KEGG   ORTHOLOGY: K03016
Entry
K03016                      KO                                     

Name
RPB8, POLR2H
Definition
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Pathway
ko03020  RNA polymerase
ko04623  Cytosolic DNA-sensing pathway
ko05016  Huntington disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04623 Cytosolic DNA-sensing pathway
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Genes
HSA: 5437(POLR2H)
PTR: 471027(POLR2H)
PPS: 100980213(POLR2H)
PON: 100452428(POLR2H)
NLE: 100582655(POLR2H)
MCC: 100429040(POLR2H)
MCF: 102140336(POLR2H)
CSAB: 103221131(POLR2H)
RRO: 104664622(POLR2H)
RBB: 108525206(POLR2H)
CJC: 100394075(POLR2H)
SBQ: 101046822(POLR2H)
MMU: 245841(Polr2h)
MCAL: 110311143(Polr2h)
MPAH: 110329787(Polr2h)
RNO: 498109(Polr2h)
MUN: 110549397(Polr2h)
CGE: 100769706(Polr2h)
NGI: 103732659(Polr2h)
HGL: 101706663(Polr2h)
CCAN: 109694099(Polr2h)
OCU: 100347834(POLR2H)
TUP: 106736235(POLR2H)
CFA: 478656(POLR2H)
VVP: 112926268(POLR2H)
AML: 100470168(POLR2H)
UMR: 103676079(POLR2H)
UAH: 113254312(POLR2H)
ORO: 101373084(POLR2H)
ELK: 111148606
FCA: 101084389(POLR2H)
PTG: 102968963(POLR2H)
PPAD: 109275232(POLR2H)
AJU: 106983811(POLR2H)
BTA: 505599(POLR2H)
BOM: 102275957(POLR2H)
BIU: 109557349(POLR2H)
BBUB: 102407019(POLR2H)
CHX: 102182068(POLR2H)
OAS: 101119867(POLR2H)
SSC: 100628241(POLR2H)
CFR: 102521897(POLR2H)
CDK: 105085875(POLR2H)
BACU: 103001378(POLR2H)
LVE: 103088960(POLR2H)
OOR: 101275030(POLR2H)
DLE: 111173227(POLR2H)
PCAD: 102977584(POLR2H)
ECB: 100059115(POLR2H)
EPZ: 103554737(POLR2H)
EAI: 106834516(POLR2H)
MYB: 102245238(POLR2H)
MYD: 102769153(POLR2H)
MNA: 107543117(POLR2H)
HAI: 109396799(POLR2H)
DRO: 112305134(POLR2H)
PALE: 102878376(POLR2H)
RAY: 107504910(POLR2H)
MJV: 108395273(POLR2H) 108400990
LAV: 100676232(POLR2H)
TMU: 101356817
MDO: 100013916(POLR2H)
SHR: 100933932(POLR2H)
PCW: 110221304(POLR2H)
OAA: 100089660(POLR2H)
GGA: 424954(POLR2H)
MGP: 100545178(POLR2H)
CJO: 107318259(POLR2H)
NMEL: 110397886(POLR2H)
LSR: 110478152(POLR2H)
SCAN: 103815332(POLR2H)
GFR: 102031433(POLR2H)
FAB: 101806753(POLR2H)
PHI: 102109122(POLR2H)
PMAJ: 107209007(POLR2H)
CCAE: 111933392(POLR2H)
CCW: 104687986(POLR2H)
ETL: 114060801(POLR2H)
FPG: 101913371(POLR2H)
FCH: 102060193(POLR2H)
CLV: 102089188(POLR2H)
EGZ: 104122290(POLR2H)
NNI: 104015624(POLR2H)
ACUN: 113483578(POLR2H)
PADL: 103925628(POLR2H)
AAM: 106482255 106494211(POLR2H)
ASN: 102380713(POLR2H)
AMJ: 102574727(POLR2H)
PSS: 102459209(POLR2H)
CMY: 102935557(POLR2H)
CPIC: 101948266(POLR2H)
ACS: 100555951(polr2h)
PVT: 110089822(POLR2H)
PBI: 103062347(POLR2H)
PMUR: 107298410(POLR2H)
TSR: 106556135(POLR2H)
PMUA: 114598049(POLR2H)
GJA: 107123682(POLR2H)
XLA: 108718026(polr2h.S) 443896(polr2h.L)
XTR: 548867(polr2h)
NPR: 108804657(POLR2H)
DRE: 550263(polr2h)
SRX: 107731657(polr2h) 107732651
SANH: 107668490 107668663
SGH: 107569681 107570459
CCAR: 109080980(polr2h)
IPU: 100528377(polr2h)
PHYP: 113536669(polr2h)
AMEX: 103046918(polr2h)
EEE: 113585743(polr2h)
TRU: 101079851(polr2h)
TNG: GSTEN00022903G001
LCO: 104927504(polr2h)
NCC: 104961920(polr2h)
MZE: 101486540(polr2h)
ONL: 100711485(polr2h)
OLA: 101159426(polr2h)
XMA: 102229592(polr2h)
XCO: 114151213(polr2h)
PRET: 103463459(polr2h)
CVG: 107083666(polr2h)
NFU: 107392756(polr2h)
KMR: 108234305(polr2h)
ALIM: 106510851(polr2h)
AOCE: 111574902(polr2h)
CSEM: 103394099(polr2h)
POV: 109636641(polr2h)
LCF: 108881225(polr2h)
SDU: 111240292(polr2h)
SLAL: 111652428(polr2h)
HCQ: 109518943 109519125
BPEC: 110160197(polr2h)
MALB: 109958237(polr2h)
SASA: 100286712(polr2h)
OTW: 112253288(polr2h)
SALP: 111957308(polr2h)
ELS: 105026920(polr2h)
SFM: 108921679(polr2h)
PKI: 111853565(polr2h)
LCM: 102364801(POLR2H)
CMK: 103184435(polr2h)
RTP: 109936978(polr2h)
BFO: 118430028
CIN: 100178283
SPU: 591688
APLC: 110983881
SKO: 100370657
DME: Dmel_CG11246(Rpb8)
DER: 6543997
DSE: 6616497
DSI: Dsimw501_GD14989(Dsim_GD14989)
DYA: Dyak_GE19787 Dyak_GE23031
DAN: 6507791
DSR: 110177507
DPO: Dpse_GA10862
DPE: 6595763
DMN: 108152744
DWI: 6639203
DGR: Dgri_GH15097
DMO: Dmoj_GI13746
DAZ: 108614015
DNV: 108651571
DHE: 111600961
DVI: 6624180
MDE: 101895411
LCQ: 111687485
AGA: AgaP_AGAP012397
AAG: 5565447
AALB: 109426039
CQU: CpipJ_CPIJ005206 CpipJ_CPIJ018569
AME: 102655904
BIM: 105680630
BTER: 105665726
CCAL: 108631712
OBB: 114876500
SOC: 105200408 113003421
MPHA: 105835853
AEC: 105143874
ACEP: 105620560
PBAR: 105431087
VEM: 105566722
HST: 105185593
DQU: 106748084
CFO: 105252932
LHU: 105675987
PGC: 109859413
OBO: 105282978
PCF: 106787253
NVI: 100115406
CSOL: 105367095
MDL: 103578682
TCA: 658676
DPA: 109542690
ATD: 109597514
NVL: 108560253
BMOR: 101744611
BMAN: 114241662
DPL: KGM_203884
PMAC: 106713416
PRAP: 111002451
HAW: 110382505
TNL: 113508233 113508652
PXY: 105391936 105394737
API: 100169136(Polr2h)
DNX: 107162624
AGS: 114128922
RMD: 113554784
BTAB: 109034906 109038719 109043418
CLEC: 106662971
PHU: Phum_PHUM180020
ZNE: 110827651
FCD: 110843124
DPX: DAPPUDRAFT_191687
PVM: 113817375
ISC: IscW_ISCW021032
TUT: 107359990 107362841
DPTE: 113791220
CSCU: 111621523
PTEP: 107447028
CEL: CELE_F26F4.11(rpb-8)
CBR: CBG18189(Cbr-rpb-8)
BMY: Bm1_26995
LOA: LOAG_00799
NAI: NECAME_03482
TSP: Tsp_00326
HRO: HELRODRAFT_165578
LGI: LOTGIDRAFT_109608
PCAN: 112567979
CRG: 105330854
MYI: 110464273
OBI: 106867543
LAK: 106179848
SMM: Smp_006850
SHX: MS3_01594
OVI: T265_14648
EGL: EGR_04064
NVE: 5511656
EPA: 110237977
ADF: 107341034
AMIL: 114963011
PDAM: 113668806
SPIS: 111331653
DGT: 114527138
HMG: 100203045
TAD: TRIADDRAFT_56007
AQU: 100631571 109585383 109585384 109591006
ATH: AT1G54250(NRPB8A) AT3G59600(NRPB8B)
ALY: 9312582 9327862
CRB: 17885653 17899044
CSAT: 104699958 104742947 104749380 104749404 104758772 104778365
EUS: EUTSA_v10006298mg EUTSA_v10029046mg
BRP: 103841806
BNA: 106368445 106368446 111208524
BOE: 106309990
RSZ: 108805380
THJ: 104799640 104803962
CPAP: 110821511 110821838
CIT: 102613961 102625354
CIC: CICLE_v10022723mg
TCC: 18586467 18594588
GRA: 105766229 105775720
GHI: 107902952 107932634 107941303 107948496
GAB: 108449972 108461382
DZI: 111276035 111298896
EGR: 104429973 104445264
GMX: 100499860 100780342 100806909 100816388
GSJ: 114387090 114391771 114421967 114425796
PVU: PHAVU_007G263200g PHAVU_009G069200g PHAVU_010G060300g
VRA: 106761461 106769948
VAR: 108324311 108330888
VUN: 114162669 114189898
CCAJ: 109789332 109804461
MTR: MTR_1g056890 MTR_4g133090 MTR_6g090500
CAM: 101490143 101512443
LJA: Lj0g3v0150319.1(Lj0g3v0150319.1) Lj0g3v0150319.2(Lj0g3v0150319.2) Lj0g3v0150319.3(Lj0g3v0150319.3) Lj0g3v0270299.1(Lj0g3v0270299.1) Lj0g3v0270299.2(Lj0g3v0270299.2) Lj5g3v0975900.1(Lj5g3v0975900.1) Lj5g3v0975900.2(Lj5g3v0975900.2)
ADU: 107463112 107475996 107476744
AIP: 107614074 107626200 107628963 107630078
LANG: 109325967 109335071 109341808 109352163
FVE: 101300927 101314988
RCN: 112166185 112174403 112182612 112187804
PPER: 18772687 18778776
PMUM: 103326838 103331623 103343840
PAVI: 110744659 110748285 110755249
MDM: 103401690 103401760 103407488 103437616
PXB: 103934091 103940532 103955918 103959268
ZJU: 107406585 107423562
CSV: 101207932 101220087 116401612
CMO: 103494404 103494598
MCHA: 111008140 111015176
CMAX: 111470753 111481850 111483257
CMOS: 111435865 111439203 111447307
CPEP: 111799670 111809783
RCU: 8263166
JCU: 105628362 105628367 105628371 105628439 105628469
HBR: 110641311 110649848 110650743
MESC: 110604267 110613405 110626583
POP: 18104532 18104533 7482406
PEU: 105111328 105112130 105112131 105134658
JRE: 108980886 109013258
QSU: 112000193 112012711 112023590
VVI: 100249225 100254322
SLY: 101254169 101256121
SPEN: 107009598 107012482
SOT: 102590066 102594913
CANN: 107868305
NTA: 107771156 107786989 107796898 107796905 107801754 107815072 107832253
NSY: 104211897 104217832 104235999 104236000
NTO: 104085507 104085894 104108784
NAU: 109211727 109245039 109245042
INI: 109153069 109155590 109182040
SIND: 105172291 105178672
OEU: 111378734 111383700 111384224 111384228
HAN: 110884502 110884569 110898729
LSV: 111898203 111903462
CCAV: 112518156 112519441
DCR: 108198732 108215206 108217706 108219510
BVG: 104889864
SOE: 110790464 110799489
CQI: 110695905 110736101
NNU: 104605253
PSOM: 113283245 113356296
OSA: 4334766 4341946
DOSA: Os03t0845700-01(Os03g0845700) Os06t0697400-01(Os06g0697400)
OBR: 102702107 102719924
BDI: 100837358 100842614
ATS: 109737850 109783265
SBI: 8060881 8065134 8080154
ZMA: 100281008(pco144871)
SITA: 101771355 111258493
PDA: 103699115
EGU: 105060651
MUS: 103998751
DCT: 114578826
PEQ: 110027243
AOF: 109832463
ATR: 18448978
SMO: SELMODRAFT_104121 SELMODRAFT_105067 SELMODRAFT_125701
PPP: 112295370
CRE: CHLREDRAFT_126483(RPB8)
VCN: VOLCADRAFT_82285
MNG: MNEG_7835
CSL: COCSUDRAFT_44692
CVR: CHLNCDRAFT_33921
APRO: F751_6084
OLU: OSTLU_12967
OTA: OT_ostta10g01270
BPG: Bathy11g01180
MIS: MICPUN_98777
CME: CYME_CMT451C
GSL: Gasu_11020
SCE: YOR224C(RPB8)
AGO: AGOS_ACR111C
ERC: Ecym_8331
KLA: KLLA0_D07139g
KMX: KLMA_20792(RPB8)
LTH: KLTH0D10538g
VPO: Kpol_1059p24
ZRO: ZYRO0F06644g
CGR: CAGL0J04070g
NCS: NCAS_0B01380(NCAS0B01380)
NDI: NDAI_0E01380(NDAI0E01380)
TPF: TPHA_0F03280(TPHA0F03280)
TBL: TBLA_0J00350(TBLA0J00350)
TDL: TDEL_0A05920(TDEL0A05920)
KAF: KAFR_0G01860(KAFR0G01860)
ZMK: HG535_0F05360
PPA: PAS_chr2-2_0309
DHA: DEHA2G22902g
PIC: PICST_87046(RPB8)
PGU: PGUG_01872
SPAA: SPAPADRAFT_59580
LEL: LELG_03260
CAL: CAALFM_CR04780WA(RPB8)
CTP: CTRG_00528
COT: CORT_0D04130
CDU: CD36_30150
CTEN: CANTEDRAFT_114705
YLI: YALI0F09383g
CLU: CLUG_03164
CLUS: A9F13_12g02024
CAUR: CJI97_002164
SLB: AWJ20_18(RPB8)
PKZ: C5L36_0E01440
BNN: FOA43_004595(RPB8)
NCR: NCU08030
SMP: SMAC_03803
PAN: PODANSg7324
TTT: THITE_2128764
MTM: MYCTH_2298731
CTHR: CTHT_0033930
MGR: MGG_07080
TMN: UCRPA7_550
SSCK: SPSK_08032
FGR: FGSG_04273
FPU: FPSE_10470
FVR: FVEG_10463
FOX: FOXG_11352
NHE: NECHADRAFT_81387
TRE: TRIREDRAFT_104015
TRR: M419DRAFT_32497
MAJ: MAA_02710
CMT: CCM_00394
PLJ: VFPFJ_08900
VAL: VDBG_08235
VDA: VDAG_10430
CFJ: CFIO01_00507
SAPO: SAPIO_CDS0864
PFY: PFICI_05701
SSL: SS1G_08475
BFU: BCIN_12g02760(Bcrpb8)
MBE: MBM_06705
PSCO: LY89DRAFT_661535
GLZ: GLAREA_10650
ANI: AN0192.2
AFM: AFUA_5G11120
ACT: ACLA_014170
NFI: NFIA_076140
ANG: ANI_1_286014(An01g02200)
AFV: AFLA_132290
PCS: Pc21g06060
PDP: PDIP_60630
TMF: PMAA_033120
TRG: TRUGW13939_05539
CIM: CIMG_00666
CPW: CPC735_056030
PBL: PAAG_02337
PBN: PADG_05475
URE: UREG_00664
ABE: ARB_03020
TVE: TRV_04927
AJE: HCAG_00906
BGH: BDBG_01083
PNO: SNOG_08636
PTE: PTT_04001
BZE: COCCADRAFT_107606
BSC: COCSADRAFT_214409
BOR: COCMIDRAFT_31906
AALT: CC77DRAFT_941517
ZTR: MYCGRDRAFT_47713
PFJ: MYCFIDRAFT_37035
NPA: UCRNP2_8377
TML: GSTUM_00004676001
SPO: SPBC14C8.12(rpb8)
CNE: CNI02630
CNB: CNBH2490
CGI: CGB_H3630W
TMS: TREMEDRAFT_24691
TASA: A1Q1_03009
TVS: TRAVEDRAFT_159392
PCO: PHACADRAFT_152837
SHS: STEHIDRAFT_89655
HIR: HETIRDRAFT_413246
PSQ: PUNSTDRAFT_58431
ADL: AURDEDRAFT_110715
FME: FOMMEDRAFT_83492
GTR: GLOTRDRAFT_53405
LBC: LACBIDRAFT_291551
MRR: Moror_107
CCI: CC1G_03663
SCM: SCHCODRAFT_64989
ABP: AGABI1DRAFT117227(AGABI1DRAFT_117227)
ABV: AGABI2DRAFT197624(AGABI2DRAFT_197624)
CPUT: CONPUDRAFT_133976
SLA: SERLADRAFT_479872
WSE: WALSEDRAFT_48234
WIC: J056_002976
UMA: UMAG_04460
PFP: PFL1_05713
MGL: MGL_3267
MRT: MRET_2426
MSYM: MSY001_3084
PGR: PGTG_07968
MLR: MELLADRAFT_33205
ECU: ECU07_0840
EIN: Eint_070780
EHE: EHEL_070810
ERO: EROM_070790
MBR: MONBRDRAFT_30048
SRE: PTSG_01222
DDI: DDB_G0278039(rpb8)
DPP: DICPUDRAFT_30399
DFA: DFA_08762(rpb8)
EHI: EHI_038570(7.t00016)
EDI: EDI_259550
EIV: EIN_095490
ACAN: ACA1_365330
PFA: PF3D7_1213700
PFD: PFDG_01493
PFH: PFHG_02802
PYO: PY17X_1431700
PCB: PCHAS_143140(PC000459.03.0)
PBE: PBANKA_1429500
PKN: PKH_143100
PVX: PVX_123375
PCY: PCYB_144030
TAN: TA19535
TPV: TP01_0233
TOT: TOT_010000217
BEQ: BEWA_032210
BBO: BBOV_IV005100(23.m06188)
BMIC: BMR1_02g00620
CPV: cgd1_2260
CHO: Chro.10257
TGO: TGME49_233720(POLR2H)
TET: TTHERM_00475220 TTHERM_00549610
PTM: GSPATT00002070001
SMIN: v1.2.027601.t1(symbB.v1.2.027601.t1)
PTI: PHATRDRAFT_22597
FCY: FRACYDRAFT_268152
TPS: THAPSDRAFT_38815(Rpb8)
PIF: PITG_09712
PSOJ: PHYSODRAFT_355025
SPAR: SPRG_12350
EHX: EMIHUDRAFT_226295 EMIHUDRAFT_226344
GTT: GUITHDRAFT_62660
TBR: Tb11.02.5790
TBG: TbgDal_XI9040
TCR: 506933.80
LMA: LMJF_28_0810
LIF: LINJ_28_0870
LDO: LDBPK_280870
LMI: LMXM_28_0810
LBZ: LBRM_28_0850
LPAN: LPMP_280840
NGR: NAEGRDRAFT_71611
TVA: TVAG_186530
GLA: GL50803_0015144
 » show all
Reference
PMID:8524256
  Authors
McKune K, Moore PA, Hull MW, Woychik NA
  Title
Six human RNA polymerase subunits functionally substitute for their yeast counterparts.
  Journal
Mol Cell Biol 15:6895-900 (1995)
DOI:10.1128/mcb.15.12.6895
  Sequence
[hsa:5437]
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  Sequence
[hsa:5437]
Reference
  Authors
Engel C, Sainsbury S, Cheung AC, Kostrewa D, Cramer P
  Title
RNA polymerase I structure and transcription regulation.
  Journal
Nature 502:650-5 (2013)
DOI:10.1038/nature12712
  Sequence
[sce:YOR224C]

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Gene (3694)   
   KEGG GENES (682)   
   KEGG MGENES (170)   
   RefGene (2839)   
   OC (3)   
Literature (3)   
   PubMed (3)   
All databases (3707)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system