KEGG   ORTHOLOGY: K12881
Entry
K12881                      KO                                     

Name
THOC4, ALY
Definition
THO complex subunit 4
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko03040  Spliceosome
ko05168  Herpes simplex virus 1 infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05168 Herpes simplex virus 1 infection
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
   03041 Spliceosome
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
    TREX complex
     K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
Genes
HSA: 10189(ALYREF)
PTR: 744649(ALYREF)
PPS: 100982290(ALYREF)
GGO: 101140258(ALYREF)
PON: 100450309(ALYREF)
NLE: 100598331(ALYREF)
MCC: 714852(ALYREF)
MCF: 102137569(ALYREF)
CSAB: 103243737(ALYREF)
RRO: 104655016(ALYREF)
RBB: 108534261(ALYREF)
SBQ: 101047063(ALYREF)
MMU: 100043292(Gm4340) 21681(Alyref) 56009(Alyref2)
RNO: 690585(Alyref)
MUN: 110548822(Alyref)
CGE: 100756310(Alyref)
NGI: 103730234(Alyref)
HGL: 101714006(Alyref)
CCAN: 109702811(Alyref)
TUP: 102486459 102496357(ALYREF)
CFA: 607948(ALYREF)
VVP: 112920580(ALYREF)
AML: 100470742(ALYREF)
UMR: 103666001(ALYREF)
UAH: 113244498(ALYREF)
ORO: 101378175(ALYREF)
ELK: 111160380
FCA: 101100167(ALYREF)
PTG: 102953202(ALYREF)
PPAD: 109276767(ALYREF)
AJU: 106986304(ALYREF)
BTA: 537706(ALYREF)
BOM: 102288412(ALYREF)
BIU: 109574142(ALYREF)
BBUB: 102412833(ALYREF)
CHX: 102180256(ALYREF)
OAS: 105606265(ALYREF)
SSC: 100620496(ALYREF)
CFR: 102507187(ALYREF)
CDK: 105106390(ALYREF)
BACU: 103018146(ALYREF)
LVE: 103077382(ALYREF)
OOR: 101275531(ALYREF)
DLE: 111182691(ALYREF)
PCAD: 102993393(ALYREF)
ECB: 106782613(ALYREF)
EPZ: 103551119(ALYREF)
EAI: 106845059(ALYREF)
MYD: 102758859(ALYREF) 102775153
MNA: 107539043(ALYREF)
HAI: 109393013(ALYREF)
DRO: 112298936(ALYREF)
PALE: 102888897(ALYREF)
RAY: 107520286(ALYREF)
MJV: 108395247(ALYREF)
LAV: 100675595(ALYREF)
TMU: 101340286
MDO: 100025556(ALYREF)
SHR: 100924980 100925707(ALYREF)
PCW: 110218276(ALYREF)
OAA: 114808830(ALYREF)
GGA: 769169(ALYREF)
MGP: 100545751(ALYREF)
CJO: 107322159(ALYREF)
NMEL: 110407220(ALYREF)
ACYG: 106046757(ALYREF)
TGU: 100190053(ALYREF)
LSR: 110472418(ALYREF)
GFR: 102032472(ALYREF)
FAB: 101820634(ALYREF)
PHI: 102105761(ALYREF)
PMAJ: 107212422(ALYREF)
CCAE: 111937592(ALYREF)
CCW: 104698227(ALYREF)
ETL: 114060368(ALYREF)
FPG: 101915709(ALYREF)
FCH: 102053625(ALYREF)
CLV: 102093451(ALYREF)
EGZ: 104131198(ALYREF)
NNI: 104018627(ALYREF)
ACUN: 113486983(ALYREF)
PADL: 103917461(ALYREF)
AAM: 106487100(ALYREF)
ASN: 102383182(ALYREF)
AMJ: 102562580(ALYREF)
PSS: 102456370(ALYREF)
CMY: 102932069(ALYREF)
CPIC: 101935406(ALYREF)
ACS: 100552907(alyref)
PVT: 110090589(ALYREF)
PBI: 103064440(ALYREF)
PMUR: 107295823(ALYREF)
TSR: 106544966(ALYREF)
PMUA: 114589524(ALYREF)
GJA: 107118132(ALYREF)
XLA: 444644(alyref-b) 734364(alyref.L)
XTR: 549781(alyref)
NPR: 108784729(ALYREF)
DRE: 560127(alyref)
SGH: 107548725(alyref) 107558876
CCAR: 109088985
IPU: 108279173(alyref)
PHYP: 113528444(alyref)
AMEX: 103044901(alyref)
EEE: 113571439(alyref)
LCO: 104920400 104929524(alyref)
NCC: 104948528(alyref) 104956261
MZE: 101469959 101478884(alyref)
ONL: 100707310(alyref) 100709252
PRET: 103463390(alyref) 103469127
CVG: 107085474(alyref) 107087450
NFU: 107376695(alyref) 107396438
KMR: 108229566 108243004(alyref)
ALIM: 106516496(alyref) 106526928
AOCE: 111565382(alyref) 111575058
CSEM: 103384291(alyref) 103393202
POV: 109627572 109639522(alyref)
LCF: 108881046(alyref) 108884547
SDU: 111217935 111230306(alyref)
SLAL: 111647521(alyref) 111660396
HCQ: 109514870(alyref) 109527530
BPEC: 110158204(alyref) 110173859
MALB: 109956830 109958939(alyref)
LCM: 102357835(ALYREF)
CMK: 103175595(alyref)
RTP: 109915933(alyref)
CIN: 100175132
APLC: 110980896
SKO: 100375459
DME: Dmel_CG1101(Ref1) Dmel_CG17031(Ref2)
DSI: Dsimw501_GD19510(Dsim_GD19510) Dsimw501_GD22109(Dsim_GD22109)
DSR: 110177160
DPE: 6594292
DMN: 108156591
DWI: 6650510
DAZ: 108620728
DNV: 108656108
DHE: 111603566
MDE: 101895626
LCQ: 111680254
AAG: 5566793
AME: 725396
BIM: 100749627
BTER: 100645586
CCAL: 108631713
OBB: 114883186
SOC: 105197072
MPHA: 105834849
AEC: 105153739
ACEP: 105622645
PBAR: 105428676
VEM: 105563508
HST: 105186754
DQU: 106748787
CFO: 105251186
LHU: 105677900
PGC: 109854262
OBO: 105278689
PCF: 106787919
NVI: 100170121(Thoc4) 103315318
MDL: 103579611
TCA: 660256
DPA: 109539320
BMOR: 733049
BMAN: 114249920
PMAC: 106717812
HAW: 110372825
TNL: 113499040
PXY: 105387480
API: 100165216
DNX: 107162965
AGS: 114120519
RMD: 113549393
BTAB: 109037371
CLEC: 106674272
ZNE: 110839222
FCD: 110843793
PVM: 113807594
TUT: 107368068
CSCU: 111636389
CEL: CELE_C01F6.5(aly-1) CELE_C02B10.4(C02B10.4) CELE_F23B2.6(aly-2) CELE_M18.7(aly-3)
CBR: CBG06234(Cbr-aly-3) CBG19980 CBG21775(Cbr-aly-1) CBG21776
TSP: Tsp_00653
PCAN: 112571354
CRG: 105322560
MYI: 110451214
OBI: 106867362
LAK: 106159727
SHX: MS3_04179
EGL: EGR_06901
NVE: 5505607
EPA: 110239951
ADF: 107356199
AMIL: 114956659
PDAM: 113671482
SPIS: 111337166
DGT: 114519567
HMG: 100201462
AQU: 100632867
LJA: Lj0g3v0358519.1(Lj0g3v0358519.1) Lj0g3v0358519.2(Lj0g3v0358519.2) Lj1g3v3218060.1(Lj1g3v3218060.1) Lj1g3v3218060.2(Lj1g3v3218060.2) Lj3g3v3177300.1(Lj3g3v3177300.1) Lj6g3v0423730.1(Lj6g3v0423730.1) Lj6g3v0423730.2(Lj6g3v0423730.2)
DOSA: Os03t0278300-01(Os03g0278300) Os06t0256200-01(Os06g0256200) Os07t0237100-00(Os07g0237100) Os08t0427900-01(Os08g0427900) Os11t0100200-00(Os11g0100200) Os12t0100100-01(Os12g0100100)
ATS: 109745291(LOC109745291) 109755644(LOC109755644) 109757782(LOC109757782) 109767624(LOC109767624) 109769408(LOC109769408) 109787643(LOC109787643)
ZMA: 100193488(cl8663_2a) 100272743(si946052g10b) 100278324 100279524 100280157 100280336
CRE: CHLREDRAFT_168261(REF1)
SCE: YDR381W(YRA1)
KMX: KLMA_20594(YRA1)
NCS: NCAS_0A11840(NCAS0A11840)
NDI: NDAI_0A04440(NDAI0A04440)
TPF: TPHA_0E01590(TPHA0E01590) TPHA_0J02700(TPHA0J02700)
TBL: TBLA_0A02650(TBLA0A02650) TBLA_0A06405(TBLA0A06405)
TDL: TDEL_0A03220(TDEL0A03220)
KAF: KAFR_0E03720(KAFR0E03720)
NTE: NEUTE1DRAFT123085(NEUTE1DRAFT_123085) NEUTE1DRAFT90482(NEUTE1DRAFT_90482)
ANG: ANI_1_730124(An14g05300)
CIM: CIMG_09786 CIMG_11845(CIMG06815)
TVE: TRV_03404
PTE: PTT_00586
ABP: AGABI1DRAFT115275(AGABI1DRAFT_115275) AGABI1DRAFT115306(AGABI1DRAFT_115306) AGABI1DRAFT115612(AGABI1DRAFT_115612)
ABV: AGABI2DRAFT194123(AGABI2DRAFT_194123) AGABI2DRAFT194237(AGABI2DRAFT_194237) AGABI2DRAFT194268(AGABI2DRAFT_194268)
MGL: MGL_0518
MRT: MRET_2346
DFA: DFA_04683
TAN: TA14065
TPV: TP02_0067
SPAR: SPRG_10255
 » show all
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
DOI:10.1038/35098106
  Sequence
[hsa:10189]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:10189]
Reference
PMID:9952027
  Authors
Wichmann I, Garcia-Lozano JR, Respaldiza N, Gonzalez-Escribano MF, Nunez-Roldan A
  Title
Autoantibodies to transcriptional regulation proteins DEK and ALY in a patient with systemic lupus erythematosus.
  Journal
Hum Immunol 60:57-62 (1999)
DOI:10.1016/S0198-8859(98)00085-8
  Sequence
[hsa:10189]

DBGET integrated database retrieval system