KEGG   Cylindrospermum stagnale: Cylst_0479
Entry
Cylst_0479        CDS       T02398                                 
Name
(GenBank) putative calcium-binding protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
csg  Cylindrospermum stagnale
Pathway
csg02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csg00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    Cylst_0479
SSDB
Motif
Pfam: Cadherin_5 Big_9 Cadherin_4 FG-GAP_3 HemolysinCabind FG-GAP Cadherin_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFZ22821
UniProt: K9WSR1
Position
complement(516379..521457)
AA seq 1692 aa
MTEPNFIAPITNPFGLANVVFSAVPTFADIDGDGDLDAFVGNQQGNTLFYRNSGTATAPA
FTLEATNPFGLTNVGSYATPTFADIDGDGDLDAFVGNVDGNTLFYRNSGTATAPAFTLEA
TNPFGLTNVVYVAVPTLADIDGDGDLDAFVGNGYGNTVFYRNTGTSAAPSFTVEATNPFG
LTDVGFSAKPTFADIDADGDLDAFVGNFDGNTLFYRNTGSATVPTFTLEATNPFGLTNVG
NLAAPTFADIDGDGDLDAFVGNLDGDTLFFENTSANTPVNNPPIANNDTATIGEDTSVTG
NVLTNDTDPDAGDILTVAAVNGVAADVGNQITLASGALLTLNSDGTYSYNPNAQFESLAA
GQTASDSFTYTVSDGQGGTSDATVTITINGADEILGTDPNFITPITNPFGLTDVGFSATP
TFADIDADGDLDAFVGNVNGNTLFYRNTGSASNPVFAAPTTNPFGLTDVGNYAAPTFADI
DADGDLDAFVGNNAGDTLFYRNTGSASNPAFAAPTTNDFGLTDVGLYAKPTLADIDGDSD
LDAFVGNLSGNTLFYRNTGSASNPVFAAPTTNDFGLTDVGNAAKPTLADMDGDGDLDAFV
GNRDGNTLFYRNTGSASNPAFAAPTTNPFGLTDVGFYAAPTFADIDGDGDLDAFVGERYG
NTVFFENQPVSTPTVSITAQTATANEGGSNGVYRITRTDTTGDLTINLTLDGGSTAATAD
YSLSGGSVTVSGNTLTVTIAAGQSFVDVDLSAINDIAAEADETLTLNLDTGTGYTVDGTN
NTATVTIAANDTVVTNTNDSGEGSLRQAILNANAFAGADTITFASSVFADATPDTITLTS
GELVITDALTINGLGASNLIISGNNASTVFNVNDGSSNQIAVAINGLTITAGSNNTVGAG
IFNVENLTLSDDIISNNSNNGGDVGAIENKGSLSLINSTVSNNIGFLVGGIYNNGTFSLT
NSTVSNNDGFVTGGIFNEGLFNVTGSTVSNNSGAVTGGIENNGTSTLSLTNSIVSDNTGG
SNGGISISGTATLLNTTISGNRSFGDGGGISISGTATLINTTITNNTADFDNDGFGDGGG
ISSQGTVTVQNTIIAGNFDSGNEAPDIAGAVTGNGNNLIGSLTGASGSIGTGSDITFASA
GITNINQVIASLADNGGATFTHAIVSGSAAINAGDNTLIPSGVTTDQRGITRTIGDTVDI
GAYESPFIPPVAANDTATTDENTLVNINVLVNDTDANGDSLSVIKVNGNSVTVSTPITLA
SGALLTLNANGTFDYNPNGQFESLGVGATASDSFTYTVSDNGNGGTSTATVNLTINGVND
APTGSPTATLSNTPEDTAINITAADLLTGFSDVDAGDILSVTNLTATNGALVDNLNGTYT
FTPTADFNGAVNLTYDVTDGTATLAGQTRSFSVTPVNDAPVAVNDSASTFFGTSVNIAVS
SLLANDTDIDSTSLSITGVSGATHGTAVLNNNGTANNTADDFVSFTPNLLFFGNASFNYT
LSDGSLTDTATVTVAVGLNILGTNFADNLFGTSGNDIIDGGNGNDTIYGGAGDDSLYGGN
GNDVLYGDGLMDGGAGNDTLNGGNGNDTLYGGAGSDTLYGGAGSDLLYGGIGSDTLTGGN
GNDTFAFAAGEGTDTITDFSDGQDLIGLYSGLSFGQLSFSGSNILVTSTNEILATLTGIN
TTTFTAADFVNL
NT seq 5079 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactgaaccgaattttattgccccaattaccaaccccttcggactagcgaatgtggtt
ttttctgccgtgcccacctttgccgatatcgatggcgatggcgacttggatgcttttgtg
ggtaatcagcagggcaataccctgttctaccgcaacagtggaactgccacggctcccgcc
ttcacgctggaagccaccaatccctttggactgacgaatgtggggtcgtatgctacaccc
acctttgccgatatcgatggcgatggggacttggatgcttttgtgggtaatgttgatggc
aataccctgttctaccgcaacagtggaactgccacggctcccgccttcacgctggaagcc
accaaccccttcggactgacaaatgtggtgtatgttgctgtacccaccttagccgatatc
gatggcgatggggacttggatgcttttgtggggaatggttacggcaataccgtgttctac
cgcaacactggaacttcggctgctcccagcttcaccgtggaagccaccaatcccttcgga
ctgacggatgtagggttttctgcgaaacccacctttgccgatatcgatgctgatggagac
ttggatgcttttgtgggtaattttgacggcaataccctgttctaccgcaacaccggaagt
gcaactgttcccaccttcaccctggaagccaccaaccccttcggactgactaatgtgggt
aatcttgctgcacccacctttgccgatatcgatggcgatggcgacttagatgcttttgtc
ggtaatcttgatggcgataccctgttcttcgagaatacatccgctaataccccagtcaac
aatcctcccattgccaataacgacactgctaccatcggcgaagatacctctgtcactggt
aacgtcttaaccaatgacaccgaccccgatgcgggcgatatcttgacagtagcggctgta
aatggcgttgctgctgatgtcggcaatcagattaccttagcttccggtgctttattaacg
ctcaacagtgacggcacatacagttacaaccccaacgctcaatttgaatccttggctgcg
ggtcaaaccgctagtgatagcttcacttataccgtcagtgatggtcaaggcgggactagc
gatgctactgtcaccattacaattaacggcgctgacgagattttaggcactgacccgaat
tttatcacgccaattaccaaccccttcggtctgactgatgtggggttttctgccacgccc
acctttgccgatatcgatgccgatggcgacctcgatgcttttgtgggcaatgttaacggc
aatacgttgttctaccgcaacacgggcagtgccagcaatccagtcttcgccgcccccact
accaaccccttcggtctgactgatgtggggaattatgccgcgcccacctttgccgatatc
gatgccgatggcgacctcgatgcttttgtggggaataatgccggcgatacgttgttctac
cgcaacacgggcagtgccagcaatccagccttcgccgcccccactaccaacgacttcggt
ctgactgatgtggggttatatgccaagcccaccttagccgatatcgatggcgatagcgac
ctcgatgcttttgtgggcaatcttagcggcaatacgttgttctaccgcaacacgggcagc
gccagcaatccagtcttcgccgcccccactaccaacgacttcggtctgactgatgtgggg
aatgccgccaagcccaccttagccgatatggatggcgatggcgacctcgatgcttttgtg
ggcaatcgggacggcaatacgttgttctaccgcaacacgggcagtgccagcaatccagcc
ttcgccgcccccactaccaaccccttcggtctgactgatgtggggttctatgccgcgccc
acctttgccgatatcgatggcgatggcgacctcgatgcttttgtgggggaacgttacggc
aataccgtgttcttcgagaatcaacccgtttctacccctactgtcagcatcaccgcacaa
actgccacagccaatgaaggcggcagtaacggtgtctatcgcatcactcgcaccgacacc
acaggggatttaaccattaacctcacccttgatggcggcagcacagctgcaactgctgac
tatagcctcagtggtggtagcgtcacggtttctggtaataccttaaccgtcaccattgct
gctggacaaagttttgttgacgttgacttatctgctattaatgatatcgctgctgaagca
gacgaaaccctcaccctcaacttagatactggcacaggttacacggtagatggtaccaac
aataccgcaacggttactatcgctgccaacgataccgtcgtcaccaacaccaacgattct
ggtgaaggttccttgcggcaagcgattctcaacgccaatgcctttgcaggtgcagataca
attacctttgcgagtagtgtgttcgctgatgccacccccgacaccattaccttaacttct
ggggaattagttattactgatgccttgaccatcaatggattaggggcaagtaacctgatt
attagtggtaacaatgcctctactgtctttaatgtcaatgatggcagtagcaatcaaatt
gcggtagcaattaatggactaacgattacggctggaagtaataatactgtcggtgctggt
atctttaacgtagaaaacctgacactatccgacgacatcatctctaacaatagcaataat
ggaggagatgtgggcgctattgagaacaaaggctccctcagcctaattaacagcactgtt
tctaacaatattgggtttcttgtaggcggcatctacaataatggtacttttagcctaact
aacagtactgtctctaacaatgatgggtttgtgacaggcggtattttcaacgaaggtctt
ttcaacgtcacgggaagcaccgtctctaacaatagtggggctgttacaggcggcatcgaa
aataatggtactagtactcttagcctaactaacagcattgtctctgacaatactggagga
tctaacggtggtatcagtatatcgggtacagcaaccctgctcaacactactatctctggc
aataggtcatttggagatggcggtggtatcagtatatcgggtacagcaaccctgatcaac
actactattaccaataacactgctgatttcgataacgatggttttggagatggtgggggt
atcagctctcaaggcaccgtcaccgtccaaaacaccatcatcgccggcaactttgattct
ggtaacgaagccccggatattgcgggtgcagtcacaggcaatggcaacaacctcatcggt
agcttgactggcgcatctggcagcatcggcactggtagcgatatcacctttgcctcggct
ggcattaccaatattaaccaagtcatcgcctctctcgccgacaacggcggtgccactttc
actcacgctatagtttccggttcggctgccatcaacgcgggagacaataccctcatcccc
tctggtgtcaccacagaccaacggggtatcactcgcaccattggcgatactgtggatatt
ggcgcttatgaatcacctttcatcccccctgttgccgccaacgatactgccaccactgat
gaaaataccctcgtcaacatcaacgtcttggtaaatgacaccgatgccaatggcgacagc
ctgagtgtgattaaagttaatggcaacagcgtcacagtaagtacaccaattactctagct
tctggtgcgctacttactctcaacgccaatggcactttcgactataatcccaacggtcaa
tttgagtctttgggtgtgggtgctactgccagcgatagtttcacttacacagtcagcgat
aatggtaatggtggcactagcacagcaacggttaacctgactatcaacggtgttaacgat
gcgccaacaggttcacccactgcaaccttaagcaacacaccagaagatacagccatcaat
attactgcggctgacttattaacaggtttcagtgatgtggatgcgggtgatatcctctca
gttaccaacttaactgccactaacggtgcattggtggacaacttgaatgggacttatacc
ttcaccccaactgccgactttaatggtgcagttaatctgacttacgatgtgaccgatggc
acagccaccctagctggacaaacccgcagtttctctgtcacccccgttaacgatgcgcct
gttgctgttaatgacagtgcttccacattctttggtacttctgtcaacatcgcagttagt
agcctactagcaaatgataccgatatagatagcacctcgttgagcattactggtgtcagc
ggtgctactcacggtactgccgtcctgaataataacggcacagccaacaacaccgcagat
gatttcgtttcctttaccccaaatcttctgttctttggcaatgccagctttaattacacc
ctcagtgatggtagcctgactgatactgctacggtgactgtggctgttggtctgaacatt
ttgggcactaattttgctgataacctgtttggtactagcggtaacgacatcatcgacggc
ggtaatggcaacgataccatctacggcggcgcaggtgacgacagtctctacggcggtaat
ggtaacgatgtcttatatggcgatggactgatggatgggggcgcgggtaacgataccctt
aacggtggtaatggcaacgataccctctacgggggtgctggcagcgataccctctacggg
ggtgctggcagcgatctcctctatggcggtattggcagcgataccctcactggtggcaat
ggtaacgatacatttgcctttgctgctggggaaggtactgatactattactgatttctct
gacggtcaagatttaatcggactgtatagtggtttgagctttgggcaactgagtttctct
ggtagcaatatcctggtgacttccacgaatgaaattttggcaacgctgactggtattaat
accacgacgttcaccgctgctgatttcgtaaacctctag

DBGET integrated database retrieval system