K14570                      KO                                     

RNA exonuclease 1 [EC:3.1.-.-]
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14570  REX1, REXO1, RNH70; RNA exonuclease 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14570  REX1, REXO1, RNH70; RNA exonuclease 1
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.-  Acting on ester bonds
     K14570  REX1, REXO1, RNH70; RNA exonuclease 1
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
    K14570  REX1, REXO1, RNH70; RNA exonuclease 1
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CAL: CAALFM_C107090CA(CaO19.6195) CAALFM_C113200CA(REX3)
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MAW: MAC_04208
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CMT: CCM_06810
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PNO: SNOG_10708 SNOG_16531(SNOG_16530)
MGL: MGL_2563
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DDI: DDB_G0291590(rexo1)
DFA: DFA_09916(rexo1)
BBO: BBOV_III006800(17.m07602)
 » show all
van Hoof A, Lennertz P, Parker R
Three conserved members of the RNase D family have unique and overlapping functions in the processing of 5S, 5.8S, U4, U5, RNase MRP and RNase P RNAs in yeast.
EMBO J 19:1357-65 (2000)

K13288                      KO                                     

orn, REX2, REXO2
oligoribonuclease [EC:3.1.-.-]
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
   03009 Ribosome biogenesis
    K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.-  Acting on ester bonds
     K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
     K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
    K13288  orn, REX2, REXO2; oligoribonuclease
Other DBs
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CCAN: 109697442(Rexo2)
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PIN: Ping_3335
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SDE: Sde_2676
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MICC: AUP74_01172(orn)
MICT: FIU95_01125(orn)
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CBU: CBU_1235(orn)
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CBC: CbuK_1096(orn)
CEY: CleRT_08080(orn)
RVI: RVIR1_10650(orn)
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ASIP: AQUSIP_03030(orn)
LPN: lpg2741(orn)
LPH: LPV_3091(orn)
LPO: LPO_3028(orn)
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LPF: lpl2666
LPP: lpp2797
LPC: LPC_0389(orn)
LPA: lpa_04001(orn)
LPE: lp12_2733
LLO: LLO_0311(orn)
LFA: LFA_0318(orn)
LHA: LHA_2779(orn)
LOK: Loa_00485
LCD: clem_02375(orn)
LLG: 44548918_02326(orn)
LJR: NCTC11533_02415(orn)
LCJ: NCTC11976_00292(orn)
TMC: LMI_2855(orn)
MCA: MCA0539(orn)
METL: U737_21120
MAH: MEALZ_1020(orn)
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FTQ: RO31_0263(orn)
FTF: FTF0228c(orn)
FTW: FTW_1861
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FTC: DA46_554
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FTN: FTN_0068(orn)
FTX: AW25_132(orn)
FTD: AS84_646(orn)
FTY: CH70_61(orn)
FPH: Fphi_0765
FPT: BZ13_1265(orn)
FPI: BF30_975(orn)
FPM: LA56_1407(orn)
FPX: KU46_580(orn)
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HCO: LOKO_00833(orn)
HBE: BEI_2783(orn)
HOL: HORIV_25330(orn)
ABO: ABO_2210(orn)
ADI: B5T_00767(orn)
APAC: S7S_15810
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KKO: Kkor_0512
KGE: TQ33_1856
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OAI: OLEAN_C35060(orn)
BMAR: HF888_14700(orn)
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ASA: ASA_0858(orn)
AVR: B565_3281
AMED: B224_0662
ASR: WL1483_2138(orn)
ACAV: VI35_04240
AEL: NCTC12917_00877(orn)
TAU: Tola_2487
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DNO: DNO_0904(orn)
CHJ: NCTC10426_01365(orn)
ORB: IPMB12_11595(orn)
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RSM: CMR15_20062(orn)
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CNC: CNE_1c26070(orn)
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CTI: RALTA_A2200(orn)
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BMAF: DM51_186
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BPL: BURPS1106A_2908(orn)
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BPSD: BBX_1356
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BPSH: DR55_2030
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BTE: BTH_I1670
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BTZ: BTL_1364
BTD: BTI_1143
BTV: BTHA_1457
BTHA: DR62_181
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BCON: NL30_10265
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PPNM: LV28_23015
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PAPI: SG18_16115
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LMIR: NCTC12852_01278(orn)
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BPE: BP2687
BPC: BPTD_2644
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BPET: B1917_1165
BPEU: Q425_11470
BPAR: BN117_1687
BPA: BPP1670
BBR: BB3438
BPT: Bpet1921(orn)
BAV: BAV1378(orn)
BHO: D560_2521
BHM: D558_2502
BHZ: ACR54_03051(orn)
BTRM: SAMEA390648703822(orn)
AXY: AXYL_01755(orn)
AXX: ERS451415_01645(orn)
TEA: KUI_0893
TEG: KUK_0400
TAS: TASI_0790
TAT: KUM_0006
PUT: PT7_1466
PUD: G9Q38_09100(orn)
AMIM: MIM_c16420(orn)
BPSI: IX83_07355
AFQ: AFA_11875
ODI: ODI_R1550
RFR: Rfer_1412
POL: Bpro_1700
PNA: Pnap_1470
AAV: Aave_1893
AJS: Ajs_3346
AAA: Acav_3267
ACRA: BSY15_2531
VEI: Veis_0324
VPD: VAPA_1c15750(orn)
CTES: O987_05050
RTA: Rta_12190(orn)
LIM: L103DPR2_02371(orn)
LIH: L63ED372_01876(orn)
HYB: Q5W_04110
HPSE: HPF_17950(orn)
DIH: G7047_17505(orn)
CBAA: SRAA_0361(orn)
CBAB: SMCB_0273(orn)
MPT: Mpe_A2911
HAR: HEAR0876(orn)
MMS: mma_0852(orn)
JAG: GJA_3897(orn)
HSE: Hsero_1434(orn)
HRB: Hrubri_1258(orn)
CFU: CFU_3228(orn)
CARE: LT85_1273
OFO: BRW83_0428(orn)
UPI: EJG51_004215(orn)
DUG: HH213_19985(orn)
SUTT: SUTMEG_19040(orn)
LCH: Lcho_0985
TIN: Tint_0939
THI: THI_1193(orn)
RGE: RGE_13550(orn)
BBAG: E1O_06250
PBH: AAW51_3746(orn)
NEU: NE0075
NET: Neut_2290
SHD: SUTH_01286(orn)
TBD: Tbd_1839
MFA: Mfla_1473
MMB: Mmol_1353
MEH: M301_1512
MEP: MPQ_1513(orn)
MBAC: BN1209_1007(orn)
MBAT: BN1208_0823(orn)
SLT: Slit_1043
GCA: Galf_2165
SPLB: SFPGR_15580(orn)
SNIV: SFSGTM_06950(orn)
NIM: W01_24560(orn)
EBA: ebA5206(orn)
DSU: Dsui_3222
OTR: OTERR_20580(orn)
DAR: Daro_3001
AZO: azo1518(orn)
AZA: AZKH_2981(orn)
AOA: dqs_1641
AZQ: G3580_11595(orn)
TCL: Tchl_2281
FMY: HO273_01035(orn)
KCI: CKCE_0198
KCT: CDEE_0701
KBT: BCUE_0677
KDE: CDSE_0686
KGA: ST1E_0757
KON: CONE_0655
KSO: CKSOR_00403(orn)
SSDC: SSDC_01510
BPRC: D521_1451
DAL: Dalk_0213
MXA: MXAN_7151(orn)
CCX: COCOR_00252(orn)
SUR: STAUR_0629(orn)
SCL: sce7653
CCRO: CMC5_009570(orn)
HOH: Hoch_5181
BBA: Bd1346
BBAT: Bdt_1320
BBW: BDW_04625
BBAC: EP01_16625
BEX: A11Q_1608
AFR: AFE_2320(orn)
ACU: Atc_0673
ATX: GCD22_03033(orn)
HTL: HPTL_0487(orn)
MTU: Rv2511(orn)
MTV: RVBD_2511
MTC: MT2586
MRA: MRA_2537(orn)
MTUR: CFBS_2660(orn)
MTO: MTCTRI2_2557(orn)
MTD: UDA_2511(orn)
MTN: ERDMAN_2761(orn)
MTUB: MT7199_2542(orn)
MTUC: J113_17470
MTUE: J114_13430
MTUH: I917_17725
MTUL: TBHG_02448
MTUT: HKBT1_2651(orn)
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MTQ: HKBS1_2658(orn)
MBO: BQ2027_MB2539(orn)
MBB: BCG_2531(orn)
MBT: JTY_2525(orn)
MBM: BCGMEX_2523(orn)
MBX: BCGT_2348
MAF: MAF_25260(orn)
MMIC: RN08_2783
MCE: MCAN_25501(orn)
MCQ: BN44_50503(orn)
MCV: BN43_40178(orn)
MCX: BN42_40469(orn)
MCZ: BN45_50897(orn)
MLE: ML0427
MLB: MLBr00427
MPA: MAP_2320
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MAVI: RC58_07470
MAVU: RE97_07470
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MIT: OCO_17300
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MID: MIP_02439
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MMC: Mmcs_3640
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MMAE: MMARE11_37440(orn)
MMM: W7S_07325
MLI: MULP_04107(orn)
MHAD: B586_08550
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MFJ: MFLOJ_51730(orn)
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MVA: Mvan_4100
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MPHL: MPHLCCUG_03676(orn)
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MCHT: MCHIJ_30170(orn)
MAB: MAB_1533c
MCHE: BB28_08335
MSTE: MSTE_01526(orn)
MSAL: DSM43276_01391(orn)
MJD: JDM601_1394(orn)
MTER: 4434518_01287(orn)
MMIN: MMIN_29610(orn)
ASD: AS9A_1037
CGL: NCgl2386(Cgl2473)
CGB: cg2718(ornA)
CGU: WA5_2386(OrnA)
CGM: cgp_2718(ornA)
CGJ: AR0_11880
CEF: CE2370
CDI: DIP1813(orn)
CDP: CD241_1742(orn)
CDH: CDB402_1701(orn)
CDT: CDHC01_1745(orn)
CDE: CDHC02_1741(orn)
CDR: CDHC03_1722(orn)
CDA: CDHC04_1717(orn)
CDZ: CD31A_1814(orn)
CDB: CDBH8_1785(orn)
CDS: CDC7B_1794(orn)
CDD: CDCE8392_1708(orn)
CDW: CDPW8_1805(orn)
CDV: CDVA01_1683(orn)
CDIP: ERS451417_01831(orn)
CJK: jk0518(ornA)
CUR: cu1393
CUA: CU7111_1385(ornA)
CAR: cauri_2059(ornA)
CPL: Cp3995_1677(orn)
CPP: CpP54B96_1663(orn)
CPZ: CpPAT10_1636(orn)
COR: Cp267_1701(orn)
COD: Cp106_1593(orn)
COS: Cp4202_1625(orn)
CPSE: CPTA_00005
CPSU: CPTB_01521
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CRD: CRES_0609(ornA)
CUN: Cul210932_1813(orn)
CUS: CulFRC11_1711(orn)
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CUZ: Cul05146_1799(orn)
CUJ: CUL131002_1736(orn)
CVA: CVAR_0795
CTER: A606_03385
CGY: CGLY_12085(orn)
COA: DR71_1688
CSX: CSING_10670(orn)
CMQ: B840_09965(orn)
CKU: UL82_03245(orn)
CCJ: UL81_09080(orn)
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CEI: CEPID_09900(orn)
CTED: CTEST_10470(orn)
CUT: CUTER_08670(orn)
CSP: WM42_1950
CPHO: CPHO_03050
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CAQU: CAQU_09650
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CMIN: NCTC10288_00503(ornA)
CPEG: CPELA_02595(orn)
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NFA: NFA_12870
NFR: ERS450000_02833(orn)
NCY: NOCYR_1286(orn)
NNO: NONO_c61880(orn)
NSR: NS506_07022(rex2)
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REY: O5Y_17870
ROP: ROP_11290(orn)
REQ: REQ_30680
RHB: NY08_341
RFA: A3L23_03667(orn)
RHS: A3Q41_04573(orn)
RHU: A3Q40_00940(orn)
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GBR: Gbro_2012
GPO: GPOL_c19090(orn)
GOR: KTR9_1937
GRU: GCWB2_15340(orn)
GOM: D7316_00523(orn)
TPR: Tpau_1339
SRT: Srot_0359
SCO: SCO2793(2SCC13.01)
SALB: XNR_4180
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SGR: SGR_4741(ornA)
SGB: WQO_11830
SCB: SCAB_57821(ornA)
SCT: SCAT_1862(orn)
SFA: Sfla_4099
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SHY: SHJG_4296
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SDV: BN159_5476(orn)
STRP: F750_2616
SFI: SFUL_2387
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SGU: SGLAU_12740(orn)
STRE: GZL_05644
SLD: T261_5305
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SAMB: SAM23877_2830(orn)
SRW: TUE45_03409(orn)
SLE: sle_44470(sle_44470)
SRN: A4G23_01844(orn)
SNR: SNOUR_26420(orn)
STRD: NI25_24890
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SALJ: SMD11_4390(orn)
SLX: SLAV_23855(orn)
SFK: KY5_2933
SGE: DWG14_05316(orn)
SRJ: SRO_4680
KSK: KSE_26940(orn)
TWH: TWT_406(orn)
TWS: TW364(orn)
LXL: KDY119_01265(rex2)
LXX: Lxx14150
LEIF: HF024_08850(orn)
CMI: CMM_1440(ornA)
CMS: CMS1536
CMC: CMN_01416(ornA)
MTS: MTES_3303
MOO: BWL13_01488(orn)
MLV: CVS47_01604(orn)
AQG: HRU87_02575(orn)
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ARM: ART_1117
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AAI: AARI_15820(orn)
KRH: KRH_14510(orn)
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RDN: HMPREF0733_11798(orn)
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PAK: HMPREF0675_4683(orn)
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PSUU: Psuf_022190(orn)
CAI: Caci_5970
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AHW: NCTC11636_02626(orn)
BLO: BL1723(orn)
BLJ: BLD_1173(orn1) BLD_1900(orn2)
BLF: BLIF_1598
BLL: BLJ_1576
BLB: BBMN68_1756(orn2)
BAD: BAD_0453(orn)
BLA: BLA_1060(orn)
BBB: BIF_00588
BBC: BLC1_0505
BLV: BalV_0506
BLW: W7Y_0531
BLS: W91_0548
BANI: Bl12_0490
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BANM: EN10_02695
BDE: BDP_0626(orn)
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BBI: BBIF_1343(orn)
BBF: BBB_1370(orn)
BBRU: Bbr_1471(orn)
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BBRV: B689b_1500
BBRJ: B7017_1659
BBRC: B7019_1666
BBRN: B2258_1450
BBRS: BS27_1494(orn)
BTP: D805_1292
BKS: BBKW_0481
BPSP: AH67_02940
SIJ: SCIP_0457
PDO: PSDT_1072
TBI: Tbis_2680
AFO: Afer_0863
AYM: YM304_38580(orn)
PCU: pc1621
WCH: wcw_0797
VBL: L21SP4_00724(orn)
FSC: FSU_0337(orn)
SAAL: L336_0590
BANA: BARAN1_1192(orn)
DPB: BABL1_gene_402(orn)
NAX: HC341_08195(orn)
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Oligoribonuclease is encoded by a highly conserved gene in the 3'-5' exonuclease superfamily.
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The human homolog of Escherichia coli Orn degrades small single-stranded RNA and DNA oligomers.
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[hsa:25996] [mmu:104444]

DBGET integrated database retrieval system