KEGG   ORTHOLOGY: K03047
Entry
K03047                      KO                                     
Symbol
rpoD
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit D [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03047
Other DBs
COG: COG0202
GO: 0003899
Genes
ADC: FOC79_08995
MJA: MJ_0192
MFE: Mefer_0487
MVU: Metvu_1634
MFS: MFS40622_0085
MIF: Metin_0698
MJH: JH146_1612
MESG: MLAUSG7_0380(rpoD)
MESA: MLASG1_1559(rpoD)
MIG: Metig_0862
MMP: MMP1322(rpoD)
MMQ: MmarC5_0271
MMX: MmarC6_1351
MMZ: MmarC7_0567
MMD: GYY_07435
MMAK: MMKA1_15450(rpoD)
MMAO: MMOS7_14260(rpoD)
MMAD: MMJJ_15180
MAE: Maeo_1098
MVN: Mevan_0633
MVO: Mvol_0217
MOK: Metok_1006
METF: CFE53_00715
MTH: MTH_37
MMG: MTBMA_c05260(rpoD)
MWO: MWSIV6_0491(rpoD)
MTEE: MTTB_11050
METC: MTCT_0036
METE: tca_00037(rpoA)
METZ: METMT2_0285
METK: FVF72_01920
MTHM: FZP57_02320
METJ: FZP68_07340
MST: Msp_0868(rpoD)
METB: AW729_01745
MEIS: PXD04_08585
MRU: mru_0908(rpoD)
MSI: Msm_1428
MEB: Abm4_1240(rpoD)
MMIL: sm9_1651(rpoD)
MEYE: TL18_07310
MOL: YLM1_0475
MARO: MarbSA_06280
METV: K4897_07970
MEL: Metbo_0808
MEW: MSWAN_1437
METH: MBMB1_0801(rpoD)
MFC: BRM9_0373(rpoD)
MFI: DSM1535_0300(rpoD)
MCUB: MCBB_1347(rpoD)
MSUB: BK009_04720
METN: BK008_00195
METT: CIT01_08855
METO: CIT02_00355
MEME: HYG87_09300
MFEG: GCM10025860_24950
MEER: NKF70_02560
MRID: FGU46_09210
MFV: Mfer_0886
MKA: MK1474(rpoA)
AFU: AF_2282
AFG: AFULGI_00025800
APO: Arcpr_1028
AVE: Arcve_0363
AST: Asulf_00625
FPL: Ferp_0845
GAC: GACE_0207
GAH: GAH_00088
PFU: PF1647
PFI: PFC_10370
PHO: PH1637(PH1637)
PAB: PAB2410(rpoD)
PYN: PNA2_0221
PYA: PYCH_02520
PYS: Py04_1528
PYC: TQ32_08640
TKO: TK1503
TON: TON_0105
TGA: TGAM_1966(rpoD)
TSI: TSIB_0342
TBA: TERMP_00131
THE: GQS_04705
THA: TAM4_300
THM: CL1_0593
TLT: OCC_03642
THS: TES1_0226
TNU: BD01_2188
TEU: TEU_05270
TGY: X802_02860
THV: ADU37_CDS02660
TCH: CHITON_1869
TPEP: A0127_07665
TPIE: A7C91_06455
TGG: A3K92_00840
TCE: A3L02_00715
TBS: A3L01_01215
THH: CDI07_01190
TSL: A3L11_04965
TTD: A3L14_02670
TPRF: A3L09_02725
TRL: A3L10_05365
TPAF: A3L08_04230
THY: A3L12_00770
TIC: FH039_03055
TCQ: TIRI35C_0468(rpoD)
THEM: FPV09_06295
THEI: K1720_04755
TAGG: NF865_01080
PPAC: PAP_01900
MBA: Mbar_A0075
MBY: MSBRM_2577
MBW: MSBRW_0921
MBAR: MSBR2_2543
MBAK: MSBR3_2586
MMA: MM_2158
MMAZ: MmTuc01_2212
MMJ: MSMAS_2526
MMAC: MSMAC_1919
MVC: MSVAZ_0860
MEK: MSKOL_0829
MLS: MSLAZ_0682
METM: MSMTP_2443
MEF: MSWH1_0677
MEQ: MSWHS_0691
MSJ: MSSAC_3106
MSZ: MSSIH_2754
MSW: MSSIT_2787
MTHR: MSTHT_1133
MTHE: MSTHC_2170
MHOR: MSHOH_3189
MFZ: AOB57_010730
MHAB: RSJ42_01750
METW: AAY43_08080
MBU: Mbur_0039(rpoD)
MMET: MCMEM_0622
MELO: J7W08_01155
MMH: Mmah_1242
MHAZ: BHR79_07330
MPOT: BKM01_03575
MEV: Metev_0827
MZH: Mzhil_1196
MPY: Mpsy_1111
MZI: HWN40_03020
MMAV: RE476_07220
MSEB: RE474_03480
MHZ: Metho_1989
MEHF: MmiHf6_14060
MEES: MmiEs2_16380
MTP: Mthe_1621
MCJ: MCON_0640(rpoD)
MHI: Mhar_0810
MHU: Mhun_2899
MRTJ: KHC33_02450
MLA: Mlab_1244
MEM: Memar_1803
MBG: BN140_0583(rpoD)
MEMA: MMAB1_0749(rpoD)
MCHK: MchiMG62_20680
MSUM: OH143_03235
MRC: R6Y96_08690
MPI: Mpet_0751
MEND: L6E24_04840
MEFW: F1737_07280
MAQE: RJ40_09615
MFK: E2N92_09815
MOU: OU421_12835
MESB: L1S32_04590
MANQ: L1994_07705
MBN: Mboo_2222
MFO: Metfor_0485
MESK: METHP_01014
MPL: Mpal_2385
MPD: MCP_2258(rpoD)
MEZ: Mtc_1534(rpoD)
RCI: RCIX2583(rpoD)
MJK: N2V74_06760
HAL: VNG_1136G(rpb3)
HSL: OE_2631F(rpoD)
HANR: LJ422_04640
HDL: HALDL1_11640
HHB: Hhub_2761(rpoD)
HAGS: JT689_05945
HABO: JRZ79_04410
HNO: LT974_10995
HLU: LT972_04685
HANX: ABSL23_13665
HALH: HTSR_0774(rpoD)
HHSR: HSR6_0800(rpoD)
HSU: HLASF_1462(rpoD)
HSF: HLASA_1449(rpoD)
HAHS: HSRCO_1982(rpoD)
SALR: FQU85_08385
HALR: EFA46_008475
HJE: HacjB3_08750
HDO: MUK72_12160
HALX: M0R89_13200
HAXZ: M0R88_13570
HAYC: NGM10_02660
HAXY: NGM07_00700
SALI: L593_05235
SAIM: K0C01_08310
HARA: AArcS_0681(rpoD)
HMA: rrnAC0062(rpoD)
HSIN: KDQ40_09405
HHI: HAH_0821(rpoD)
HHN: HISP_04250
HAB: SG26_11965
HTA: BVU17_04040
HALJ: G9465_13530
NPH: NP_2834A(rpoD)
NMO: Nmlp_2752(rpoD)
NHO: HWV23_17020
NSAL: HWV07_02300
HUT: Huta_2521
HTI: HTIA_2282
HALA: Hrd1104_07275
HASV: SVXHr_2043(rpoD)
HABN: HBNXHr_2029(rpoD)
HMU: Hmuk_2592
HALZ: E5139_00240
HALL: LC1Hm_1936(rpoD)
HAZP: GBQ70_00240
HALI: BV210_01120
HSN: DV733_12545
HDS: HSR122_2659(rpoA_Rpo1)
HRR: HZS55_19140
HPEL: HZS54_23185
HLT: I7X12_16260
HARC: HARCEL1_03355
SSAI: N0B31_06150
HAAD: MW046_02170
HWA: HQ_2941A(rpoD)
HWC: Hqrw_3356(rpoD)
HVO: HVO_2781(rpoD)
HALE: G3A49_17585
HLN: SVXHx_1822(rpoD)
HME: HFX_2791(rpoD)
HGI: ABY42_13920
HLS: KU306_14645
HBO: Hbor_12540
HAQ: DU484_13190
HAJ: DU500_13290
HAER: DU502_10410
HRA: EI982_01850
HLM: DV707_06205
HALM: FCF25_04990
HLA: Hlac_1819
HALP: DOS48_08785
HALB: EKH57_00735
HEZZ: EO776_10720
HALQ: Hrr1229_013045
HSS: J7656_06045
HSAI: HPS36_11300
HAZZ: KI388_08725
SRUB: C2R22_11475
HAE: halTADL_2774
HALN: B4589_004915
HALG: HUG10_04520
HALU: HUG12_12440
HMP: K6T50_02595
HRE: K6T36_02430
HRM: K6T25_13990
HACB: Hbl1158_09470
HDF: AArcSl_2722(rpoD)
HAAA: AArcCO_1167(rpoD)
HAH: Halar_1555
HTU: Htur_2551
HSAL: JMJ58_16070
HAKZ: J0X25_18655
NMG: Nmag_0423(rpoD)
HXA: Halxa_0741
NAT: NJ7G_1093
NPE: Natpe_1674
NVR: FEJ81_08630
NPL: FGF80_03190
NAY: HYG81_01080
HALY: HYG82_04930
HJT: DVR14_17855 DVR14_21985
HLO: J0X27_14585
NGE: Natgr_2554
HLC: CHINAEXTREME11245
HRU: Halru_1750
SAWL: NGM29_08495
HALV: NGM15_00655
NOU: Natoc_1812
HLR: HALLA_13865
NAJ: B1756_03100
NAG: AArcMg_2068
NAN: AArc1_1609
NARA: QQ977_03045
NBG: DV706_11990
NAS: GCU68_00100
HDA: BB347_07545
NAC: AQV86_00195
MELU: MTLP_00880
MEAM: MU439_03575
MEAE: QEN48_06810
TAC: Ta1030
TVO: TVG0551901(TVG0551901)
OMR: OXIME_000214
PTO: PTO1222
FAC: FACI_IFERC01G1252
FAI: FAD_0263
CDIV: CPM_1499
TAR: TALC_00429
MAX: MMALV_03530
MER: MMINT_07540
MEAR: Mpt1_c01590(rpoD)
MEUZ: KRP56_01885
MARC: AR505_1439
ABI: Aboo_1399
ACF: AciM339_1557
APE: APE_1744.1(rpoD)
ACJ: ACAM_1094(rpoD)
SMR: Smar_0815
SHC: Shell_1652
IHO: Igni_0183
IIS: EYM_03290
IPC: IPA_05205
DKA: DKAM_1363
DFD: Desfe_1458
DMU: Desmu_1354
TAG: Tagg_1394
TCS: IMZ38_00420
IAG: Igag_0193
THG: TCELL_0530
HBU: Hbut_0530
PFM: Pyrfu_1057
PDL: Pyrde_2031
PABI: PABY_20590
PARE: PYJP_18730
STO: STK_20670(rpoD)
SOH: D1869_11340
SJV: SJAV_04160
SSO: SSO0071(rpoD)
SOL: Ssol_1052
SSOA: SULA_1089
SSOL: SULB_1090
SSOF: SULC_1089
SSHI: J5U23_00176
SCAS: SACC_32560
SIS: LS215_2213
SIA: M1425_2048
SIM: M1627_2128
SID: M164_2055
SIY: YG5714_2174
SIN: YN1551_0745
SII: LD85_2315
SIH: SiH_1994
SIR: SiRe_1921
SIC: SiL_1901
SULA: BFU36_05485
SULE: GFS03_11200
SAI: Saci_0083(rpoD)
SACN: SacN8_00390
SACR: SacRon12I_00390
SACS: SUSAZ_00395
SULO: GFS33_03015
SULL: EWF20_12500
MSE: Msed_2145
MEMJ: MJ1HA_2419
MCN: Mcup_0144
MHK: DFR87_07745
MPRU: DFR88_07415
MTEN: GWK48_04405
MJN: MjAS7_0456
AHO: Ahos_0661
AMAN: B6F84_06725
ABRI: DFR85_08890
ASUL: DFR86_05785
AAMB: D1866_11080
ACIH: HS5_20360
SACD: HS1genome_2313
SAZO: D1868_09600
CSTY: KN1_04920
STEP: IC006_1971
SMET: RQ359_002254
SAHS: HS7_08990
PAI: PAE0671
PIS: Pisl_0697
PCL: Pcal_2097
PAS: Pars_2327
PYR: P186_2184
POG: Pogu_2538
TNE: Tneu_1969
PYW: PYWP30_02231
CMA: Cmaq_1166
TTN: TTX_1672(rpoD)
TUZ: TUZN_1839
VDI: Vdis_0085
VMO: VMUT_0966
VSO: Vsou_04990
TPE: Tpen_0280
THB: N186_02310
TCB: TCARB_1537
THEL: IG193_06195
ASC: ASAC_1008
ACIA: SE86_06040
CLG: Calag_0551
FFO: FFONT_0464
KCR: Kcr_1582
MVJ: ACO0C9_03140
NMR: Nmar_0428
NIR: NSED_02225
NKR: NKOR_02130
NID: NPIRD3C_1934
NIN: NADRNF5_1745
NIW: Nisw_02675
NCL: C5F47_02215
NOX: C5F49_02320
NUE: C5F50_03110
NIP: NsoK4_06275
NZT: NZOSNM25_001592
NCT: NMSP_1298(rpoD)
NIC: DSQ20_02390
NGA: Ngar_c23900(rpoD)
NVN: NVIE_000220(rpoD)
NEV: NTE_01338
TAA: NMY3_00739
NFN: NFRAN_1744
NCV: NCAV_0363
NDV: NDEV_0384
CSY: CENSYa_1544
CSU: CSUB_C0317
NBV: T478_0402(rpoA)
TAH: SU86_003905
NIU: DSQ19_02235
NCK: QVH35_06110
CCAI: NAS2_0345
BARC: AOA65_1555(rpoD)
BARB: AOA66_1086(rpoD)
NEQ: NEQ452
MARH: Mia14_0013
FLT: Sv326_0849
MIY: Micr_01026(rpoD_2)
MARV: ARM1_0406
NCON: LC1Nh_1072(rpoD)
NOCC: SVXNc_0914(rpoD)
WAR: HYS32_03030
LOKI: Lokiarch_01060(rpoD)
LOB: NEF87_004046
PSYT: DSAG12_01592
AGW: QT03_C0001G0885
ARG: QT11_C0001G0836
 » show all
Reference
PMID:19880312
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

  All links  
Ontology (2)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Gene (3666)   
   MGENES (2883)   
   RefGene (776)   
   OC (7)   
All databases (3668)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system