KEGG   ORTHOLOGY: K03530Help
Entry
K03530                      KO                                     

Name
hupB
Definition
DNA-binding protein HU-beta
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
   03036 Chromosome and associated proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Prokaryotic Type
  DNA Replication Initiation Factors
   Initiation factors (bacterial)
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Prokaryotic Type
  Nucleoid associated proteins
   HU (heat unstable protein)
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic Type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Supressor
      K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0776
Genes
ECO: b0440(hupB)
ECJ: JW0430(hupB)
ECD: ECDH10B_0396(hupB)
EBW: BWG_0322(hupB)
ECOK: ECMDS42_0339(hupB)
ECE: Z0547(hupB)
ECS: ECs0494
ECF: ECH74115_0526(hupB)
ETW: ECSP_0508(hupB)
ELX: CDCO157_0482
EOJ: ECO26_0475(hupB)
EOI: ECO111_0473(hupB)
EOH: ECO103_0417(hupB)
ECOH: ECRM13516_0424(hupB)
ECG: E2348C_0375(hupB)
EOK: G2583_0552(hupB)
ESO: O3O_06010
ESM: O3M_19265
ESL: O3K_19290
ECW: EcE24377A_0476(hupB)
ELH: ETEC_0493
ECC: c0556(hupB)
ECP: ECP_0501
ECI: UTI89_C0468(hupB)
ECV: APECO1_1571(hupB)
ECX: EcHS_A0517(hupB)
ECM: EcSMS35_0483(hupB)
ECY: ECSE_0466
ECR: ECIAI1_0444(hupB)
ECQ: ECED1_0464(hupB)
ECK: EC55989_0454(hupB)
ECT: ECIAI39_0233(hupB)
EOC: CE10_0413(hupB)
EUM: ECUMN_0480(hupB)
ECZ: ECS88_0437(hupB)
ELO: EC042_0478(hupB)
ESE: ECSF_0401
EBR: ECB_00392(hupB)
EBD: ECBD_3215
EKF: KO11_21375(hupB)
EAB: ECABU_c05230(hupB)
EDJ: ECDH1ME8569_0425(hupB)
EIH: ECOK1_0422(hupB)
ENA: ECNA114_0418(hupB)
ELW: ECW_m0512(hupB)
ELL: WFL_02545(hupB)
ELC: i14_0534(hupB)
ELD: i02_0534(hupB)
ELP: P12B_c0454(hupB)
EBL: ECD_00392(hupB)
EBE: B21_00396(hupB)
ELF: LF82_1048(hupB)
ECOI: ECOPMV1_00427(hupB)
ECOJ: P423_02240
ECOS: EC958_0579(hupB)
EFE: EFER_2577(hupB)
EAL: EAKF1_ch0992c(hupB)
STY: STY0493(hupB)
STT: t2409(hupB)
STM: STM0451(hupB)
SEO: STM14_0534(hupB)
SEY: SL1344_0445(hupB)
SEJ: STMUK_0458(hupB)
SEB: STM474_0472(hupB)
SEF: UMN798_0495(hupB)
SENR: STMDT2_04481(hupB)
SENI: CY43_02595
SPT: SPA2271(hupB)
SEK: SSPA2113
SEI: SPC_0465(hupB)
SEC: SCH_0493(hupB)
SEH: SeHA_C0554(hupB)
SHB: SU5_01143
SEE: SNSL254_A0500(hupB) SNSL254_p_0022(hup)
SEW: SeSA_A0510(hupB)
SEA: SeAg_B0491(hupB)
SENS: Q786_02225
SED: SeD_A0493(hupB)
SEG: SG0462(hupB)
SEL: SPUL_2514(hupB)
SEGA: SPUCDC_2500(hupB)
SET: SEN0433(hupB)
SENA: AU38_02210
SENO: AU37_02205
SENV: AU39_02210
SENQ: AU40_02450
SENL: IY59_02260
SEEP: I137_11450
SENB: BN855_4490(hupB)
SENE: IA1_02405
SBG: SBG_0396(hupB)
SBZ: A464_404
SFL: SF0385(hupB)
SFX: S0391(hupB)
SFV: SFV_0414(hupB)
SFE: SFxv_0428(hupB)
SFN: SFy_0483
SFS: SFyv_0522
SFT: NCTC1_00397(hupB)
SSN: SSON_0423(hupB)
SBO: SBO_0334(hupB)
SBC: SbBS512_E0363(hupB)
SDY: SDY_0292(hupB)
ENC: ECL_01198
EEC: EcWSU1_00964(hupB)
ECLX: LI66_04930
ECLY: LI62_05450
ECLZ: LI64_05135
ESA: ESA_02858
CSK: ES15_2943(hupB)
CTU: CTU_10200(hupB)
KPN: KPN_00402(hupB)
KPU: KP1_1273(hupB)
KPP: A79E_3881
KPT: VK055_2151(hupB)
KPE: KPK_4280(hupB)
KPR: KPR_4317(hupB)
KPJ: N559_4004
KPNU: LI86_20595
KPNK: BN49_1376(hupB)
KVA: Kvar_3979
KOX: KOX_12760
KOE: A225_1283
EAE: EAE_12780
CKO: CKO_02720
CRO: ROD_04951(hupB)
CAMA: F384_01945
BEN: BOBLI757_301(hupB)
BED: BTURN675_258(hupB)
EBT: EBL_c28820(hupB)
SBW: TGUWTKB_6060(hupB)
DEN: MHIR_DE00108(hupB)
EBF: D782_3398
PSTS: E05_48760(hupB)
YPE: YPO3154(hupB)
YPK: y1030(hupB)
YPH: YPC_3438(hupB)
YPA: YPA_2649
YPN: YPN_0936
YPM: YP_0777(hupB)
YPG: YpAngola_A3051(hupB)
YPW: CH59_2905(hupB)
YPJ: CH55_1732(hupB)
YPV: BZ15_374(hupB)
YPL: CH46_1946(hupB)
YPS: YPTB0962(hupB)
YPO: BZ17_1585(hupB)
YPI: YpsIP31758_3089(hupB)
YPY: YPK_3231
YPB: YPTS_1003
YPQ: DJ40_1396(hupB)
YPU: BZ21_206(hupB)
YPR: BZ20_1084(hupB)
YPC: BZ23_482(hupB)
YPF: BZ19_319(hupB)
YEN: YE3131(hopD)
YEY: Y11_20511
YEW: CH47_2507(hupB)
YET: CH48_2704(hupB)
YEE: YE5303_35941(hopD)
YAL: AT01_1453(hupB)
YFR: AW19_2097(hupB)
YIN: CH53_2864(hupB)
YKR: CH54_3689
YRO: CH64_3581(hupB)
YRU: BD65_2835(hupB)
SPE: Spro_1098
SRL: SOD_c09370(hupB)
SPLY: Q5A_004985(hupB)
SSZ: SCc_485(hupB)
SMAF: D781_1012
SMW: SMWW4_v1c10410(hupB)
SMAR: SM39_0405(hupB)
SMAC: SMDB11_0345(hupB)
SERF: L085_23345
RAA: Q7S_16875
ECA: ECA1151(hupB)
PATR: EV46_05800
PATO: GZ59_11800(hupB)
PCT: PC1_1051
PEC: W5S_3258
SOD: Sant_2997(hupB)
PES: SOPEG_4003(hupB)
DDD: Dda3937_03317(hupB)
DDQ: DDI_0895
ETA: ETA_25040(hopD)
EPY: EpC_26140(hopD)
EPR: EPYR_02836(hupB)
EAM: EAMY_0986(hupB)
EAY: EAM_0995(hupB)
EBI: EbC_10110(hopD)
ERJ: EJP617_21160(hopD)
EGE: EM595_0978(hupB)
PAM: PANA_0999(hupB)
PLF: PANA5342_3300(hupB)
PAJ: PAJ_0326(hupB)
PVA: Pvag_0380(hupB)
PSTW: DSJ_19155
TPTY: NCTC11468_01065(hupB)
PLU: plu3866(hupB)
PAY: PAU_03414
PMR: PMI0118(hupB)
PMIB: BB2000_0280(hupB)
XBO: XBJ1_1634(hupB)
XBV: XBW1_0938(hupB)
XNE: XNC1_0979(hupB) XNC1_p0178(hupB)
XNM: XNC2_0961(hupB) XNC2_p0195(hupB)
XDO: XDD1_0879(hupB)
XPO: XPG1_0466(hupB)
PSI: S70_06760
PSX: DR96_1904(hupB)
PRG: RB151_007600(hupB)
PHEI: NCTC12003_00765(hupB)
MMK: MU9_3239
ETR: ETAE_0995(hupB)
ETD: ETAF_0928
ETE: ETEE_2938
LRI: NCTC12151_02333(hupB)
PSHI: SAMEA2665130_2033(hupB)
XFA: XF_1190
XFT: PD_0475(hupB)
XCC: XCC0978(hupB)
XCB: XC_3262
XCP: XCR_1178
XCV: XCV1084(hupB)
XAX: XACM_1039(hupB)
XAC: XAC1081(hupB)
XCI: XCAW_01179(himA)
XFU: XFF4834R_chr10620(hupB)
XOO: XOO1036(hupB)
XOM: XOO0935(XOO0935)
XOP: PXO_02474
XOR: XOC_1136
XAL: XALC_0590(hupB)
XPH: XppCFBP6546_06160(XppCFBP6546P_06160)
SML: Smlt0992(hupB)
SMT: Smal_0839
SMZ: SMD_0873(hupB)
SACZ: AOT14_09500(ihfB_1)
PSUW: WQ53_02185
PSD: DSC_12040
LAQ: GLA29479_3141(hup)
LEZ: GLE_3415(hupB)
LEM: LEN_1702(hupB)
DKO: I596_2134
VCH: VC1919
VCS: MS6_1681
VCE: Vch1786_I1410(hupB)
VCI: O3Y_09295
VCO: VC0395_A1509(hupB)
VCR: VC395_2034(hupB)
VCM: VCM66_1843(hupB)
VVU: VV1_0019
VVY: VV1107
VPA: VP0920
VPB: VPBB_0878
VAG: N646_3070
VNI: VIBNI_A2425(hupB)
VAN: VAA_02294
VAU: VANGNB10_cI0984(hupB?)
VTA: A1996(hupB)
VFI: VF_0799(hupB)
VSA: VSAL_I0822(hupB) VSAL_p840_66(hupA)
AWD: AWOD_I_0766(hupB)
PPR: PBPRA2634(YPO3154)
PAE: PA1804(hupB) PA3940
PAEV: N297_1858(hupB) N297_4069(hupA)
PAEI: N296_1858(hupB) N296_4069(hupA)
PAEC: M802_1856(hupB) M802_4067(hupA)
PAEO: M801_1857(hupB) M801_3935(hupA)
PRE: PCA10_19380(hupN) PCA10_36830(hupB) PCA10_p1140(hup)
PPSE: BN5_1752(hupB) BN5_2403
PCQ: PcP3B5_20590(hupB_1) PcP3B5_24040(hupB_2)
PPU: PP_0975(hupN) PP_2303(hupB)
PPB: PPUBIRD1_1026(hupN) PPUBIRD1_3382(hupB)
PPX: T1E_1952 T1E_5379(hupB)
PPUN: PP4_35150(hupB) PP4_43340(hupN)
PFL: PFL_1061(hupN) PFL_3984(hupB)
PPRC: PFLCHA0_c10800(hupN) PFLCHA0_c40430(hupB)
PFC: PflA506_1033(hupN) PflA506_3298(hupB)
PFW: PF1751_v1c10080(hupN)
PMAN: OU5_1273(hupB) OU5_2412
PEN: PSEEN1871(hupB) PSEEN4448(hupN)
PSA: PST_2064(hupB)
PSZ: PSTAB_1962(hupB)
PSR: PSTAA_2095(hupB)
PKC: PKB_1988 PKB_2033(hupN)
PAR: Psyc_1474(hupB)
PALI: A3K91_0860
PSYC: DABAL43B_1929(hupB)
PSYA: AOT82_2762
ACB: A1S_1637
ABM: ABSDF1857(hupB)
ABY: ABAYE2017(hupB)
ABN: AB57_1860
ABD: ABTW07_1879(hup) ABTW07_3024(hup)
ABH: M3Q_2015
ABAD: ABD1_16230(hupB)
ABAZ: P795_9095
ABAA: IX88_10095
ACC: BDGL_001006(hup)
ACI: ACIAD1408(hupB)
MCT: MCR_0612
MCS: DR90_1308(hupB)
MCAT: MC25239_00608(hupB)
SON: SO_0548 SO_1797(hupB)
ILO: IL1002(hupB)
CPS: CPS_1873(hupB1) CPS_2063(hupB2) CPS_3781(hupB3)
PHA: PSHAa2059(hupB) PSHAb0462(hupB)
PAT: Patl_3133
PSM: PSM_A2121(hupB) PSM_B0538(hupB)
PTN: PTRA_a2524(hupB) PTRA_b0665(hupB)
PEA: PESP_a2681(hupB) PESP_b0745(hupB)
PSPO: PSPO_a2143(hupB) PSPO_b0913(hupB)
PART: PARC_a1217(hupB) PARC_b0713(hupB)
PTU: PTUN_a1329(hupB) PTUN_b0812(hupB)
PNG: PNIG_a2723(hupB) PNIG_b0625(hupB)
PTD: PTET_a1969(hupA) PTET_a2402(hupB) PTET_b0669(hupB)
PSEN: PNC201_09790(hup) PNC201_11525(hupB1) PNC201_19175(hupB2)
MAQ: Maqu_1837
MHC: MARHY1466(hupB)
MAD: HP15_2182
MBS: MRBBS_2429(hupB)
AMAL: I607_12860
AMAE: I876_13245
AMAO: I634_13105
AMAD: I636_13255
AMAI: I635_13610
AMAG: I533_12845
AMAC: MASE_12705
AAUS: EP12_13445
ASP: AOR13_815
GNI: GNIT_1055(hupB)
GPS: C427_3800
PIN: Ping_1468
FBL: Fbal_2595
MVS: MVIS_3422(hupB)
CJA: CJA_0153(hup) CJA_2003
MICC: AUP74_02264(hupB)
CBU: CBU_1464(hupB)
CBD: CBUD_0508(hup)
CBG: CbuG_0544(hupB)
CBC: CbuK_1695(hupB)
CEY: CleRT_03560(hupB)
LPN: lpg1858(hupB)
LPH: LPV_2133(hubB)
LPO: LPO_1922(hubB)
LPM: LP6_1837
LPF: lpl1822(hubB)
LPP: lpp1826(hubB)
LPC: LPC_1303
LPA: lpa_02684
LPE: lp12_1797
LLO: LLO_1286(hubB) LLO_p0051(hupB)
LFA: LFA_2023(hupB)
LHA: LHA_0713(hupB)
LOK: Loa_00881
LCD: clem_11365(hupB)
TMC: LMI_2624(hupB)
MCA: MCA0532(hupB) MCA2947(hup)
MAH: MEALZ_3046(hupB)
FTU: FTT_0627(hupB)
FTQ: RO31_0716(hupB)
FTF: FTF0627(hupB)
FTW: FTW_1102(hup)
FTT: FTV_0587(hupB)
FTG: FTU_0671(hupB)
FTL: FTL_0895
FTH: FTH_0880
FTA: FTA_0946
FTS: F92_04940
FTI: FTS_0886(hupB)
FTC: DA46_1912(hupB)
FTV: CH67_1232(hupB)
FTZ: CH68_964(hupB)
FTM: FTM_0702(hupB)
FTN: FTN_1054(hupB)
FTX: AW25_954(hupB)
FTD: AS84_1468(hupB)
FTY: CH70_889
FPH: Fphi_1535
FPT: BZ13_451(hupB)
FPI: BF30_1807(hupB)
FPM: LA56_624(hupB)
FPX: KU46_1766(hupB)
FPZ: LA55_767(hupB)
FPJ: LA02_1704(hupB)
FNA: OOM_1322
TCX: Tcr_1180
MEJ: Q7A_2212
MEC: Q7C_2511
CYQ: Q91_0945(hupB)
TIG: THII_0144
AEH: Mlg_2285
TGR: Tgr7_0942
TKM: TK90_0576
TNI: TVNIR_2769(hupB_[H])
TVR: TVD_10330
GAI: IMCC3135_25580(hupB)
HCH: HCH_02163
CSA: Csal_2043
HEL: HELO_2349(hupB1)
HAM: HALO2314
HCO: LOKO_01402(hupB)
HBE: BEI_1724(hupB)
PLC: PAD_212(hupB)
PLI: PLF_211(hupB)
ABO: ABO_1213(dbh1)
ADI: B5T_02378(dbh1)
APAC: S7S_09870
AXE: P40_11430
KKO: Kkor_1952
KGE: TQ33_0589
TOL: TOL_1850
AHA: AHA_2014
ASA: ASA_1892(hupB) ASA_P4G030(hupB)
AVR: B565_2215
AMED: B224_2565
ASR: WL1483_3514(hupB)
ACAV: VI35_09925
OCE: GU3_08525
DNO: DNO_0226
SLIM: SCL_1870
SALN: SALB1_2431
TBN: TBH_C0722
RMA: Rmag_0380
VOK: COSY_0604(hupB)
ENM: EBS_1391(hupB)
NME: NMB1230(hupB)
NMP: NMBB_1315
NMQ: NMBM04240196_0974(hupB)
NMZ: NMBNZ0533_1196(hupB)
NMW: NMAA_0943(hupA) NMAA_1336(hupB)
NMX: NMA510612_1552(hupA) NMA510612_2098(hupB)
NMC: NMC1130(hupB)
NMN: NMCC_1111(hupB)
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PHE: Phep_0128
MUC: MuYL_0010
CHU: CHU_2750(hupB) CHU_3687
DFE: Dfer_4435
SLI: Slin_5982
LBY: Lbys_2921
FAE: FAES_1233 FAES_4055(hupA)
HSW: Hsw_0387
FLM: MY04_3395
AAS: Aasi_0154
CHE: CAHE_0307(ihfB)
GFO: GFO_1443(hupB) GFO_3575
FPS: FP1666(hupA) FP2008(hupB)
FBR: FBFL15_1088(hupB) FBFL15_3077(hupA)
FIN: KQS_02015(hupA) KQS_07495(hupB)
DDO: I597_0844 I597_1639(hupB)
ZGA: ZOBELLIA_1374(hupA) ZOBELLIA_3961(hupB)
NDO: DDD_1563 DDD_2844(hupB)
ELB: VO54_01245(hup) VO54_02118(hupB)
CHZ: CHSO_1247 CHSO_4082(hup)
CTAK: 4412677_02049(hupB) 4412677_02467(hup)
TMAR: MARIT_0114(hupA) MARIT_1404(hupB)
BBL: BLBBGE_051(hupB) BLBBGE_543(hupA)
BPI: BPLAN_098 BPLAN_582(hupB)
BMM: MADAR_264 MADAR_554(hupB)
BCP: BLBCPU_050(hupB) BLBCPU_512(hupA)
BBG: BGIGA_096(hupA) BGIGA_575(hupB)
BLP: BPAA_095 BPAA_581(hupB)
CTE: CT0160(hupB) CT0295
PROC: Ptc2401_00272(hupB) Ptc2401_01884(hupA)
IAL: IALB_0305(hupB) IALB_2218
CACI: CLOAM0973(hupA) CLOAM1727
HTH: HTH_0513(himA)
TTK: TST_0149
TMA: TM0266
TMW: THMA_0273
TMQ: THMB_0273
TMX: THMC_0273
TPT: Tpet_0658
TRQ: TRQ2_0682
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TLE: Tlet_1411
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THER: Y592_02930
FNO: Fnod_0010
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MARN: LN42_05170
CEX: CSE_00700(hup) CSE_00740 CSE_02030(hup)
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NDE: NIDE0404(hupA) NIDE4047(hupB)
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NJA: NSJP_0592(hupB) NSJP_1457(hupB)
LFC: LFE_2021
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MOX: DAMO_1382(hup) DAMO_2562(hupB)
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TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Bartosik AA, Jagura-Burdzy G
  Title
Bacterial chromosome segregation.
  Journal
Acta Biochim Pol 52:1-34 (2005)
Reference
  Authors
Dame RT
  Title
The role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin.
  Journal
Mol Microbiol 56:858-70 (2005)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2005.04598.x
Reference
  Authors
Azam TA, Ishihama A
  Title
Twelve species of the nucleoid-associated protein from Escherichia coli. Sequence recognition specificity and DNA binding affinity.
  Journal
J Biol Chem 274:33105-13 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.46.33105

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