KEGG   ORTHOLOGY: K14284
Entry
K14284                      KO                                     

Name
NXF, TAP, MEX67
Definition
nuclear RNA export factor
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko05164  Influenza A
ko05168  Herpes simplex virus 1 infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05164 Influenza A
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   05168 Herpes simplex virus 1 infection
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03009 Ribosome biogenesis
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   mRNA cycle factors
    Stress granule specific factors
     K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Export and cytoplasmic maturation factors
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Other DBs
TC: 3.A.18.1 3.A.22.1 1.I.1.1
Genes
HSA: 10482(NXF1) 55998(NXF5) 56000(NXF3) 56001(NXF2) 728343(NXF2B)
PTR: 100610724(NXF5) 100611904 451267(NXF1) 465774(NXF3) 735423
PPS: 100978865(NXF5) 100985902 100987014(NXF3) 100995719(NXF1)
GGO: 101128539(NXF1) 101143267(NXF5) 101145461 101146896 101154480(NXF3)
PON: 100437514 100449073(NXF1) 100451207(NXF5) 100454300 100460986(NXF3)
NLE: 100582874(NXF1) 100598965 100599996 100604276(NXF3)
MCC: 693880 695351(NXF3) 706140 718420(NXF1)
MCF: 101865792(NXF1) 102132398(NXF2) 102133037(NXF2B) 102133156 102146918(NXF3)
CSAB: 103232373 103232389 103232394 103232396(NXF3) 103233854(NXF1)
RRO: 104657745 104664213 104678266(NXF3) 104679330(NXF1) 115898698
CJC: 100386998 100397387(NXF3) 100399719(NXF1) 100414986(NXF2B)
SBQ: 101032616(NXF3) 101037624(NXF1) 101040989
MMU: 170722(Nxf7) 245610(Nxf3) 53319(Nxf1) 83454(Nxf2)
RNO: 302591(Nxf3) 308653(Nxf2) 501621(Nxf7) 59087(Nxf1) 680025(Nxf5)
HGL: 101699957(Nxf1) 101708221(Nxf2b)
PTG: 102962664 102965530(NXF3) 102965633(NXF1) 102966668(NXF2B)
BTA: 512136(NXF1) 523530(NXF3) 613789(NXF2) 615581(NXF3) 785244
CHX: 102177698 102182285(NXF3) 102183400(NXF2B) 102186192(NXF1)
CDK: 105091509(NXF1)
BACU: 102997145(NXF3) 103009735 103020946(NXF1)
DLE: 111170887(NXF3) 111171143 111183845(NXF1)
EPZ: 103545444 103558948(NXF1) 103559758(NXF3) 103566147(NXF5)
HAI: 109376052(NXF3) 109377472 109384235(NXF1) 109389566(NXF5)
DRO: 112296854 112296855(NXF3) 112317185(NXF1) 112321362(NXF5)
RAY: 107501584(NXF1) 107506262 107519684(NXF3)
MJV: 108392981 108393639(NXF1)
MDO: 100010859(NXF1)
SHR: 100918153(NXF1)
PCW: 110195408(NXF1)
OAA: 103166937(NXF1)
GGA: 101748079(NXF1)
ACYG: 106029518
TGU: 115492082(NXF1)
LSR: 110478856(NXF1)
FPG: 101920344
FCH: 102055536
NNI: 104020654(NXF1)
AAM: 106491461(NXF1)
ASN: 102374093(NXF1)
AMJ: 102564521(NXF1) 106737160
PSS: 102446109(NXF1)
CMY: 102929361(NXF1)
CPIC: 101933834(NXF1)
ACS: 100552817
PVT: 110081002(NXF1)
PBI: 103063999(NXF1)
PMUR: 107292431(NXF1)
TSR: 106553550
PMUA: 114586821(NXF1)
GJA: 107115206(NXF1)
XLA: 108713918(nxf1.L) 108717690 432035(nxf1.S)
XTR: 100490733 734058(nxf1)
NPR: 108794524(NXF1)
DRE: 323865(nxf1) 751719(zgc:153681)
PHYP: 113529362 113541528(nxf1)
TRU: 101078622(nxf1)
LCO: 104925535(nxf1)
NCC: 104968006(nxf1)
MZE: 101464671(nxf1)
ONL: 100704151(nxf1)
OLA: 101172252(nxf1)
XMA: 102222705(nxf1)
XCO: 114139402(nxf1)
PRET: 103471442(nxf1)
CVG: 107087912(nxf1)
NFU: 107377521(nxf1)
KMR: 108231413(nxf1)
ALIM: 106515852(nxf1)
AOCE: 111576375(nxf1)
CSEM: 103390831(nxf1)
POV: 109640031(nxf1)
LCF: 108872558(nxf1)
SDU: 111232716(nxf1)
SLAL: 111655825(nxf1)
HCQ: 109511958(nxf1)
BPEC: 110158932(nxf1)
MALB: 109955377(nxf1)
ELS: 105010949(nxf1) 105026736
SFM: 108925402(nxf1)
PKI: 111834735(nxf1)
LCM: 102357219(NXF1)
CMK: 103173353(nxf1)
RTP: 109923474(nxf1)
CIN: 100176525
SPU: 586399
APLC: 110979242
SKO: 100373311
DME: Dmel_CG1664(sbr) Dmel_CG31501(nxf4) Dmel_CG32135(Nxf3)
DSE: 6617590
DSI: Dsimw501_GD16011(Dsim_sbr) Dsimw501_GD19931(Dsim_GD19931) Dsimw501_GD29338(Dsim_GD29338)
DVI: 6631403
MDE: 101892060
LCQ: 111684943
DPA: 109536665
HAW: 110376462
BTAB: 109043430
FCD: 110856155
TUT: 107368479
DPTE: 113791563
CSCU: 111639068
PTEP: 107456009
CEL: CELE_C15H11.3(nxf-1) CELE_C15H11.6(nxf-2)
CBR: CBG04621(Cbr-nxf-2) CBG04623(Cbr-nxf-1)
BMY: Bm1_10740
TSP: Tsp_03999
PCAN: 112570102
CRG: 105322156
MYI: 110464295
OBI: 106881596
SHX: MS3_03341
EGL: EGR_04877
NVE: 5510737
EPA: 110233946
ADF: 107345014
AMIL: 114946822
PDAM: 113674180
SPIS: 111339613
DGT: 114522222
HMG: 100214173
AQU: 100640489
QSU: 112013341
SCE: YPL169C(MEX67)
ERC: Ecym_2373
KMX: KLMA_30457(MEX67)
NCS: NCAS_0C01210(NCAS0C01210)
NDI: NDAI_0K01220(NDAI0K01220)
TPF: TPHA_0D01390(TPHA0D01390)
TBL: TBLA_0B03720(TBLA0B03720)
TDL: TDEL_0A06440(TDEL0A06440)
KAF: KAFR_0A03970(KAFR0A03970) KAFR_0B03080(KAFR0B03080)
PIC: PICST_85667(MEX67)
CAL: CAALFM_CR04050CA(MEX67)
SLB: AWJ20_74(MEX67)
NCR: NCU09317
NTE: NEUTE1DRAFT72776(NEUTE1DRAFT_72776)
MGR: MGG_04430
SSCK: SPSK_08711
MAW: MAC_03014
MAJ: MAA_04170
CMT: CCM_06267
MBE: MBM_02565
ANI: AN2737.2
ANG: ANI_1_550014(An01g04310)
ABE: ARB_04614
TVE: TRV_00896
PTE: PTT_09472
SPO: SPBC1921.03c(mex67)
CNE: CNI03520
CNB: CNBH3360
ABP: AGABI1DRAFT114891(AGABI1DRAFT_114891)
ABV: AGABI2DRAFT191117(AGABI2DRAFT_191117)
MGL: MGL_0232
MRT: MRET_1081
DFA: DFA_04663
EHI: EHI_035490(17.t00035) EHI_080900(251.t00008) EHI_182830(28.t00012)
TCR: 506127.20
NGR: NAEGRDRAFT_67690(AM44)
 » show all
Reference
  Authors
Levesque L, Guzik B, Guan T, Coyle J, Black BE, Rekosh D, Hammarskjold ML, Paschal BM
  Title
RNA export mediated by tap involves NXT1-dependent interactions with the nuclear pore complex.
  Journal
J Biol Chem 276:44953-62 (2001)
DOI:10.1074/jbc.M106558200
  Sequence
[mmu:53319]
Reference
  Authors
Hautbergue GM, Hung ML, Golovanov AP, Lian LY, Wilson SA
  Title
Mutually exclusive interactions drive handover of mRNA from export adaptors to TAP.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 105:5154-9 (2008)
DOI:10.1073/pnas.0709167105
  Sequence
[hsa:10482]
Reference
  Authors
Braun IC, Rohrbach E, Schmitt C, Izaurralde E
  Title
TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus.
  Journal
EMBO J 18:1953-65 (1999)
DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
  Sequence
[hsa:10482]

DBGET integrated database retrieval system