KEGG   ORTHOLOGY: K15633
Entry
K15633                      KO                                     

Name
gpmI
Definition
2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [EC:5.4.2.12]
Pathway
ko00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
ko00260  Glycine, serine and threonine metabolism
ko00680  Methane metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00001  Glycolysis (Embden-Meyerhof pathway), glucose => pyruvate
M00002  Glycolysis, core module involving three-carbon compounds
M00003  Gluconeogenesis, oxaloacetate => fructose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00010 Glycolysis / Gluconeogenesis
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.4  Intramolecular transferases
   5.4.2  Phosphotransferases (phosphomutases)
    5.4.2.12  phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
     K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Other DBs
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Genes
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SMW: SMWW4_v1c47510(gpmM)
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SOF: NCTC11214_01607(gpmI)
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ABAS: ACPOL_0167
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EMI: Emin_1340
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GBA: J421_3922
BTH: BT_3419
BTHO: Btheta7330_04882(gpmI)
BFR: BF0292
BFS: BF9343_0237(gpmI)
BFG: BF638R_0293(gpmI)
BVU: BVU_1375
BXY: BXY_27430
BOA: Bovatus_03554(gpmI)
BCEL: BcellWH2_02396(gpmI)
BUN: Bun01g_04580(gpmI)
PDI: BDI_2656
TFO: BFO_0709(gpmI)
APS: CFPG_581
PRU: PRU_2355(gpmI)
PMZ: HMPREF0659_A5189(gpmI)
PDN: HMPREF9137_0769(gpmI)
PIT: PIN17_A0343(gpmI)
POC: NCTC13071_02597(gpmI)
AFD: Alfi_2953
ASH: AL1_03860
AOK: A3BBH6_25650(gpmI)
ACOU: A5CBH24_22010(gpmI)
ADA: A5CPEGH6_20490(gpmI)
BACC: BRDCF_p2207(gpmI)
DORI: FH5T_09395
BLQ: L21SP5_01793(gpmI)
MBAS: ALGA_2149
SRU: SRU_1986 SRU_2355(gpmI)
SRM: SRM_02205 SRM_02575(gpmI)
RMR: Rmar_1837
CPI: Cpin_0475
FLN: FLA_6192
SGN: SGRA_3330(gpm)
PHE: Phep_1196
SMIZ: 4412673_01784(gpmI)
SDJ: NCTC13534_02488(gpmI)
MUC: MuYL_1416
MGOT: MgSA37_01332(gpmI)
CHU: CHU_3731(apgM)
DFE: Dfer_4375
SLI: Slin_5029
LBY: Lbys_1671
FAE: FAES_1213
PSEZ: HME7025_00238(gpmI)
HSW: Hsw_0021
FLM: MY04_3620
AAS: Aasi_0287
CHE: CAHE_0692(gpmI)
CEC: CE557_596
GFO: GFO_0414(gpmI)
GFL: GRFL_2230
FPS: FP2135(gpmI)
FJO: Fjoh_1764
FJG: BB050_00849(gpmI_2)
FBR: FBFL15_0359(gpmI)
FIN: KQS_11610(gpmI)
ZPR: ZPR_0961
RAI: RA0C_0370
RAR: RIA_2131
RAG: B739_1910
RAE: G148_1465
RAT: M949_0117
MARM: YQ22_03740
CBAL: M667_08720
CBAT: M666_08685
DOK: MED134_00395(pgm)
DDO: I597_0192(gpmI)
ZGA: ZOBELLIA_738(gpmI)
MLT: VC82_2150
NDO: DDD_2044
POM: MED152_07615(pgmI)
EAO: BD94_2386
ELB: VO54_00345(gpmI_1)
MYR: MYRA21_1607(gpmI)
MPW: MPR_0431
CHZ: CHSO_2305
CTAK: 4412677_00298(gpmI)
WIN: WPG_2028
TJE: TJEJU_0586(gpmI)
TMAR: MARIT_0409(gpmI)
AALG: AREALGSMS7_00127(gpmI)
SPON: HME9304_02370(gpmI)
KOS: KORDIASMS9_02174(gpmI)
KAN: IMCC3317_39460(gpmI_2)
MARF: CJ739_805
MESQ: C7H62_0431
FBA: FIC_01327
FBU: UJ101_02371(gpmI)
BBL: BLBBGE_231(gpmA)
BPI: BPLAN_405(gpmM)
BMM: MADAR_384(pgm)
BCP: BLBCPU_222(gpmI)
BBG: BGIGA_396(gpmM)
BLP: BPAA_405(gpmA)
BLU: K645_1111
CTS: Ctha_0195
CPRV: CYPRO_2689
CABY: Cabys_791(gpmI)
TMG: US01_C0001G0630(gpmI)
SRG: XF24_00462(gpmI)
PWO: UX70_C0001G0071(gpmI)
MAC: MA_2671(yibO) MA_4007(yibO)
MMA: MM_0904
MMAC: MSMAC_0420
METM: MSMTP_0458
MTHR: MSTHT_1514
MTHE: MSTHC_1775
MBU: Mbur_1914
MMH: Mmah_1844
MCJ: MCON_2722(gpmI)
MEZ: Mtc_1473
RCI: RCIX2675
HAL: VNG_1887G(gpm)
HSL: OE_3653R(gpmI)
HHB: Hhub_3227(gpmI)
HALH: HTSR_1830(gpmI)
HHSR: HSR6_1899(gpmI)
HSU: HLASF_1926(gpmI)
HSF: HLASA_1912(gpmI)
HMA: rrnAC3403(pgm)
HHI: HAH_0632(pgm)
NPH: NP_1964A(gpmI)
NMO: Nmlp_2202(gpmI)
HUT: Huta_1587
HTI: HTIA_1461
HMU: Hmuk_1492
HALL: LC1Hm_0823(gpmI)
HWA: HQ_2781A(gpmI)
HWC: Hqrw_3153(gpmI)
HVO: HVO_2516(gpmI)
HME: HFX_2529(gpm)
HLA: Hlac_1851
HDF: AArcSl_2857(gpmI)
HTU: Htur_0622
NMG: Nmag_2266(gpmI)
NAT: NJ7G_3891
SALI: L593_11605
AG: AAD26328(gpmI)
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Reference
  Authors
Fraser HI, Kvaratskhelia M, White MF
  Title
The two analogous phosphoglycerate mutases of Escherichia coli.
  Journal
FEBS Lett 455:344-8 (1999)
DOI:10.1016/S0014-5793(99)00910-2
  Sequence
[eco:b3612]
Reference
PMID:8021172
  Authors
Leyva-Vazquez MA, Setlow P
  Title
Cloning and nucleotide sequences of the genes encoding triose phosphate isomerase, phosphoglycerate mutase, and enolase from Bacillus subtilis.
  Journal
J Bacteriol 176:3903-10 (1994)
DOI:10.1128/jb.176.13.3903-3910.1994
  Sequence
[bsu:BSU33910]

KEGG   ORTHOLOGY: K15635
Entry
K15635                      KO                                     

Name
apgM
Definition
2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [EC:5.4.2.12]
Pathway
ko00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
ko00260  Glycine, serine and threonine metabolism
ko00680  Methane metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00001  Glycolysis (Embden-Meyerhof pathway), glucose => pyruvate
M00002  Glycolysis, core module involving three-carbon compounds
M00003  Gluconeogenesis, oxaloacetate => fructose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00010 Glycolysis / Gluconeogenesis
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.4  Intramolecular transferases
   5.4.2  Phosphotransferases (phosphomutases)
    5.4.2.12  phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
     K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Other DBs
RN: R01518
COG: COG3635
GO: 0004619
Genes
MMAI: sS8_0739
NHL: Nhal_1577
NWR: E3U44_15175
GSU: GSU1818
GSK: KN400_1841
GME: Gmet_1428
GUR: Gura_2382
GLO: Glov_2464
GBM: Gbem_1879
GEO: Geob_2765
GEM: GM21_2331
GEB: GM18_1698
PCA: Pcar_0824(apgM) Pcar_1514
PPD: Ppro_0776
DEU: DBW_1698
DVU: DVU0889
DVL: Dvul_2095
DVM: DvMF_1414
DDE: Dde_2732
DMA: DMR_28980
DHY: DESAM_22581(apgM)
DGG: DGI_2697
DFL: DFE_0104
DPI: BN4_10242(apgM) BN4_20389
PPRF: DPRO_0282(apgM) DPRO_3892(apgM)
DBA: Dbac_3387
DRT: Dret_1930
DPS: DP1731
DSF: UWK_00456
DML: Dmul_36820(apgM)
DAL: Dalk_3060
SFU: Sfum_1217
DBR: Deba_1383
MGM: Mmc1_0814
PLUT: EI981_03830(apgM)
CNO: NT01CX_2398(apgM)
CBV: U729_239
CACE: CACET_c11130(apgM)
CTH: Cthe_1292
HSC: HVS_11105
CCE: Ccel_2140
CSS: Cst_c06320(apgM)
CSD: Clst_0600(pgm2)
ESR: ES1_14490
ESU: EUS_07740
RCH: RUM_16750
BPRO: PMF13cell1_00910(gpmI_1)
BPRL: CL2_06890
HSD: SD1D_2181(apgM)
EAC: EAL2_c21490(apgM2)
SWO: Swol_1301
SLP: Slip_0290
SALQ: SYNTR_1225
DAE: Dtox_1375
PTH: PTH_1598
DAU: Daud_1058
SGY: Sgly_2881
CBAR: PATL70BA_1010(apgM)
TACI: TDSAC_0218
FMA: FMG_0474
LPIL: LIP_2706
PDX: Psed_6291
RXY: Rxyl_2948
DMC: btf_1575 btf_665(apgM)
DMD: dcmb_1521 dcmb_711(apgM)
DMG: GY50_0630(gpmM) GY50_1530
DFO: Dform_00032(apgM) Dform_00837(apgM)
ABAT: CFX1CAM_0780(apgM) CFX1CAM_1181(apgM)
DRA: DR_2227
DGE: Dgeo_2232
DDR: Deide_22650(apgM)
DGO: DGo_CA0246(bcpC)
DFC: DFI_01355
DGA: DEGR_02330(apgM)
TTH: TT_C1888
TTJ: TTHA0116
TAQ: TO73_1905
MRB: Mrub_0466
RBA: RB8924(bcpC)
IPA: Isop_0585
KST: KSMBR1_0297(ppd) KSMBR1_1005(apgM1)
TLI: Tlie_0818
BTH: BT_2402
BFR: BF0609
BFG: BF638R_0606(apgM)
BVU: BVU_2051
BXY: BXY_09920
PBT: ING2E5B_2218(apgM)
PMUC: ING2E5A_0098(apgM)
PDI: BDI_0260
TFO: BFO_3154
PSAC: PSM36_0077(apgM)
APS: CFPG_658
PRU: PRU_1017
DORI: FH5T_13805
AAE: aq_542(bcpC)
HTH: HTH_1861
TAL: Thal_0634
TMA: TM1774
TMW: THMA_1818
TMQ: THMB_1818
TMX: THMC_1818
TPT: Tpet_1062
TRQ: TRQ2_1050
TNA: CTN_0964
TNP: Tnap_1040
TLE: Tlet_0278
TME: Tmel_1409
TAF: THA_1725
THER: Y592_07880
FNO: Fnod_0732
PMO: Pmob_0139
MARN: LN42_11160
DTN: DTL3_1207(apgM)
KOL: Kole_1526
ASAC: ATHSA_1733
DTU: Dtur_0007
NDE: NIDE4112(apgM)
NMV: NITMOv2_4466(apgM)
NIO: NITINOP_0768(apgM)
NJA: NSJP_0748(apgM)
LFC: LFE_1124
BANA: BARAN1_0502(apgM)
MOX: DAMO_1610(apgM)
MWO: MWSIV6_0135(apgM) MWSIV6_0803(apgM2)
METE: tca_00384 tca_01540(gpmI)
MST: Msp_0485(apgM1) Msp_1299(apgM2)
MRU: mru_0459(apgM1) mru_1139(apgM2)
MEB: Abm4_0224(apgM) Abm4_0809
MMIL: sm9_0312(apgM1) sm9_0897(apgM2)
METH: MBMB1_0408(apgM1) MBMB1_1171(apgM2)
MFC: BRM9_1376(apgM1) BRM9_1854(apgM2)
MFI: DSM1535_0038(apgM1) DSM1535_2075(apgM)
MCUB: MCBB_0374(apgM1) MCBB_1076(apgM2)
MKA: MK1193
TAC: Ta0413
TVO: TVG1213330(TVG1213330)
PTO: PTO1271
FAI: FAD_0440
CDIV: CPM_0369
MEAR: Mpt1_c02310(apgM) Mpt1_c05450(apgM1)
MARC: AR505_0474
ABI: Aboo_1101
PFU: PF1959
PFI: PFC_08785
PHO: PH0037(PH0037)
PAB: PAB2318
PYN: PNA2_0565
PYS: Py04_0108
TKO: TK0866
TON: TON_0442
TGA: TGAM_0731(apgM)
TSI: TSIB_1580
THE: GQS_03000
THA: TAM4_869
THM: CL1_0248
TLT: OCC_11994
THS: TES1_0154
TNU: BD01_0264
TEU: TEU_07035
PPAC: PAP_01310
MBAR: MSBR2_2244
MBAK: MSBR3_2297
MAC: MA_0132
MMA: MM_1418
MMAC: MSMAC_3266
METM: MSMTP_3139
MTHR: MSTHT_1913
MTHE: MSTHC_1370
MHOR: MSHOH_3991
MBU: Mbur_1982
MMET: MCMEM_0211
MMH: Mmah_0223
MPY: Mpsy_2177
MTP: Mthe_0545
MCJ: MCON_1451
MHI: Mhar_0528
MHU: Mhun_0447
MEMA: MMAB1_0442(apgM) MMAB1_2342(apgM)
MPI: Mpet_0068
MBN: Mboo_0678
MPD: MCP_1263(apgM-1) MCP_1945(apgM-2) MCP_2448(apgM-3)
MEZ: Mtc_1004(gpmA-1) Mtc_1636(gpmA-2)
RCI: RCIX2144(gpmA-2) RCIX838(gpmA-1)
APE: APE_1616.1(apgM)
ACJ: ACAM_1014(apgM)
SMR: Smar_0332
IHO: Igni_1374
IIS: EYM_07205
DKA: DKAM_0338
TAG: Tagg_0654
IAG: Igag_0471
HBU: Hbut_1197
STO: STK_03770(apgM)
SSO: SSO0417
SOL: Ssol_1394
SSOA: SULA_1440
SSOL: SULB_1441
SSOF: SULC_1439
SAI: Saci_0837
SID: M164_1734
SII: LD85_1944
SIH: SiH_1662
SIR: SiRe_1583
SIC: SiL_1575
MSE: Msed_2238
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PIS: Pisl_1043
PCL: Pcal_1668
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PYR: P186_0579
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CCAI: NAS2_0489
NAA: Nps_03375
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Reference
  Authors
Johnsen U, Schonheit P
  Title
Characterization of cofactor-dependent and cofactor-independent phosphoglycerate mutases from Archaea.
  Journal
Extremophiles 11:647-57 (2007)
DOI:10.1007/s00792-007-0094-x
  Sequence
[afu:AF_1751]

KEGG   ENZYME: 5.4.2.12
Entry
EC 5.4.2.12                 Enzyme                                 

Name
phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent);
cofactor independent phosphoglycerate mutase;
2,3-diphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase;
phosphoglycerate phosphomutase (ambiguous);
phosphoglyceromutase (ambiguous);
monophosphoglycerate mutase (ambiguous);
monophosphoglyceromutase (ambiguous);
GriP mutase (ambiguous);
PGA mutase (ambiguous);
iPGM;
iPGAM;
PGAM-i
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Phosphotransferases (phosphomutases)
Sysname
D-phosphoglycerate 2,3-phosphomutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
Reaction(IUBMB)
2-phospho-D-glycerate = 3-phospho-D-glycerate [RN:R01518]
Reaction(KEGG)
R01518
Substrate
2-phospho-D-glycerate [CPD:C00631]
Product
3-phospho-D-glycerate [CPD:C00197]
Comment
The enzymes from higher plants, algae, some fungi, nematodes, sponges, coelenterates, myriapods, arachnids, echinoderms, archaea and some bacteria (particularly Gram-positive) have maximum activity in the absence of 2,3-bisphospho-D-glycerate. cf. EC 5.4.2.11 phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-dependent). The enzyme contains two Mn2+ (or in some species two Co2+ ions). The reaction involves a phosphotransferase reaction to serine followed by transfer back to the glycerate at the other position. Both metal ions are involved in the reaction.
History
EC 5.4.2.12 created 2013
Pathway
ec00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
ec00260  Glycine, serine and threonine metabolism
ec00680  Methane metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K15633  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
K15635  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Genes
BFO: BRAFLDRAFT_285351
SPU: 591606
APLC: 110981255
SKO: 100374181
VEM: 105557541
PXY: 105396475
ISC: IscW_ISCW020443
TUT: 107364420
DPTE: 113798840
CSCU: 111632029
CEL: CELE_F57B10.3(ipgm-1)
CBR: CBG12654
BMY: Bm1_04665
TSP: Tsp_02466
EPA: 110245398
ADF: 107354794
AMIL: 114972505
PDAM: 113670039
SPIS: 111340131
DGT: 114516156
HMG: 100201970
AQU: 100632232
ATH: AT1G09780(iPGAM1) AT3G08590(iPGAM2)
CPAP: 110821299
CIT: 102622582
TCC: 18602404
VRA: 106759444
VAR: 108329339
VUN: 114185029
CCAJ: 109818417
CAM: 101512802
LJA: Lj1g3v2570560.1(Lj1g3v2570560.1) Lj1g3v2570560.2(Lj1g3v2570560.2) Lj1g3v2570560.3(Lj1g3v2570560.3) Lj3g3v0461640.1(Lj3g3v0461640.1)
ADU: 107485416
AIP: 107639756
FVE: 101294379
RCN: 112192241
PPER: 18772584
PMUM: 103342439
PAVI: 110769388
CSV: 101217925
CMO: 103501500
MCHA: 111023145
RCU: 8283033
JCU: 105649052
JRE: 108990002
VVI: 100245007
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SOT: 102577561(PGAM)
CANN: 107878039
NTA: 107769473(PGAM-I) 107831677
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PEQ: 110032367
ATR: 18432463
CRE: CHLREDRAFT_196305(PGM1a)
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NTE: NEUTE1DRAFT117878(NEUTE1DRAFT_117878)
MGR: MGG_00901
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EHI: EHI_050940(60.t00033) EHI_112990
EHX: EMIHUDRAFT_435848(PGMI1)
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ECO: b3612(gpmM)
ECJ: JW3587(gpmI)
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ECS: ECs4490
ECF: ECH74115_4985(gpmI)
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ESO: O3O_24905
ESM: O3M_00795
ECK: EC55989_4079(gpmI)
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ECW: EcE24377A_4116(gpmI)
EUN: UMNK88_4399(gpmI)
ECP: ECP_3713
ENA: ECNA114_3766(gpmI)
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EBR: ECB_03470(yibO)
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EBE: B21_03421(gpmM)
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EIH: ECOK1_4056(gpmI)
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STY: STY4091
STT: t3815
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SEO: STM14_4464(pmgI)
SEY: SL1344_3670(pmgI)
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SEI: SPC_3786(pmgI)
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SENE: IA1_18005
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SFX: S4117(yibO)
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SFT: NCTC1_03947(gpmM)
SSN: SSON_3793(yibO)
SBO: SBO_3618(yibO)
SBC: SbBS512_E4040(gpmI)
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ECLX: LI66_00765
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ECHG: FY206_00705(gpmM)
ENF: AKI40_0137(gpmI)
EBG: FAI37_05990(gpmM)
ESA: ESA_04115
CSK: ES15_0089(gpmI)
CTU: CTU_41210(gpmI)
KPN: KPN_03956(yibO)
KPU: KP1_5306(yibO)
KPP: A79E_0159
KPT: VK055_3514(gpmI)
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KPX: PMK1_01460(gpmI)
KPNU: LI86_00785
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EAE: EAE_06270
EAR: CCG32748
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CKO: CKO_05070
CPOT: FOB25_12010(gpmM)
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YEW: CH47_3419(gpmI)
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YAL: AT01_2403(gpmI)
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SOF: NCTC11214_01607(gpmI)
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PSA: PST_4080(gpmA)
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PSR: PSTAA_4232(gpmA)
PSTT: CH92_20370
PPUU: PputUW4_00276(gpmI)
PKC: PKB_5422(gpmI)
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