KEGG   ORTHOLOGY: K12878
Entry
K12878                      KO                                     

Name
THOC1
Definition
THO complex subunit 1
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
   03041 Spliceosome
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    TREX complex
     K12878  THOC1; THO complex subunit 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
Other DBs
TC: 3.A.22.1
Genes
HSA: 9984(THOC1)
PTR: 455324(THOC1)
PPS: 100975888(THOC1)
GGO: 101144825(THOC1)
PON: 100431839(THOC1)
NLE: 100580031(THOC1)
MCC: 697954(THOC1)
MCF: 101864817(THOC1)
CSAB: 103222672(THOC1)
RRO: 104655464(THOC1)
RBB: 108530563(THOC1)
CJC: 100393939(THOC1)
SBQ: 101052441(THOC1)
MMU: 225160(Thoc1)
MCAL: 110284475(Thoc1)
MPAH: 110333130(Thoc1)
RNO: 291797(Thoc1)
MUN: 110564214(Thoc1)
CGE: 100758451 100770844(Thoc1)
NGI: 103728975(Thoc1)
HGL: 101719619(Thoc1)
CCAN: 109689992(Thoc1)
OCU: 100350164(THOC1)
TUP: 102468042(THOC1)
CFA: 490529(THOC1)
VVP: 112925738(THOC1)
AML: 100473279(THOC1)
UMR: 103662831(THOC1)
UAH: 113253264(THOC1)
ORO: 101385430(THOC1)
ELK: 111142540
FCA: 101094299(THOC1)
PTG: 102963057(THOC1)
PPAD: 109248561(THOC1)
AJU: 106970028(THOC1)
BTA: 100138748(THOC1)
BOM: 102284986(THOC1)
BIU: 109577785(THOC1)
BBUB: 102400748(THOC1)
CHX: 102168224(THOC1)
OAS: 101121992(THOC1)
SSC: 100625217(THOC1)
CFR: 102509483(THOC1)
CDK: 105086241(THOC1)
BACU: 103004761(THOC1)
LVE: 103083639(THOC1)
OOR: 101279647(THOC1)
DLE: 111181450(THOC1)
PCAD: 102988826(THOC1)
ECB: 100051155(THOC1)
EPZ: 103562847(THOC1)
EAI: 106845105(THOC1)
MYB: 102239888(THOC1) 102246100
MYD: 102756955(THOC1)
MNA: 107535904(THOC1)
HAI: 109388823(THOC1)
DRO: 112322924(THOC1)
PALE: 102880532(THOC1)
RAY: 107520582(THOC1)
MJV: 108403940 108408174(THOC1)
LAV: 100658183(THOC1)
TMU: 101341542
MDO: 100013574(THOC1)
SHR: 100914787(THOC1)
PCW: 110197065(THOC1)
OAA: 100092994(THOC1)
GGA: 421062(THOC1)
MGP: 100538518(THOC1)
CJO: 107310040(THOC1)
NMEL: 110393618(THOC1)
APLA: 101801491(THOC1)
ACYG: 106037593(THOC1)
TGU: 100220228(THOC1)
LSR: 110482377(THOC1)
SCAN: 103815984(THOC1)
GFR: 102037359(THOC1)
FAB: 101805719(THOC1)
PHI: 102101441(THOC1)
PMAJ: 107199143(THOC1)
CCAE: 111924951(THOC1)
CCW: 104687307(THOC1)
ETL: 114056503(THOC1)
FPG: 101916897(THOC1)
FCH: 102052799(THOC1)
CLV: 102097182(THOC1)
EGZ: 104134147(THOC1)
NNI: 104018146(THOC1)
ACUN: 113476115(THOC1)
PADL: 103923219(THOC1)
AAM: 106484722(THOC1)
ASN: 102377036(THOC1)
AMJ: 102559048(THOC1)
PSS: 102447403(THOC1)
CMY: 102938419(THOC1)
CPIC: 101948264(THOC1)
ACS: 100558864(thoc1)
PVT: 110079446(THOC1)
PBI: 103059838(THOC1)
PMUR: 107285296(THOC1)
PMUA: 114600699(THOC1)
GJA: 107120575(THOC1)
XLA: 398505(thoc1.L)
XTR: 733546(thoc1)
NPR: 108797183(THOC1)
DRE: 373077(thoc1)
SRX: 107711694 107727519
SANH: 107660399 107671701
SGH: 107567873(thoc1) 107576157
CCAR: 109107610 109109571
IPU: 108267256(thoc1)
PHYP: 113524108(thoc1)
AMEX: 103041587(thoc1)
EEE: 113588250(thoc1)
TRU: 101070705(thoc1)
TNG: GSTEN00016123G001
LCO: 104917745(thoc1)
NCC: 104942422(thoc1)
MZE: 101477998(thoc1)
ONL: 100697306(thoc1)
OLA: 101157731(thoc1)
XMA: 102235698(thoc1)
XCO: 114146430(thoc1)
PRET: 103479723(thoc1)
CVG: 107081716(thoc1)
NFU: 107383842(thoc1)
KMR: 108241708(thoc1)
ALIM: 106533150(thoc1)
AOCE: 111585718(thoc1)
CSEM: 103396391(thoc1)
POV: 109642619(thoc1)
LCF: 108883338(thoc1)
SDU: 111231148(thoc1)
SLAL: 111653277(thoc1)
HCQ: 109521248(thoc1)
BPEC: 110169988(thoc1)
MALB: 109955440(thoc1)
SASA: 106569323 106600433
OTW: 112226776(thoc1)
SALP: 111956559 111979124
ELS: 105019902(thoc1)
SFM: 108937477(thoc1)
PKI: 111845942(thoc1)
LCM: 102347083(THOC1)
CMK: 103183445(thoc1)
RTP: 109936536(thoc1)
BFO: BRAFLDRAFT_126015
CIN: 100179277
SPU: 589021
APLC: 110985710
SKO: 100367757
DME: Dmel_CG2031(Hpr1)
DER: 6552708
DSE: 6614034
DSI: Dsimw501_GD19579(Dsim_GD19579)
DYA: Dyak_GE24134
DAN: 6501415
DSR: 110190946
DPO: Dpse_GA15194
DPE: 6588208
DMN: 108156526 117187448
DWI: 6649814
DGR: Dgri_GH17514
DMO: Dmoj_GI10383
DAZ: 108608867
DNV: 108655553
DHE: 111598713
DVI: 6629425
MDE: 101897929
LCQ: 111690872
AGA: AgaP_AGAP004070
AAG: 5580204
AALB: 109425308
CQU: CpipJ_CPIJ004005
AME: 409647
BIM: 100740929
BTER: 100649742
CCAL: 108625518
OBB: 114876994
SOC: 105196856
MPHA: 105836031
AEC: 105152883
ACEP: 105627456
PBAR: 105430904
VEM: 105565637
HST: 105186511
DQU: 106743222
CFO: 105254396
LHU: 105674727
PGC: 109856299
OBO: 105279508
PCF: 106788270
NVI: 100123388
CSOL: 105359322
MDL: 103572700 106693281
TCA: 658815
DPA: 109536923
ATD: 109604081
NVL: 108558138
BMOR: 101742757
BMAN: 114241392
PMAC: 106713738
PRAP: 111002124
HAW: 110372007
TNL: 113497534
PXY: 105398174
API: 100160269 100167909
DNX: 107166277
AGS: 114122363
RMD: 113548498
BTAB: 109044762
CLEC: 106671985
PHU: Phum_PHUM457770
ZNE: 110829409
FCD: 110850730
DPX: DAPPUDRAFT_226474
PVM: 113829099
ISC: IscW_ISCW016836
TUT: 107363259
DPTE: 113795573
CSCU: 111632541
PTEP: 107454495
CEL: CELE_T02H6.2(thoc-1)
CBR: CBG24217(Cbr-thoc-1)
BMY: Bm1_42335
LOA: LOAG_00915
NAI: NECAME_08287
TSP: Tsp_12746
HRO: HELRODRAFT_81226
LGI: LOTGIDRAFT_138363
PCAN: 112573295
CRG: 105338779
MYI: 110461533
LAK: 106171155
SMM: Smp_160600
SHX: MS3_04886
EGL: EGR_02666
NVE: 5502221
EPA: 110252215
ADF: 107328242 107342761
AMIL: 114968980
PDAM: 113686652
SPIS: 111340458
DGT: 114522865
HMG: 100209197
TAD: TRIADDRAFT_1612
AQU: 100637238
ATH: AT5G09860(THO1)
ALY: 9309496
CRB: 17883277
CSAT: 104708129 104734985 104769177
EUS: EUTSA_v10013059mg
BRP: 103850354
BNA: 106383003 106418721
BOE: 106320174
RSZ: 108842538
THJ: 104826748
CPAP: 110814881
CIT: 102612813
CIC: CICLE_v10000631mg
TCC: 18587092
GRA: 105780200
GHI: 107897015 107927603
GAB: 108460706
DZI: 111296365
EGR: 104445651
GMX: 100781333
GSJ: 114409476
PVU: PHAVU_005G004500g
VRA: 106762555
VAR: 108333895
VUN: 114188485
CCAJ: 109818744
CAM: 101513603
LJA: Lj0g3v0087829.1(Lj0g3v0087829.1)
ADU: 107486759
AIP: 107630030
LANG: 109334160
FVE: 101308506
RCN: 112174532
PPER: 18771779
PMUM: 103339041
PAVI: 110772734
MDM: 103453961
PXB: 103944397
CSV: 101216402
CMO: 103499294
MCHA: 111010121
CMAX: 111466514
CMOS: 111449893
CPEP: 111802273
RCU: 8283403
JCU: 105631259
HBR: 110666944
MESC: 110613578
POP: 7455804 7460257
PEU: 105122821 105132732
JRE: 108993471
QSU: 112017192 112018210 112040302 112040304
VVI: 100250474 100262610
SLY: 101245499
SPEN: 107007975
SOT: 102589544
CANN: 107839361
NTA: 107803158 107828687 107832705
NSY: 104222030
NTO: 104102721
NAU: 109212864
INI: 109148474
SIND: 105168045
OEU: 111394830
HAN: 110922195
LSV: 111900437
CCAV: 112521976
DCR: 108228155
BVG: 104898822
SOE: 110774872
CQI: 110694954 110713355
NNU: 104603927 104607737
PSOM: 113298264 113303278
OSA: 4331353
DOSA: Os03t0110400-01(Os03g0110400)
OBR: 102706637
BDI: 100832078
ATS: 109787591(LOC109787591)
SBI: 8078017
ZMA: 100304252
SITA: 101786851
PDA: 103712979
EGU: 105053713
MUS: 103972960
PEQ: 110023794
AOF: 109825643
ATR: 18437658
SMO: SELMODRAFT_135550 SELMODRAFT_96989
PPP: 112278897
VCN: VOLCADRAFT_104130
CSL: COCSUDRAFT_64866
CVR: CHLNCDRAFT_55304
APRO: F751_6053
OLU: OSTLU_14373
OTA: OT_ostta02g02920
MIS: MICPUN_88394
MPP: MICPUCDRAFT_42320
GSL: Gasu_31170
CCP: CHC_T00010279001
YLI: YALI0C21131g
SLB: AWJ20_3043
NCR: NCU07865
NTE: NEUTE1DRAFT80974(NEUTE1DRAFT_80974)
SMP: SMAC_02140
PAN: PODANSg5525
TTT: THITE_2120207
MTM: MYCTH_2303495
CTHR: CTHT_0071520
MGR: MGG_06394
TMN: UCRPA7_1671
SSCK: SPSK_03022
FGR: FGSG_05424
FPU: FPSE_03583
FVR: FVEG_07103
FOX: FOXG_09474
NHE: NECHADRAFT_46674
TRE: TRIREDRAFT_54408
TRR: M419DRAFT_11771
MAW: MAC_08338
MAJ: MAA_03586
CMT: CCM_07411
PLJ: VFPFJ_01151
VAL: VDBG_07013
VDA: VDAG_06655
CFJ: CFIO01_03168
SAPO: SAPIO_CDS0181
ELA: UCREL1_4512
PFY: PFICI_11764
SSL: SS1G_00664
BFU: BCIN_03g03120
MBE: MBM_03643
PSCO: LY89DRAFT_611898
GLZ: GLAREA_00896
ANI: AN7013.2
AFM: AFUA_4G04330
ACT: ACLA_054040
NFI: NFIA_029030
AOR: AO090206000059
ANG: ANI_1_1042124(An14g00510)
AFV: AFLA_114980
PCS: Pc13g06570
PDP: PDIP_15630
TMF: PMAA_085640
CIM: CIMG_08634
CPW: CPC735_062420
PBL: PAAG_06335
PBN: PADG_01235
URE: UREG_02634
ABE: ARB_03584
TVE: TRV_00269
AJE: HCAG_07756
BGH: BDBG_09261
PNO: SNOG_08238
PTE: PTT_08697
BZE: COCCADRAFT_33004
BSC: COCSADRAFT_174485
BOR: COCMIDRAFT_102671
AALT: CC77DRAFT_1034272
ZTR: MYCGRDRAFT_70063
PFJ: MYCFIDRAFT_42306
BCOM: BAUCODRAFT_41548
NPA: UCRNP2_4126
TML: GSTUM_00004452001
SPO: SPCP25A2.03
CNE: CNG03370
CNB: CNBG1380
CGI: CGB_G2020C
TMS: TREMEDRAFT_28261
TASA: A1Q1_07504
DSQ: DICSQDRAFT_41994
PCO: PHACADRAFT_248470
SHS: STEHIDRAFT_123683
HIR: HETIRDRAFT_308152
PSQ: PUNSTDRAFT_97766
ADL: AURDEDRAFT_156143
FME: FOMMEDRAFT_114065
GTR: GLOTRDRAFT_118437
LBC: LACBIDRAFT_291759
MRR: Moror_1696
WSE: WALSEDRAFT_62616
WIC: J056_002204
UMA: UMAG_04563
PFP: PFL1_01432
MGL: MGL_3467
MRT: MRET_2101
MSYM: MSY001_1660
PGR: PGTG_07648
MLR: MELLADRAFT_118113
SRE: PTSG_04478
DDI: DDB_G0275717(thoc1)
DPP: DICPUDRAFT_29296
DFA: DFA_06354(thoc1)
ACAN: ACA1_210210 ACA1_249770 ACA1_327400
PTM: GSPATT00008233001 GSPATT00011901001
PTI: PHATRDRAFT_47759
TPS: THAPSDRAFT_9591
AAF: AURANDRAFT_67353 AURANDRAFT_72585
PIF: PITG_07047
PSOJ: PHYSODRAFT_540491
SPAR: SPRG_04163
EHX: EMIHUDRAFT_453346
GTT: GUITHDRAFT_139464
NGR: NAEGRDRAFT_61424
 » show all
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:9984]

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (3)   
   TC (1)   
Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Gene (2912)   
   KEGG GENES (482)   
   KEGG MGENES (417)   
   RefGene (2006)   
   OC (7)   
Protein sequence (239)   
   UniProt (235)   
   SWISS-PROT (4)   
Literature (1)   
   PubMed (1)   
All databases (3160)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system