KEGG   Amphimedon queenslandica (sponge): 100635034
Entry
100635034         CDS       T02284                                 
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase rnf213-alpha-like
  KO
K22754  E3 ubiquitin-protein ligase RNF213 [EC:2.3.2.27]
Organism
aqu  Amphimedon queenslandica (sponge)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aqu00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system [BR:aqu04121]
    100635034
Enzymes [BR:aqu01000]
 2. Transferases
  2.3  Acyltransferases
   2.3.2  Aminoacyltransferases
    2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase
     100635034
Ubiquitin system [BR:aqu04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Single Ring-finger type E3
   Other single Ring-finger type E3
    100635034
SSDB
Motif
Pfam: ZnF_RZ-type AAA_5 zf-C3HC4_2 AAA AAA_22 ABC_tran zf-RING_4 zf-C3HC4 MCM AAA_2 zf-RING_5
Other DBs
NCBI-GeneID: 100635034
NCBI-ProteinID: XP_019856417
Position
Unknown
AA seq 2436 aa
MKMLAIHMKFRCGIPVVMIGETGCGKTRLLRYLCEIQDKAFKAKTLICLKVHGGINANRI
NSEVESAAKLAIENKGKCNYTVLFFDEVNTTEALGLIKEAICDRTLNGKPIIPEELKFAA
ACNPYKIHDDETIKNLQKAGLGFYLKDGEKIPKLGQLPLRKLVYRVLPLPESMYRYVYDF
GTVTGKTENEYIEKIVNNQLSGCKFITSEHKAIQILVKSVLCECQAFMREQKNECKYVSL
RDVVRAMILLKWFLEKMCTVNIIKKKLTEQILNDKTINQDTYQELNEITRALIYSVSVCY
YVRLTDREPFIERIVKCFTNEYELPGETNQKKISFFANEINRIQNVFLNAMTIPSNIAHN
AALRENIFMMIVCIENRLPLFIVGKPGSSKSLAKSIVSNSMQGRYSSNELLQRLKQVQIF
PYQCNQFSTTKSLIDVFEEAMNFQKSQDATKFASVVVLEEIGLAEDAPGLPLKVLHPYLE
DGTSGADPYAMDIKPDERVAFIGISNWALDPAKMNRGIMVVRCSPEPQELTESACGIANM
VTDVNLRSELTISFDMLAKMYQKICLKQEECETMEKDEAREFFGLRDFYTMIKMICWKCI
DIKAPPSPRDYRRIVLRNFSGHTKINPLEELPNPDLLIEMEGTENESLEIVKESVQPLEI
KDVNVTLPKQENRYLLYITENQSALQILQYKLLPKKEKLFVFYGSSFPKDTEYTQVCVNI
NKIKVFMEKGIPVVLLNYEQIYESLYDVLNQCYTELPTGRYVDLGLRSYRIKCRVDPNFR
LIIIAERDRVFKQFPAALINRLEKHFVASSTILTPQQKALAMKIRKWVNEFANIEHNGKR
YCVSDSFIGFQEDTPSSVVLHVSNTKEQDQQIYDDSIALLLQTASIDAVTRLKSSSSKCS
PDTKDKAFRIFFEEQQHFSMMNFLSNVIEDFENNGAMIQITTFGPLLTQNYIVTLKQELT
INSIKLFQLSDFDTEMDFCNEIKAFYALNHKKKLLIVQCEYGDKKTDLIACARHRLMDEG
QRITISGPGITCAVFTIFIIQLPRVAGGTSFASFQGGSWICTHIDELTCHSGVKEILQSA
ISKPLHKFFHMLIEKKDEVPDEFNVSKRIRDIVQVSVSMIISIGTYKQMECLIGLLLQLI
SNDFSTEDVSDNFTSCLLLRIGDLLQQRDYLILHPNNWAIDAAMDRSKLQASFTLVNSIK
KAIDTQLQPILAYIISCINKNNNLILLKSENKCLKKLWTSLFSSLSFLPFDYGTIVTTTI
QAINIKGRSYNCKFPFSWEIIDQVNAAFVTVGHNDGNKKKAFQDLVESTRNQAFVKHIEK
LPSDDALIFYDCYLHDFVNNLVLPFSEEAIESVHEILFEVLRQIVIKFEPLAATREHFPL
INVITAIHLAYSIIEQEIFWLAELSEGFPKLPCQIKDKQLLSSGKTVFHFKAVECVIDKI
WPEKPEWKDDESVNYLILNFHSSKSAVETILYLKGHDDMSNKVLFNLRSRWQGLMSIVLF
AEHVIAPFMPNVTLTTSKFTFLKRFSNVVKVVKEPSSTCMFSEPKILKQSIRQIQAVLIA
LPVQEQANCQLCKSVLKITEIIYVPCDQSHMFCEKCFNDSIEKRGPRCPSCDTPIPRKRA
KDFCIPDYKKKEYEQLKQVQQYCLDFFMELVSQCCFSPITPTKPTDDFYKELLTIVTDIE
HKDYKNLFPIEENYTHGCPIARSVLLQLLLEHNPKEVQIKLQEYQNYIKRTFGSEYITDD
KELTLLCIKSLEDGLHKSRTKKECLDDELQFGIKCLNGALALLRDGDHFRACQDNLSVEF
MQCIANVRFGICFAVDIFYHYYCFGSDERNQLPRVTKEKLQELCKSIHGIIGKGVLKEPY
KFFIKQFVRQFGFPYLSELGKLKQFEWLDLKKTETFDGFIVCGKEYTTLRAKWIFTADLL
TEDDLVNDLEEHDSKSVLNKVASTLVYYRHIESNTSNATALGQKDLFFTHQKVQKLLSHV
FNGGPGSLVTGVIFNPREPKTTDIAAVVVHWISVLETRIDNSLFGPFKEILHQTANSKEM
YWPTMDDDILDIVVDATAGTTDTQWKCPNGHTYFVQNCGRQVVGDVKKCFCGAEIGGKSY
NVPKEGNIKVKDSTELTKKGHTLGNPNSRTTDPLPQRDLSPLSNCIIRLLINATCVWIAS
SINEAACKALQDVTSDLTTNAKPMELCWLLNYFWHHLEVDIQTLCRATQYSFDDCILFLH
IIVHNMLIANLETNIDFDSKLCSRKDRKSWEIKFNQIVIKPNIEVQTERGKEYLIGKHIE
RGRQLIIEDSDLDHRKLLEMIYETVPVISKSIMPHLWIYRPLITIDHVSLSLENDTRSAD
LNVLRQFLKQVKLLEALTCLPDIIRLQQFLYEMCHLRIDKTEVDQPFNEFIRKGFIRTHR
QKKLLAQAESFCTAWNSVKNELLSLSRKAYCIHCLL
NT seq 7311 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatgttagccatacacatgaaattcaggtgtggtatccccgttgttatgattggt
gaaactggatgtggcaaaacacgacttttaagatacttgtgtgaaatacaagataaagca
ttcaaagctaagacattgatatgtttaaaggttcatggtggaatcaatgctaatcgtatt
aattctgaagttgaatcagctgctaaattagcaatagaaaacaaaggaaagtgtaactat
actgtcttgttttttgatgaagtcaacactaccgaagcactggggctaattaaagaagct
atatgtgataggactctgaatggcaaaccaattattcctgaagaactgaagtttgctgct
gcttgcaatccttataaaatccacgatgatgaaacaatcaaaaatttgcaaaaagctgga
ctgggattttatctaaaagatggagaaaaaattccaaaattaggtcaacttccgttgcgt
aaattagtgtatcgggttcttcctctcccagaaagcatgtatcgatatgtttatgacttt
ggcactgtcactgggaaaactgaaaatgaatacattgagaaaatagttaacaatcagctt
tcaggatgtaaatttataacctctgaacataaagctatacagatacttgtgaagagtgtt
ctttgtgaatgtcaagcttttatgagagaacaaaaaaatgaatgcaaatatgtcagtttg
agagatgttgttcgagcaatgatccttttaaaatggtttctggagaaaatgtgtactgtt
aatatcatcaaaaaaaagctgacagagcaaattctaaatgataaaacaattaatcaagat
acttatcaggagttaaatgagatcacacgtgcattgatatattctgtcagtgtttgctat
tatgtgagacttactgatagggaaccctttattgagagaatagtaaaatgttttacaaat
gaatatgaacttccaggagagactaatcaaaaaaagatctctttttttgcaaacgaaatt
aacagaattcaaaatgtattccttaatgcaatgactattcctagtaatattgctcataat
gctgctttacgggagaacatatttatgatgattgtttgcattgaaaacagattaccattg
tttattgttggtaaaccaggtagctctaagtcactagcaaaatcaatagttagtaattca
atgcaaggacggtattcttctaatgaacttttgcaacgtttaaagcaagttcaaatcttt
ccttatcaatgtaatcaattttctactacaaaatcactgattgatgtttttgaagaggca
atgaactttcaaaaaagtcaggatgccactaaatttgcttcagtagttgttttagaagaa
attggattagcggaagatgctcctggtctccctctgaaagtattgcatccctatcttgag
gatggtacttctggagctgatccttatgctatggatataaaaccagacgaaagagtagct
tttattggtatttctaactgggccctcgatccagctaaaatgaacagaggtattatggtt
gtcagatgttcacctgagccacaagaactaactgagagtgcttgtggtattgctaacatg
gtaacagatgttaatttgagaagtgaattaacaatttcttttgatatgttagctaaaatg
tatcagaaaatttgtttgaagcaagaagaatgtgaaaccatggaaaaagatgaagctcgg
gaattttttggtttacgagatttttatacaatgattaagatgatatgttggaaatgcata
gacataaaagctccaccaagtcctagagactatcgacgtattgtattgcgtaacttcagt
gggcacaccaaaatcaatccattggaagagctacctaatcctgatttacttatagagatg
gaaggaacagagaatgaatctcttgaaattgttaaagaaagtgtccagccactagaaatt
aaagatgtaaatgtaactcttccaaaacaggaaaatcgatacttattatatatcacagag
aatcaatctgctctacaaatacttcagtataagctattgccaaaaaaggaaaaattattt
gtcttttatggcagcagttttccaaaagatacagaatacactcaagtttgtgttaatatc
aacaaaatcaaagtttttatggagaaaggtattccagtggtattactgaattatgaacaa
atctatgaaagtctttatgatgtccttaaccagtgttacacagagctgcctactggtcgt
tatgttgatcttggattacgatcgtacagaataaagtgtcgtgttgatcctaattttcgt
ctaattatcatagctgagagagatcgtgtcttcaaacagtttccagcagcactcattaat
cgcttagaaaaacattttgtagcatctagtacaatattaacacctcagcaaaaagcacta
gcaatgaaaattagaaaatgggttaatgaatttgctaatattgaacacaatggaaaaaga
tattgtgtctcagattctttcattggttttcaagaagatacaccttcctctgttgttctt
catgttagcaatactaaggaacaagatcaacagatatatgatgacagtattgctctcctc
cttcaaacagcctctattgatgcagtcactcgcctaaaatcaagcagttctaaatgcagc
cctgacacaaaagataaagcttttagaattttttttgaggaacaacagcacttttccatg
atgaattttctctcgaatgtcattgaagattttgaaaataatggtgctatgatacaaatt
acaacatttgggccactattgactcaaaactacattgttactcttaaacaagaacttact
ataaatagtataaaattattccaactttcagactttgatacagaaatggatttctgcaat
gaaataaaagcattctatgcattaaaccataaaaaaaaattactgattgttcagtgtgaa
tatggagacaaaaagactgatcttattgcttgtgctcggcatcgcctaatggatgaagga
cagagaataaccatcagtggacctgggattacatgtgctgtatttacaatatttataatt
caactacctcgagtagctggtggaacatcgtttgcttcttttcaaggtggatcctggatt
tgtactcatattgatgaactgacctgccactctggagtgaaagaaattctccagagtgcc
atctcaaagccacttcataaattctttcatatgctcattgagaaaaaagatgaagtgcct
gatgaatttaatgtcagtaagagaatcagagatattgttcaagtttcagtgtcgatgatt
atttccattggcacatataagcaaatggaatgcttaattggtttactgctccagttgata
tcaaatgatttcagcacagaagatgtttcagataattttactagttgtcttcttttgaga
attggtgacctacttcaacagagagattatctaattctacatccaaataattgggctatt
gatgcagcaatggatagatcgaagctgcaggctagttttactcttgttaactccatcaaa
aaggctattgatacacaattacaacctattctagcatatataatttcttgcatcaacaaa
aacaacaatttaatcctactgaaaagtgaaaataaatgccttaaaaaactctggacttca
ctttttagtagtttgtctttcttaccatttgattatggaacaattgttacaactacaatt
caagccattaatataaaaggaaggagctacaactgtaaatttccattttcatgggaaata
attgatcaagttaatgctgcatttgttactgttggacacaatgatggaaacaagaagaaa
gcttttcaagacttggttgaatcaacaagaaatcaagcatttgtgaaacatatagaaaaa
cttccttctgatgatgcattgatattttatgattgctatcttcatgattttgttaacaat
ttagtgctgccatttagtgaggaagcaattgagagtgttcatgaaattttattcgaagtc
ttgagacaaatagtgatcaaatttgaacccctggctgctacaagagaacactttccactg
attaatgtcataacagctattcatcttgcttatagtataatagaacaagaaatattttgg
ttagctgaattgtctgaaggtttccctaaattaccatgccaaataaaagataaacaattg
ttatcctctggaaaaacagtatttcattttaaagctgtagaatgtgttattgacaaaata
tggcctgaaaagcctgagtggaaagatgatgaatcagttaactatttaatattaaacttc
cattccagcaaaagtgcagttgaaacaattttatatttgaagggtcatgatgatatgagt
aacaaagtcctttttaatttaaggtcgagatggcaaggactaatgagcatagtattattt
gctgagcatgttatagctccttttatgcctaatgtaacattgactacaagcaagtttacc
ttcttaaaacggttttctaatgttgttaaggttgtgaaagaacctagctctacatgcatg
ttttctgaaccaaaaattcttaagcagagtattagacaaattcaagctgttttgattgca
ttgccagtccaagaacaagctaattgtcaactatgcaaatctgtattaaaaattactgaa
attatttatgttccttgtgatcagagtcacatgttctgtgagaagtgttttaatgattca
attgaaaaacgtggtccacgctgtccttcatgtgatacaccaatacctagaaagagagca
aaagatttttgtattcctgattataaaaagaaagagtatgaacagttaaagcaagttcag
cagtattgtttggatttttttatggagttggtgtcgcaatgctgcttctcaccaataact
ccaacaaaacctactgatgatttttataaagaattactaacaatagtgacagatattgaa
cataaagactacaaaaatctctttccaattgaagaaaactatactcacggttgtcctata
gctcgttctgtattgctgcaactattattggagcacaatccaaaagaagtccaaataaag
ttgcaggaatatcaaaattacattaaaagaacttttgggagtgagtacattactgatgac
aaggaacttacactattgtgcattaagtcattagaagacggtcttcataaatcaagaaca
aaaaaagaatgtctagatgatgagctccagtttggaataaagtgtttaaatggagcattg
gctttgctaagagatggtgatcactttagggcatgtcaagataatctctcggttgagttc
atgcaatgtattgctaatgttcgatttgggatatgttttgctgttgacattttttatcac
tattactgctttggttcagacgaaagaaatcaattgcccagagtaacaaaagaaaagtta
caagagctttgcaaatctattcatggtatcattggcaagggtgtgctgaaggaaccttat
aaattctttatcaaacaatttgtgcgacaatttggttttccatatcttagtgagcttgga
aaattaaaacaatttgaatggctagatttgaaaaaaactgagacttttgatggcttcatt
gtatgtggtaaagaatacactacattgagagcaaagtggattttcacagcagatctcctt
acagaagatgatttagttaatgatttggaagaacatgacagtaaaagtgttctcaataaa
gttgcctcaactttagtatattatcggcacattgaatcaaatacatccaatgctactgca
ttgggacaaaaggacctattttttacccatcaaaaagtgcaaaaactgctttcacatgtg
ttcaacggtggtccaggatcacttgttactggtgtcattttcaatccaagggaaccaaaa
accacagacatagctgcagttgttgtgcattggatttctgttcttgaaacaagaattgac
aatagtttatttggtccatttaaagaaattttacatcaaacagcaaattctaaagaaatg
tattggccaacaatggatgatgacatactggatatagtagttgatgctacagctggtact
actgatacgcagtggaaatgccccaatggacatacttattttgttcaaaattgtggtaga
caagttgttggagatgttaaaaaatgtttttgtggtgctgaaattggaggaaaatcttac
aatgtacctaaggaaggaaacattaaagttaaagatagcactgaacttacaaaaaaaggt
cacactcttggaaatcctaattcaagaactactgacccattgcctcaacgagatctatct
cctttgtctaactgtattatcagacttttaattaatgctacatgtgtttggatagctagt
tctatcaacgaagcagcatgcaaagctcttcaagatgttacttcagatctaactactaat
gctaaaccaatggagctttgttggttgttgaactacttctggcatcatcttgaagtagat
atacaaacactgtgtagagctacacagtacagctttgatgattgcatcctatttcttcat
ataattgtacacaacatgttaatagccaacttagaaacaaatattgactttgattctaaa
ctttgctctcgtaaagataggaaaagttgggaaattaaatttaatcaaattgtcattaaa
ccaaacattgaagtacaaacagaaaggggaaaagaatatttaattggaaaacacattgaa
agagggagacaattaataattgaagattctgacttagaccacagaaaactgttagagatg
atttatgaaactgttcctgtaataagcaaaagcataatgccacacttgtggatctatcga
ccattaattactattgaccatgtctctctctctcttgaaaatgataccagatctgctgat
ctgaatgtactgaggcagttcctcaaacaggtcaaactgcttgaagctttgacttgtctt
cctgatataatacgattacagcaatttttgtatgaaatgtgtcatcttcgaattgataag
actgaagtagatcagccatttaacgaatttattagaaaaggatttataagaactcatagg
caaaaaaagttattggcacaggctgaaagcttctgcactgcttggaatagtgtcaaaaat
gagctactaagtttgagtaggaaagcatattgcattcactgtttactttaa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (61)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (57)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (11)   
   Pfam (11)   
All databases (79)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system