KEGG   ORTHOLOGY: K12845
Entry
K12845                      KO                                     

Name
SNU13, NHP2L
Definition
U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
   03009 Ribosome biogenesis
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6 snRNP specific factors
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Sno RNPs
   Box C/D snoRNPs
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Other DBs
COG: COG1358
Genes
HSA: 4809(SNU13)
PTR: 458869(SNU13)
PPS: 100968235(SNU13)
GGO: 101129194(SNU13)
PON: 100447181(SNU13)
NLE: 100600266 115830397
MCC: 708283(SNU13)
MCF: 101926085(SNU13)
CSAB: 103223391(SNU13)
RRO: 104671607(SNU13)
RBB: 108543551 108543572
CJC: 100390384(SNU13)
SBQ: 101028525(NHP2L1)
MMU: 100862468 20826(Snu13)
MCAL: 110310556(Snu13)
MPAH: 110334528(Snu13)
RNO: 100359574 102552503 300092(Nhp2l1)
MUN: 110554106(Snu13)
CGE: 100771351 113834620
NGI: 103743470(Snu13)
HGL: 101703114(Snu13)
CCAN: 109689387(Snu13)
OCU: 100351699(SNU13)
TUP: 102492648 102497810(SNU13)
CFA: 474484(SNU13)
VVP: 112934036(SNU13)
AML: 100478368(SNU13)
UMR: 103674077(SNU13)
UAH: 113241721(SNU13)
ORO: 101383074(NHP2L1)
ELK: 111157457
FCA: 101081647(SNU13)
PTG: 102961087(SNU13)
PPAD: 109265638(SNU13)
AJU: 106979937(SNU13)
BTA: 767931(SNU13)
BOM: 102276892(SNU13)
BIU: 109559866(SNU13)
BBUB: 102400154(SNU13)
CHX: 102168897(SNU13)
OAS: 101112386(SNU13) 105613621
SSC: 100155420(SNU13)
CFR: 102521603(SNU13)
CDK: 105091892(SNU13)
BACU: 103003350(SNU13) 103004724
LVE: 103082397 103089777(SNU13)
OOR: 101275200(NHP2L1)
DLE: 111186396(SNU13)
PCAD: 102977483(SNU13)
ECB: 100070695(SNU13)
EPZ: 103562701(SNU13)
EAI: 106848514(SNU13)
MYB: 102244468 102256910(SNU13)
MYD: 102756919(SNU13)
MNA: 107534975(SNU13)
HAI: 109377513(SNU13)
DRO: 112321729(SNU13)
PALE: 102889833(SNU13)
RAY: 107505582(SNU13) 107507484
MJV: 108399626(SNU13)
LAV: 100655775(SNU13)
TMU: 101361106
MDO: 100021588 100028876(SNU13)
SHR: 100924060(SNU13)
PCW: 110205847(SNU13)
OAA: 100076480(SNU13)
GGA: 417986(SNU13)
MGP: 100546935(SNU13)
CJO: 107313195(SNU13)
NMEL: 110392140(SNU13)
APLA: 106020692(SNU13)
ACYG: 106045249(SNU13)
TGU: 100221514(SNU13)
LSR: 110483117(SNU13)
SCAN: 103813303(SNU13)
GFR: 102039006(SNU13)
FAB: 101806665(SNU13)
PHI: 102106194(SNU13)
PMAJ: 107204597(SNU13)
CCAE: 111934460(SNU13)
CCW: 104692300 104696539(SNU13)
ETL: 114058053(SNU13)
FPG: 101923234(SNU13)
FCH: 102046835(SNU13)
EGZ: 104134256(NHP2L1)
NNI: 104021703(NHP2L1)
ACUN: 113488070(SNU13)
PADL: 103915793(NHP2L1)
AAM: 106488871(SNU13)
ASN: 102368710(SNU13)
AMJ: 102558074(SNU13)
PSS: 102445152(SNU13)
CMY: 102946830(SNU13)
CPIC: 101945752(SNU13)
ACS: 100552266(snu13)
PVT: 110076064(SNU13)
PBI: 103054140(SNU13)
PMUR: 107285352(SNU13) 107301260
TSR: 106537810(SNU13)
PMUA: 114606006(SNU13)
GJA: 107117165(SNU13)
XLA: 380416(snu13.L) 495253(snu13.S)
XTR: 394590(snu13)
NPR: 108793020(SNU13)
DRE: 321114(snu13b) 393282(snu13a)
SRX: 107726815 107745681 107753298
SANH: 107675984 107684777 107695558
SGH: 107569189 107573053 107596616
IPU: 100528760(nh2l1) 101154660 108273948
PHYP: 113527529 113528352
AMEX: 103032763 103040872
EEE: 113569909 113584634
TRU: 101079948(snu13)
TNG: GSTEN00024151G001
LCO: 104918064(snu13)
NCC: 104958529(nhp2l1)
MZE: 101484437(snu13)
ONL: 100708852(snu13)
OLA: 101175271(snu13)
XMA: 102217383(snu13)
XCO: 114151423(snu13)
PRET: 103481973(snu13)
CVG: 107099871(snu13)
NFU: 107388175(snu13)
KMR: 108237140(snu13)
ALIM: 106531816(snu13)
AOCE: 111575377(snu13)
CSEM: 103382356(snu13)
POV: 109626638(snu13)
LCF: 108880776(snu13)
SDU: 111220234(snu13)
SLAL: 111672008(snu13)
HCQ: 109516574(snu13)
BPEC: 110159671(snu13)
MALB: 109969181(snu13)
SASA: 106589607(NH2L1) 106601742(NH2L1) 106606728 106609990
OTW: 112224484 112259556
SALP: 111967958 111977412 112080026
ELS: 105026144 105031476
SFM: 108939966(snu13)
PKI: 111853876 111856000
LCM: 102367071(SNU13)
CMK: 103178742(snu13)
RTP: 109913147(snu13)
BFO: BRAFLDRAFT_172247 BRAFLDRAFT_68109
CIN: 100182620
SPU: 115917922 587294
APLC: 110981887
SKO: 100371232
DME: Dmel_CG3949(hoip)
DER: 6540856
DSE: 6611840
DSI: Dsimw501_GD23622(Dsim_GD23622)
DYA: Dyak_GE18862
DAN: 6505442
DSR: 110177893
DPO: Dpse_GA17798
DPE: 6589887
DMN: 108163004
DWI: 6643749
DGR: Dgri_GH25137
DMO: Dmoj_GI20000
DAZ: 108611567
DNV: 108650002
DHE: 111594661
DVI: 6628804
MDE: 101888628
LCQ: 111680289
AGA: AgaP_AGAP008163
AAG: 5577910
AALB: 109429944
CQU: CpipJ_CPIJ005818
AME: 102655272
BIM: 105681017
BTER: 105666221
CCAL: 108631296
OBB: 114881728
SOC: 105205201
MPHA: 105837492
AEC: 105152628
ACEP: 105621762
PBAR: 105426119
VEM: 105566113
HST: 105182443 105183270
DQU: 106743338 106749246
CFO: 105249083
LHU: 105671353
PGC: 109851868
OBO: 105279548 113562516
PCF: 106793426
NVI: 103317617
CSOL: 105366974
MDL: 103569123
TCA: 664143
DPA: 109544783
ATD: 109604783
NVL: 108566492
BMOR: 692972(RpL7Ae)
BMAN: 114251531
PMAC: 106720749
PRAP: 111003458
HAW: 110375590
TNL: 113497867
PXY: 105383607
API: 100164236
DNX: 107172967 107172968
AGS: 114124109 114124118 114130619
RMD: 113547919
BTAB: 109041454
CLEC: 106663036
PHU: Phum_PHUM044570
ZNE: 110837339
FCD: 110842222
DPX: DAPPUDRAFT_231249
PVM: 113828659
ISC: IscW_ISCW019216
TUT: 107368451 107368532
DPTE: 113788603 113790038
CSCU: 111625735
PTEP: 107445859
CEL: CELE_M28.5(M28.5)
CBR: CBG03041
BMY: Bm1_42550
LOA: LOAG_03139
NAI: NECAME_02955
HRO: HELRODRAFT_184927
PCAN: 112575648
CRG: 105348805 105348815
MYI: 110453768
OBI: 106882140
LAK: 106156251
SMM: Smp_104660
OVI: T265_10578
NVE: 5508307
EPA: 110240820
AMIL: 114956675
PDAM: 113679330
SPIS: 111321604
DGT: 114541724
HMG: 100207378
TAD: TRIADDRAFT_51156
AQU: 100636318
ATH: AT4G12600 AT4G22380 AT5G20160
ALY: 9303844 9307995 9310854
CRB: 17878025 17881471 17882712 17883796
CSAT: 104706364 104707559 104717379 104718074 104722799 104731269 104736090 104737274 104770398
EUS: EUTSA_v10015017mg EUTSA_v10026563mg EUTSA_v10029067mg
BRP: 103839875 103856428 103858643 103860007 103868150
BNA: 106353919 106366115 106376528 106381583 106381595 106386705 106434620 106436275 106436276 106437622 106438771
BOE: 106307731 106315593 106316951 106327610 106329291 106331832
RSZ: 108819941 108826162 108826478 108835190 108844648 108846640 108846641 108846642
THJ: 104799743 104811033 104815102
CPAP: 110812736
CIT: 102610748 102625613
CIC: CICLE_v10009899mg CICLE_v10017168mg
TCC: 18588745
GRA: 105774371 105792865
GHI: 107901289 107909217 107962625
GAB: 108468101 108484536
DZI: 111300316 111310015
EGR: 104436675 104438520
GMX: 100305817 100527424 100798912 100817627
GSJ: 114374581 114383413 114392703 114396822
PVU: PHAVU_008G269000g
VRA: 106764051 106767391
VAR: 108336855 108337239
VUN: 114177103 114193466
CCAJ: 109790111 109791563 109812106
MTR: MTR_0011s0330 MTR_4g114330
CAM: 101500272 101514303
LJA: Lj0g3v0120989.1(Lj0g3v0120989.1) Lj1g3v0672680.1(Lj1g3v0672680.1)
AIP: 107620074
LANG: 109337302 109351395
FVE: 101301807
RCN: 112188400
PPER: 18769693 18777451
PMUM: 103336611 103341057
PAVI: 110748682 110758072 110759974 110761390
MDM: 103415747 103448224
PXB: 103936719 103958302
ZJU: 107404143
CSV: 101222939
CMO: 103487460 103497328
MCHA: 111012970 111014423
CMAX: 111465723 111485307 111493643 111495275
CMOS: 111433008 111444377 111450370 111461690
CPEP: 111780250 111785309 111785654 111792357 111798153 111805974
RCU: 8275870
JCU: 105639351
HBR: 110642912 110651533
MESC: 110616824 110630990
POP: 18104497 7467445
PEU: 105109483 105120061 105135151
JRE: 109006247 109010760 109019399
QSU: 111989045 111992936 112008991
VVI: 100241010 100252442
SLY: 101244799 101267649
SPEN: 107029401 107029539
SOT: 102583911 102588744
CANN: 107845965 107845971 107854203
NTA: 107788355 107801239 107821552 107829442
NSY: 104222431 104223231 104246088
NTO: 104097991 104112409
NAU: 109207016 109208816
INI: 109157718 109180947
SIND: 105170591
OEU: 111365845 111366236 111368943 111379025
HAN: 110877334 110886700 110893855
LSV: 111887214 111887406
CCAV: 112506706 112516710
DCR: 108197510 108203752 108206036 108214876 108226782
BVG: 104902053
SOE: 110795007 110797033
CQI: 110707934 110725655
NNU: 104597067 104601142
PSOM: 113307908 113313913 113323766
OSA: 4332209 4348007
DOSA: Os03t0241200-00(Os03g0241200) Os10t0124000-01(Os10g0124000)
OBR: 102722656
BDI: 100824839 100844088
ATS: 109740262(LOC109740262)
SBI: 8078864 8085664
ZMA: 100282785 100303837 103630317 103633413 103652757 109944832 109945944
SITA: 101781743
PDA: 103704260 103707630 113462460
EGU: 105055906 105058176
MUS: 103993810 103999471
DCT: 110093060
PEQ: 110026277 110027371
AOF: 109828628 109833167 109835286
ATR: 18437624 18440993
SMO: SELMODRAFT_159569 SELMODRAFT_77105 SELMODRAFT_83348
PPP: 112274836 112291118 112294073 112294080
MNG: MNEG_1179
CSL: COCSUDRAFT_24812
CVR: CHLNCDRAFT_31020
APRO: F751_2002
OLU: OSTLU_41236
OTA: OT_ostta02g01210
BPG: Bathy05g04480
MIS: MICPUN_89886
MPP: MICPUCDRAFT_35474
CME: CYME_CMP335C
GSL: Gasu_50730
CCP: CHC_T00010068001
SCE: YEL026W(SNU13)
AGO: AGOS_AEL070W
ERC: Ecym_1375
KLA: KLLA0_E22529g
KMX: KLMA_10721(SNU13)
LTH: KLTH0H14410g
VPO: Kpol_1067p31
ZRO: ZYRO0E03058g
CGR: CAGL0I03234g
NCS: NCAS_0A08350(NCAS0A08350)
NDI: NDAI_0G04810(NDAI0G04810)
TPF: TPHA_0B04030(TPHA0B04030)
TBL: TBLA_0D01990(TBLA0D01990)
TDL: TDEL_0B05380(TDEL0B05380)
KAF: KAFR_0F01320(KAFR0F01320)
PPA: PAS_chr3_1041
DHA: DEHA2F11616g
PIC: PICST_53138
PGU: PGUG_00866
SPAA: SPAPADRAFT_62238
LEL: LELG_02649
CAL: CAALFM_C304380CA(CaO19.5885)
CTP: CTRG_02311
COT: CORT_0C03040
CDU: CD36_84320
CTEN: CANTEDRAFT_96961
YLI: YALI0F24497g
CLU: CLUG_05499
CLUS: A9F13_16g00946
CAUR: CJI97_005592
SLB: AWJ20_3897(SNU13)
PKZ: C5L36_0D00950
NCR: NCU01331
NTE: NEUTE1DRAFT115856(NEUTE1DRAFT_115856)
SMP: SMAC_04021
PAN: PODANSg8082
TTT: THITE_2106775
MTM: MYCTH_2300637
CTHR: CTHT_0066810
MGR: MGG_02467
TMN: UCRPA7_3452
SSCK: SPSK_03688
FGR: FGSG_10001
FPU: FPSE_03899
FVR: FVEG_02777
FOX: FOXG_05353
NHE: NECHADRAFT_69255
TRE: TRIREDRAFT_104595
TRR: M419DRAFT_127441
MAW: MAC_03411
MAJ: MAA_02009
CMT: CCM_00301
PLJ: VFPFJ_04105
VAL: VDBG_00634
VDA: VDAG_00247
CFJ: CFIO01_02392
SAPO: SAPIO_CDS10823
ELA: UCREL1_7355
PFY: PFICI_07133
SSL: SS1G_10239
BFU: BCIN_14g02020
MBE: MBM_04703
PSCO: LY89DRAFT_614677
GLZ: GLAREA_03367
ANI: AN1319.2
AFM: AFUA_2G05950
ACT: ACLA_068380
NFI: NFIA_082670
AOR: AO090001000712
ANG: ANI_1_1980024(An02g14340)
AFV: AFLA_130100
PCS: Pc20g11410 Pc21g13030 Pc21g22190
PDP: PDIP_65220
TMF: PMAA_004830 PMAA_044800
CIM: CIMG_00710
CPW: CPC735_055690
PBL: PAAG_00775
PBN: PADG_04054
URE: UREG_00700
ABE: ARB_02998
TVE: TRV_01714
AJE: HCAG_04171
BGH: BDBG_01792
PNO: SNOG_10693(SNOG_10692)
PTE: PTT_16812
BZE: COCCADRAFT_99569
BSC: COCSADRAFT_99251
BOR: COCMIDRAFT_23431
AALT: CC77DRAFT_941527
ZTR: MYCGRDRAFT_75672
PFJ: MYCFIDRAFT_47812
BCOM: BAUCODRAFT_31133
NPA: UCRNP2_4477 UCRNP2_9048
TML: GSTUM_00010439001
SPO: SPAC607.03c(snu13)
CNE: CNG01500
CNB: CNBG3280
CGI: CGB_G4610W
TMS: TREMEDRAFT_71963
TASA: A1Q1_02311 A1Q1_02315
PPL: POSPLDRAFT_125838
DSQ: DICSQDRAFT_132256
SHS: STEHIDRAFT_137546
HIR: HETIRDRAFT_414960
PSQ: PUNSTDRAFT_121740
ADL: AURDEDRAFT_182233
FME: FOMMEDRAFT_83902
GTR: GLOTRDRAFT_136808
LBC: LACBIDRAFT_176816
MRR: Moror_841
CCI: CC1G_01038
SCM: SCHCODRAFT_66058
CPUT: CONPUDRAFT_117225
WSE: WALSEDRAFT_61417
WIC: J056_002562
UMA: UMAG_06360
PFP: PFL1_04637
MGL: MGL_0793
MRT: MRET_0023
MSYM: MSY001_2144
PGR: PGTG_02868
MLR: MELLADRAFT_109067
ECU: ECU07_0460
EIN: Eint_070400
EHE: EHEL_070430
ERO: EROM_070410
NCE: NCER_101542
MBR: MONBRDRAFT_33344
SRE: PTSG_07597
DDI: DDB_G0282243(nhp2l1)
DPP: DICPUDRAFT_150645
DFA: DFA_07073(nhp2l1)
EHI: EHI_053440(59.t00026) EHI_104600(415.t00007)
EDI: EDI_058220 EDI_305420
EIV: EIN_497880
ACAN: ACA1_223050
PFA: PF3D7_1123900
PYO: PY17X_0926400
PCB: PCHAS_092000(PC000674.04.0)
PBE: PBANKA_0924400
PKN: PKH_092140
PVX: PVX_091810
PCY: PCYB_092990
TAN: TA11075
TPV: TP01_0589 TP04_0892
TOT: TOT_040000050
BEQ: BEWA_011460
BBO: BBOV_III009740(17.m07845)
BMIC: BMR1_01G01580
CPV: cgd6_3850
CHO: Chro.60440
TGO: TGME49_236580
TET: TTHERM_00325650 TTHERM_00628709
PTM: GSPATT00004508001 GSPATT00006003001 GSPATT00010898001 GSPATT00019210001
SMIN: v1.2.021437.t1(symbB.v1.2.021437.t1)
PTI: PHATRDRAFT_9983
FCY: FRACYDRAFT_187183
TPS: THAPSDRAFT_28570(L7Ae)
NGD: NGA_0448500(SNU13)
AAF: AURANDRAFT_53454
PIF: PITG_19178
PSOJ: PHYSODRAFT_284090
SPAR: SPRG_04028
EHX: EMIHUDRAFT_310487 EMIHUDRAFT_460589
GTT: GUITHDRAFT_105315 GUITHDRAFT_98671(SNU13)
TBR: Tb09.160.3670
TBG: TbgDal_IX2720
TCR: 508277.120 509943.30
LMA: LMJF_15_1470
LIF: LINJ_15_1530
LDO: LDBPK_151530
LMI: LMXM_15_1470
LBZ: LBRM_15_1470
LPAN: LPMP_151430
NGR: NAEGRDRAFT_71325
TVA: TVAG_282030
GLA: GL50803_11287 GL50803_2825
 » show all
Reference
  Authors
Dobbyn HC, McEwan PA, Krause A, Novak-Frazer L, Bella J, O'Keefe RT
  Title
Analysis of pre-mRNA and pre-rRNA processing factor Snu13p structure and mutants.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 360:857-62 (2007)
DOI:10.1016/j.bbrc.2007.06.163
  Sequence
[sce:YEL026W]
Reference
  Authors
Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Luhrmann R, Carlomagno T, Wahl MC
  Title
Binding of the human Prp31 Nop domain to a composite RNA-protein platform in U4 snRNP.
  Journal
Science 316:115-20 (2007)
DOI:10.1126/science.1137924
  Sequence
[hsa:4809]

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (3)   
   COG (1)   
Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Gene (7954)   
   KEGG GENES (735)   
   KEGG MGENES (176)   
   RefGene (7034)   
   OC (9)   
Protein sequence (415)   
   UniProt (394)   
   SWISS-PROT (21)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (8379)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system