KEGG   ORTHOLOGY: K14278
Entry
K14278            RNA       KO                                     
Symbol
U4snRNA
Name
U4 spliceosomal RNA
Pathway
map03040  Spliceosome
Disease
H02804  ReNU syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
 Splicing related RNAs
  K14278 U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14278  U4snRNA; U4 spliceosomal RNA
Genes
HSA: 124900516 124901224 124901863 26834(RNU4-2) 26835(RNU4-1)
PTR: 112204507 112204952 112204955 112205196 112205197 112205198 112205199 112205312 112205524 112205525 112206325 112206669 112206935 112206938 112207276 112208309 112208310 112208311 112208312 112208699 112209400 112209554 112209555 112209968 112209969 112209970
PPS: 112436854 112436855 112436856 112436857 112436949 112437137 112437138 112437834 112438106 112438238 112438241 112438657 112439031 112439032 112439033 112439034 112439328 112440026 112440150 112440151 112440637 112440638 112440639 112441335 117975166
GGO: 115930386 115930387 115930388 115930389 115930503 115930746 115930747 115931375 115931512 115931872 115932078 115932614 115933681 115933682 115933683 115934069 115934708 115935052 115935054 115935058 115935535 115935937 115936426
PON: 112128686 112128972 112129855 112130026 112130544 112130874 112131070 112132231 112132232 112132233 112132235 112132979 112133683 112133943 112134546 112134547 112135083 112135691 112136033 112136034 112136035 112136036
NLE: 115830593 115831675 115832074 115832733 115832945 115833119 115833178 115833513 115834627 115834846 115835030 115835230 115835805 115836202 115836558 115836559 115837185 115837186 115837187 115837458 115837459 115837682 115838183 115838515 115838517
HMH: 116456513 116457182 116467764 116469932 116469933 116469934 116474079 116477037 116477610 116477613 116478028 116479840 116479841 116479843 116481383 116482844 116484422 116484423 116484426 116809748 116809749 116809750
MCC: 114671242 114671243 114671244 114671246 114672068 114672069 114672070 114672071 114672587 114672953 114673362 114673649 114674539 114674540 114674744 114674750 114674756 114675296 114676671 114677313 114677315 114677768 114679220 114679221 114680075 114680078
MCF: 123567837 123567838 123567840 123568554 123568555 123568556 123568991 123569315 123569676 123569932 123570682 123570689 123570749 123571553 123572146 123572148 123572722 123572723 123574339 123575060 123575063
MTHB: 126931948 126931949 126931950 126931952 126934594 126934595 126934596 126934597 126936769 126938214 126940930 126944335 126944352 126945165 126945168 126947091 126949380 126951912 126951913 126953951 126954143 126955926 126957848 126960494 126960496
MMU: 115488858(Gm25135) 115489653(Gm22005) 115490316(Gm24407) 115490317(Gm24265)
TPAI: 128084176
ACYG: 125182809
CATA: 118253037
AFUL: 116496372
TGU: 115497453
LSR: 116184202
SCAN: 115484680
OTC: 121344533
OMA: 130259933
PMAJ: 117245214
CCAE: 111945396
ETL: 114056663
HRT: 120760763
ACUN: 113486342
TALA: 122154713
GCL: 127023105
ACAR: 114818508
RTD: 128917317
DNE: 112994701
VKO: 123026230
HCG: 128333434
STOW: 125443177
SMEO: 124392995
PLEP: 121950824
MSAM: 119901583
NWH: 119416545
STRU: 115147965
CMK: 121849985
CPLA: 122559282
LERI: 129704946
AJC: 117124108
DME: Dmel_CR31625(snRNA:U4:39B) Dmel_CR32879(snRNA:U4:38AB) Dmel_CR32998(snRNA:U4:25F)
DYA: Dyak_GE27260(Dyak_snRNA:U4:1) Dyak_GE27261(Dyak_snRNA:U4:2) Dyak_GE27262(Dyak_snRNA:U4:3)
DMO: Dmoj_GI25461(Dmoj_snRNA:U4:1) Dmoj_GI25462(Dmoj_snRNA:U4:2) Dmoj_GI25463(Dmoj_snRNA:U4:3)
HIS: 119653282
ACOZ: 120960248
AARA: 120905258
AMER: 121600704
AFUN: 125772505
CNS: 116341473
BCOO: 119075026
CCAL: 113464797
OBB: 114878309
MPHA: 114255068
HST: 112589407
OBO: 113562681
VCRB: 124432143
LBD: 127282085
DAM: 114841741
AGIF: 122850738
CINS: 118067643
NPT: 124218334
NFB: 124181763
NLO: 124294354
NVG: 124304174
DPA: 125502879
ATD: 126265466
LDC: 111507334
PPYR: 116179878
HAW: 126054068
DPZ: 124341640
CQD: 128694955
ISC: 115323303
TUT: 112539463
DPTE: 113792392
DFR: 124495333
CEL: CELE_C52E4.8(C52E4.8) CELE_T11F9.16(T11F9.16)
BMY: BM_BM1726
PCAN: 112558414
OSN: 115229300
LAK: 112041437
PDAM: 113675029
HSY: 130649901
ATH: AT1G04897(U4.6) AT1G06877(U4.10) AT3G06900(U4.2) AT5G04085(U4.5) AT5G04305(U4.8) AT5G04465(U4.7)
PDUL: 117620404
TWL: 119981560
DCT: 114579569
SCE: YNCE0011C(SNR14)
KLA: KLLA0_D13566r(SNR14)
LTH: KLTH0F13288r(SNR14)
ZRO: ZYRO0G03960r(SNR14)
DHA: DEHA2D16852r(SNR14)
 » show all
Reference
  Authors
Yu AT, Ge J, Yu YT
  Title
Pseudouridines in spliceosomal snRNAs.
  Journal
Protein Cell 2:712-25 (2011)
DOI:10.1007/s13238-011-1087-1
Reference
  Authors
Hett A, West S
  Title
Inhibition of U4 snRNA in human cells causes the stable retention of polyadenylated pre-mRNA in the nucleus.
  Journal
PLoS One 9:e96174 (2014)
DOI:10.1371/journal.pone.0096174
  Sequence
[hsa:26835]

DBGET integrated database retrieval system