KEGG   ORTHOLOGY: K13171
Entry
K13171                      KO                                     

Name
SRRM1, SRM160
Definition
serine/arginine repetitive matrix protein 1
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
   03015 mRNA surveillance pathway
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
   03041 Spliceosome
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   SR-related proteins
    K13171  SRRM1, SRM160; serine/arginine repetitive matrix protein 1
Other DBs
TC: 3.A.18.1
Genes
HSA: 10250(SRRM1)
PTR: 456632(SRRM1)
PPS: 100993769(SRRM1)
GGO: 101136542(SRRM1) 115935567
PON: 100173713(SRRM1)
NLE: 100590655(SRRM1)
MCC: 712258(SRRM1)
MCF: 102142011(SRRM1)
CSAB: 103225367(SRRM1)
RRO: 104656104(SRRM1)
RBB: 108538442(SRRM1)
CJC: 100385227 100389073(SRRM1)
SBQ: 101031809(SRRM1)
MMU: 51796(Srrm1)
MCAL: 110292299(Srrm1)
MPAH: 110322803(Srrm1)
RNO: 313620(Srrm1)
MUN: 110545416(Srrm1)
CGE: 100757992(Srrm1)
NGI: 103725055(Srrm1)
HGL: 101724550(Srrm1)
CCAN: 109681243(Srrm1)
OCU: 100342974(SRRM1)
TUP: 102500097(SRRM1)
CFA: 478185(SRRM1)
VVP: 112930155(SRRM1)
AML: 100479398(SRRM1)
UAH: 113268496(SRRM1)
ORO: 101376302 101377555(SRRM1)
ELK: 111154653
FCA: 101095921 101098241(SRRM1)
PTG: 102959212(SRRM1)
PPAD: 109274321(SRRM1)
AJU: 106977633(SRRM1)
BTA: 784123(SRRM1)
BOM: 102286972(SRRM1)
BIU: 109573766(SRRM1)
BBUB: 102405070(SRRM1)
CHX: 102175909(SRRM1)
OAS: 101116288(SRRM1)
SSC: 100521629(SRRM1)
CFR: 102509535(SRRM1)
CDK: 105097274
BACU: 103011534
LVE: 103069469
OOR: 101286262(SRRM1)
DLE: 111163224(SRRM1)
PCAD: 102980515(SRRM1)
ECB: 100071467(SRRM1)
EPZ: 103559277(SRRM1)
EAI: 106839957(SRRM1)
MYB: 102246871(SRRM1)
MYD: 102765371(SRRM1)
MNA: 107541852(SRRM1)
HAI: 109386763(SRRM1)
DRO: 112299223(SRRM1)
PALE: 102885635(SRRM1)
RAY: 107499933(SRRM1)
MJV: 108384544(SRRM1)
LAV: 100670449(SRRM1)
TMU: 101351236
MDO: 100010857(SRRM1)
SHR: 100914811(SRRM1)
PCW: 110206082(SRRM1)
OAA: 100078424(SRRM1)
GGA: 428216(SRRM1)
MGP: 100546733(SRRM1)
CJO: 107323994(SRRM1)
NMEL: 110387512(SRRM1)
ACYG: 106038022(SRRM1)
TGU: 100219960(SRRM1)
LSR: 110472875(SRRM1)
SCAN: 103823569(SRRM1)
GFR: 102036553(SRRM1)
FAB: 101817622(SRRM1)
PHI: 102110416(SRRM1)
PMAJ: 107214199(SRRM1)
CCAE: 111939106(SRRM1)
CCW: 104694750(SRRM1)
ETL: 114067737(SRRM1)
FPG: 101923218(SRRM1)
FCH: 102055688(SRRM1)
CLV: 102084808(SRRM1)
EGZ: 104134960(SRRM1)
NNI: 104017853(SRRM1)
ACUN: 113488146(SRRM1)
PADL: 103923759(SRRM1)
AAM: 106493322(SRRM1)
ASN: 102379339(SRRM1)
AMJ: 102566147(SRRM1)
PSS: 102462939(SRRM1)
CMY: 102935033
CPIC: 101946604(SRRM1)
ACS: 100567164(srrm1)
PVT: 110082497(SRRM1)
PBI: 103051254(SRRM1)
PMUR: 107291300(SRRM1)
TSR: 106545810(SRRM1)
PMUA: 114601567(SRRM1)
GJA: 107121851(SRRM1)
XLA: 445881(srrm1.S) 494754(srrm1.L)
XTR: 448115(srrm1)
NPR: 108799277(SRRM1)
DRE: 406751(srrm1)
SRX: 107716009(srrm1) 107721297
SANH: 107654869(srrm1) 107659230
IPU: 108270153(srrm1)
PHYP: 113545049(srrm1)
AMEX: 103026567(srrm1)
EEE: 113589227
TRU: 101066556(srrm1)
LCO: 104919315(srrm1)
NCC: 104960715(srrm1)
MZE: 101475408(srrm1)
ONL: 100712461(srrm1)
OLA: 101163290(srrm1)
XMA: 102224403(srrm1)
XCO: 114134344(srrm1)
PRET: 103458638(srrm1)
CVG: 107096421(srrm1)
NFU: 107392526(srrm1)
KMR: 108236102(srrm1)
ALIM: 106535200(srrm1)
AOCE: 111578473(srrm1)
CSEM: 103382296(srrm1)
POV: 109628092(srrm1)
LCF: 108897984(srrm1)
SDU: 111225968(srrm1)
SLAL: 111644559 111650095(srrm1)
HCQ: 109520792(srrm1)
BPEC: 110155294(srrm1)
MALB: 109964986(srrm1)
SASA: 106579139(SRRM1) 106610815(SRRM1)
ELS: 105015814(srrm1)
SFM: 108930737(srrm1)
PKI: 111859635(srrm1)
LCM: 102346247(SRRM1)
CMK: 103185629(srrm1)
RTP: 109912982(srrm1)
CIN: 100186689
APLC: 110974606
DME: Dmel_CG11274(Srrm1)
DER: 6544946
DSE: 6605530
DSI: Dsimw501_GD14425(Dsim_GD14425)
DAN: 6506697
DSR: 110191137
DPE: 6595898
DMN: 108151979
DWI: 6639161
DAZ: 108614273
DNV: 108651204
DHE: 111594918
DVI: 6624433
MDE: 101900753
LCQ: 111688113
AAG: 23687946
AME: 725155
BIM: 100741990
BTER: 100650047
CCAL: 108627237
AEC: 105150948
DQU: 106740645
LHU: 105667984
PCF: 106783790
NVI: 100117836
CSOL: 105364699
MDL: 103573101
TCA: 100142567
DPA: 109537567
ATD: 109596012
NVL: 108563520
BMOR: 101735812
BMAN: 114251344
PMAC: 106714777
PRAP: 111000408
HAW: 110379006
PXY: 105395066
API: 100160294
DNX: 107166991
AGS: 114132731
RMD: 113547950
BTAB: 109039456
CLEC: 106661054
ZNE: 110828702
FCD: 110854234
TUT: 107371373
DPTE: 113788963
CSCU: 111626901
PTEP: 107442014
CEL: CELE_F28D9.1(rsr-1)
CBR: CBG07956(Cbr-rsr-1)
BMY: Bm1_55770
TSP: Tsp_10247
PCAN: 112565917
CRG: 105331448
MYI: 110457612
OBI: 106872131
LAK: 106165125
SHX: MS3_07222
EGL: EGR_06277
NVE: 5503648
EPA: 110249995
ADF: 107347965
AMIL: 114959615
PDAM: 113672001
SPIS: 111334548
DGT: 114535387
HMG: 100211742
ATH: AT2G29210
ALY: 9317102
CRB: 17888168
BRP: 103868054
BOE: 106340872
RSZ: 108811983
THJ: 104800686
CPAP: 110812132
CIT: 102608178
TCC: 18590634
GRA: 105781849
GAB: 108486311
EGR: 104432692
VRA: 106756035
VAR: 108319624
VUN: 114169241
CCAJ: 109816303
CAM: 101513414
ADU: 107476819
AIP: 107629074
FVE: 101297226
RCN: 112168222
PPER: 18771998
PMUM: 103321983
PAVI: 110757078
ZJU: 107411025
CSV: 101207842
CMO: 103497135
MCHA: 111012054
RCU: 8284111
JCU: 105629923
MESC: 110620314
JRE: 108982561
QSU: 111998048
VVI: 100246732
SLY: 101263053
SPEN: 107031169
SOT: 102596503
CANN: 107842644
NSY: 104236941
NTO: 104106080
NAU: 109237102
INI: 109173681
SIND: 105163886
OEU: 111369664
LSV: 111907484
CCAV: 112518044
DCR: 108209114
BVG: 104900057
SOE: 110787679
OSA: 4332383
DOSA: Os03t0270200-01(Os03g0270200)
OBR: 102708597
BDI: 100836380
ATS: 109786810(LOC109786810)
SBI: 110436881
SITA: 101767855
DCT: 110103489
PEQ: 110033965
AOF: 109843431
ATR: 18436252
MNG: MNEG_4782
APRO: F751_2920
PIC: PICST_63288(RBM25)
CAL: CAALFM_C501310WA(CaO19.1938)
NCR: NCU03285
NTE: NEUTE1DRAFT90927(NEUTE1DRAFT_90927)
MGR: MGG_04513
SSCK: SPSK_08847
MAW: MAC_05260
MAJ: MAA_03970
CMT: CCM_06190
MBE: MBM_04815
ANI: AN2929.2
ANG: ANI_1_3074024(An02g11630)
PBL: PAAG_11154(PAAG_00693)
PBN: PADG_11710(PADG_04140)
ABE: ARB_00527
TVE: TRV_00397
PTE: PTT_19724
CNE: CNB00060
CNB: CNBB5630
TASA: A1Q1_07356
ABP: AGABI1DRAFT116472(AGABI1DRAFT_116472)
ABV: AGABI2DRAFT194307(AGABI2DRAFT_194307)
MGL: MGL_1387
MRT: MRET_3973
DDI: DDB_G0286425(srrm1)
DFA: DFA_04067(srrm1)
EHI: EHI_013250(14.t00046)
PCB: PCHAS_041000(PC000763.01.0)
TAN: TA12780
TPV: TP02_0366
BBO: BBOV_III006320(17.m07562)
SMIN: v1.2.013021.t1(symbB.v1.2.013021.t1)
SPAR: SPRG_06043
 » show all
Reference
  Authors
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Caceres JF, Blencowe BJ
  Title
An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation.
  Journal
J Biol Chem 278:44153-60 (2003)
DOI:10.1074/jbc.M306856200
  Sequence
[hsa:10250]

DBGET integrated database retrieval system