KEGG   Candidatus Carsonella ruddii PV: CRP_077
Entry
CRP_077           CDS       T00403                                 
Name
(GenBank) delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
  KO
K13821  RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.5.5.2 1.2.1.88]
Organism
crp  Candidatus Carsonella ruddii PV
Pathway
crp00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
crp00330  Arginine and proline metabolism
crp01100  Metabolic pathways
crp01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
crp_M00970  Proline degradation, proline => glutamate
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:crp00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    CRP_077
   00330 Arginine and proline metabolism
    CRP_077
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors [BR:crp03000]
    CRP_077
Enzymes [BR:crp01000]
 1. Oxidoreductases
  1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors
   1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.2.1.88  L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase
     CRP_077
  1.5  Acting on the CH-NH group of donors
   1.5.5  With a quinone or similar compound as acceptor
    1.5.5.2  proline dehydrogenase
     CRP_077
Transcription factors [BR:crp03000]
 Prokaryotic type
  Ribbon-helix-helix
   Other families
    CRP_077
SSDB
Motif
Pfam: Aldedh Pro_dh Pro_dh-DNA_bdg
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAF35108
UniProt: Q05FR3
Position
complement(70076..73120)
AA seq 1014 aa
MNNLQLLNIISKYYLIEENIYLLELLKNCNFTNDFFNKVKKISLNLVNETRKNIHLDNLD
NLLGEYNLSTKEGIQLMCLAESLLRIPDFYSADSFIKDKISFQDWSYYYESDYWKIIFYN
MIIDFCSVAYYKHYTKNKEIFIKIFKRTVVFFSNYVMKHIGKKFVYSSNIINAIQKSIND
KNKYSFDMLGEAALTYYDARKFFFQYKLAINEIKKCYTEHNLNERLPSISIKLSALNPKY
SFYNIEQITRDMIPLIKILIYNAKEAFVSITIDAEEVDRLELSLILFNNIFYSKICKNWE
GFGIVVQAYSKRAIPILYWLNYISIEQKKIIPVRLVKGAYWDYEIKYSQTLNLPMYPVYI
NKFCTDLSYLLCSMYMLSNLCKKNIFSQFATHNIQTISFILSLSNDKNYEFQKLYGMGND
VYHSLKKIYNITYREYAPIGKYKELLPYLVRRLLENGANSSFVNKIIDKNVNLEILSKNP
FKINNKKYNNKIPLPTDLFGGIRSSIYFYNLNISFHNYNFYKKINLFTNKKWIASSFISN
IKRKTIVYPPFNNYSVIGLLKHDLSINNSIKILKKSFNFWKNISIFKKNKIIKNFVLLIK
HNFIELILLCSIEAGKTIIDCISDIKEAIDFCNYYCNQSILLNKKVFLPCTTGENNIYML
EGKGIFSAISPWNFPVAIFCGQLISALLSGNVVLVKPAESTSLIACKLIKLLFKAGIPIS
VCQLIIGSGFSIGNEISFHKEICGIIFTGSNEVANTISKNLIMRKNAPLYKLVAETGGIN
TLIADSTALIEQVVYDVVESAFKSCGQRCSALRLIYINENIYFDTLKLLMNVLLNINVGN
PLNLFYDIGPIITKKNFFNLNKYINTYNKKSVYSIEEKPILGNFLNPTLIRINNINDLKN
EQFGPILHVSIFKNFQIDQIISDINNSKFGLTLGIHSRNEAFCKYLSNNLKIGNIYINRN
IIGAIVGMQPFGGCNLSGTGPKAGGCNYLLSLVNEKTITINTTAQGGNVILLNE
NT seq 3045 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataatttacaattattaaatataataagtaaatattatttaatagaagaaaatatc
tatcttttagaattattaaaaaattgtaattttacaaatgatttttttaacaaagtaaaa
aaaatatctttaaatttagtaaatgaaactagaaaaaatatacatttagataatttagat
aatttattaggagaatataatttaagtacaaaagaaggaatacaattaatgtgtttagca
gaatctttgcttagaattccagatttttattctgcagattcttttataaaagataaaatc
tcgtttcaagattggtcttactattatgaatctgattattggaaaattatattttataat
atgattattgatttttgttctgttgcatattataaacattacactaaaaataaagaaata
tttataaaaatttttaaaagaacagttgtttttttttcaaattatgttatgaaacatatt
ggtaaaaaatttgtatattccagtaatataattaatgcaatacaaaaatcaataaatgat
aaaaataaatattcttttgatatgttaggagaagctgcacttacatattatgatgctaga
aaatttttttttcaatataaactagcaattaacgaaataaaaaaatgttatactgaacat
aatttaaatgaaagattaccatcaatttcaataaaattatcagcattaaatcctaaatat
tctttttataatattgaacaaattactagagacatgataccattaattaaaatattaatt
tataatgctaaagaagcatttgtatcaataactattgacgcagaagaagtcgatcgatta
gaattatctctaattctttttaataatattttttattctaaaatatgtaaaaattgggaa
ggttttggaatagttgttcaagcttattctaaaagagctattcctattctttactggtta
aattatatttctatagaacaaaaaaaaataatacctgtaagattagttaaaggagcatac
tgggattatgaaattaaatattctcaaactttaaatttacctatgtatcctgtttatata
aataaattttgtacagacttatcttatttgttatgttcaatgtatatgttatcaaattta
tgtaaaaaaaatattttttcacaatttgcaacacataatatacaaacaatttcttttatt
ttatcattatctaatgataaaaattatgagtttcaaaaattatatggaatgggaaatgat
gtttatcattcgttaaaaaaaatatataatattacatatagagaatatgctccaattgga
aaatataaagaattacttccatatttagtaagaagattattagaaaatggtgcaaattct
tcttttgttaataaaattattgataaaaatgttaatttagaaattttaagcaaaaatcct
tttaaaattaataataaaaaatataataataaaataccattaccaacagatttatttgga
ggaattcgaagttcaatatatttttataatttgaatatttcatttcataattataatttt
tataaaaaaataaatttatttactaataaaaaatggatagcaagttcatttataagtaat
attaaaagaaaaactattgtttatcctccttttaataattattcagttattggattatta
aaacatgatttaagtataaataattcaattaaaatattaaaaaaatcatttaatttttgg
aaaaatattagtatttttaaaaaaaataaaataataaaaaattttgttttattaataaaa
cataattttatagaattaatattattatgttctatagaagcaggtaaaacaattatagat
tgtatctcagatattaaagaagcaatagatttttgcaattattattgtaatcaatcaatt
ttgttaaataaaaaagtttttttaccttgtacaacaggagagaataacatatatatgcta
gaaggaaaaggaatattttctgcaattagtccttggaattttccagtagcaattttttgt
ggacaattaatttcagcattattatctggaaatgtagttttagttaaaccagcagaaagt
acatctttaattgcttgtaaattaataaaattattatttaaagcaggaatcccaattagt
gtatgtcaattaataattggttcaggtttttctattggaaatgaaatttcgtttcataaa
gaaatttgtggaattatttttacaggttctaatgaagttgctaatactattagcaaaaat
ttaataatgcgaaaaaatgctcctctatataaattagtagcagaaacaggaggaattaat
actcttatagcagattcaactgctttaattgaacaagtagtatatgatgtagttgaatcc
gctttcaaaagttgcggacaaagatgttcagctttaagattaatatatataaatgaaaac
atttattttgatacattaaaattattaatgaatgttttattaaatattaatgttggtaat
cccttaaatttattttatgatataggtcctataataacaaaaaaaaatttttttaattta
aataaatatattaatacttataacaaaaagagtgtttattctatagaagaaaaaccaata
ttaggtaattttctaaatccaacattaataagaattaataatattaatgatttaaaaaat
gaacaatttggtccaattttacatgtatcaatatttaaaaattttcaaattgatcaaata
atttctgatattaataattctaaatttggattaacactaggtattcatagtagaaatgaa
gcattttgcaaatatttatctaataatttaaaaataggaaacatttacattaatagaaat
ataataggtgcaattgttggaatgcaaccatttggtggatgtaatttatctggaactggt
ccaaaagcaggaggatgtaattatcttctttcattagttaatgaaaaaacaattactata
aatacaactgctcaaggaggaaatgtaattttgctaaatgaataa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (5)   
   KEGG PATHWAY (4)   
   KEGG MODULE (1)   
Chemical substance (15)   
   KEGG COMPOUND (15)   
Chemical reaction (10)   
   KEGG ENZYME (2)   
   KEGG REACTION (8)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (81)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (78)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (119)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system