KEGG   ORTHOLOGY: K18591
Entry
K18591                      KO                                     
Symbol
dfrD, dhfr
Name
dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein) [EC:1.5.1.3]
Pathway
map00670  One carbon pool by folate
map00790  Folate biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R00940  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R02235  dihydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R02236  dihydrofolate:NADP+ oxidoreductase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K18591  dfrD, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
   00670 One carbon pool by folate
    K18591  dfrD, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   01504 Antimicrobial resistance genes
    K18591  dfrD, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K18591  dfrD, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance genes [BR:ko01504]
 Gene variants
  Trimethoprim resistance genes
   Dihydrofolate reductases
    K18591  dfrD, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Other DBs
COG: COG0262
GO: 0004146
Genes
NTX: NQZ71_21885(dfr)
ACAI: ISX45_00040(dfr_DGK)
PASA: BAOM_2495(folA)
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SSD: SPSINT_2038
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JPO: G7058_00790
LGO: JCM16774_1587(folA)
AG: BAE15963(dfrG) CAA90486(dfrD) CAR62505(dfrK)
 » show all
Reference
PMID:19015335
  Authors
Kadlec K, Schwarz S
  Title
Identification of a novel trimethoprim resistance gene, dfrK, in a methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST398 strain and its physical linkage to the tetracycline resistance gene tet(L).
  Journal
Antimicrob Agents Chemother 53:776-8 (2009)
DOI:10.1128/AAC.01128-08
Reference
PMID:23162539
  Authors
Roberts MC, Schwarz S, Aarts HJ
  Title
Erratum: Acquired antibiotic resistance genes: an overview.
  Journal
Front Microbiol 3:384 (2012)
DOI:10.3389/fmicb.2012.00384
Reference
PMID:11432417
  Authors
Skold O
  Title
Resistance to trimethoprim and sulfonamides.
  Journal
Vet Res 32:261-73 (2001)
DOI:10.1051/vetres:2001123

  All links  
Ontology (5)   
   KEGG BRITE (3)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Chemical reaction (10)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (6)   
   KEGG RCLASS (3)   
Gene (30)   
   KEGG GENES (27)   
   KEGG MGENES (2)   
   OC (1)   
Literature (3)   
   PubMed (3)   
All databases (54)   

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KEGG   ORTHOLOGY: K13998
Entry
K13998                      KO                                     
Symbol
DHFR-TS
Name
dihydrofolate reductase / thymidylate synthase [EC:1.5.1.3 2.1.1.45]
Pathway
map00240  Pyrimidine metabolism
map00670  One carbon pool by folate
map00790  Folate biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01232  Nucleotide metabolism
map01240  Biosynthesis of cofactors
Module
M00126  Tetrahydrofolate biosynthesis, GTP => THF
M00841  Tetrahydrofolate biosynthesis, mediated by PTPS, GTP => THF
M00938  Pyrimidine deoxyribonucleotide biosynthesis, UDP => dTTP
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R00940  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R02101  5,10-methylenetetrahydrofolate:dUMP C-methyltransferase
R02235  dihydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R02236  dihydrofolate:NADP+ oxidoreductase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09104 Nucleotide metabolism
   00240 Pyrimidine metabolism
    K13998  DHFR-TS; dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K13998  DHFR-TS; dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
   00670 One carbon pool by folate
    K13998  DHFR-TS; dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K13998  DHFR-TS; dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.45  thymidylate synthase
     K13998  DHFR-TS; dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
Other DBs
GO: 0004146 0004799
Genes
DPTE: 113798991
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ALY: 9305209 9316457 9322288
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PVU: PHAVU_009G022100g PHAVU_011G043000g
VRA: 106755099 106762733 106765682
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VUN: 114163394 114168580
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PPER: 18768793
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TPS: THAPS_13647(TMS1)
AAF: AURANDRAFT_38942
PIF: PITG_06749
PSOJ: PHYSODRAFT_555231
SPAR: SPRG_06761
EHX: EMIHUDRAFT_451981
GTT: GUITHDRAFT_69716
TBR: Tb927.7.5480
TBG: TbgDal_VII6360
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LMA: LMJF_06_0860(DHFR-TS)
LIF: LINJ_06_0890(DHFR-TS)
LDO: LDBPK_060890
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LMAT: 92517853(LSCM1_07994)
LBZ: LBRM_06_0830
LPAN: LPMP_060820(DHFR-TS)
LOI: 92363604(LSCM4_07793)
NGR: NAEGRDRAFT_76251
 » show all
Reference
PMID:8374616
  Authors
Lazar G, Zhang H, Goodman HM
  Title
The origin of the bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase isogenes of Arabidopsis thaliana.
  Journal
Plant J 3:657-68 (1993)
DOI:10.1111/j.1365-313X.1993.00657.x
  Sequence
[ath:AT2G16370 AT4G34570]
Reference
PMID:8628226
  Authors
Schlichtherle IM, Roos DS, Van Houten JL
  Title
Cloning and molecular analysis of the bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase gene in the ciliated protozoan Paramecium tetraurelia.
  Journal
Mol Gen Genet 250:665-73 (1996)
DOI:10.1007/BF02172977

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (2)   
   GO (2)   
Pathway (15)   
   KEGG PATHWAY (12)   
   KEGG MODULE (3)   
Drug (5)   
   KEGG DRUG (5)   
Chemical reaction (14)   
   KEGG ENZYME (2)   
   KEGG REACTION (7)   
   KEGG RCLASS (5)   
Gene (5672)   
   KEGG GENES (381)   
   KEGG MGENES (1015)   
   RefGene (4270)   
   OC (6)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (5712)   

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KEGG   ORTHOLOGY: K19644
Entry
K19644            Tight     KO                                     
Symbol
dfrA19, dfrA18
Name
dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein) [EC:1.5.1.3]
Pathway
map00670  One carbon pool by folate
map00790  Folate biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R00940  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R02235  dihydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R02236  dihydrofolate:NADP+ oxidoreductase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K19644  dfrA19, dfrA18; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
   00670 One carbon pool by folate
    K19644  dfrA19, dfrA18; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   01504 Antimicrobial resistance genes
    K19644  dfrA19, dfrA18; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K19644  dfrA19, dfrA18; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance genes [BR:ko01504]
 Gene variants
  Trimethoprim resistance genes
   Dihydrofolate reductases
    K19644  dfrA19, dfrA18; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance: KEGG signatures [br01600.html]
 Signature KOs for antimicrobial resistance
  K19644
Other DBs
COG: COG0262
GO: 0004146
Genes
ECLY: LI62_012820
KOK: KONIH1_31170
CFD: CFNIH1_06135
CFQ: C2U38_21260(dfrA)
CFAR: CI104_25730
KIN: AB182_03125
EBC: C2U52_01420(dfrA)
AG: CAC81324(dfrA18)
Reference
PMID:9835490
  Authors
Tosini F, Visca P, Luzzi I, Dionisi AM, Pezzella C, Petrucca A, Carattoli A
  Title
Class 1 integron-borne multiple-antibiotic resistance carried by IncFI and IncL/M plasmids in Salmonella enterica serotype typhimurium.
  Journal
Antimicrob Agents Chemother 42:3053-8 (1998)
DOI:10.1128/AAC.42.12.3053
  Sequence
[ag:CAC81324]

  All links  
Ontology (6)   
   KEGG BRITE (4)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Chemical reaction (10)   
   KEGG ENZYME (1)   
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   KEGG RCLASS (3)   
Gene (9)   
   KEGG GENES (8)   
   OC (1)   
Literature (1)   
   PubMed (1)   
All databases (32)   

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KEGG   ORTHOLOGY: K19643
Entry
K19643            Tight     KO                                     
Symbol
dfrA10, dfr10
Name
dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein) [EC:1.5.1.3]
Pathway
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map01100  Metabolic pathways
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
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Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K19643  dfrA10, dfr10; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
   00670 One carbon pool by folate
    K19643  dfrA10, dfr10; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   01504 Antimicrobial resistance genes
    K19643  dfrA10, dfr10; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K19643  dfrA10, dfr10; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance genes [BR:ko01504]
 Gene variants
  Trimethoprim resistance genes
   Dihydrofolate reductases
    K19643  dfrA10, dfr10; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance: KEGG signatures [br01600.html]
 Signature KOs for antimicrobial resistance
  K19643
Other DBs
COG: COG0262
GO: 0004146
Genes
ABY: ABAYE3614(dfrA10)
AG: AAA92749(dfrA10)
Reference
PMID:1804022
  Authors
Parsons Y, Hall RM, Stokes HW
  Title
A new trimethoprim resistance gene, dhfrX, in the In7 integron of plasmid pDGO100.
  Journal
Antimicrob Agents Chemother 35:2436-9 (1991)
DOI:10.1128/AAC.35.11.2436
  Sequence
[ag:AAA92749]
Reference
PMID:12499211
  Authors
Partridge SR, Hall RM
  Title
In34, a complex In5 family class 1 integron containing orf513 and dfrA10.
  Journal
Antimicrob Agents Chemother 47:342-9 (2003)
DOI:10.1128/AAC.47.1.342-349.2003

  All links  
Ontology (6)   
   KEGG BRITE (4)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Chemical reaction (10)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (6)   
   KEGG RCLASS (3)   
Gene (3)   
   KEGG GENES (2)   
   OC (1)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (27)   

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KEGG   ORTHOLOGY: K18590
Entry
K18590                      KO                                     
Symbol
dfrA12, dhfr
Name
dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein) [EC:1.5.1.3]
Pathway
map00670  One carbon pool by folate
map00790  Folate biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R00940  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R02235  dihydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R02236  dihydrofolate:NADP+ oxidoreductase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K18590  dfrA12, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
   00670 One carbon pool by folate
    K18590  dfrA12, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   01504 Antimicrobial resistance genes
    K18590  dfrA12, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K18590  dfrA12, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance genes [BR:ko01504]
 Gene variants
  Trimethoprim resistance genes
   Dihydrofolate reductases
    K18590  dfrA12, dhfr; dihydrofolate reductase (trimethoprim resistance protein)
Antimicrobial resistance: KEGG signatures [br01600.html]
 Signature KOs for antimicrobial resistance
  K18590
Other DBs
COG: COG0262
GO: 0004146
Genes
SEM: STMDT12_L00660
SETU: STU288_1p00755
SEC: SCH_030(tri)
KPM: KPHS_p300720
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AG: AAS66087(dfrA21) CAA79767(dfrA12) CAA90683(dfrA13) CAF31623(dfrA22) CAX16467(dfrA33)
 » show all
Reference
PMID:10639362
  Authors
Adrian PV, Thomson CJ, Klugman KP, Amyes SG
  Title
New gene cassettes for trimethoprim resistance, dfr13, and Streptomycin-spectinomycin resistance, aadA4, inserted on a class 1 integron.
  Journal
Antimicrob Agents Chemother 44:355-61 (2000)
DOI:10.1128/AAC.44.2.355-361.2000
Reference
PMID:23162539
  Authors
Roberts MC, Schwarz S, Aarts HJ
  Title
Erratum: Acquired antibiotic resistance genes: an overview.
  Journal
Front Microbiol 3:384 (2012)
DOI:10.3389/fmicb.2012.00384
Reference
PMID:11432417
  Authors
Skold O
  Title
Resistance to trimethoprim and sulfonamides.
  Journal
Vet Res 32:261-73 (2001)
DOI:10.1051/vetres:2001123

  All links  
Ontology (6)   
   KEGG BRITE (4)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Chemical reaction (10)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (6)   
   KEGG RCLASS (3)   
Gene (52)   
   KEGG GENES (38)   
   KEGG MGENES (13)   
   OC (1)   
Literature (3)   
   PubMed (3)   
All databases (77)   

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KEGG   ORTHOLOGY: K00287
Entry
K00287                      KO                                     
Symbol
DHFR, folA
Name
dihydrofolate reductase [EC:1.5.1.3]
Pathway
map00670  One carbon pool by folate
map00790  Folate biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01240  Biosynthesis of cofactors
map01523  Antifolate resistance
Module
M00126  Tetrahydrofolate biosynthesis, GTP => THF
M00840  Tetrahydrofolate biosynthesis, mediated by ribA and trpF, GTP => THF
Reaction
R00936  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00937  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R00939  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R00940  5,6,7,8-tetrahydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R02235  dihydrofolate:NAD+ oxidoreductase
R02236  dihydrofolate:NADP+ oxidoreductase
R11765  tetrahydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase (7,8-dihydrobiopterin-forming)
Disease
H01197  Dihydrofolate reductase deficiency
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00790 Folate biosynthesis
    K00287  DHFR, folA; dihydrofolate reductase
   00670 One carbon pool by folate
    K00287  DHFR, folA; dihydrofolate reductase
 09160 Human Diseases
  09176 Drug resistance: antineoplastic
   01523 Antifolate resistance
    K00287  DHFR, folA; dihydrofolate reductase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.5.1.3  dihydrofolate reductase
     K00287  DHFR, folA; dihydrofolate reductase
Other DBs
COG: COG0262
GO: 0004146
Genes
HSA: 1719(DHFR) 200895(DHFR2)
PTR: 460535(DHFR2) 735442(DHFR)
PPS: 100973672(DHFR) 103784319(DHFR2)
GGO: 101124835(DHFR) 101149577(DHFR2)
PON: 100437501(DHFR) 100455969(DHFR2)
PPYG: 129032402 129037553(DHFR)
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HMH: 116467043(DHFR2)
SSYN: 129471702(DHFR2) 129492852(DHFR)
MCC: 106996159(DHFR2) 707382 711268(DHFR)
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CFR: 102504862(DHFR)
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ECB: 100073256(DHFR)
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