KEGG   Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_01885
Entry
A3Q33_01885       CDS       T04816                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
colw  Colwellia sp. PAMC 21821
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF
Other DBs
NCBI-ProteinID: ARD43174
Position
complement(470125..472122)
AA seq 665 aa
MNLTIKKVAFGLIFFLLTGMYIIFAYYYFSQRDITAKIIVTSIKNDLSELSYVLSKQIKK
EPISSARPLLDRRAANNKYLSAIAIFKDDELVMTTEHKYSKIPTASDLYFAPHKSDFVFL
NDKSALQGNIYYYQGKLIKNYALVFYFDNEYIKHNFTQAKRDFILFFILIPIIFVAIIWL
VIGRLVALPLAALRQYAYDHSNIPKPFSIREIEYIRASMVQTFSRLDQEKKELYNLARTD
SLSGLANRNYLQERVEQIIEVSNREQKEFALLFLDLDHFKSVNDSLGHDVGDELLKSIAQ
AIQKILRVNDVVARIGGDEFVIVLTHYKDDIELYEIIDRIQTQLMKAWLINTFTIQITSS
IGITVYPKDGGDLVTLMKNADIAMYETKARGRRGYHFFTESLNVKTQEYIELTNAMREAL
KNDQYELYYQPQNDVKTGIITGAEALIRWKDSNDVFIPPNVFIPIAEQNGFIIELGDWVL
ETAIKQLRIWEDNNYQLRMSINVAAQQILQRGFVSHLESLIDTYKVSANKVFLEITESVF
LNDSKAVHKTFSAIKALGVKISLDDFGTGYSSLSYLKTFPIDVLKIDKAFLDDYDTQEGA
IFIETIVNMAQTLKISVVAEGVETREQVNYLASLNCGYYQGYVCSPPVEINTFVQLLNEV
VVLKV
NT seq 1998 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatttaacgattaaaaaagtcgcctttggtttaatctttttcttacttaccggtatg
tatattatatttgcatattattacttttctcagcgtgatattaccgcaaaaattattgta
acaagtataaaaaacgacctttctgaactgtcctatgttttatcaaagcaaataaaaaaa
gagcccatttcttctgctagaccattgcttgatagaagagcagctaataataaatatttg
agtgctattgcgatctttaaagatgacgaactagtgatgacaaccgaacataagtactca
aaaataccaacagcaagcgacttgtattttgctccgcataaaagtgattttgtgtttctg
aatgacaaaagtgcattacagggcaatatttactattaccaggggaagttaattaaaaat
tacgcactggttttctattttgataatgaatatatcaaacataactttacgcaagcgaag
cgcgattttattctgttttttatccttatccccattatttttgtggctataatttggttg
gttattggacgactagtcgctttgccgctagcagctttacgccaatatgcgtacgatcat
tcaaatattcccaagccgtttagcattcgggaaatcgaatatatacgtgcttctatggtg
caaacatttagtcgactagaccaggaaaaaaaggaactttataacttagctagaacagat
tcacttagtggacttgccaaccgaaattacttgcaggaaagagtggaacaaattatagag
gtgagtaacagagagcaaaaagaatttgcactattatttttagatctagatcactttaag
tcagttaatgactctttagggcatgatgttggcgatgaattattaaaaagtattgctcaa
gcaatacaaaaaattctacgtgttaatgacgttgtagcacgtatcggtggtgatgagttt
gttattgtattaacgcattataaagacgatattgagttatatgaaatcatcgaccgtatc
caaactcaactcatgaaagcatggttaattaatacctttaccatccaaattaccagtagt
atcgggatcacggtttaccctaaagatggtggtgatcttgtgacattaatgaagaatgcc
gatattgccatgtatgaaacgaaagcacgcggtcggcgagggtatcacttttttactgaa
agccttaatgtcaaaactcaggaatatatagagctgacaaatgccatgcgtgaagcgctg
aaaaacgatcagtacgagctttattaccagccacaaaatgatgtgaaaacaggtattata
actggcgctgaagcacttattcgctggaaagattctaacgacgtctttattccacctaat
gtttttatccctattgctgaacagaatggctttattattgagcttggtgattgggtactg
gaaacagcgattaaacaactgagaatttgggaagataataactatcagcttagaatgtcg
attaatgttgcagctcaacaaattcttcaacgaggatttgtttctcatctcgagtcttta
atagacacctataaagtaagcgccaacaaagtttttttagagattactgaatctgtattt
ttaaatgacagcaaagcggtacataaaacattttcggccattaaagcactaggtgttaaa
atatcactcgacgattttggtaccggttattcttcgttatcctatttaaaaacctttcct
atcgatgtactcaaaatagacaaggcatttttggatgattacgatacccaagagggcgca
atctttattgaaaccattgttaatatggctcaaacgctaaaaataagtgtagtggcggaa
ggtgttgaaacgcgtgagcaagtgaactacttagcatcactaaactgtggttattatcaa
ggctatgtgtgtagtcctcccgttgaaattaatacttttgttcaactgcttaatgaagtc
gttgtgctaaaagtgtaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (12)   
   RefGene (10)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (15)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system