KEGG   ORTHOLOGY: K05787Help
Entry
K05787                      KO                                     

Name
hupA
Definition
DNA-binding protein HU-alpha
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
   03036 Chromosome and associated proteins
    K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Prokaryotic Type
  DNA Replication Initiation Factors
   Initiation factors (bacterial)
    K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Prokaryotic Type
  Nucleoid associated proteins
   HU (heat unstable protein)
    K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic Type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Supressor
      K05787  hupA; DNA-binding protein HU-alpha
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0776
Genes
ECO: b4000(hupA)
ECJ: JW3964(hupA)
ECD: ECDH10B_4189(hupA)
EBW: BWG_3660(hupA)
ECOK: ECMDS42_3438(hupA)
ECE: Z5576(hupA)
ECS: ECs4923
ECF: ECH74115_5469(hupA)
ETW: ECSP_5070(hupA)
ELX: CDCO157_4664
EOJ: ECO26_5109(hupA)
EOI: ECO111_4817(hupA)
EOH: ECO103_4749(hupA)
ECOO: ECRM13514_5121(hupA)
ECOH: ECRM13516_4857(hupA)
ECG: E2348C_4307(hupA)
EOK: G2583_4818(hupA)
ESO: O3O_01490
ESM: O3M_23775
ESL: O3K_23855
ECW: EcE24377A_4543(hupA)
ELH: ETEC_4260
ECC: c4957(hupA)
ECP: ECP_4213
ECI: UTI89_C3819(hupA)
ECX: EcHS_A4234(hupA)
ECM: EcSMS35_4448(hupA)
ECY: ECSE_4288
ECR: ECIAI1_4215(hupA)
ECQ: ECED1_4707(hupA)
ECK: EC55989_4485(hupA)
ECT: ECIAI39_4390(hupA)
EOC: CE10_4680(hupA)
EUM: ECUMN_4524(hupA)
ECZ: ECS88_4461(hupA)
ELO: EC042_4367(hupA)
ESE: ECSF_3854
EBR: ECB_03877(hupA)
EBD: ECBD_4032
EKF: KO11_02370(hupA)
EAB: ECABU_c45160(hupA)
EDJ: ECDH1ME8569_3860(hupA)
EIH: ECOK1_4476(hupA)
ENA: ECNA114_3423(hupA)
ELW: ECW_m4359(hupA)
ELL: WFL_21215(hupA)
ELC: i14_4547(hupA)
ELD: i02_4547(hupA)
ELP: P12B_c4112(hupA)
EBL: ECD_03877(hupA)
EBE: B21_03830(hupA)
ELF: LF82_1047(hupA)
ECOI: ECOPMV1_02788(hupA)
ECOJ: P423_22170
ECOS: EC958_5111(hupA)
EFE: EFER_3754(hupA)
EAL: EAKF1_ch1916c(hupA)
STY: STY3715(hupA)
STT: t3461(hupA)
STM: STM4170(hupA)
SEO: STM14_5011(hupA)
SEY: SL1344_4109(hupA)
SEJ: STMUK_4154(hupA)
SEB: STM474_4356(hupA)
SEF: UMN798_4517(hupA)
SENR: STMDT2_40231(hupA)
SEND: DT104_41671(hupA)
SENI: CY43_21770
SPT: SPA4007(hupA)
SEK: SSPA3722
SEI: SPC_4001(hupA)
SEC: SCH_4051(hupA)
SEH: SeHA_C4501(hupA)
SHB: SU5_0249
SEE: SNSL254_A4503(hupA)
SEW: SeSA_A4381(hupA)
SEA: SeAg_B4414(hupA)
SENS: Q786_20425
SED: SeD_A4577(hupA)
SEG: SG3436(hupA)
SEL: SPUL_3414(hupA)
SEGA: SPUCDC_3400(hupA)
SET: SEN3956(hupA)
SENA: AU38_20470
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SENQ: AU40_22885
SENL: IY59_20975
SEEP: I137_16315
SENB: BN855_42360(hupA)
SENE: IA1_20280
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SFL: SF4072(hupA)
SFX: S3663(hupA)
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SFE: SFxv_4439(hupA)
SFN: SFy_5833
SFS: SFyv_5900
SFT: NCTC1_04419(hupA)
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EEC: EcWSU1_00227(hupA)
ESA: ESA_03673
CSK: ES15_3613(hupA)
CTU: CTU_03110(hupA)
KPN: KPN_04382(hupA)
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KPP: A79E_4805
KPT: VK055_3092(hupA)
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KPNU: LI86_25350
KVA: Kvar_4860
KOX: KOX_07995
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CRO: ROD_37521(hupA)
CAMA: F384_22015
BEN: BOBLI757_562(hupA)
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EBT: EBL_c37070(hupA)
CLAP: NCTC11466_04338(hupA)
ICP: ICMP_522(hupA)
HED: TPER_HE00026(hupA)
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PPET: C9I82_351
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YPK: y0499(hupA)
YPH: YPC_0522(hupA)
YPA: YPA_3604
YPN: YPN_0234
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YPV: BZ15_3994(hupA)
YPL: CH46_1345(hupA)
YPS: YPTB0297(hupA)
YPO: BZ17_2276(hupA)
YPI: YpsIP31758_3846(hupA)
YPY: YPK_0354
YPB: YPTS_0318
YPQ: DJ40_2114(hupA)
YPU: BZ21_3664(hupA)
YPR: BZ20_1817(hupA)
YPC: BZ23_3936(hupA)
YPF: BZ19_3767(hupA)
YEN: YE0300(hupA)
YEY: Y11_35081
YEW: CH47_3177(hupA)
YET: CH48_2008(hupA)
YEE: YE5303_43401(hupA)
YAL: AT01_2165(hupA)
YFR: AW19_2896(hupA)
YIN: CH53_2108(hupA)
YKR: CH54_2893
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YRU: BD65_1636(hupA)
SPE: Spro_0290
SRL: SOD_c02510(hupA)
SPLY: Q5A_001385(hupA)
SMAF: D781_0268
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SMAR: SM39_4211(hupA)
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PATO: GZ59_02630(hupA)
PCT: PC1_0222
PEC: W5S_0237
SGL: SG0141
SOD: Sant_3910(hupA)
PES: SOPEG_3547(hupA)
DDD: Dda3937_00241(hupA)
DDQ: DDI_4564
ETA: ETA_01770(hupA)
EPY: EpC_02670(hupA)
EPR: EPYR_00278(hupA)
EAM: EAMY_0259(hupA)
EAY: EAM_0246(hupA)
EBI: EbC_02740
ERJ: EJP617_13620(hupA)
EGE: EM595_3239(hupA)
BUC: BU032(hupA)
BAP: BUAP5A_031(hupA)
BAU: BUAPTUC7_032(hupA)
BAW: CWU_00175
BAJC: CWS_00160
BUA: CWO_00155
BUP: CWQ_00175
BAK: BAKON_032(hupA)
BUH: BUAMB_031(hupA)
BAPF: BUMPF009_CDS00554(hupa)
BAPG: BUMPG002_CDS00555(hupa)
BAPU: BUMPUSDA_CDS00553(hupa)
BAPW: BUMPW106_CDS00554(hupa)
BAS: BUsg_033(hupA)
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BAPH: IX46_00170
WBR: hupA
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PAM: PANA_0225(hupA)
PLF: PANA5342_4200(hupA)
PAJ: PAJ_3386(hupA)
PVA: Pvag_3479(hupa3)
HHS: HHS_00670
PSTW: DSJ_01885
TPTY: NCTC11468_00205(hupA)
PLU: plu0492(dbhA)
PAY: PAU_00403(dbhA)
PMR: PMI2771(hupA)
PMIB: BB2000_2782(hupA)
XBO: XBJ1_4021(hupA)
XBV: XBW1_0439(hupA)
XNE: XNC1_0621(hupA)
XNM: XNC2_0608(hupA)
XDO: XDD1_3610(hupA)
XPO: XPG1_3141(hupA)
PSI: S70_08500
PSX: DR96_1477(hupA)
PRG: RB151_004190(hupA)
PHEI: NCTC12003_00416(hupA)
MMK: MU9_713
ETR: ETAE_0183(hupA)
ETD: ETAF_0156
ETE: ETEE_1941
LRI: NCTC12151_00418(hupA)
PSHI: SAMEA2665130_2779(hupA)
HIN: HI0430
HIT: NTHI0554(hupA)
HIP: CGSHiEE_00840(nudC)
HIU: HIB_05390
HIE: R2846_0150(hupA)
HIZ: R2866_0145(hupA)
HIK: HifGL_000047(hup)
HIA: H733_0323
HIW: NTHI477_01542(hupA)
HIC: NTHIC486_00558(hupA)
HIX: NTHI723_01259(hupA)
HDU: HD_1004(hupA)
HAP: HAPS_0793(hupA)
HPAZ: K756_02655
HPAS: JL26_02155
HPAK: JT17_11055
HSO: HS_1538(hupA)
HSM: HSM_0566
PMU: PM1732(hupA)
PMV: PMCN06_2039(himA)
PMP: Pmu_20370(hup)
PMUL: DR93_622(hupA)
PDAG: 4362423_01495(hup)
MSU: MS0185(himA)
MHQ: D650_5230
MHAT: B824_6030
MHX: MHH_c00590(hupA)
MHAE: F382_05440
MHAM: J450_04780
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MHAL: N220_11580
MHAQ: WC39_02635
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MVR: X781_4300
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APJ: APJL_0115(hupA)
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ASU: Asuc_1984
AAT: D11S_0683
AAN: D7S_00989
AACN: AANUM_0721
BTO: WQG_16350
BTRE: F542_5730
BTRH: F543_6900
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RPNE: NCTC8284_00987(hup)
VCH: VC0273
VCS: MS6_0136
VCE: Vch1786_I2556(hupA)
VCI: O3Y_01270
VCO: VC0395_A2650(hupA)
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VCM: VCM66_0258(hupA)
VCX: VAA049_3423(hupA)
VCZ: VAB027_3572(hupA)
VVU: VV1_1224
VVY: VV3145
VPA: VP2911
VPB: VPBB_2749
VAG: N646_1987
VSP: VS_2954
VNI: VIBNI_A3315(hupA)
VAN: VAA_02532
VAU: VANGNB10_cI2475c(hupA)
VTA: A2909(hupA)
VFI: VF_2397(hupA)
VSA: VSAL_I2846(hupA) VSAL_p840_28(hupA)
AWD: AWOD_I_2492(hupA)
PPR: PBPRA3422(Y0499)
PAE: PA5348
PAEV: N297_5528(hupB)
PAEI: N296_5528(hupB)
PAU: PA14_70600(hupA)
PNC: NCGM2_6114(hupA)
PAEB: NCGM1900_6192(hupA)
PAEP: PA1S_28895
PAEM: U769_29395
PAEL: T223_29355
PAEG: AI22_05095
PAEC: M802_5526(hupB)
PAEO: M801_5393(hupB)
PMY: Pmen_4401
PMK: MDS_4733
PRE: PCA10_55490(hupA)
PPSE: BN5_4230(hupA)
PCQ: PcP3B5_60760(hupB_3)
PPU: PP_5313(hupA)
PPF: Pput_5222
PPT: PPS_5162
PPB: PPUBIRD1_5106(hupA)
PPI: YSA_04862
PPX: T1E_4000
PPUH: B479_26300
PPUT: L483_31705
PPUN: PP4_53740(hupA)
PPUD: DW66_5732
PMON: X969_25515
PMOT: X970_25150
PSB: Psyr_5027
PSYR: N018_25380
PFL: PFL_6102(hupA)
PPRC: PFLCHA0_c60610(hupA)
PPRO: PPC_6055
PFO: Pfl01_5600(hupA)
PFS: PFLU_6032(hupA)
PFC: PflA506_5314(hupA)
PFW: PF1751_v1c54430(hupA)
PFB: VO64_2924
PMAN: OU5_3563
PEN: PSEEN5458(hupA)
PSA: PST_0439(hupA)
PSZ: PSTAB_0470(hupA)
PSR: PSTAA_0492(hupA)
PSTT: CH92_01835
PPUU: PputUW4_05348(hupA)
PKC: PKB_5679
PSES: PSCI_1867
PSEM: TO66_31045
PSOS: POS17_6063
PANR: A7J50_5767
PSET: THL1_5640
PSIL: PMA3_29610
AVN: Avin_48480(hupA)
AVL: AvCA_48480(hupA)
AVD: AvCA6_48480(hupA)
ACX: Achr_3630(hupA)
SON: SO_1863
SDN: Sden_1500
SFR: Sfri_1439
SAZ: Sama_1611
SBL: Sbal_1762
PHA: PSHAa1287(hupA)
PTN: PTRA_a1627(hupA)
PSPO: PSPO_b1074(hupA)
PNG: PNIG_a1714(hupA)
MAQ: Maqu_3758
MHC: MARHY3662(hup)
MAD: HP15_3504
PIN: Ping_3218
FBL: Fbal_1419
MVS: MVIS_0450(hupA)
MYA: MORIYA_2513(hupA)
HCH: HCH_00556
CSA: Csal_3249
HEL: HELO_4413(hupB3)
HAM: HALO0040
HCO: LOKO_02283(hup)
HBE: BEI_3744
TOL: TOL_0164
OAI: OLEAN_C38710(hupA)
AHA: AHA_3678
ASA: ASA_3644(hupA)
AVR: B565_3442
AMED: B224_4643
ASR: WL1483_1000(hupA)
ACAV: VI35_18270
TAU: Tola_2590
OCE: GU3_14215
BCI: BCI_0040(hup)
BCIB: IM45_099
BCIG: AB162_033(hupA)
PLG: NCTC10937_05174(hupA)
SIL: SPO2612
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Dame RT
  Title
The role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin.
  Journal
Mol Microbiol 56:858-70 (2005)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2005.04598.x
  Sequence
[eco:b4000]

DBGET integrated database retrieval system