KEGG   Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan: SFBM_0186
Entry
SFBM_0186         CDS       T01591                                 
Name
(GenBank) beta-galactosidase
  KO
K01190  beta-galactosidase [EC:3.2.1.23]
Organism
asf  Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan
Pathway
asf00052  Galactose metabolism
asf00511  Other glycan degradation
asf01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:asf00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00052 Galactose metabolism
    SFBM_0186
  09103 Lipid metabolism
   00600 Sphingolipid metabolism
    SFBM_0186
  09107 Glycan biosynthesis and metabolism
   00511 Other glycan degradation
    SFBM_0186
Enzymes [BR:asf01000]
 3. Hydrolases
  3.2  Glycosylases
   3.2.1  Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
    3.2.1.23  beta-galactosidase
     SFBM_0186
SSDB
Motif
Pfam: Glyco_hydro_2_C Bgal_small_N Glyco_hydro_2_N LacZ_4 Glyco_hydro_2 Laminin_G_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAK55965
UniProt: F9VJ05
Position
198789..202352
AA seq 1187 aa
MEIFSLDYAPEDRNLDFYRRDYDVSSWEYINVPSNWQMEGYDFPIYVNFRYPWTGFENLE
FYKAPKIFNPVGNYRRDFYVDESWLDDKVYISFQGVESCFYLWINGGFVGYSEDSFSPSE
FDVTDFLVCGNNSISVQVFRWCDGSFIEDQDFIRLSGIFRDVFLYRTPKIHIADFEVITK
ADDNYMNFDLLVNINMLNHINENRNYTISAVIFDEKWNLINSVENMGNFDRNYPYRDAIK
SDFSLCLNIKEPNRWSAEEPNLYNLIISLKNDLLNETQSIHTRVGFRAFEIKGNKMYING
KPILFKGVNRHETHPLKGRALSTLDMEFDIREIKKNNINSVRTSHYPNHPYFISLCNEYG
IYVVDEGNIEAHGVEGEIPGNKEIWKNACFDRINSLVERDKNNPSVLIWSLGNESGGGSV
FRDLYNYVSLRDGTRVIHYEGERDEYYASDVVSKMYVKIDDIEKQSKYMYHKPYILCEYA
HSMGNSGGSLDKYIEKFESIDNVQGGFIWDFIDQGIYRDVPDMGIFINSHSIFHGDFEGY
IENGYKDKGYRGCIFYDNVSNLKFDEFTIDLKVKPSVYEGEGCVYLKKGNEFGLREIMNY
DKSNNRAVEFYVRDNSGIFETIVFITPKDWVNNFHSVSAIYKNKIMRLFIDDNLVGEKTF
NYNIAYFKDGIQIGGNDGYTHCESMNGIIDEVKLFSKGMDIEELRKKSFYNIDATRIIWN
DFDNERNMIMKKLSRDKYLATGGDFNDSPNDSAFCANGILLASRKIKPQVSEVKYAYQNI
DIRDYDILNGKVIIKNKNLFKNLRDYILKWDYLVDGKIVRGDTAIVNVDPMSEIIFNVHD
MDKIKDLNGKEFFLNIGFVLNESTNWGNRGFEISRNQLKINLDNLFYEVGNVSKVVQNFM
IDDLSDKLEIKSKEYYIGFNKISGTLQNYRYKNEDLINSELYVDFWNPLNDNERLCNIYN
KIVFWKNIFNRSRNNSYNILHEDGCILVKFYKPIYDLNNSVLITTYKIDEYGEISIELYM
ELLKNGIPHARSVGFKIFIPTNFKNIEYYGRGPLENYNDRNKGSNLGEYKSDVDSQFTDY
MTPQRTGNITDIRWINFYRNNGIGIRIKYINEFLQINVSSYNDDEFEKKHSYQMNKYSSI
IVNVRSKDYGSTFESFEDECINYIDKNHIYNFSFKLSPLLTDNVLIN
NT seq 3564 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagattttttcacttgattatgcaccagaagatagaaatttagatttttataggaga
gattatgatgtatctagttgggaatatataaatgtgccgagtaattggcaaatggaggga
tatgatttccccatatatgttaattttagatatccttggactggatttgaaaatttagaa
ttttataaggctcctaagatttttaatcctgttggtaattataggagagatttttatgta
gatgaatcttggcttgatgataaagtttacatatcatttcagggtgttgaatcttgtttt
tatttatggataaatggaggatttgttggatatagtgaggatagtttttcacctagcgag
tttgatgttaccgattttttagtatgtggtaataattctatatctgttcaggtttttaga
tggtgtgatggaagttttattgaagatcaggattttattcggttaagtggaatttttagg
gatgtatttttatatagaacccctaagatacatattgcagattttgaggttataactaaa
gcggatgataactatatgaattttgatttgttagttaatattaatatgctcaatcacatt
aatgagaataggaattataccatatcggccgttatatttgacgagaaatggaatttaata
aatagtgttgagaatatgggtaattttgacaggaattatccatatagagatgctatcaag
agtgattttagtttatgtttgaatataaaagagcctaatagatggtcggcagaggaacct
aatttatataatttaataatttctcttaaaaatgatttgcttaatgaaacacaatcaata
catacaagggttggatttagagcatttgagataaaaggaaataaaatgtacataaatggg
aaaccgattttgtttaagggtgtaaatagacatgaaactcatccattaaaaggaagggca
ttatctacactggatatggaattcgatataagagagattaagaaaaataatataaactct
gtaagaacttcacattatcctaatcatccttattttatttcattatgtaatgaatatgga
atttatgtagttgatgagggtaatatagaggcacatggcgttgagggtgagatacctggg
aataaagagatttggaagaatgcatgttttgatagaattaattcacttgtagagagagat
aagaataatcctagtgttttaatatggtctcttggaaatgagagtggaggaggaagtgta
tttagagatttatataattatgttagtttaagagatggaaccagagtaatacactatgaa
ggcgagagagatgaatactatgcaagtgatgttgtaagtaaaatgtatgttaaaatagat
gacattgagaaacagagtaaatatatgtatcacaagccttatattttgtgtgaatatgct
cattctatgggaaatagtggtggaagtttagataaatatattgaaaaatttgagagtatt
gataatgttcagggaggatttatatgggattttatagatcaaggaatttatagagatgtt
cctgatatgggtatttttattaattctcatagtatatttcatggagattttgaaggatat
atagaaaatggatacaaagataaagggtataggggatgtatattctatgataatgttagt
aatttaaagtttgatgaatttaccatagatttaaaggtaaaaccaagtgtatatgaggga
gaaggatgtgtttatctaaagaaaggtaatgaatttggattaagggaaattatgaattat
gataagtctaataatagggctgttgaattttatgtaagagataattctgggatatttgag
acaattgtatttataacacctaaggattgggtgaataattttcatagtgtaagtgcgata
tataaaaataagattatgagattatttatagatgataatttggttggagagaagacattt
aattataatatagcatatttcaaagatggtattcaaattggaggaaatgatggttatact
cactgtgaaagtatgaatgggataatagatgaggttaagttattttctaaaggaatggat
atagaggaattacgtaaaaagagtttttataatatagatgctacaaggataatatggaat
gattttgataatgagagaaatatgattatgaaaaaattatccagagataaatatttggct
acgggaggtgacttcaatgattctccaaatgattctgcattttgtgctaatggtatattg
ttagcatctagaaagattaaaccacaagtaagtgaggttaagtatgcatatcaaaatata
gatattagggattatgatattttaaatggtaaagtaattattaaaaataaaaacttattt
aaaaatttaagagattatatattgaaatgggactatttagttgatggcaaaatagtaaga
ggagatacagctatagttaatgttgatcccatgagtgaaattatatttaatgtacatgat
atggataaaattaaggatttaaatggaaaagaattttttttaaatattggatttgtatta
aatgaaagtacaaattggggtaacagggggtttgaaatatcaaggaatcaattaaaaata
aacttagataatttgttttatgaagtaggtaatgttagcaaggtagttcaaaattttatg
attgatgatttgtcggataaattggaaattaaatctaaagaatattatattggatttaat
aaaatatcaggtactctccaaaattataggtataagaatgaggatttaataaattctgaa
ttatatgttgatttttggaatccattaaatgataacgaaagattatgtaatatatataat
aagatagtattctggaaaaatatatttaatagaagtaggaataatagttacaatattttg
catgaagatggttgtatattggtaaaattttacaaaccaatctatgatttaaataattca
gttcttattacaacatataagatagatgagtacggggaaattagtattgagctatatatg
gagttattaaagaatggtataccgcatgctaggtcagtaggatttaagatatttatacct
actaattttaaaaatattgagtattacggaagaggaccattagaaaattataatgatcga
aataaaggtagtaatttaggagaatataaaagcgatgtagatagtcaatttacagattat
atgactcctcaaagaacagggaatataacagatattagatggataaatttttataggaac
aatggtataggtattagaatcaaatatattaatgaatttcttcaaataaatgttagttca
tataatgatgatgaatttgagaaaaaacattcttatcaaatgaataaatattcgtcaatt
atagtaaatgttagatcaaaggattatggaagcacattcgaaagttttgaagatgaatgt
attaactatattgataaaaatcatatatataatttttcattcaaattatcacctttatta
acggataatgtattaattaattga

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Chemical substance (12)   
   KEGG COMPOUND (12)   
Chemical reaction (6)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (5)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (45)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (42)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (6)   
   Pfam (6)   
All databases (76)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system