KEGG   Acyrthosiphon pisum (pea aphid): 100169254
Entry
100169254         CDS       T01076                                 
Name
(RefSeq) CCR4-NOT transcription complex subunit 1 isoform X3
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
api  Acyrthosiphon pisum (pea aphid)
Pathway
api03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:api00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    100169254
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:api03019]
    100169254
Messenger RNA biogenesis [BR:api03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     100169254
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     100169254
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_TTP_bind DUF3819 CNOT1_HEAT
Other DBs
NCBI-GeneID: 100169254
NCBI-ProteinID: XP_003241722
UniProt: A0A8R2AAX6
Position
A1:complement(157938235..157962734)
AA seq 2447 aa
MNLDSLSYTLSQISYIVANLSKKNYKSSVQELVDAIQLQGFEADRHLLRCLLSHIDLKDI
EGPRNISHKDYYQVQLLAQQCTTLLNKPSLTSILCFALDNPLHIHKPLKPSIQLFVQLSR
ILHLSLVQEVVFGLVCLESANYSTFALQFVKQKLPELIKSYINSDNTEQVTGGGLHDSSP
EVLHLILSHVFAVDDQIFGISEEIKEVLLKNLRRDFPLEVAPVLLAPLIYSDNPDRPMDK
INQDMSSISNSMLDPSLADLVMEMGYTICSSLEECRRNLLSVISGNGSPDIFGSLSIAKV
LSMMIRTHTGLETQSNLTYWPGDNANQDQEKSSINCTTWNVEVFVHTVKDLNPSLSWSDV
IKELDHNDFIIKDRQGLVLLFTALRLGLKAQGYHADNFPVEMIYRHWSNSEAQMSLVQLI
LQNSDVFCFADYPYRSVSIDLLKVTPEADNKDINNWRSIELVDLMLYLAERGLYYQVQEC
LKFPAQKCPDLLALALIQSNGPLSMVRHEMISGLIPIFLGNHSNAGVILHHAWNHQNVGL
RHTLVQAMSEWYVRSDHDHVKLSRILDIAQDLKALSLLLSVQQFVFVIDLACLASRREYL
KLDKWLSDKIREHGENFVSACVKFLQKRCPQLTGSSTKDEHLSKYTPLSSETVLTILNCL
RNVTGTISQELSDAILQMVTNCTNMYMSKVVSARINSTAPPPAILRASQHHRPNEGPSSQ
VLVDQLTGLATSLASLGMNSSAQSGSTFSLPGSLGQLVQTPGSPSRNNIGNTSGHGGFSI
MTPSSSNAPGPVVSSQLSGPSNMLGRLPPHQITPSVIGKSNHPIDNSLFVDGNMPVSVPK
DIEDEANSYFQRIYNLAPHHSLSIDEVLEMLKRFQESPVKREREVFCCMLRNLFEEYRFF
PAYPEKELITTAHLFGGIIEHGLVSNYKALGLALRFILDALKKSPNSKMYNFGITALDRF
KHRLKDYHQYCSHISTIPHFQQFPQHLIEYVEYGKNSQEPPSRVSDLAGASSNTISQGSF
MPNPHNAFKAQSITTTTTTTTVSSSSSKLTTTNAVLPSRPSIANTTNIDTLLVATEQEDK
MIAPAENVQDKIAFIFNNLSQVNLQTKCDEIREIITHECLPWLSQYLVMKRVSIEFNFHS
LYSNFLDCLNNEDLNSLIILETFRNIRVLLKSDKGMANFSDRSLLKNLGHWLGMITLAKN
KPILLDDIDLKMLLVEAYNKGHQELLFTVPFIAKILESCAKSKVFKPRNPWTMSVMNCLA
ELHEEPDLKLTLKFEVEVLCKALNLELKDLTAGYVLKDPEVAKKLEPQLSNTEKSKPRPQ
SAPEPPKVSVPTPQRQTPIIQTIVSSQAQQQQNNNSTIPSVSSNTRFNDELVGHVVAAGG
VTTLTSTGSMGISGTPGMSPPLPLVEPKFNYVTFNTTNSSQIMSMIVINSQIPLFHSQPT
LKTYVRNAIERSIQEWINPVVERSVKIAVITTEHIVKKDFGMDPDDTHLRKAAHCMVRNL
TSGLAMITCREQVIQTLTTNLKQHFMSVLISPSQSQKEMIDQACTMCANDNLELACAFVQ
KTATEKAVIEIDKYLKIEYERRSMSRMEGRRYCDPLVLGGQAEYLPETLRNKVGLPPPQM
IGVYEEFARNIPGFQPLDREAVSLFIPKSGFPPDEMTVVYEKLISEIESLLQLYMANQRI
LSNTTQPSNLHGVMEAMTTLRRSRDIVTAANVVNKTVESYLDGLSSPANHDLDMSIRYRD
MHLSIFRAFQDPRAYNLQWTNKTLTKALIESRDELRFNIDAIDVLIRAGMVNISMYDMHL
AMSMDNGANYVSMAYIKQFLQNYLIDNRSNSPITEHHLQATIDALNSIVLSGRPVPDGLA
SLMEVIRPPQAENNVSERIASGSSSSSAHIQHGMLQGRDFDDPPGLLEKTEYLLKEWLTI
YSAAPNRDPGKTFSVYIHQMNVQGILKSDDIITRFFRLSTQMMVELCYRQIPDQTQSPST
VRAKLFHTIDAYVKLIVLLVKHSGDATAITTKTNLLNKVLGIVVGVLLQDHDVQATDFHQ
LPYHRILITLFLDLNAPDPVLESINCPILAAFCHTFHLLRPRKVPGFAYAWLELISHRIF
IGRLLGLTPQQKRQRAYDQTPVTDVQGWNFYAQLLIDLFKYLAPFLRNAELAKPVHLLYK
GTLRVLLILLHDFPEFLCEFHYGFCDVIPPNCIQMRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVD
VLQEISLAPKISPDFQCYIQPASFKKDLDLYLKTRAPVTFLSEIRTTMQQSCCEPGMRYN
LSLLNAIVLYVGTQAIQHIRSKGLVPNTSTIAHSAHMDIFQNLSVDLDTEGRYLFLNAIA
NQLRFPNSHTHYFSCTLLYLFAEANSEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIK
NPAYKFWNHEFVHCAPEIEKLFESVARSCMVHKQPNTSTDSGDLPDL
NT seq 7344 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacctggattcattgtcatatacgttgtcgcaaatcagctatattgttgctaatttg
tcgaaaaaaaattacaagtctagcgttcaagaattagtggacgcaatccagttgcaagga
tttgaagcagatcggcatttattgcgctgtcttctatctcacatagatcttaaagatatt
gaaggaccgcggaatatatcacacaaggattactaccaagttcaattgttggcacaacag
tgtacaactcttttaaataagccttcactcacttcaattttgtgctttgcacttgacaac
ccacttcatatacacaagccactgaaaccatcaatacagctgtttgtccaactgagtagg
atattacatcttagccttgttcaagaagttgtttttggacttgtttgtttggaatcagca
aattattcgacatttgcattacaatttgttaagcaaaaattaccagagctaatcaaatct
tatattaactcagataatactgaacaagttactggaggaggattgcacgattctagtcct
gaagttttacatttaatattaagtcacgtatttgctgttgatgatcaaatatttggcata
agcgaagaaatcaaggaagttttattaaaaaatttacgccgtgatttcccgcttgaagtt
gctcctgtattattggctcctttaatatattctgataacccagaccgcccaatggataaa
ataaatcaagatatgtcatctatttccaactcaatgttggatccatcattagctgattta
gttatggaaatgggctatactatttgttcatcattagaagagtgtcgtcggaacttgtta
tctgtgattagcggaaatggttctcctgatatttttggctctttatcaattgcaaaagtg
ttatcaatgatgatacgaacacatactggacttgagactcaatctaatttgacatactgg
cctggtgacaatgcaaaccaagatcaagagaaaagctctattaattgcacaacctggaat
gttgaagtttttgtacatacagttaaagacttgaatccgtcattatcttggtcagatgtc
atcaaagaacttgaccataatgattttattattaaagataggcaaggtttagttcttctt
tttactgctttgcgacttggtttaaaagcccaaggatatcatgcggataactttcctgtt
gaaatgatctatcgacattggtcaaattctgaagcacagatgtctcttgtccaacttata
ttacaaaattctgatgttttctgttttgctgattatccatatcgttctgtgtcaattgat
ttgctaaaagtaacaccagaagcagacaataaagatattaataattggcgttcgattgag
cttgttgatttaatgttgtatttggctgaacgtggtctttattatcaagtgcaagagtgt
ttaaagtttccagctcaaaaatgtcccgatctattagcccttgctctaattcagtccaac
ggtccattgagtatggttagacatgagatgataagtggccttatacctatatttcttgga
aatcacagcaatgcaggggtcatcttgcaccatgcatggaaccatcagaatgtcggactc
aggcatactttagtgcaagctatgagcgaatggtatgtgcgtagtgatcacgaccatgta
aaactttcccgaattttagatatagcccaagatttaaaggcattatctctattgttaagt
gttcagcagtttgtatttgtcattgatttagcttgtttagcttcacgtcgagaatattta
aaacttgataaatggttgtcagacaaaattcgtgaacatggtgaaaactttgtttcggct
tgtgttaaatttttgcagaaacgatgccctcaattaactggatcttcaaccaaagatgaa
catttgtctaaatatactccattgtcatctgaaactgttctaacaatcttaaattgttta
cgcaacgttactggaacaatttcacaagaactttcagatgctattttgcaaatggtgacc
aattgtaccaatatgtatatgtctaaagtagtatccgctcgtattaattcaacagctcca
ccaccagctatcctccgtgcttcacaacatcatcgaccaaatgaaggcccatcatcacaa
gtactagttgatcagcttactggactggccactagtcttgctagtcttgggatgaattct
tcagcacaatctggttctacattcagtttacccggctctttagggcagttagttcaaacc
cctggatcaccatcccgtaataatattggtaatacatctggacatggaggcttctctatc
atgaccccttcatcttcaaatgctccaggtcctgtagtttccagtcaattgtctggacca
tctaatatgttaggtcgcttaccacctcaccagataacaccatcagtaattggaaaatct
aatcatccaattgacaacagtttatttgttgatggtaacatgccagtctctgtacctaaa
gatatagaagatgaagcaaatagttatttccagcgtatttataacttggcaccccatcac
tctctatcaattgatgaagttctagaaatgttaaaaagatttcaagaatctccagttaaa
cgtgaaagggaagtattttgttgtatgttgagaaacttgtttgaagagtatagatttttc
ccagcatatccagaaaaagagctaataacaacagctcatctttttggtggaattatagag
catggccttgtttcaaactataaagctttaggtcttgcgcttcgttttattttggatgcg
ctaaagaaaagtccaaattctaaaatgtataattttggtattaccgctttggatcgtttt
aaacatcgtttgaaggattaccaccaatactgttctcacatttctacaatccctcatttc
caacagttcccacaacatcttattgagtatgtcgaatatggtaaaaattcacaagaacca
ccatctagagtgtcagatttagctggagcaagtagtaatactatatctcaaggatcattc
atgccaaaccctcataatgctttcaaagctcaaagtatcactactactactactactacc
acagtatcatcttcatcttccaaacttactactaccaatgctgtattaccatccaggcca
tcaattgcaaacacaacaaatattgatactttgttggtagccacagaacaagaggataaa
atgattgcgccagccgaaaatgttcaagataagattgcttttatctttaacaacctaagt
caagtgaatctgcaaacaaagtgtgatgaaattagagaaattatcacccatgaatgttta
ccatggctatcacaatatttagtcatgaaacgtgtcagtattgaatttaattttcattca
ttgtactcaaactttttggattgcttgaataatgaagacttgaattctttaataattttg
gaaaccttcagaaatattagagttttgttaaaaagtgacaaaggaatggccaatttttct
gataggtcactgttgaagaatttaggtcattggttgggaatgatcacattagcaaaaaat
aaacctatactattagacgatattgacttaaaaatgttattggtagaagcatataacaag
ggacatcaagaactactatttacggtgccatttattgccaagatactagaatcatgtgct
aaaagcaaagtatttaaacctagaaatccgtggacaatgtctgtaatgaactgtttagcc
gaacttcacgaagaaccagatttgaaattaactttgaaatttgaagttgaagtgttgtgt
aaagctttaaacttagagcttaaggatttgactgctggatatgttcttaaagatccagaa
gtagcaaaaaaattagaacctcagctgtctaatactgaaaaatctaagcctagaccacaa
agtgctccagagcctccaaaagtttctgttcctacgccccaacgtcaaacacctattatt
caaacaatagtttcttcccaagcccagcaacaacagaataataattcaaccattccatca
gtaagttctaatactcgattcaatgatgaacttgttggccatgttgtggctgctggagga
gttacaacattgacatctactggcagcatgggcataagtggtacaccaggcatgtctcca
ccactacctttggttgagcctaagtttaactatgtcacattcaacactactaattcatca
cagataatgtctatgattgttattaattcacaaattccactgtttcatagtcaaccaaca
ctaaagacttatgtacgtaatgccatagaacggtctatccaagaatggataaatcctgtt
gttgagaggtcggtaaaaatcgcagttattaccacggaacatattgttaaaaaagatttt
ggtatggacccagatgacactcatttgcgaaaagcagcgcattgtatggtaagaaattta
acttctggtttagcaatgattacgtgtcgagaacaagtcattcaaacattgacaaccaac
ttgaagcaacattttatgagtgttttgatttctccatcacagtctcaaaaggaaatgatt
gatcaagcttgtaccatgtgtgcaaatgataatttagaattagcatgtgcgtttgtgcaa
aaaaccgctactgagaaagccgtgatagaaattgacaaatacttaaaaattgaatatgaa
aggcgcagtatgtcaagaatggaaggtcgtcgttattgtgatcctttagtactaggtggc
caagcagaatatttgccagaaactctacgtaataaagttggcttaccaccacctcagatg
attggagtttatgaagaatttgctagaaacatacctggttttcagccattagatcgggaa
gcagtttcattattcattcctaaatctggctttccacctgatgagatgacagtagtatac
gaaaaactcatcagtgaaattgagtcacttttacagttatatatggccaatcaacgaatt
ctttccaatacaactcaaccatcaaatttacatggtgttatggaagcaatgaccacatta
agaagatcacgtgatattgttactgcagcaaatgttgttaacaaaactgtagaaagttat
ttagatgggcttagttcaccagccaaccatgatttggatatgagcatcagataccgtgac
atgcatctcagtatatttagagcttttcaagatcctcgcgcttacaatttacaatggacc
aataaaactctaaccaaagctctcatagaatctagagacgagttacgttttaatattgat
gcaattgatgttttaatacgtgccggaatggtgaatattagcatgtacgacatgcacttg
gctatgtctatggataatggtgcaaattatgtatccatggcatacattaaacaattttta
caaaactatttgatagataatcgttctaattcaccaataactgaacatcatctccaagca
actattgatgcattgaatagcattgtgcttagcggtcgtcctgttcctgatgggttggca
tcacttatggaagtaattagaccaccacaagcagaaaataatgtttcagaaagaatagct
agtggcagtagtagttcttcagcacatattcaacatggaatgctacagggtagagacttt
gatgatcctcctggactgttggaaaaaactgagtatttgcttaaagaatggttaaccatt
tatagtgctgcacccaatagggatccaggaaaaacttttagtgtatacattcatcaaatg
aatgtccaaggaattttaaaatctgatgatattataactagatttttccgactcagtaca
caaatgatggttgaactatgttatagacagatacctgatcaaacacagtctccttccact
gtacgtgcaaaacttttccatacaattgatgcctatgttaaactcattgtattactagtt
aaacattctggtgatgcaactgctataactaccaaaacaaatcttttgaataaagttctt
ggaattgttgttggtgtcttgcttcaagatcatgatgtccaagccactgactttcatcaa
ctaccataccatagaattttaatcactcttttccttgatttgaatgcacctgatccagta
ctcgaatcaatcaattgtcccatactcgctgctttttgtcatacttttcacctgctacga
ccaagaaaagtcccaggctttgcatatgcttggctggaactcatatctcataggatattc
atcggtcgtcttttgggattaactccgcaacaaaagcgacagcgtgcttacgatcaaact
ccggtcactgatgttcagggttggaatttctatgctcaattactcattgatctgttcaaa
tacctggctccatttttaagaaatgctgaacttgccaagcctgttcatttgttatataag
ggaacattgagagtgctcctcattttgcttcacgattttcccgaattcttgtgcgagttt
cactatggtttttgtgatgtgatacctccaaattgtattcagatgaggaatttgatacta
tctgcattcccacgtaatatgcgtttaccagatccatttactccaaacttaaaagttgat
gtgcttcaagaaatatctttggctccaaaaattagcccggatttccagtgttatatccaa
ccagccagctttaaaaaagatttagatttgtatttgaaaactcgagctccggttacattc
ttgtcagagatccgtactaccatgcaacagagttgttgtgaaccaggaatgcgatataac
ctttcacttttaaatgccattgttctgtatgttggtactcaagccatacagcacattcgc
agcaagggcttagtgccgaatacctctactattgctcattctgcgcacatggatattttt
caaaatttatccgtggaccttgacacagaaggtcgctatttgtttttaaatgccattgca
aaccaattacgtttccccaatagtcatacacattactttagctgtactcttttgtattta
ttcgccgaggctaatagtgaagctattcaagaacaaataacaagagttcttttggagaga
ttgatcgttaacagacctcatccttggggtctattgatcacatttatcgagctgataaaa
aatcctgcctacaagttttggaaccatgaatttgtacattgtgcaccagaaattgagaag
ctttttgaatctgttgcccgttcgtgcatggttcataaacaacccaacacttcgacagat
agcggagatttaccggatttataa

DBGET integrated database retrieval system