KEGG   ORTHOLOGY: K14278
Entry
K14278            RNA       KO                                     

Name
U4snRNA
Definition
U4 spliceosomal RNA
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Spliceosomal RNAs
  K14278 U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Genes
HSA: 26834(RNU4-2) 26835(RNU4-1)
PTR: 112204507 112205196 112205197
GGO: 115930386 115930387 115935937
PON: 112135083 112136033 112136034
NLE: 115836202 115836558 115837185 115837186
MCC: 114671242 114671243 114673362
RRO: 115894125 115900243 115900244
MMU: 115490316(Gm24407) 115490317(Gm24265)
CGE: 113835498 113835513
VVP: 112932937 112932938
AJU: 113595200
PCAD: 112064116
DRO: 112310914
LAV: 111753153
TMU: 111821052
SHR: 111719272
GGA: 112533523
APLA: 113845369
TGU: 115497453
SCAN: 115484680
CCAE: 111945396
ETL: 114056663
FCH: 114017569
ACUN: 113486342
ASN: 112549632
PSS: 112544397
PMUR: 114922670
PMUA: 114587253
EEE: 113587620
TRU: 115251153
ONL: 112847590
OLA: 111947570
XMA: 111606586
XCO: 114137714
KMR: 112451323
SLAL: 111650480
SALP: 112079371
ELS: 114830157
SFM: 114909930
PKI: 111854977
CIN: 113474293
DME: Dmel_CR31625(snRNA:U4:39B) Dmel_CR32879(snRNA:U4:38AB)
DER: 6548863
DYA: Dyak_GE27261(Dyak_snRNA:U4:2) Dyak_GE27262(Dyak_snRNA:U4:3)
DPO: Dpse_GA29991(Dpse_snRNA:U4:3)
DPE: 6596243
DWI: 6641884
DGR: Dgri_GH25902(Dgri_snRNA:U4:1)
DMO: Dmoj_GI25461(Dmoj_snRNA:U4:1) Dmoj_GI25463(Dmoj_snRNA:U4:3)
DNV: 115562566
AME: 113219290
BIM: 112212780
CCAL: 113464797
OBB: 114878309
SOC: 113004180
MPHA: 114255068
HST: 112589407
CFO: 112639376
OBO: 113562681
BMAN: 114250176
TNL: 113493604
API: 115034522
RMD: 113550752
CLEC: 112128063
PVM: 113801927
TUT: 112539463
DPTE: 113792392
CSCU: 111641256
CEL: CELE_C52E4.8(C52E4.8)
PCAN: 112558414
LAK: 112041437
PDAM: 113675029
DGT: 114519881
SCE: snR14
LTH: KLTH0F13288r(SNR14)
ZRO: ZYRO0G03960r(SNR14)
CGR: CAGL0J01994r(SNR14)
DHA: DEHA2D16852r(SNR14)
YLI: YALI0D22905r(SNR14)
 » show all
Reference
  Authors
Yu AT, Ge J, Yu YT
  Title
Pseudouridines in spliceosomal snRNAs.
  Journal
Protein Cell 2:712-25 (2011)
DOI:10.1007/s13238-011-1087-1
Reference
  Authors
Hett A, West S
  Title
Inhibition of U4 snRNA in human cells causes the stable retention of polyadenylated pre-mRNA in the nucleus.
  Journal
PLoS One 9:e96174 (2014)
DOI:10.1371/journal.pone.0096174
  Sequence
[hsa:26835]

DBGET integrated database retrieval system