX: s-rRNA
OAS: 12S_rRNA
SSC: 100861538(RN18S) 12S_rRNA
CFR: s-rRNA
LVE: s-rRNA
ECB: 100861557(RN18S) s-rRNA
MYB: 12S_rRNA
MYD: 12S_rRNA
PALE: s-rRNA
LAV: s-rRNA
MDO: 12S_rRNA
SHR: s-rRNA
OAA: 12S_rRNA
MGP: s-rRNA
CJO: 12S_rRNA
APLA: s-rRNA
TGU: s-rRNA
FAB: s-rRNA
PHI: s-rRNA
FPG: 12S_rRNA
FCH: 12S_rRNA
CLV: s-rRNA
ASN: 12S_rRNA
AMJ: 12S_rRNA
PSS: s-rRNA
CMY: s-rRNA
ACS: s-rRNA
PBI: s-rRNA
GJA: 26044415(APQ53_gr02)
XLA: 12S_rRNA
XTR: s-rRNA
DRE: 140505(mt-rnr1)
TRU: 12S_rRNA
TNG: 12S_rRNA
MZE: 26037630(APK84_gr02)
OLA: s-rRNA
XMA: s-rRNA
SASA: 12S_rRNA
LCM: s-rRNA
CMK: s-rRNA
BFO: s-rRNA
SPU: s-rRNA
SKO: s-rRNA
DME: Dmel_CR34096(srRNA) Dmel_CR41548(18SrRNA:CR41548) Dmel_CR45838(18SrRNA:CR45838) Dmel_CR45841(18SrRNA:CR45841)
DSE: s-rRNA
DSI: s-rRNA
DYA: s-rRNA
DPO: Dpse_GA30004(Dpse_18SrRNA:GA30004)
DMO: Dmoj_GI25475(Dmoj_18SrRNA:GI25475)
MDE: 12S_rRNA
AGA: s-rRNA
CQU: s-rRNA
SOC: s-rRNA
TCA: s-rRNA
BMOR: s-rRNA
DPL: 12S_rRNA
PXY: 12S_rRNA
API: s-rRNA
DPX: SSU_rRNA
CEL: CELE_F31C3.7(rrn-1.1) CELE_F31C3.8(rrn-1.2) s-rRNA
CBR: s-rRNA
BMY: SSU_rRNA
LOA: s-rRNA
TSP: s-rRNA
SMM: s-rRNA
ADF: s-rRNA
HMG: s-rRNA
TAD: TradoM_r03(rns)
AQU: s-rRNA
ATH: AT3G41768 ArthCr086(rrn16S) ArthCr088 ArthMr003(rrn18)
EUS: ASK66_gr001(rrn16S) ASK66_gr008(rrn16S)
BNA: 11542036(rrn16S) 11542053(rrn16S) 4237952(rrn18)
CIT: 4271104(CisiCr008) 4271177(CisiCr001)
TCC: 9978167(rrn16) 9978195(rrn16)
GRA: 11538527(A6772_cr001) 11538601(A6772_cr008) 27429572(rrn18) 27429620(rrn18)
EGR: 9829709(rrn16) 9845765(EucgrC_r008)
GMX: 15308557(rrnS) 3989345(rrn16) 3989374(rrn16)
PVU: PhvuCr105(rrn16) PhvuCr121(rrn16)
VAR: 15382720(rrn16)
CAM: 6797524(CiarC_r001)
FVE: 10251570(rrn16) 10251599(rrn16)
PMUM: 18681166(CP95_r008) 18681169(CP95_r001)
MDM: 13630232(18rrn)
CSV: 11123874(rrnS) 11123911(rrnS) 3429365(16SrRNA) 3429366(16SrRNA)
RCU: 10221391(rrn18) 11542369(rrn16) 11542398(rrn16)
JCU: 7636391(rrn16) 7636408(rrn16)
VVI: 4025010(ViviCr008) 4025065(ViviCr001) 7498754(18Srrn)
SLY: 3950430(LyesC2r008) 3950467(LyesC2r001)
SOT: 4099937(SotuCr001) 4099944(SotuCr008)
INI: 29200395(rrnS) 29200436(rrn16) 29200443(rrn16)
SIND: 11452464(rrn16) 11452494(rrn16)
BVG: 809573(rrn18)
NNU: 20964221(rrn16) 20964238(rrn16) 28482677(rRNA18) 28482717(rRNA18)
OSA: 3131364(OrsajCr113) 3131380(OrsajCr120) 6450167(rrn18)
OBR: BBW32_gr001(rrn16) BBW32_gr008(rrn16)
BDI: 6439810(BrdiC_r001) 6439890(BrdiC_r008)
ZMA: 1466350(ZemaCr113) 1466357(ZemaCr120)
SITA: 19526838(W841_r001) 19526866(W841_r008)
PDA: 18S_rRNA 8890561(rrn16) 8890612(rrn16)
EGU: 12079438(rrn16) 12079492(rrn16)
ATR: 2546492(AmtrCr008) 2546558(rrn16S)
SMO: SemoP_r001(rrn16) SemoP_r008(rrn16)
CRE: ChreCr001(rrnS) ChreCr010(rrnS)
CSL: CospCoM_r02(rrnS) CospP_r003(rrs)
CVR: ChvaP_r003(rrnS) OJ20_r01(rrnS)
APRO: ChprMr003(rns)
OTA: OstapCr01(rrs) OstapCr06(rrs) OstapMr01(rrs) OstapMr02(rrs) OstapMr05(rrs) OstapMr06(rrs)
MIS: MicpuN_chl59(rrs3) MicpuN_chl6(rrs1) MicpuN_mit43(rrs_2.1) MicpuN_mit44(rrs_2.2) MicpuN_mit8(rrs_1.1) MicpuN_mit9(rrs_1.2)
GSL: JL72_r001(rrn16) JL72_r006(rrn16) JL72_r02(rrnS)
CCP: CHC_195(rrs) ChcroMr28(rns)
SCE: Q0020(15S_RRNA) RDN18-1 RDN18-2
KLA: KllafMr02(srRNA)
CGR: CAGL0L13398r CaglfMr14(15S_rRNA)
KAF: KAFR_RDN18-1(RDN18-1)
DHA: SSU_rRNA(SSU)
CAL: CAALFM_CR08770WA(RDN18) CaalfMr17(rns)
YLI: YalifMr31
PAN: PoanfMr56(rns)
ANI: ANID_20048(rns)
ANG: Asnifr01
PNO: SNOGr02
DDI: DidioMr43(rnsA)
PCB: BN827_A580(rrs) MAL9_18S_rRNA(MAL9_18S:rRNA) chab5_18s_rRNA(chab5_18s:rRNA)
TPV: TP05_0045
TET: TepyoMr49(rns_b)
AAF: AuanCr001(rrn16S)
PSOJ: PhsooMr02
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Reference
  Authors
Shen Z, Zheng J, Chen B, Peng G, Zhang T, Gong S, Zhu Y, Zhang C, Li R, Yang L, Zhou J, Cai T, Jin L, Lu J, Guan MX
  Title
Frequency and spectrum of mitochondrial 12S rRNA variants in 440 Han Chinese hearing impaired pediatric subjects from two otology clinics.
  Journal
J Transl Med 9:4 (2011)
DOI:10.1186/1479-5876-9-4
  Sequence
[hsa:4549]
Reference
  Authors
Venema J, Tollervey D
  Title
Ribosome synthesis in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Annu Rev Genet 33:261-311 (1999)
DOI:10.1146/annurev.genet.33.1.261
  Sequence

DBGET integrated database retrieval system