KEGG   ORTHOLOGY: K10713
Entry
K10713                      KO                                     

Name
fae
Definition
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase [EC:4.2.1.147]
Pathway
ko00680  Methane metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K10713  fae; 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase
Enzymes [BR:ko01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.1  Hydro-lyases
    4.2.1.147  5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase
     K10713  fae; 5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase
Other DBs
RN: R08058
COG: COG1795
Genes
KMI: VW41_19435
CNT: JT31_16265
CEM: LH23_01445
CEN: LH86_01435
YPE: YPO2460
YPK: y1729
YPH: YPC_1667
YPA: YPA_1958
YPN: YPN_2056
YPM: YP_2279
YPZ: YPZ3_2110
YPD: YPD4_2151
YPX: YPD8_2236
YPW: CH59_2(fae)
YPJ: CH55_148(fae)
YPV: BZ15_1068(fae)
YPL: CH46_2648(fae)
YPS: YPTB2503
YPO: BZ17_4134(fae)
YPY: YPK_1651
YPB: YPTS_2597
YPQ: DJ40_4039(fae)
YPU: BZ21_1799(fae)
YPR: BZ20_3706(fae)
YPC: BZ23_2084(fae)
YPF: BZ19_1865(fae)
SPE: Spro_2468
EAME: GXP68_21270(fae)
DYE: EO087_01975(fae)
PCQ: PcP3B5_53090(fae)
PMAN: OU5_6013
PSEM: TO66_12085
PSOS: POS17_3724
PANR: A7J50_2664
PKE: DLD99_16655(fae)
METU: GNH96_00505(fae) GNH96_03515(fae)
METL: U737_02620(fae) U737_05120(fae) U737_11025(fae) U737_14805(fae)
MAH: MEALZ_0850(fae2) MEALZ_1456(fae) MEALZ_2428(fae)
MBUR: EQU24_09110(fae) EQU24_10305(fae) EQU24_13345(fae) EQU24_14320(fae)
MPSY: CEK71_02655(fae) CEK71_20175(fae)
MMOB: F6R98_04980(fae) F6R98_15000(fae) F6R98_19005(fae)
MEJ: Q7A_1764(fae) Q7A_1938(fae) Q7A_47(fae)
BLEP: AL038_08760(fae) AL038_13645(fae)
NHL: Nhal_3879
NWR: E3U44_04660(fae)
AMAH: DLM_3633
RIN: ACS15_3974(fae)
BCEN: DM39_4730(fae)
BMK: DM80_4395(fae)
BTEI: WS51_00910
BXE: Bxe_B2436(fae)
BXB: DR64_4764(fae)
BFN: OI25_5387(fae)
PARB: CJU94_31180(fae)
PHS: C2L64_25890(fae) C2L64_32370(fae) C2L64_38280(fae)
PTER: C2L65_22495(fae) C2L65_29025(fae) C2L65_34275(fae)
PGP: CUJ91_21485(fae) CUJ91_30315(fae)
PCJ: CUJ87_23435(fae) CUJ87_27745(fae)
PTS: CUJ90_21415(fae) CUJ90_28055(fae)
PMEG: FNZ07_05665(fae)
CABA: SBC2_54700(fae)
RHG: EXZ61_07325(fae)
METP: C1M51_15005(fae) C1M51_15080(fae)
CARE: LT85_1433
RGE: RGE_40280(fae) RGE_40430
AON: DEH84_18915(fae)
METR: BSY238_1372(fae) BSY238_3289(fae)
AZA: AZKH_p0238(fae) AZKH_p0270(fae)
AZD: CDA09_11330(fae) CDA09_11535(fae)
THK: CCZ27_13170(fae) CCZ27_13240(fae)
MESM: EJ066_29735(fae)
RGA: RGR602_PC01571(fae)
AZC: AZC_0890
STAR: G3545_09615(fae) G3545_09875(fae)
LNE: FZC33_09350(fae)
ANC: GBB76_00705(fae) GBB76_01750(fae)
APRA: G3A50_17700(fae)
MEA: Mex_1p1339(fae) Mex_1p1766(fae) Mex_1p3356(fae)
MDI: METDI2111(fae) METDI2518(fae) METDI3927(fae)
MAQU: Maq22A_1p31155(fae) Maq22A_c16490(fae)
METS: DK389_14645(fae) DK389_20670(fae)
MROS: EHO51_09550(fae) EHO51_11440(fae) EHO51_13070(fae) EHO51_13075(fae)
MTW: CQW49_09280(fae) CQW49_13475(fae) CQW49_13480(fae)
PLEO: OHA_1_02036(fae)
AALA: IGS74_05765(fae)
HDI: HDIA_0174(fae_1) HDIA_2315(fae_2) HDIA_3044(fae_3)
METG: HT051_03555(fae) HT051_10195(fae)
ABS: AZOBR_p270080(fae)
AZT: TSH58p_01220(fae)
AZM: DM194_17130(fae)
AOZ: HUE56_08815(fae) HUE56_08905(fae)
SMAL: SMALA_7629
SNQ: CP978_00965(fae)
SSPO: DDQ41_05910(fae)
MOY: CVS54_02583(fae)
LTR: EVS81_09120(fae)
LEB: G7066_15115(fae)
ARN: CGK93_03385(fae)
AAU: AAur_0648
AMD: AMED_6210
AMN: RAM_31860
AMM: AMES_6120
AMZ: B737_6120
RUB: GBA63_16325(fae)
RBA: RB10297(fae) RB9338(fae)
PIR: VN12_03550(fae_1) VN12_18235(fae_2)
RUL: UC8_03170(fae_1) UC8_11080(fae_2)
MFF: MFFC18_24490(fae_1) MFFC18_35380(fae_2)
ROL: CA51_24730(fae)
AHEL: Q31a_40200(fae)
LCRE: Pla8534_42870(fae)
AMUC: Pan181_45480(fae)
PEH: Spb1_04510(fae_1) Spb1_19420(fae_2)
PLS: VT03_23680(fae_1) VT03_31915(fae_2)
PLH: VT85_01025(fae_1) VT85_19960(fae_2)
FMR: Fuma_01647(fae_1) Fuma_04816(fae_2)
GMR: GmarT_10980(fae_1) GmarT_49910(fae_2)
GIM: F1728_09275(fae) F1728_20510(fae)
BVO: Pan97_44420(fae)
MRI: Mal4_08490(fae)
SDYN: Mal52_22840(fae_1) Mal52_35040(fae_2)
PLON: Pla110_13110(fae)
GES: VT84_01760(fae_1) VT84_22510(fae_2)
GOG: C1280_14275(fae) C1280_25120(fae)
IPA: Isop_1013
PBOR: BSF38_03483(fae_1) BSF38_04915(fae_2)
AGV: OJF2_60590(fae_1) OJF2_74120(fae_2)
MOX: DAMO_0454(fae)
METH: MBMB1_1667
MFC: BRM9_0918(fae)
MCUB: MCBB_1971(fae-hps_3)
METO: CIT02_09565(fae)
MKA: MK1275
FPL: Ferp_1735
GAH: GAH_00673
MBAR: MSBR2_2410
MBAK: MSBR3_2463
MAC: MA_3006
MTHE: MSTHC_0717
MFZ: AOB57_002495(fae)
MBU: Mbur_0367
MMET: MCMEM_1329
MZI: HWN40_05490(fae)
MCJ: MCON_1033(faeA)
MHI: Mhar_0339
MEMA: MMAB1_2454(faeA)
RCI: RCIX1876(fae)
IAG: Igag_0274
 » show all
Reference
  Authors
Vorholt JA, Marx CJ, Lidstrom ME, Thauer RK
  Title
Novel formaldehyde-activating enzyme in Methylobacterium extorquens AM1 required for growth on methanol.
  Journal
J Bacteriol 182:6645-50 (2000)
DOI:10.1128/JB.182.23.6645-6650.2000
  Sequence
Reference
  Authors
Goenrich M, Thauer RK, Yurimoto H, Kato N
  Title
Formaldehyde activating enzyme (Fae) and hexulose-6-phosphate synthase (Hps) in Methanosarcina barkeri: a possible function in ribose-5-phosphate biosynthesis.
  Journal
Arch Microbiol 184:41-8 (2005)
DOI:10.1007/s00203-005-0008-1

KEGG   ORTHOLOGY: K13812
Entry
K13812                      KO                                     

Name
fae-hps
Definition
bifunctional enzyme Fae/Hps [EC:4.2.1.147 4.1.2.43]
Pathway
ko00030  Pentose phosphate pathway
ko00680  Methane metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00345  Formaldehyde assimilation, ribulose monophosphate pathway
M00580  Pentose phosphate pathway, archaea, fructose 6P => ribose 5P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00030 Pentose phosphate pathway
    K13812  fae-hps; bifunctional enzyme Fae/Hps
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K13812  fae-hps; bifunctional enzyme Fae/Hps
Enzymes [BR:ko01000]
 4. Lyases
  4.1  Carbon-carbon lyases
   4.1.2  Aldehyde-lyases
    4.1.2.43  3-hexulose-6-phosphate synthase
     K13812  fae-hps; bifunctional enzyme Fae/Hps
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.1  Hydro-lyases
    4.2.1.147  5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase
     K13812  fae-hps; bifunctional enzyme Fae/Hps
Other DBs
RN: R05338 R08058
COG: COG1795 COG0269
Genes
MJA: MJ_1447
MFE: Mefer_1012
MVU: Metvu_1176
MFS: MFS40622_0906
MIF: Metin_1286
MJH: JH146_0570
MIG: Metig_0664
MAE: Maeo_0614
MOK: Metok_1249
METF: CFE53_04300
MTH: MTH_1474
MMG: MTBMA_c00570(fae_hps)
METC: MTCT_1339
MWO: MWSIV6_0011(fae-hps)
METE: tca_01421(fae)
MST: Msp_1498
MRU: mru_2131
MSI: Msm_1213
MEB: Abm4_0046
MMIL: sm9_0074
MEYE: TL18_10355
MOL: YLM1_1686
METH: MBMB1_0009(fae-hps)
MFC: BRM9_0060
MFI: DSM1535_1378(fae-hps)
MCUB: MCBB_0021(fae-hps_1)
METT: CIT01_05685(fae)
METO: CIT02_07030(fae)
MFV: Mfer_0572
AFU: AF_1305
FPL: Ferp_2129
GAC: GACE_2158
GAH: GAH_00575
MBAR: MSBR2_2313
MBAK: MSBR3_2375
MAC: MA_4608
MMA: MM_1279
MMAC: MSMAC_0037
METM: MSMTP_0040
MTHR: MSTHT_1787
MTHE: MSTHC_1499
MHOR: MSHOH_0037
MBU: Mbur_1994(fae-hps)
MMET: MCMEM_0222
MMH: Mmah_0234
MPY: Mpsy_1425
MTP: Mthe_0988
MCJ: MCON_1383
MHI: Mhar_0019
MHU: Mhun_1628
MLA: Mlab_0996
MEMA: MMAB1_1386(fae-hps)
MPI: Mpet_0801
MBN: Mboo_0772
MPL: Mpal_1036
MPD: MCP_2904(fae_hps)
MEZ: Mtc_0381(fae)
RCI: RCIX775(fae-hps)
CCAI: NAS2_0542
BARC: AOA65_1083(faeB-hpsB)
BARB: AOA66_1278
PSYT: DSAG12_03237(faeB-hpsB)
 » show all
Reference
  Authors
Grochowski LL, Xu H, White RH
  Title
Ribose-5-phosphate biosynthesis in Methanocaldococcus jannaschii occurs in the absence of a pentose-phosphate pathway.
  Journal
J Bacteriol 187:7382-9 (2005)
DOI:10.1128/JB.187.21.7382-7389.2005
  Sequence
[mja:MJ_1447]

KEGG   ENZYME: 4.2.1.147
Entry
EC 4.2.1.147                Enzyme                                 

Name
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase;
formaldehyde-activating enzyme
Class
Lyases;
Carbon-oxygen lyases;
Hydro-lyases
Sysname
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase (formaldehyde-adding, tetrahydromethanopterin-forming)
Reaction(IUBMB)
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin + formaldehyde = 5,10-methylenetetrahydromethanopterin + H2O [RN:R08058]
Reaction(KEGG)
R08058
Substrate
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin [CPD:C01217];
formaldehyde [CPD:C00067]
Product
5,10-methylenetetrahydromethanopterin [CPD:C04377];
H2O [CPD:C00001]
Comment
Found in methylotrophic bacteria and methanogenic archaea.
History
EC 4.2.1.147 created 2014
Pathway
ec00680  Methane metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K10713  5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase
K13812  bifunctional enzyme Fae/Hps
Genes
KMI: VW41_19435
CNT: JT31_16265
CEM: LH23_01445
CEN: LH86_01435
YPE: YPO2460
YPK: y1729
YPH: YPC_1667
YPA: YPA_1958
YPN: YPN_2056
YPM: YP_2279
YPZ: YPZ3_2110
YPD: YPD4_2151
YPX: YPD8_2236
YPW: CH59_2(fae)
YPJ: CH55_148(fae)
YPV: BZ15_1068(fae)
YPL: CH46_2648(fae)
YPS: YPTB2503
YPO: BZ17_4134(fae)
YPY: YPK_1651
YPB: YPTS_2597
YPQ: DJ40_4039(fae)
YPU: BZ21_1799(fae)
YPR: BZ20_3706(fae)
YPC: BZ23_2084(fae)
YPF: BZ19_1865(fae)
SPE: Spro_2468
EAME: GXP68_21270(fae)
DYE: EO087_01975(fae)
PCQ: PcP3B5_53090(fae)
PMAN: OU5_6013
PSEM: TO66_12085
PSOS: POS17_3724
PANR: A7J50_2664
PKE: DLD99_16655(fae)
METU: GNH96_00505(fae) GNH96_03515(fae)
METL: U737_02620(fae) U737_05120(fae) U737_11025(fae) U737_14805(fae)
MAH: MEALZ_0850(fae2) MEALZ_1456(fae) MEALZ_2428(fae)
MBUR: EQU24_09110(fae) EQU24_10305(fae) EQU24_13345(fae) EQU24_14320(fae)
MPSY: CEK71_02655(fae) CEK71_20175(fae)
MMOB: F6R98_04980(fae) F6R98_15000(fae) F6R98_19005(fae)
MEJ: Q7A_1764(fae) Q7A_1938(fae) Q7A_47(fae)
BLEP: AL038_08760(fae) AL038_13645(fae)
NHL: Nhal_3879
NWR: E3U44_04660(fae)
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RIN: ACS15_3974(fae)
BCEN: DM39_4730(fae)
BMK: DM80_4395(fae)
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PCJ: CUJ87_23435(fae) CUJ87_27745(fae)
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CABA: SBC2_54700(fae)
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MEA: Mex_1p1339(fae) Mex_1p1766(fae) Mex_1p3356(fae)
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PLEO: OHA_1_02036(fae)
AALA: IGS74_05765(fae)
HDI: HDIA_0174(fae_1) HDIA_2315(fae_2) HDIA_3044(fae_3)
METG: HT051_03555(fae) HT051_10195(fae)
ABS: AZOBR_p270080(fae)
AZT: TSH58p_01220(fae)
AZM: DM194_17130(fae)
AOZ: HUE56_08815(fae) HUE56_08905(fae)
SMAL: SMALA_7629
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Reference
1  [PMID:11073907]
  Authors
Vorholt JA, Marx CJ, Lidstrom ME, Thauer RK
  Title
Novel formaldehyde-activating enzyme in Methylobacterium extorquens AM1 required for growth on methanol.
  Journal
J Bacteriol 182:6645-50 (2000)
DOI:10.1128/JB.182.23.6645-6650.2000
  Sequence
Reference
2  [PMID:15632161]
  Authors
Acharya P, Goenrich M, Hagemeier CH, Demmer U, Vorholt JA, Thauer RK, Ermler U
  Title
How an enzyme binds the C1 carrier tetrahydromethanopterin. Structure of the tetrahydromethanopterin-dependent formaldehyde-activating enzyme (Fae) from Methylobacterium extorquens AM1.
  Journal
J Biol Chem 280:13712-9 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M412320200
  Sequence
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 4.2.1.147
IUBMB Enzyme Nomenclature: 4.2.1.147
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 4.2.1.147
BRENDA, the Enzyme Database: 4.2.1.147

KEGG   REACTION: R08058
Entry
R08058                      Reaction                               

Name
5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase (formaldehyde-adding, 5,10-methylenetetrahydromethanopterin-forming)
Definition
5,6,7,8-Tetrahydromethanopterin + Formaldehyde <=> 5,10-Methylenetetrahydromethanopterin + H2O
Equation
Reaction class
RC01583  C01217_C04377
RC01795  C00067_C04377
Enzyme
Pathway
rn00680  Methane metabolism
rn01100  Metabolic pathways
rn01120  Microbial metabolism in diverse environments
rn01200  Carbon metabolism
Orthology
K10713  5,6,7,8-tetrahydromethanopterin hydro-lyase [EC:4.2.1.147]
K13812  bifunctional enzyme Fae/Hps [EC:4.2.1.147 4.1.2.43]
Other DBs
RHEA: 24681

DBGET integrated database retrieval system