KEGG   ORTHOLOGY: K14276
Entry
K14276            RNA       KO                                     
Symbol
U1snRNA
Name
U1 spliceosomal RNA
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14276  U1snRNA; U1 spliceosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14276  U1snRNA; U1 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14276  U1snRNA; U1 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K14276 U1snRNA; U1 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14276  U1snRNA; U1 spliceosomal RNA
Genes
HSA: 101447996(RNVU1-8) 101954264(RNVU1-4) 101954266(RNVU1-14) 101954267(RNVU1-15) 101954268(RNVU1-20) 101954269(RNVU1-17) 101954272(RNVU1-3) 101954273(RNVU1-1) 101954276(RNVU1-6) 101954277(RNVU1-19) 124903120 124904122 124904613 124904616(RNVU1-28) 124904619(RNVU1-31) 124904621(RNVU1-27) 124904624(RNVU1-26) 124904627(RNVU1-30) 124904631 124904634 124905307 124905321 124905573 124905574 124905809 26863(RNVU1-18) 26864(RNVU1-7) 26869(RNU1-3) 26870(RNU1-2) 26871(RNU1-1) 6060(RNU1-4) 6063(RNVU1-2A)
PTR: 112204321 112204322 112205304 112205469 112206136 112206169 112206285 112206602 112206887 112206889 112207586 112207615 112207621 112207655 112208059 112208060 112208872 112208880 112209110 112209382 112209383 112209512 112209709 112209710 112209711 112209712 112209713 112209956
PPS: 112436943 112437075 112437643 112437676 112437803 112438039 112438628 112438668 112438688 112438752 112438754 112438757 112438801 112439510 112439516 112439713 112440009 112440010 112440301 112440302 112440303 112440304 112440305 112440625 112440793 112440794 117975932 117978378
GGO: 115930495 115930684 115931367 115931472 115932426 115932457 115932580 115932659 115932667 115932673 115932676 115932729 115933117 115933437 115934248 115934250 115934449 115934460 115934891 115934893 115934895 115935204 115935205 115935206 115935209 115935512 115935728
PON: 112128670 112128908 112129799 112129821 112130016 112130423 112130806 112130807 112130810 112131207 112131665 112131670 112131677 112131683 112131689 112132957 112133279 112133664 112133665 112134101 112134102 112134103 112134532 112134836 112134837
NLE: 115832045 115832193 115832214 115833486 115833591 115833899 115833901 115834602 115834603 115834604 115835005 115835344 115835345 115835346 115835347 115835685 115836540 115836542 115837832 115837839 115837844 115838167 115838168
HMH: 116456471 116457171 116458180 116458182 116460557 116461574 116462182 116463112 116464082 116467734 116467735 116467738 116470061 116470071 116470082 116476029 116477747 116477856 116809946 116812391 116812395
MCC: 114670687 114671236 114671621 114672571 114673279 114673638 114673906 114673913 114674531 114674644 114674645 114674662 114674664 114674665 114674669 114674671 114674672 114674674 114674678 114674685 114674687 114674694 114676610 114676648 114677913 114677929 114677931 114677934 114678534 114678546 114679197 114679198
MCF: 107128305 123567368 123568160 123569604 123569922 123570120 123570131 123570622 123570623 123570626 123570629 123570638 123570640 123570743 123571532 123572096 123572123 123573277 123573280 123573282 123573742 123573753 123574316 123574317 123574851 123575426
MTHB: 126929949 126940919 126941604 126941612 126944115 126944184 126944189 126944203 126944213 126944223 126944242 126944259 126945156 126947070 126949569 126949574 126954107 126954118 126954121 126954123 126955832 126955844 126957824 126957825 126961958
MMU: 115487530(Gm22739) 115487842(Gm22068) 115487853(Gm26121) 115488051(Gm22513) 115488065(Gm23804) 115488991(Gm24924) 115489237(Gm23322) 115489624(Gm26505) 115489816(Gm23686) 115489832(Gm23511) 115489842(Gm23330) 115489864(Gm23467) 115489865(Gm26361) 115490033(Gm22042) 115490042(Gm25581) 115490478(Gm25818) 19842(Rnu1a1) 19847(Rnu1b6)
GGA: 112532220
PCOC: 116230691
TPAI: 128090177
LMUT: 125690233
TGU: 115493325
LSR: 116183512
SCAN: 115485015
PMOA: 120502945
OTC: 121341364
PRUF: 121353380
CCAE: 111927520
HRT: 120751332
FCH: 114014345
SHAB: 115610153
ACUN: 113490184
GCL: 127015359
NPD: 112955777
DNE: 112989968
VKO: 123028767
BBUF: 120992911
OMC: 131545066
PPRM: 120470455
TROS: 130551432
EEE: 113585096
CHAR: 116220896
ELY: 117271308
PLEP: 121940813
SLUC: 116053449
PPUG: 119200038
CLUM: 117742210
ALAT: 119013151
OML: 112150031
XHE: 116708360
KMR: 112451508
NWH: 119422228
AOCE: 111579462
BSPL: 114868752
STRU: 115182924
OTW: 112235223
OMY: 118936964
OGO: 124044725
SNH: 120035582
CMK: 121850723
CPLA: 122545014
BFO: 118410679
CIN: 113474884
SCLV: 120340239
DME: Dmel_CR31185(snRNA:U1:95Cc) Dmel_CR31341(snRNA:U1:95Ca) Dmel_CR31656(snRNA:U1:21D) Dmel_CR32866(snRNA:U1:95Cb)
DER: 6541407
DYA: Dyak_GE27240(Dyak_snRNA:U1:1)
DPE: 6587655
DWI: 6646999
DGR: 6569556
DMO: Dmoj_GI25445(Dmoj_snRNA:U1:1)
DNV: 115561892
CCAT: 111591847
TDA: 119673541
MDE: 131803354
VCRB: 124423247
CINS: 118070014
VCAN: 122405654
DPA: 125504672
AGB: 111691395
HVI: 124361599
FOC: 113214086
DPZ: 124321945
HAZT: 125178596
DSV: 119443235
PTEP: 122270216
GAE: 121366126
MMER: 123565096
OBI: 128248955
OSN: 115209978
LAK: 112042309
NVE: 116612426
PDAM: 113672059
ATH: AT1G04907(U1.10) AT1G06873(U1.14p) AT1G08115(U1.5) AT3G01695(U1.7) AT3G01715(U1.6) AT4G07120(U1.2) AT4G07145(U1.12p) AT5G04105(U1.4) AT5G04315(U1.9) AT5G04455(U1.8)
KLA: KLLA0_D19455r(SNR19)
LTH: KLTH0B08184r(SNR19)
ZRO: ZYRO0F15246r(SNR19)
DHA: DEHA2A07898r(SNR19)
 » show all
Reference
PMID:3056718
  Authors
Seraphin B, Kretzner L, Rosbash M
  Title
A U1 snRNA:pre-mRNA base pairing interaction is required early in yeast spliceosome assembly but does not uniquely define the 5' cleavage site.
  Journal
EMBO J 7:2533-8 (1988)
DOI:10.1002/j.1460-2075.1988.tb03101.x
Reference
PMID:6085956
  Authors
Denison RA, Weiner AM
  Title
Human U1 RNA pseudogenes may be generated by both DNA- and RNA-mediated mechanisms.
  Journal
Mol Cell Biol 2:815-28 (1982)
DOI:10.1128/mcb.2.7.815
  Sequence

DBGET integrated database retrieval system