KEGG   ORTHOLOGY: K14277
Entry
K14277            RNA       KO                                     
Symbol
U2snRNA
Name
U2 spliceosomal RNA
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14277  U2snRNA; U2 spliceosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14277  U2snRNA; U2 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14277  U2snRNA; U2 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K14277 U2snRNA; U2 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14277  U2snRNA; U2 spliceosomal RNA
Genes
HSA: 124900915 124901219 124904135 124904136 124904137 124904138 124904139 124904140 124904141 124904142 124904143 124904144 124904145 124904146 124904147 124904651 124905062 124907963 124907964 124907965 6066(RNU2-1)
PTR: 112204481 112204492 112204499 112204710 112204942 112204943 112205702 112206203 112206204 112206607 112206665 112206911 112208887 112208892 112209155 112209387
PPS: 112437262 112438044 112438102 112438222 112438636 112439523 112439528 112439766 112440014 112441328 117974442 117976725
GGO: 115930496 115930918 115931370 115931799 115931868 115932052 115934256 115934262 115934901 115935037 115935928 115935929 115935930 115936155 115936417 115936418
PON: 112128671 112128952 112129199 112129502 112129838 112130429 112130541 112130845 112132960 112133669 112133673 112135045 112135057 112135363 112135682 112135683 112136025
NLE: 115831397 115831658 115832052 115834606 115835011 115835348 115835718 115836098 115836110 115836200 115837176 115837854 115838175
HMH: 116456497 116458189 116461579 116461580 116466237 116467746 116470129 116472131 116476064 116477919 116482776 116812401
MCC: 114670713 114672574 114672576 114672923 114672940 114673345 114673347 114673348 114673639 114675879 114675880 114677938 114679201 114679207
MCF: 123567392 123568203 123568979 123568981 123569282 123571592 123573285 123574320 123574324
MTHB: 126929955 126936757 126936759 126938181 126940069 126940085 126940086 126940087 126957828 126957834 126960360
MMU: 115486988(Gm25813) 115487687(Gm23472) 115487690(Gm25360) 115487691(Gm25939) 115487919(Gm26316) 115488085(Gm22973) 115488575(Gm57628) 115489258(Gm26108) 115490310(Gm57747) 19848(Rnu2-10)
TPAI: 128091973
ACYG: 125182952
AFUL: 116485213
OMA: 130263505
CCW: 120411668
ZAB: 113459304
TALA: 116963940
ACAR: 114818378
NPD: 112957299
ASN: 112549722
TST: 117877492
MAMB: 125252044
EEE: 113585098
XHE: 116725122
CPLA: 122540790
SCLV: 120340240
LPIC: 129259761
DME: Dmel_CR31850(snRNA:U2:34ABa) Dmel_CR31854(snRNA:U2:34ABb) Dmel_CR32878(snRNA:U2:38ABb) Dmel_CR32882(snRNA:U2:38ABa) Dmel_CR32913(snRNA:U2:14B) Dmel_CR33788(snRNA:U2:34ABc)
DSE: 6614742
DYA: Dyak_GE27253(Dyak_snRNA:U2:1) Dyak_GE27255(Dyak_snRNA:U2:3) Dyak_GE27256(Dyak_snRNA:U2:4)
DMN: 117189183
DMO: Dmoj_GI25453(Dmoj_snRNA:U2:1) Dmoj_GI25454(Dmoj_snRNA:U2:2) Dmoj_GI25455(Dmoj_snRNA:U2:3) Dmoj_GI25456(Dmoj_snRNA:U2:4) Dmoj_GI25457(Dmoj_snRNA:U2:5) Dmoj_GI25458(Dmoj_snRNA:U2:6) Dmoj_GI25459(Dmoj_snRNA:U2:7) Dmoj_GI25460(Dmoj_snRNA:U2:8)
TDA: 119673643
MDE: 131803707
CNS: 116338931
CCAL: 113464710
MGEN: 117218269
NMEA: 116426331
PFUC: 122523705
LHT: 122498535
AGIF: 122850735
CINS: 118070837
CCIN: 112494074
DSM: 124406416
MCIX: 123661299
CFEL: 113370719
AGS: 114129825
HVI: 124374130
IEL: 124173774
DPZ: 124351178
HAME: 121859186
CQD: 128687716
HAZT: 125179455
DSV: 119457124
DPTE: 113791446
DFR: 124494376
SDM: 118202246
CEL: CELE_C05G6.4(C05G6.4)
BMY: BM_BM7768
HRF: 124117889
MMER: 123537683
LAK: 112041338
EPA: 114576438
AMIL: 114947595
DGT: 114540842
XEN: 124450016
HMG: 124812846
HSY: 130661478
ATH: AT1G04733(U2.11) AT2G04375(U2.10) AT3G56705(U2.6) AT3G57645(U2.2) AT5G61455(U2.7)
KLA: KLLA0_F10776r(SNR20)
LTH: KLTH0H06138r(SNR20)
ZRO: ZYRO0C14586r(SNR20)
DHA: DEHA2D10846r(SNR20)
 » show all
Reference
  Authors
Yu AT, Ge J, Yu YT
  Title
Pseudouridines in spliceosomal snRNAs.
  Journal
Protein Cell 2:712-25 (2011)
DOI:10.1007/s13238-011-1087-1
Reference
  Authors
Baraniskin A, Zaslavska E, Nopel-Dunnebacke S, Ahle G, Seidel S, Schlegel U, Schmiegel W, Hahn S, Schroers R
  Title
Circulating U2 small nuclear RNA fragments as a novel diagnostic biomarker for primary central nervous system lymphoma.
  Journal
Neuro Oncol 18:361-7 (2016)
DOI:10.1093/neuonc/nov144
  Sequence
[hsa:6066]

DBGET integrated database retrieval system