KEGG   ORTHOLOGY: K14483
Entry
K14483            RNA       KO                                     

Name
U3snoRNA, snR17
Definition
U3 small nucleolar RNA
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03013  RNA transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs involved in processing reactions
    K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small non-coding RNA
  Small nucleolar RNA
   K14483  U3snoRNA, snR17; U3 small nucleolar RNA
Genes
HSA: 109617015(SNORD3E) 26851(SNORD3B-1) 780851(SNORD3A) 780852(SNORD3B-2) 780853(SNORD3C)
PTR: 112206209 112208897
GGO: 115934266 115934907
PON: 112131446 112131813 112131814 112131815
NLE: 115834205 115834207
MCC: 114673351 114673352 114675698 114675699
RRO: 115895082 115895084
MMU: 115487696(Gm24826) 115487926(Gm24949) 19850(Rnu3a) 19858(Rnu3b1) 19859(Rnu3b2) 19860(Rnu3b3) 19861(Rnu3b4)
CGE: 113834297
VVP: 112918175 112923595
UAH: 113269201
FCA: 111557945 111559225
AJU: 113592748 113592749
BTA: 112442867 112446151
BBUB: 112584018 112584021
OAS: 114117130
CDK: 116158046 116158048
DLE: 115803561
PCAD: 112066018 112066020
ECB: 111775814 111775815
DRO: 112300524
PALE: 112473427
LAV: 111751801 111751802 111751803
TMU: 111820880 111820882
SHR: 111720476 111720482
OAA: 114809883 114818041 114818042 114818043
GGA: 112530089 112530097 112530098
MGP: 116217363
CJO: 116654260 116654268
APLA: 113845691 113845703 113845705
TGU: 115497831 115497843 115497844
SCAN: 115484695 115484706 115484717 115484728
CCAE: 111944589
ETL: 114067733
FCH: 114018131
ASN: 112550062
PSS: 112543976 112543977 112543978 112545875
PBI: 112542480 112543386
PMUR: 114923473 114923474
PMUA: 114586005
XTR: 116409874 116409875 116409876 116409877 116409878 116409879 116409881 116409882 116409883
PHYP: 113540704 113540706
EEE: 113581873
TRU: 115253397
MZE: 111500979 111500985 111500986 112435063
ONL: 112847228 112847245
OLA: 111948369
XMA: 111611264
XCO: 114158075
KMR: 112450817
AOCE: 111562772 111575025
SLAL: 111652842
OTW: 112215096
SALP: 111956518 111972434
ELS: 114830208 114830209 114830211 114830212 114830213 114830703
SFM: 114912237 114912238 114912239 114912240 114912241 114912252
PKI: 111844008
CIN: 113474802
SPU: 115920072 115922015 115922016 115922017 115922018 115924986 115925748
DME: Dmel_CR33628 Dmel_CR33921
DER: 6548028 6548031
DYA: Dyak_GE27082(Dyak_snoRNA:GE27082) Dyak_GE27083(Dyak_snoRNA:GE27083)
DAN: 6508181 6508182
DPO: Dpse_GA29865(Dpse_snoRNA:GA29865) Dpse_GA29866(Dpse_snoRNA:GA29866)
DPE: 6592304 6592307
DWI: 6646171 6646174
DGR: Dgri_GH25761(Dgri_snoRNA:GH25761) Dgri_GH25762(Dgri_snoRNA:GH25762)
DMO: Dmoj_GI25366(Dmoj_snoRNA:GI25366) Dmoj_GI25367(Dmoj_snoRNA:GI25367)
DNV: 115563876
DHE: 111595596 111595597
DVI: 116649750 6625821
LCQ: 111689164
AALB: 115262471
AME: 113219422
BIM: 112212298
CCAL: 113464252
SOC: 113003329
MPHA: 114255548
HST: 112589793
CFO: 112637493 112637494 112637629 112637630 112637662
OBO: 113562227 113563570
NVI: 116416421 116416422
TNL: 113505960
API: 115034357
AGS: 114127612
CLEC: 112127831
TUT: 112539300
DPTE: 113790906
CSCU: 111642529 111642530
CEL: CELE_T19C4.11(T19C4.11) CELE_T19C4.17(T19C4.17)
LAK: 112041361 112041362 112041451
AMIL: 114955229 114958578
PDAM: 113685235
QSU: 112029493
PSOM: 113331699
SCE: snR17a snR17b
AGO: AGOS_AgSNR17
KLA: KLLA0_D07408r(SNR17)
LTH: KLTH0D10758r(SNR17)
ZRO: ZYRO0D16808r(SNR17) ZYRO0F06886r(SNR17)
CGR: CAGL0J03883r(SNR17)
DHA: DEHA2E15818r(SNR17) DEHA2G09746r(SNR17)
CAL: CAALFM_C304150WA
YLI: YALI0E01422r(SNR17) YALI0E31947r(SNR17) YALI0F23873r(SNR17)
 » show all
Reference
PMID:7556076
  Authors
Beltrame M, Tollervey D
  Title
Base pairing between U3 and the pre-ribosomal RNA is required for 18S rRNA synthesis.
  Journal
EMBO J 14:4350-6 (1995)
DOI:10.1002/j.1460-2075.1995.tb00109.x
Reference
  Authors
Venema J, Tollervey D
  Title
Ribosome synthesis in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Annu Rev Genet 33:261-311 (1999)
DOI:10.1146/annurev.genet.33.1.261
Reference
  Authors
Knox AA, McKeegan KS, Debieux CM, Traynor A, Richardson H, Watkins NJ
  Title
A weak C' box renders U3 snoRNA levels dependent on hU3-55K binding.
  Journal
Mol Cell Biol 31:2404-12 (2011)
DOI:10.1128/MCB.05067-11
  Sequence
[hsa:780851]

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Gene (212)   
   KEGG GENES (212)   
Literature (3)   
   PubMed (3)   
All databases (222)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system