KEGG   ORTHOLOGY: K07306Help
Entry
K07306                      KO                                     

Name
dmsA
Definition
anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A [EC:1.8.5.3]
Pathway
ko00920  Sulfur metabolism
ko01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00920 Sulfur metabolism
    K07306  dmsA; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K07306  dmsA; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.8  Acting on a sulfur group of donors
   1.8.5  With a quinone or similar compound as acceptor
    1.8.5.3  respiratory dimethylsulfoxide reductase
     K07306  dmsA; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Transmembrane electron carriers
   K07306  dmsA; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R09501
COG: COG0243
TC: 5.A.3.3.2
Genes
ECO: b0894(dmsA)
ECJ: JW5118(dmsA)
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ESO: O3O_08410
ESM: O3M_16855
ESL: O3K_16880
ECW: EcE24377A_0969(dmsA)
ELH: ETEC_0962
ECC: c1031(dmsA)
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ECI: UTI89_C0967(dmsA)
ECV: APECO1_1195(dmsA)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Rothery RA, Trieber CA, Weiner JH
  Title
Interactions between the molybdenum cofactor and iron-sulfur clusters of Escherichia coli dimethylsulfoxide reductase.
  Journal
J Biol Chem 274:13002-9 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.19.13002
  Sequence
[eco:b0894]

KEGG   ORTHOLOGY: K07307Help
Entry
K07307                      KO                                     

Name
dmsB
Definition
anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit B
Pathway
ko00920  Sulfur metabolism
ko01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00920 Sulfur metabolism
    K07307  dmsB; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit B
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K07307  dmsB; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit B
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Transmembrane electron carriers
   K07307  dmsB; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit B
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R09501
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 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Rothery RA, Trieber CA, Weiner JH
  Title
Interactions between the molybdenum cofactor and iron-sulfur clusters of Escherichia coli dimethylsulfoxide reductase.
  Journal
J Biol Chem 274:13002-9 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.19.13002

KEGG   ORTHOLOGY: K07308Help
Entry
K07308                      KO                                     

Name
dmsC
Definition
anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C
Pathway
ko00920  Sulfur metabolism
ko01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00920 Sulfur metabolism
    K07308  dmsC; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters
    K07308  dmsC; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C
Transporters [BR:ko02000]
 Other transporters
  Transmembrane electron carriers
   K07308  dmsC; anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R09501
COG: COG3302
TC: 5.A.3.3.2
Genes
ECO: b0896(dmsC)
ECJ: JW0879(dmsC)
ECD: ECDH10B_0966(dmsC)
EBW: BWG_0748(dmsC)
ECOK: ECMDS42_0748(dmsC)
ECE: Z1242(dmsC) Z3783
ECS: ECs0981 ECs3382
ECF: ECH74115_1058(dmsC1) ECH74115_3745
ETW: ECSP_1001(dmsC) ECSP_3460
ELX: CDCO157_0957 CDCO157_3149
EOJ: ECO26_1022(dmsC)
EOI: ECO111_0964(dmsC)
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EOK: G2583_1133(dmsC) G2583_3045(ynfH)
ESO: O3O_08420
ESM: O3M_16845
ESL: O3K_16870
ECW: EcE24377A_0972(dmsC1)
ELH: ETEC_0964
ECC: c1033(dmsC)
ECP: ECP_0910
ECI: UTI89_C0969(dmsC)
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ECQ: ECED1_0926(dmsC)
ECK: EC55989_0941(dmsC)
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EOC: CE10_0922(dmsC)
EUM: ECUMN_1091(dmsC)
ECZ: ECS88_0927(dmsC)
ELO: EC042_0988(dmsC)
ESE: ECSF_0820
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PAW: PAZ_c05410(dmsC)
PACC: PAC1_02660
PACH: PAGK_0533
CACN: RN83_03095
PFR: PFREUD_20590(dmsC)
PFRE: RM25_1962
AHE: Arch_1254
TPYO: X956_09580
TBW: NCTC13354_01264(dmsC)
CBAC: JI75_08395
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Rothery RA, Trieber CA, Weiner JH
  Title
Interactions between the molybdenum cofactor and iron-sulfur clusters of Escherichia coli dimethylsulfoxide reductase.
  Journal
J Biol Chem 274:13002-9 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.19.13002

KEGG   ENZYME: 1.8.5.3Help
Entry
EC 1.8.5.3                  Enzyme                                 

Name
respiratory dimethylsulfoxide reductase;
dmsABC (gene names);
DMSO reductase (ambiguous);
dimethylsulfoxide reductase (ambiguous)
Class
Oxidoreductases;
Acting on a sulfur group of donors;
With a quinone or similar compound as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
dimethyl sulfide:menaquinone oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
dimethylsulfide + menaquinone + H2O = dimethylsulfoxide + menaquinol [RN:R09501]
Reaction(KEGG)
Substrate
dimethylsulfide;
menaquinone [CPD:C00828];
H2O [CPD:C00001]
Product
dimethylsulfoxide;
menaquinol [CPD:C05819]
Comment
The enzyme participates in bacterial electron transfer pathways in which dimethylsulfoxide (DMSO) is the terminal electron acceptor. It is composed of three subunits - DmsA contains a bis(guanylyl molybdopterin) cofactor and a [4Fe-4S] cluster, DmsB is an iron-sulfur protein, and DmsC is a transmembrane protein that anchors the enzyme and accepts electrons from the quinol pool. The electrons are passed through DmsB to DmsA and on to DMSO. The enzyme can also reduce pyridine-N-oxide and trimethylamine N-oxide to the corresponding amines with lower activity.
History
EC 1.8.5.3 created 2011, modified 2019
Pathway
ec00920  Sulfur metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K07306  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A
Genes
ECO: b0894(dmsA)
ECJ: JW5118(dmsA)
ECD: ECDH10B_0964(dmsA)
EBW: BWG_0746(dmsA)
ECOK: ECMDS42_0746(dmsA)
ECE: Z1240(dmsA) Z3785
ECS: ECs0979 ECs3384
ECF: ECH74115_1056(dmsA) ECH74115_3747
ETW: ECSP_0999(dmsA) ECSP_3462
ELX: CDCO157_0955 CDCO157_3151
EOJ: ECO26_1020(dmsA)
EOI: ECO111_0962(dmsA)
EOH: ECO103_0937(dmsA)
ECOO: ECRM13514_1000(dmsA)
ECOH: ECRM13516_0935(dmsA)
EOK: G2583_1131(dmsA) G2583_3047(dmsA)
ESO: O3O_08410
ESM: O3M_16855
ESL: O3K_16880
ECW: EcE24377A_0969(dmsA)
ELH: ETEC_0962
ECC: c1031(dmsA)
ECP: ECP_0908
ECI: UTI89_C0967(dmsA)
ECV: APECO1_1195(dmsA)
ECX: EcHS_A0999(dmsA)
ECM: EcSMS35_2226(dmsA)
ECY: ECSE_0952
ECR: ECIAI1_0934(dmsA)
ECQ: ECED1_0924(dmsA)
ECK: EC55989_0939(dmsA)
ECT: ECIAI39_2254(dmsA)
EOC: CE10_0920(dmsA)
EUM: ECUMN_1089(dmsA)
ECZ: ECS88_0925(dmsA)
ELO: EC042_0986(dmsA)
ESE: ECSF_0818
EBR: ECB_00898(dmsA)
EBD: ECBD_2701
EKF: KO11_19045(dmsA)
EAB: ECABU_c09350(dmsA)
EDJ: ECDH1ME8569_0845(dmsA)
EIH: ECOK1_0919(dmsA)
ENA: ECNA114_0928(dmsA)
ELW: ECW_m1004(dmsA)
ELL: WFL_04880(dmsA)
ELC: i14_0945(dmsA)
ELD: i02_0945(dmsA)
ELP: P12B_c0880(dmsA)
EBL: ECD_00898(dmsA)
EBE: B21_00905(dmsA)
ELF: LF82_0497(dmsA)
ECOI: ECOPMV1_00934(dmsA_1)
ECOJ: P423_04705
ECOS: EC958_1052(dmsA)
EFE: EFER_4181(dmsA)
EAL: EAKF1_ch0576c(dmsA)
STY: STY0962(dmsA)
STT: t1970(dmsA)
STM: STM0964(dmsA) STM2530
SPT: SPA1834(dmsA)
SEK: SSPA1706
SEI: SPC_0964(dmsA) SPC_1124 SPC_4368(dmsA)
SEC: SCH_0918(dmsA) SCH_2527(dmsA) SCH_4183(dmsA)
SEG: SG0907(dmsA) SG2565
SEL: SPUL_0348
SET: SEN0869(dmsA) SEN2510
SEEP: I137_01585
SBG: SBG_0820(dmsA) SBG_2306(dmsA3) SBG_3750(dmsA4)
SFX: S0894(dmsA)
SFE: SFxv_0923(dmsA)
SFN: SFy_1155
SFS: SFyv_1196
SFT: NCTC1_00855(dmsA_1) NCTC1_00856(dmsA_2)
SSN: SSON_0895(dmsA)
SBO: SBO_0827(dmsA)
SDY: SDY_2367(dmsA)
ENC: ECL_02756 ECL_03864(dmsA)
EEC: EcWSU1_01481(dmsA)
CSK: ES15_1928(dmsA1) ES15_2075(dmsA2)
CTU: CTU_20690(dmsA) CTU_22100(dmsA)
KPN: KPN_00926(dmsA)
KPU: KP1_1895(dmsA)
KPP: A79E_3313
KPT: VK055_1559(dmsA2)
KPE: KPK_3634(dmsA)
KPR: KPR_3652(dmsA)
KPJ: N559_3353
KPX: PMK1_03262(dmsA_2)
KPNU: LI86_17410
KPNK: BN49_2025(dmsA)
KVA: Kvar_3450
KOX: KOX_15920
KOE: A225_2022
EAE: EAE_15095
EAR: CCG30943
CKO: CKO_02177
CRO: ROD_09581(dmsA) ROD_34401
EBT: EBL_c08510(dmsA1) EBL_c25210(dmsA2)
RTG: NCTC13098_05060(dmsA_3) NCTC13098_05061(dmsA_4)
REE: electrica_03391(dmsA)
CLAP: NCTC11466_03046(dmsA_4)
KIE: NCTC12125_02060(dmsA_3)
AHN: NCTC12129_02548(dmsA_2) NCTC12129_02612(dmsA_3) NCTC12129_02613(dmsA_4)
IZH: FEM41_14320(dmsA)
EBF: D782_2916
YPE: YPO2965(dmsA) YPO3325(dmsA)
YPK: y0864(dmsA) y1519
YPH: YPC_1431(dmsA) YPC_3642
YPM: YP_0361(dmsA1) YP_2590(dmsA2)
YPZ: YPZ3_2610(dmsA) YPZ3_2927(dmsA)
YPD: YPD4_2596(dmsA) YPD4_2914(dmsA)
YPX: YPD8_2591(dmsA) YPD8_2912(dmsA)
YPW: CH59_2724(dmsA) CH59_3111
YPJ: CH55_1905(dmsA) CH55_4114
YPV: BZ15_198(dmsA) BZ15_568
YPL: CH46_1770(dmsA) CH46_2142
YPS: YPTB0805(dmsA) YPTB2688(dmsA)
YPO: BZ17_1751(dmsA) BZ17_3949
YPQ: DJ40_1568(dmsA) DJ40_3854
YPU: BZ21_1986 BZ21_8(dmsA)
YPR: BZ20_1253(dmsA) BZ20_3520
YPC: BZ23_2270 BZ23_280(dmsA)
YPF: BZ19_153(dmsA) BZ19_2053
YEY: Y11_22261
YET: CH48_2530(dmsA)
YAL: AT01_3340(dmsA)
YFR: AW19_27(dmsA) AW19_407
YIN: CH53_491 CH53_839(dmsA)
YRO: CH64_1312 CH64_3428(dmsA)
PAY: PAU_02336
PMR: PMI1204 PMI1705(dmsA) PMI2964
PSX: DR96_2304 DR96_611(dmsA)
PRG: RB151_005100(dmsA_1) RB151_020280(dmsA_2) RB151_020290(ynfF) RB151_020780(ynfE_1) RB151_026220(ynfE_3) RB151_039880(dmsA_3) RB151_039890(dmsA_4)
PHEI: NCTC12003_00514(dmsA_1) NCTC12003_01605(dmsA_2) NCTC12003_02059(dmsA_4) NCTC12003_02152(dmsA_5) NCTC12003_02228(dmsA_6) NCTC12003_02665(dmsA_7)
PRJ: NCTC6933_00159(dmsA_1) NCTC6933_00160(dmsA_2) NCTC6933_02285(dmsA_4) NCTC6933_02286(dmsA_5)
ANS: ArsFIN_16130(ynfE) ArsFIN_16140(dmsA)
ETR: ETAE_2194(dmsA1)
ETD: ETAF_1986
ETE: ETEE_0185
LRI: NCTC12151_01399(dmsA_1) NCTC12151_02829(dmsA_3) NCTC12151_03036(dmsA_4) NCTC12151_03708(dmsA_6)
HIN: HI1047(dmsA)
HIT: NTHI1207(dmsA)
HIU: HIB_12080
HIE: R2846_1286(dmsA)
HIZ: R2866_1351(dmsA)
HIK: HifGL_000659(dmsA)
HIA: H733_1402(dmsA)
HIW: NTHI477_00683(dmsA)
HIC: NTHIC486_01742(dmsA)
HIX: NTHI723_00589(dmsA)
HPIT: NCTC13334_01820(dmsA_1)
HPAK: JT17_01180
PMU: PM1754(dmsA)
PMP: Pmu_15770(dmsA)
PMUL: DR93_179(dmsA)
PDAG: 4362423_01645(dmsA)
PAET: NCTC13378_02076(dmsA_2)
APL: APL_1674(dmsA)
APJ: APJL_1705(dmsA)
APA: APP7_1734(dmsA)
ASU: Asuc_1523
AAT: D11S_0493
AAN: D7S_01382
AACN: AANUM_0302
BTO: WQG_10790
BTRE: F542_11270
BTRH: F543_12730
BTRA: F544_11160
VPA: VP1447
VPB: VPBB_1358
VSC: VSVS12_01330(dmsA)
VFI: VF_A0082(dmsA)
PPR: PBPRB0330(Y0864)
SON: SO_1429(dmsA) SO_4358
SPL: Spea_2818
SWD: Swoo_0233
SWP: swp_3459
TBN: TBH_C1564
LHK: LHK_02496(dmsA)
RGE: RGE_20320(dmsA)
WSU: WS1430(DMSA)
CJU: C8J_1482
CJM: CJM1_1521(dmsA)
CJQ: UC78_1514(dmsA)
CCV: CCV52592_2107(dmsA)
CSPF: CSF_1760(dmsA)
SHAL: SHALO_2055
DVM: DvMF_1612
DAL: Dalk_4207
BBEV: BBEV_0337(dmsA-1) BBEV_2212(dmsA-2)
CSR: Cspa_c23400(dmsA)
CSB: CLSA_c40290(dmsA)
CACE: CACET_c08460(dmsA)
AMT: Amet_1330
STH: STH2332(dmsA1) STH713(dmsA2)
DSY: DSY0186(dmsA) DSY0357(dmsA) DSY1240(dmsA) DSY1251(dmsA) DSY1448(dmsA) DSY3410(dmsA) DSY3466(dmsA) DSY3470(dmsA) DSY4087(dmsA) DSY4820(dmsA) DSY4821(dmsA) DSY4824(dmsA)
PUF: UFO1_2838
PFT: JBW_00203
MANA: MAMMFC1_00219(dmsA)
STED: SPTER_05140(dmsA_1) SPTER_05980(dmsA_2)
CUR: cu0825(dmsA)
CUA: CU7111_0811(dmsA)
DCO: SAMEA4475696_0019(dmsA_1)
PAC: PPA0517
PAW: PAZ_c05430(dmsA)
PACH: PAGK_0535
CACN: RN83_03105
PFR: PFREUD_20610(dmsA)
PFRE: RM25_1964
AHE: Arch_1256
TPYO: X956_09570
TBW: NCTC13354_01266(dmsA)
ELE: Elen_1190
CBAC: JI75_00515
LOKI: Lokiarch_08420(ynfE) Lokiarch_11930(dmsA_1) Lokiarch_16140(dmsA_2)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:1769531]
  Authors
Daruwala R, Meganathan R
  Title
Dimethyl sulfoxide reductase is not required for trimethylamine N-oxide reduction in Escherichia coli.
  Journal
FEMS Microbiol Lett 67:255-9 (1991)
Reference
2
  Authors
Miguel, L. and Meganthan, R.
  Title
Electron donors and the quinone involved in dimethyl sulfoxide reduction in Escherichia coli.
  Journal
Curr Microbiol 22:109-115 (1991)
Reference
3  [PMID:8969520]
  Authors
Simala-Grant JL, Weiner JH
  Title
Kinetic analysis and substrate specificity of Escherichia coli dimethyl sulfoxide reductase.
  Journal
Microbiology 142 ( Pt 11):3231-9 (1996)
DOI:10.1099/13500872-142-11-3231
  Sequence
[eco:b0894]
Reference
4  [PMID:10224050]
  Authors
Rothery RA, Trieber CA, Weiner JH
  Title
Interactions between the molybdenum cofactor and iron-sulfur clusters of Escherichia coli dimethylsulfoxide reductase.
  Journal
J Biol Chem 274:13002-9 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.19.13002
  Sequence
[eco:b0894]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.8.5.3
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.8.5.3
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.8.5.3
BRENDA, the Enzyme Database: 1.8.5.3

KEGG   REACTION: R09501Help
Entry
R09501                      Reaction                               

Name
dimethyl sulfide:menaquinone oxidoreductase
Definition
Dimethyl sulfide + Menaquinone + H2O <=> Dimethyl sulfoxide + Menaquinol
Equation
Reaction class
RC00819  C00828_C05819
RC02555  C00580_C11143
Enzyme
Pathway
rn00920  Sulfur metabolism
rn01100  Metabolic pathways
Orthology
K07306  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A [EC:1.8.5.3]
K07307  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit B
K07308  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C

DBGET integrated database retrieval system