KEGG ORTHOLOGY: K14280

ORTHOLOGY: K14280

Entry

K14280            RNA       KO

Symbol

U6snRNA

Name

U6 spliceosomal RNA

Pathway

map03040

Spliceosome

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
Spliceosome [BR:ko03041]
Splicing related RNAs
  K14280 U6snRNA; U6 spliceosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
Small non-coding RNA
  Small nuclear RNA
   K14280  U6snRNA; U6 spliceosomal RNA

Genes

HSA:	101954271(RNU6-9) 101954275(RNU6-7) 101954278(RNU6-8) 103625684(RNU6-2) 124900488 124900632 124900883 124900887 124901516 124902331 124902335 124903414 124904107 124904109 124904694 124904727 124904986 124905264 124905326 124907960 124907961 124908124 26827(RNU6-1)

MMU:

115486786(Gm25790) 115486822(Gm23103) 115486843(Gm22444) 115486850(Gm23445) 115486996(Gm26331) 115487003(Gm24445) 115487005(Gm22509) 115487332(Gm22286) 115487337(Gm23730) 115487341(Gm23248) 115487342(Gm22069) 115487553(Gm22623) 115487554(Gm26239) 115487555(Gm24019) 115487561(Gm22911) 115487563(Gm25626) 115487572(Gm23041) 115487575(Gm26122) 115487579(Gm22950) 115487583(Gm22260) 115487587(Gm23422) 115487706(Gm24267) 115487710(Gm22114) 115487713(Gm25457) 115487843(Gm25930) 115487845(Gm23507) 115487933(Gm24149) 115487937(Gm23506) 115487940(Gm25929) 115488243(Gm24870) 115488249(Gm25020) 115488447(Gm25670) 115488453(Gm23622) 115488582(Gm26178) 115488731(Gm22977) 115488866(Gm23649) 115488867(Gm22474) 115488968(Gm23610) 115488969(Gm22886) 115489063(Gm25431) 115489068(Gm22113) 115489158(Gm24535) 115489166(Gm24268) 115489173(Gm26441) 115489184(Gm23794) 115489274(Gm22057) 115489275(Gm25793) 115489278(Gm23678) 115489281(Gm25207) 115489324(Gm24592) 115489660(Gm25258) 115489667(Gm23369) 115489669(Gm23503) 115489754(Gm22505) 115489762(Gm26166) 115489764(Gm23096) 115489765(Gm23941) 115489770(Gm22458) 115489772(Gm25039) 115489773(Gm25199) 115490098(Gm25137) 115490229(Gm24538) 115490326(Gm22450) 115490328(Gm25672) 115490330(Gm22308) 115490511(Gm23924) 115490515(Gm23648) 19862(Rnu6)

DNM:

111758683 111758792 111758821 111758980 111759239 111759407 111759493 111759496 111759799 111759925 111759993 111760087 111760139 111760266 111760285 111760301 111760398 111760416 111760453 111760739 111760865 111761229 111761293 111761470 111761522 111761770 111761778 111761793 111761794 111761953 111761991 111761992 111762077 111762098 111762136 111762193 111762226 111762308 111762433 111762455 111762483 111762779 111762816 111762948 111763270 111763404 111763423 111763606 111763692 111763719 111763875 111763966 111764058 111764178 111764204 111764233 111764270 111764424 111764430 111764814 111764950 111764981 111765039 111765339 111765498 111765545 111765628 111765681 111765712 111765793 111765835 111765906 111765908 111766106 111766213 111766234 111766254 111766335 111766548 111766663 111766795 111766845 111767035 111767065

OAA:	114806911 114808858 114809268 114809301 114809335 114810874 114813950 114814946 114815694 114816798 114818046 114818047

GGA:	112530043 112530464 112533305

PCOC:

116227809 116232682 116236457 116241712

MGP:	116216389 116216390 116217186 116217333

CJO:	116652452 116653986

TPAI:

128072050 128089823

LMUT:

125685132 125687444

APLA:

113842462 113842463 113842464 113843387 113843388 113843678 113845567 113845708

ACYG:

125179979 125180646 125180647 125182006 125182007 125184595

CATA:

118246240 118247816 118255467 118255620 118260079

AFUL:

116485218 116486922 116488371 116488372 116489312 116499280 116501481

TGU:

LSR:

SCAN:

PMOA:

OTC:

OMA:

CCAE:

CCW:

ETL:	114058607 114066423

ZAB:

113460572

MMEA:

130578184

HRT:

120761151

FCH:	114015694 114017306

SHAB:

115609167 115610162 115613378 115616867

ACUN:

113475974 113477450 113487005 113487006

TALA:

116963578

ACHC:

115334747 115342361 115347790

AGEN:

126042403 126053076

GCL:	127017465 127024224 127027886 127029796

ACAR:

114818416

RTD:	128900831 128906432

AROW:

112965677

NPD:	112946925 112954178

DNE:

112988110

ASN:	112549206 112550949 112551112 112551114 112551188

PSS:

112545286

CMY:	114019047 114019476 114019756 114020255 114020474 114020979 114021159 114021244 114022459 114022461 114022573

CCAY:

125621916 125627361 125627363 125637476 125642023 125643263

DCC:	119843414 119848538 119850277 119856450

CPIC:

112058923 112058987 112058994 112059037 112059597 112059992 112060190

TST:	117871440 117877501 117879687 117881125 117883452 117887838

CABI:

116815776 116815822 116822154 116824777 116825672 116826375 116827234 116829929

MRV:	120384092 120384097 120391967 120408785

SUND:

121920099 121920100 121920103 121920104 121920105 121920106 121920110 121924525 121927430 121930200 121930201 121930202 121930206 121935836

PBI:	112540168 112540662 112541418 112541419

PMUR:

114922207 114922362 114922437 114922551 114922665 114922671 114922782 114923125 114923135 114923317 114923456 114923534 114923884

CTIG:

120297206 120297458 120298094 120298098 120299942 120300855 120302819 120302820 120303365 120303366 120303473 120303987 120305414 120306014 120310005 120310706 120318464

PTEX:

113433875 113434203 113434204 113434205 113434558 113435357 113438304 113438560 113440182 113440901 113444563 113444689 113447930

NSS:	113409924 113410162 113410163 113410324 113414232 113415830 113417664 113417690 113417735 113419748 113429146 113430137

VKO:	123019345 123022433 123024870 123025709 123026978 123029605 123034356 123035402

PMUA:

114583755 114583756 114585782 114586014 114588208 114588717 114593099 114596637 114596638 114601441 114601442 114603648 114607940 114607942 114607945

PRAF:

128398580 128403206 128403262 128409675 128409676 128411669 128416784 128418125

ZVI:	118075516 118075635 118085807 118085808 118088044 118089583 118089584 118093325 118093341

HCG:	128325524 128325526 128328644 128328645 128328647 128332222 128341332 128348374 128348375 128348379 128352650

STOW:

125425614 125425629 125427603 125434066 125443179

EMC:	129325358 129329462 129329480 129331531 129332959 129332960 129332961 129340748 129345866

XLA:	121396350 121398531 121398532 121398535 121398541

XTR:	100335113 116408094 116408095 116409348

RTEM:

120916638 120916639 120918049 120923237 120925363 120925366 120929733 120934125 120934126 120934131 120942079 120946342

BBUF:

120984609 120987422 120987423 120992602 120992617 120992626 120992628 120992999 120993001 120996765 120996794 120996804 120996807 120996812 121002965

BGAR:

122919966 122925246 122925247 122925261 122925264 122929802 122929806 122929809 122933505 122933506 122937014 122939742 122942913 122942914 122945892

MUO:	115456918 115460829 115460834 115460839 115460841 115475219

GSH:	117347930 117352420 117356141 117356142 117360170 117361682 117361685 117364386 117366264 117368776

CAUA:

CGIB:

PPRM:

MAMB:

CIDE:

MASI:

IPU:	124626199 124628924 124628925

IFU:	128599354 128618811

PHYP:

113526316 113537218 113537259

SMEO:

124381064 124403490

EEE:

113567692

CHAR:

116223952

TRU:	115246563 115246713 115246715

CGOB:

115014176 115026877 115027938

ELY:	117253243 117260380 117267670

EFO:	125889574 125891032 125901485

SLUC:

ECRA:

ESP:

PFLV:

GAT:

PPUG:

AFB:

CLUM:

MSAM:

CUD:

ALAT:

MZE:	111500842 111501599

ONL:	112842546 112847594

OAU:

116334150

OLA:	111948268 111948540

OML:

112162717

XMA:	111606593 111608744 111609008

XCO:	114137738 114145666 114147253

XHE:

116720860

GAF:	122823833 122836361 122836368

CTUL:

GMU:

KMR:

NWH:

AOCE:

MCEP:

SSEN:

SLAL:

XGL:

BSPL:

OTW:	112219270 112241832

OMY:	118940563 118943030 118956548

OGO:

OKI:

OKE:

SALP:

ELS:

SFM:	114910292 114910775 114910781

PKI:	111837154 111846442

AANG:

118207147

ARUT:

117414822 117968889 117969902

CMK:	121850564 121852639

CPLA:

122539223 122539607 122549621 122550390 122551201 122552069 122554042 122554815 122557571 122560351 122562898 122564247

LERI:

129695974 129695976 129696773 129697762 129700636 129700640 129704949 129709556 129709983

BFO:	118407731 118418721

CIN:	113474324 113474805 113475582

SPU:

115927792

LPIC:

129266068

AJC:

117105130

DME:	Dmel_CR31379(snRNA:U6:96Aa) Dmel_CR31539(snRNA:U6:96Ac) Dmel_CR32867(snRNA:U6:96Ab)

DER:	6554676 6556361

DSE:

6607767

DYA:	Dyak_GE27273(Dyak_snRNA:U6:1)

DAN:

DPO:

DPE:

DMN:

DWI:	6647446 6650013

DGR:

6564012

DMO:	Dmoj_GI25471(Dmoj_snRNA:U6:1) Dmoj_GI25472(Dmoj_snRNA:U6:2) Dmoj_GI25473(Dmoj_snRNA:U6:3)

DNV:

DHE:

DVI:

CCAT:

BOD:

TDA:

MDE:

LCQ:	111684670 111684674

LSQ:

ECOE:

HIS:

ACOZ:

AARA:

AMER:

AFUN:

AALI:

AALB:

115254373 115256909 115260780 115262974

CPII:

120425757 120427516

CNS:	116337860 116341474

BCOO:

AME:

ACER:

ALAB:

ADR:

AFLR:

BIM:	112212708 112213159 112213160

BBIF:

BVK:

BVAN:

BAFF:

BPYO:

CCAL:

OBB:	114873271 114874857

MGEN:

NMEA:

CGIG:

SOC:

MPHA:

HST:

CFO:

FEX:

OBO:

PFUC:

VPS:

VCRB:

NVI:

TPRE:

LHT:

LBD:

CGLO:

123260234 123260235 123260236 123262324

DAM:

AGIF:

CINS:

VCAN:

CCIN:

DSM:	124407827 124407828 124412797

NPT:	124215762 124215769 124222583

NFB:	124179267 124179268 124185895

NLO:	124293769 124293770 124293773 124295223

NVG:	124301706 124301707 124308296

DPA:

125503600

SOY:	115878601 115889149

AGRG:

126735795 126736954 126744824

CSET:

123308841 123310613 123312626 123316172

AGB:	111691413 111691414 111691856

LDC:	111507274 111515386 111516377

APLN:

112904536

PPYR:

116165201

OTU:

111420672

BMOR:

119628490 119628590 119628773 119629270 119629273 119629441 119630823

BMAN:

114239521 114239660 114240559 114240861 114241273 114241432 114245029 114248037 114249345 114251604

MSEX:

115441558 115456000

BANY:

112046097

MJU:

123869495

NIQ:	126772597 126779321 126779325

VCD:	124533303 124538676 124541325

MCIX:

PRAP:

PBX:

ZCE:

CCRC:

LSIN:

HAW:

HZE:

TNL:	113504349 113504351

OFU:

114357416

PGW:	126371657 126377966 126380802 126382314

CFEL:

113368531 113383838 113383922

CCRN:

123294344

API:	115033443 115033991 115033994

AGS:

114120274

RMD:

113555337

ACOO:

126832973

DCI:	113465618 113466908

CLEC:

112127373 112127931 112128109 112128414

HHAL:

112210134 112210604 112210896 112211956

NLU:

120350736

HVI:	124353276 124356374 124361588

FOC:	113205898 113214851

CSEC:

111861844 111865056 111866888 111874423

SGRE:

126268501 126279315 126279317 126279318 126279326 126279627 126279718 126279736 126301335

IEL:	124156674 124158295

DMK:	116918085 123474793 123474836

DPZ:	124322962 124346331 124346336

PVM:	113809294 113818385 113818408

PJA:	122244977 122253656 122253677 122258532

PCHN:

PMOO:

HAME:

PCLA:

CQD:	128684786 128686245 128690978 128699241 128704720

PTRU:

123508489 123512118

ESN:

126987054

HAZT:

125177596

EAF:	111702757 111702810 111702811

LSM:	121123813 121128788

DSV:

RSAN:

RMP:

TUT:

DPTE:

DFR:	124495334 124495336

CSCU:

111619598 111619630 111624585 111631465 111634037 111640637

PTEP:

122270383 122272943

UDV:

129227073

SDM:	118187021 118190912 118204029 118204628 118206062

CEL:	CELE_C28A5.7(C28A5.7) CELE_F54C8.10(F54C8.10) CELE_K09B11.19(K09B11.19)

NAI:	NECAME_08028 NECAME_10466 NECAME_19578

BMY:	BM_BM15506

PCAN:

112554745

GAE:	121366534 121391013 121392266 121392820

CRG:

PMAX:

MCAF:

MMER:

DPOL:

127832759 127832831 127840228

OBI:	128247145 128247153 128247163 128247446 128247705 128248217 128249225 128249454 128249649 128250087 128250090

LAK:

112041419

SMM:	Smp_sma.U6-7.1.1 Smp_sma.U6.1.1

NVE:

EPA:

ATEN:

AMIL:

PDAM:

DGT:

ATH:	AT3G13855(U6-26) AT4G04615(U6.4) AT4G08755(U6.5) AT5G46315(U6-29)

CRB:	111828794 111829125 111830270 111830272

BRP:

117126363

BNA:	125578892 125584926 125591053 125607688 125608477

RSZ:	130495413 130497142 130498277 130508924 130510344

CIT:	112495833 112497335 112497403

PVY:	116104976 116104978

MINC:

123205352 123219855 123224612

GRA:	128034396 128040696 128041518 128042232

GHI:	121209035 121222682 121231198

EGR:	120287926 120295178

GMX:	112997960 112998894 112999673 112999674

GSJ:	114369046 114377731

VUN:	114165476 114165530

CCAJ:

114914994

APRC:

113853414 113856749 113856750 113864109 113870502

MTR:	112416904 112416910 112416911

TPRA:

123882637 123893418 123900250 123919163

PSAT:

127090054

ADU:	127740124 127746937 127746970 127747957

AHF:	112699568 112745667 112759851 112798746 112804771

PCIN:

129296586 129304276 129304277

RCN:	112181068 112181074 112181075 112191119

PDUL:

117620419 117620420 117620422

MDM:	114819338 114824261 114825282 114825283

MSYL:

126584012 126594651

ZJU:

112489163

MNT:

112092809

CSAV:

115696114 115711835 115721586

CSV:	116402291 116403005

CMO:	127144331 127149134 127150777

BHJ:	120070445 120074841 120074842 120074843 120084325 120092292

CMAX:

111469939 111480147 111481320 111487867

CMOS:

111431460 111432224 111439421 111450076 111450862

CPEP:

111783725 111783726 111783728 111797760

RCU:	112534102 112534491 112534794 112535559

JCU:	119369698 119370052 119370887

MESC:

110628881 122723581 122723585

POP:	112323444 112327065 112328705

PALZ:

118035291 118043719 118054760

JRE:	118343884 118344420 118347790 118347791

CILL:

122274891 122312028

CAVE:

132166827 132168279 132173145

QSU:	111989026 111990534

QLO:	115954339 115973197 115978496 115983089

TWL:

119981562

VVI:	132253579 132253693 132253977

VRI:

117911931

SLY:	108353825(U6) 112939958 112939959 112939994 112940004

SPEN:

114074546 114075436 114078176 114078490 114078491

SSTN:

125846151 125850620 125853983 125857303 125857305 125869484

CANN:

124886146 124888196 124893349 124894559 124895617 124897503

LBB:	132604683 132629496 132634583

ITR:	116000560 116007711 116011488 116011489 116028134

SSPL:

121763132 121773078 121773079 121775613 121783110 121783113

SMIL:

130987279

APAN:

127244477 127250748

HAN:	110941625 118483044 118483146 118483153 118483158 118486194 118488629

ECAD:

122580703 122580704 122586199 122602443

LSV:	111875900 111878798 111884322 111884323 111890565 111896037 111897493 111908460 111911168 111914326

CCAV:

112503712 112503719 112503721 112513885 112522330

CSIN:

114256922 114262353 114285641 114294241 114299134 114316747

RVL:	131299297 131308994 131312219 131312224 131312226

AEW:	130752222 130756061 130771138

SOE:	130460519 130462298 130464441 130466422 130468200

ATRI:

130804910

MOF:	131143571 131143593 131143604 131152521

MING:

122063356

TSS:	122638444 122644386 122660636

PSOM:

113284733 113284737 113307032 113307034 113325914 113335072 113343067

OBR:	121055237 121055403

OGL:	127753587 127756083 127769140

BDI:	112269023 112269031

TDC:	119266172 119282878 119290130 119290136 119290167 119290179 119313163 119326913

TAES:

123056254 123063798 123088729 123088774 123126841

TUA:	125511703 125555037 125555045 125555213 125555218

LPER:

127297686 127297687 127297688 127297689

LRD:	124650666 124658621 124658622 124668723 124679873

ZMA:	111590089 111590679 111590995

SVS:

117834887

PVIR:

120646626 120663093 120684096 120696392 120696394

PHAI:

112872493 112891268 112901790

PDA:	113461083 113462036 113462201 113462316 113463492 113463503 120110030 120112079

ZOF:	121968741 122003353

DCT:	114579244 114579667 114579669 114580842 114580957 114581232

NCOL:

116259759 116263475

PPP:	112272889 112277072 112278565 112278566 112290080 112292497

SCE:	YNCL0006W(SNR6)

AGO:	AGOS_AgSNR6U6

KLA:	KLLA0_F19950r(SNR6)

LTH:	KLTH0G12804r(SNR6)

ZRO:	ZYRO0D06292r(SNR6)

DHA:	DEHA2D15774r(SNR6)

CAL:	CAALFM_C305500WA(SNR6)

ECU:	ECU06_0555

EHE:	EHEL_080490

ERO:	EROM_080490

TBR:	Tb927.4.1213

LMA:	LMJF24_snRNA_01

LIF:	LINJ_24_snRNA1

LDO:	LDBPK_24snRNA1

LBZ:	LBRM_24_snRNA1

» show all

Reference

PMID:21976061

Authors

Yu AT, Ge J, Yu YT

Title

Pseudouridines in spliceosomal snRNAs.

Journal

Protein Cell 2:712-25 (2011)
DOI:10.1007/s13238-011-1087-1

Reference

PMID:3360322

Authors

Kunkel GR, Pederson T

Title

Upstream elements required for efficient transcription of a human U6 RNA gene resemble those of U1 and U2 genes even though a different polymerase is used.

Journal

Genes Dev 2:196-204 (1988)
DOI:10.1101/gad.2.2.196

Sequence

[hsa:26827]

All links

Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Gene (6760)   
   KEGG GENES (6760)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (6767)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system