KEGG   ORTHOLOGY: K14268
Entry
K14268                      KO                                     
Symbol
davT, gabT
Name
5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase [EC:2.6.1.48 2.6.1.19]
Pathway
map00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
map00310  Lysine degradation
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00957  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => glutarate => succinate/acetyl-CoA
Reaction
R01648  4-aminobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
R02274  5-aminopentanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00650 Butanoate metabolism
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
   00310 Lysine degradation
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
    2.6.1.48  5-aminovalerate transaminase
     K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Other DBs
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Genes
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 » show all
Reference
  Authors
Yamanishi Y, Mihara H, Osaki M, Muramatsu H, Esaki N, Sato T, Hizukuri Y, Goto S, Kanehisa M
  Title
Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network. Reconstruction of the lysine-degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa.
  Journal
FEBS J 274:2262-73 (2007)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.05763.x
  Sequence
[pae:PA0266]

KEGG   ORTHOLOGY: K00823
Entry
K00823                      KO                                     
Symbol
puuE
Name
4-aminobutyrate aminotransferase [EC:2.6.1.19]
Pathway
map00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
map00410  beta-Alanine metabolism
map00640  Propanoate metabolism
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
Reaction
R00908  beta-alanine:2-oxoglutarate aminotransferase
R01648  4-aminobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00640 Propanoate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
   00650 Butanoate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Other DBs
COG: COG0160 COG4992
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Genes
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Reference
  Authors
Kurihara S, Oda S, Kato K, Kim HG, Koyanagi T, Kumagai H, Suzuki H.
  Title
A novel putrescine utilization pathway involves gamma-glutamylated intermediates of Escherichia coli K-12.
  Journal
J Biol Chem 280:4602-8 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M411114200
  Sequence
[eco:b1302]

KEGG   ORTHOLOGY: K07250
Entry
K07250                      KO                                     
Symbol
gabT
Name
4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase [EC:2.6.1.19 2.6.1.22 2.6.1.48]
Pathway
map00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
map00280  Valine, leucine and isoleucine degradation
map00310  Lysine degradation
map00410  beta-Alanine metabolism
map00640  Propanoate metabolism
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
M00956  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => succinate
M00957  Lysine degradation, bacteria, L-lysine => glutarate => succinate/acetyl-CoA
Reaction
R00908  beta-alanine:2-oxoglutarate aminotransferase
R01648  4-aminobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
R02274  5-aminopentanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
R04188  L-3-amino-isobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00640 Propanoate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00650 Butanoate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00280 Valine, leucine and isoleucine degradation
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00310 Lysine degradation
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
    2.6.1.22  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
    2.6.1.48  5-aminovalerate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Other DBs
COG: COG0160 COG4992
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Genes
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CAUN: CLAUR_002500(gabT_1)
CNN: CNEO_2049(gabT)
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CINT: HZF06_07165(gabT)
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MBM: BCGMEX_2605(gabT)
MBX: BCGT_2433
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MCQ: BN44_60050(gabT)
MCV: BN43_40264(gabT)
MCX: BN42_40571(gabT)
MCZ: BN45_50980(gabT)
MORY: MO_002717(gabT)
MLE: ML0485(gabT)
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MPA: MAP_1041c(gabT)
MAO: MAP4_2815
MAVI: RC58_13950
MAVU: RE97_13975
MAV: MAV_3470(gabT)
MIT: OCO_33060
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MID: MIP_04971
MYO: OEM_33190
MIR: OCQ_34180
MMAL: CKJ54_15405(gabT)
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MSER: MTY59_50410(gabT)
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MPSE: MPSD_21600(gabT)
MSHO: MSHO_50410(gabT)
MMC: Mmcs_2274
MKM: Mkms_2321
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MSHG: MSG_01956(gabT)
MFJ: MFLOJ_12900(gabT)
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MNV: MNVI_36180(gabT)
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MGI: Mflv_3818
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MVQ: MYVA_1692(gabT) MYVA_2485
MHAS: MHAS_02259(gabT)
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MCHT: MCHIJ_42910(gabT)
MAUU: NCTC10437_02416(gabT)
MMAG: MMAD_24910(gabT)
MMOR: MMOR_39140(gabT)
MFX: MFAL_05300(gabT)
MAIC: MAIC_22290(gabT)
MALV: MALV_11650(gabT_1) MALV_31500(gabT_2)
MTY: MTOK_42870(gabT)
MPSC: MPSYJ_41120(gabT_1) MPSYJ_47760(gabT_2)
MARZ: MARA_14910(gabT)
MGAD: MGAD_13660(gabT)
MHEV: MHEL_36630(gabT_1) MHEL_46770(gabT_2)
MSAR: MSAR_03860(gabT_1) MSAR_45550(gabT_2)
MANY: MANY_01050(gabT_1) MANY_09090(gabT_2)
MAUB: MAUB_53390
MPOF: MPOR_28860(gabT)
MPHU: MPHO_16070
MMUC: C1S78_010340(gabT)
MMAT: MMAGJ_04130(gabT_1) MMAGJ_15490(gabT_2) MMAGJ_59410(gabT_3)
MBOK: MBOE_17030(gabT_1) MBOE_46960(gabT_2) MBOE_60520(gabT_3)
MFG: K6L26_18690(gabT) K6L26_24745(gabT) K6L26_28925(gabT)
MSEI: MSEDJ_36760(gabT)
MBRM: L2Z93_000144(gabT) L2Z93_001582(gabT) L2Z93_002245(gabT)
MMON: EWR22_11590(gabT)
MSEN: K3U95_02840(gabT) K3U95_06985(gabT) K3U95_11080(gabT)
MPAE: K0O64_12460(gabT)
MRF: MJO55_08370(gabT) MJO55_11585(gabT)
MDF: K0O62_02295(gabT) K0O62_12890(gabT)
MCRO: MI149_13260(gabT)
MGRO: FZ046_17770(gabT)
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MCHE: BB28_21670
MSTE: MSTE_04382
MSAL: DSM43276_04088(puuE)
MJD: JDM601_2377(gabT)
MTER: 4434518_02309(gabT)
MMIN: MMIN_00710(gabT)
MHIB: MHIB_18200(gabT)
MHER: K3U94_13410(gabT)
MVM: MJO54_13200(gabT)
ASD: AS9A_1362(gabT3) AS9A_2743(gabT)
CGL: Cgl0479(Cgl0479)
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CGT: cgR_0582
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CGJ: AR0_02970
CAR: cauri_0643(gabT1) cauri_0646(gabT2)
CUL: CULC22_02310(gapT)
CUC: CULC809_02153(gabT)
CUE: CULC0102_2307(gapT)
CUN: Cul210932_2295(gabT)
CUQ: Cul210931_2249(gabT)
CUZ: Cul05146_2289(gabT)
CUJ: CUL131002_2197c(gabT)
CVA: CVAR_0951(gabT1) CVAR_2953(gabT2)
CTER: A606_00430
CGY: CGLY_01585(gabT)
CSX: CSING_03575(gabT1) CSING_03590(gabT2)
CMQ: B840_03585(gabT)
CCJ: UL81_02730(gabT)
CMV: CMUST_11915(gabT)
CTED: CTEST_03990(gabT)
CDX: CDES_02580(gabT)
CSP: WM42_0732(gabT)
CAMG: CAMM_03710
CMIN: NCTC10288_01891(gabT2)
CPEG: CPELA_02985(puuE)
CPRE: Csp1_26230(gabT)
CPSO: CPPEL_03240(puuE)
CSUR: N24_0620
CCYS: SAMEA4530656_1852(gapT)
CKF: I6I12_00485(gabT)
CPRP: I6I69_03015(gabT)
CGLU: I6J20_11640(gabT)
CZO: IAU67_06760(gabT)
CORY: FQV43_00120(gabT)
CPOY: GP475_00460(gabT) GP475_00555(gabT) GP475_03275(gabT)
CACC: CACC_00520(davT)
CHIN: J5O04_10645(gabT)
CHEI: CHEID_06285(gabT)
CFG: CFREI_10650(gabT)
CCAW: CCANI_10825(gabT)
CFOU: CFOUR_11030(puuE)
CFEU: CFELI_10670(gabT)
CATR: CATRI_03810(puuE)
CGP: KBP53_00190(gabT) KBP53_02430(gabT)
NFR: ERS450000_00335(gabT)
NSR: NS506_02927(gabT)
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RCR: NCTC10994_01292(puuE)
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Reference
  Authors
Schneider BL, Ruback S, Kiupakis AK, Kasbarian H, Pybus C, Reitzer L
  Title
The Escherichia coli gabDTPC operon: specific gamma-aminobutyrate catabolism and nonspecific induction.
  Journal
J Bacteriol 184:6976-86 (2002)
DOI:10.1128/JB.184.24.6976-6986.2002
Reference
  Authors
Knorr S, Sinn M, Galetskiy D, Williams RM, Wang C, Muller N, Mayans O, Schleheck D, Hartig JS
  Title
Widespread bacterial lysine degradation proceeding via glutarate and L-2-hydroxyglutarate.
  Journal
Nat Commun 9:5071 (2018)
DOI:10.1038/s41467-018-07563-6
  Sequence
[eco:b2662]

KEGG   ORTHOLOGY: K13524
Entry
K13524                      KO                                     
Symbol
ABAT
Name
4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase [EC:2.6.1.19 2.6.1.22]
Pathway
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map00410  beta-Alanine metabolism
map00640  Propanoate metabolism
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
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Module
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Reaction
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Disease
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Brite
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 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00640 Propanoate metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
   00650 Butanoate metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
   00280 Valine, leucine and isoleucine degradation
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
 09150 Organismal Systems
  09156 Nervous system
   04727 GABAergic synapse
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
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     K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
    2.6.1.22  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
     K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
Other DBs
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