KEGG T03275: MED134

Dokdonia sp. MED134: MED134_16483

Entry

MED134_16483      CDS       T03275

Name

(GenBank) hypothetical protein

K20276

large repetitive protein

Organism

dok Dokdonia sp. MED134

Pathway

dok02024

Quorum sensing

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:dok00001]
09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    MED134_16483

SSDB

Motif

Pfam:

TSP3_bac CHU_C

Other DBs

NCBI-ProteinID:

AIN49935

Position

complement(1631448..1636841)

AA seq 1797 aa
MKDPNGTDPAPEDPCDFTAGSTPDTTNAIWQAADCDGDGTPNGVDPDPLDPCTDDGVIGD
EDTTNPIWQAADCDGDGTPNGTDTAPYDPCVDDGTIGDEDTTNAIWQAADCDGDGETNGT
EDMNGSDPNDPCSVSGVATIPAPADPNYDVWAAADCDGDGETNGEEVMNGTDPFDPCSVT
TPTVQVDPMAPGTAAQNAYDVWAAADCDGDGDPNGTDPAPEDPCDFTAGSTPDTTNAIWQ
AADCDGDGTPNGVDPDPLDPCTDDGVIGDEDTTNPIWQAADCDGDGTPNGTDTAPYDPCV
DDGTIGDEDTTNAIWQAADCDGDGETNGTEDMNGSDPNDPCSVSGVATIPAPADPNYDVW
AAADCDGDGETNGEEVMNGTDPFDPCSVTTPTVQVDPMAPGTAAQNAYDVWAAADCDGDG
DPNGTDPAPEDPCDFTAGSTPDTTNAIWQAADCDGDGTPNGVDPDPLDPCTDDGVIGDED
TTNPIWQAADCDGDGTPNGTDTAPYDPCVDDGTIGDEDTTNAIWQAADCDGDGETNGTED
MNGSDPNDPCSVSGVATIPAPADPNYDVWAAADCDGDGVTNGEEVHAMVQIHLILVISIA
SVDLITVLVIIYRADCDGDGVTNGDEIADGTDPNNPCDFDVASQDVTTIAEPFISSDCDG
DGETNGDEIANGTDIFDPCDVTVATIPDAADENYAIWAAADCDGDGVSNGDEAANGTNPF
DPCDFDPSLVTLSQMGDYFDADCDGDGVSNGDEIADGTDPNNPCDFDVASQDVTTIAEPF
ISSDCDGDGETNGDEIANGTDIFDPCDVTVATIPDAADEYYAIWAAADCDGDGVSNGDEA
ANGTDPFDPCDFDPSLVTLSQMGDYFDSDCDGDGVTNGDEIAAGTDPFDPCDFDVEDITV
TQTTAFLNADCDGDGVTNGDEIADGTDPNDPCDFDIVNQDITIVEGDYLAADCDGDGVTN
GNEIATGTDPNNPCEYDASIQDVIMVSTLWLALDCDGDGVSNGTEINDGSNPLDTCDYLE
DNQDITIVTDEWNNADCDGDGVTNGQETIDGTDPLDACDFDLDNQDVTIVGDIYLNADCD
GDGVTNGNEIATGTDPNDPCEYDASIQDVTIVSTLWLALDCDGDGVSNGTEINDGTNPLD
TCDYLEENQDITIVTDEWNNADCDGDGEPNSSDTDPFDPCAGDTDIVTIPDPTDPNYDVW
AAADCDGDGEVNGNDPDPYDPCIGGNIANVNLFDNNSDWYMADCDGDGVTNGIEVDPDMD
GTAGPDGTDPTDACDYNVDDVSLPQSGDWLTADCDGDGNPNETDDDPLDPCVDADVTMVD
LTDTDSDWYNADCDGDGTINGEDPDPLDPCVDNGVIGDEDSTNSIWALADCDGDGTINAN
DPDPNDPCVDDGTIGDEDQNNPIWQGSDCDGDGVLNGQEVIDGTNPYDSCSYDTANQDIS
IVTSQWEMQDCDGDGVTNGDEVTGGTDPVDPCDFELDDVSLPQSPAWNMLDCDGDGVTNG
DELEDGTNPLDLCDYILDSQTVTPSQEWLDTDCDDDGTPNGSDNNTGDPCIFDLDNLDLS
TISEENALADCDGDGVTNIDELDPDGDGMIGPNNTDPNDPCDFSFENQSVEPSEEWNDLD
CDGDGVTNGVEILDGTNPLDPCDLNPENQDMTATTQEWKDLDCDGDGIPNGDECGDENGN
GIIDFLEVNNGNPNATDGLEVFDIMTPNGDGLNDVFVIRGIKKYPNNTVRIYNRWGVEVY
GVKGYGQDGQYFRGESNGRATINGDQLLPVGTYYYTVEYTNASGKLQQLAGPLYLNR

NT seq 5394 nt +upstreamnt +downstreamnt
gtgaaggatccaaacggaacagatccagcaccagaagatccttgtgattttacagcagga
agtacaccagatacgacgaatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggaaca
ccaaatggagtagatccagatccacttgatccttgtacggatgacggggtgataggagat
gaagatacgacgaatccaatctggcaagctgctgattgtgatggggatggaacaccaaac
ggaacagatacagcgccttatgatccttgtgtagacgatggaacgataggcgatgaagat
acgaccaatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggtgagactaacggtaca
gaagatatgaatggttcagatcctaacgatccttgtagtgttagtggtgttgctacgata
ccagcacctgcagacccgaactatgatgtatgggctgctgccgattgtgatggtgatgga
gagactaatggtgaagaagtaatgaatggtacagatccgtttgatccttgtagtgttacg
acaccgacggttcaggtagatcctatggctccgggtactgctgctcagaatgcttatgat
gtatgggctgctgcagattgtgatggcgatggtgatccaaacggaacagatccagcacca
gaagatccttgtgatttcacagcaggaagtacaccagatacgacgaatgcgatttggcaa
gctgccgattgtgatggtgatggaacaccaaatggagtagatccagatccacttgatcct
tgtacggatgacggggtgataggagatgaagatacgacgaatccaatctggcaagctgct
gattgtgatggggatggaacaccaaacggaacagatacagcgccttatgatccttgtgta
gacgatggaacgataggcgatgaagatacgaccaatgcgatttggcaagctgccgattgt
gatggtgatggtgagactaacggtacagaagatatgaatggttcagatcctaacgatcct
tgtagtgttagtggtgttgctacgataccagcacctgcagacccgaactatgatgtatgg
gctgctgccgattgtgatggtgatggagagactaatggtgaagaagtaatgaatggtaca
gatccgtttgatccttgtagtgttacgacaccgacagttcaggtagatcctatggctccg
ggtactgctgctcagaatgcttatgatgtatgggctgctgcagattgtgatggcgatggt
gatccaaacggaacagatccagcaccagaagatccttgtgatttcacagcaggaagtaca
ccagatacgacgaatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggaacaccaaat
ggagtagatccagatccacttgatccttgtacggatgacggggtgataggagatgaagat
acgacgaatccaatctggcaagctgctgattgtgatggggatggaacaccaaacggaaca
gatacagcgccttatgatccttgtgtagacgatggaacgataggcgatgaagatacgacc
aatgcgatttggcaagctgccgattgtgatggtgatggtgagactaacggtacagaagat
atgaatggttcagatcctaacgatccttgtagtgttagtggtgttgctacgataccagca
cctgcagacccgaactatgatgtatgggctgctgccgattgtgatggtgatggagtaact
aatggtgaagaagtacatgcaatggtacagatccatttgatccttgtgatttcaatcgct
tcagtagaccttatcacagtactggtgattatttatcgtgcagattgtgatggagatgga
gtaactaacggtgatgagattgctgatggtaccgatccaaataatccttgtgactttgat
gttgcaagtcaagatgtgactacgatagcagagccatttatttcaagtgactgtgatggt
gacggcgagacaaatggagatgagatagcaaacggaacagatatattcgatccttgtgat
gtaacagttgcaacgattccagatgctgcagatgagaactatgctatatgggctgctgcc
gattgtgatggtgatggagtaagtaatggagatgaggctgctaatggtacaaatccattt
gatccttgtgattttgatccttctttagtgaccttatcacagatgggtgattattttgat
gcagattgtgatggtgatggagtaagtaatggtgatgagattgctgatggtaccgatcca
aataatccttgtgactttgatgttgcaagtcaagatgtgactacgatagcagagccattt
atttcaagtgactgtgatggtgacggcgagacaaatggagatgagatagcaaacggaaca
gatatattcgatccttgtgatgtaactgttgcaacgattccagatgctgcagatgagtac
tatgctatatgggctgctgccgattgtgatggtgatggagtaagtaatggagatgaggct
gctaatggtacagatccatttgatccttgtgattttgatccttcgttagtgaccttatca
cagatgggtgattattttgattcagattgtgatggtgatggagtaactaacggtgacgag
attgcagcaggaacagacccatttgatccttgtgattttgacgttgaggatattactgta
acacaaacaacagcgtttttaaatgctgattgtgatggtgatggagtaactaacggtgac
gagattgccgatggtaccgatccaaatgatccttgtgattttgatattgtaaatcaagat
ataacaattgtggaaggcgattatttagctgcagattgtgatggagatggagtaaccaat
ggtaatgagattgcgactggcacagatccaaataatccttgtgaatacgatgcttcaatc
caagatgttataatggtatcaacactgtggttggcactagattgtgatggagatggtgtt
tcaaatggaacggaaataaatgatggaagtaatccgcttgatacttgtgattatttagaa
gacaatcaggatatcacaatagtgacagatgaatggaacaatgcagattgtgatggcgat
ggtgtaaccaatggtcaggaaactatagatggaacagatcctctcgacgcttgtgatttt
gatctcgataatcaagatgtaactatagtaggtgatatttatttgaatgcagattgtgat
ggtgacggagtaaccaatggtaatgagattgcgactggtaccgatccaaatgatccttgt
gaatatgatgcttcaatccaggatgttacaatcgtatcaacactgtggttagcactagat
tgtgatggcgatggtgtttcaaatggaacggaaataaatgatggaactaatccgcttgat
acttgtgattatttagaagagaatcaggatatcacaatagtgacagatgaatggaataat
gcagattgtgatggcgatggagaaccaaacagttcagatacagatccatttgatccttgt
gctggtgatacagatatagtaactattccagatccaacggatccaaactatgatgtttgg
gcagcggcagattgtgatggagatggagaggttaatggaaatgatccagatccatatgat
ccttgtataggaggaaacatagcaaacgtaaacctgttcgataataattcagattggtat
atggcagattgtgatggagatggtgtaacaaatggaatagaagtagatcctgatatggat
ggtacagctggtcctgatggtacagatccaaccgatgcttgtgattacaatgttgatgat
gttagtttaccgcaatcaggagattggttaacagcggattgtgatggtgatggtaatcca
aatgaaacagatgacgatccattagatccttgtgttgatgctgatgttactatggtagat
cttacggatacagattcagattggtataatgcagattgtgatggtgatgggactatcaat
ggtgaagatccagacccattagatccttgtgtagataatggagtaataggtgatgaggat
tcaacaaattctatatgggcattagcagattgtgatggtgacggaactatcaatgcaaat
gatccggatccaaatgatccttgtgttgatgatggtacaataggtgacgaagatcaaaac
aacccaatttggcaaggttctgattgtgatggtgatggtgttttaaatggtcaagaggtt
attgatggaacaaatccatatgattcttgtagttacgataccgcaaaccaagatatctcg
atagtgacatctcagtgggaaatgcaggattgtgatggtgatggtgtaacaaatggtgat
gaagtaaccggtggtactgaccctgtagatccgtgtgattttgagcttgatgatgttagt
ctacctcaatcaccagcgtggaatatgctggattgtgatggcgacggagttactaatggt
gatgaattggaagacggaacaaacccattagacttgtgtgattacatattagatagtcag
actgttacacctagccaagaatggttagatacagactgtgatgatgatgggacacctaat
ggtagtgataataatacaggtgatccgtgtatctttgatttagataacttagatctaagc
actatttctgaagaaaacgctttagcagattgtgatggagatggcgttactaatattgac
gagcttgatcctgatggagatgggatgataggacctaataatacagatccaaatgaccct
tgtgacttcagttttgagaatcagtctgtagaaccaagtgaagaatggaatgatcttgat
tgtgatggcgatggcgttactaatggagtagaaatattagatggtactaatccattagat
ccttgtgatttaaatccagaaaatcaagatatgacagctacaactcaagagtggaaagat
ctagattgtgatggtgatggtatacctaatggagatgaatgtggagatgaaaatggtaat
ggtataattgacttcttagaggttaacaatggtaatcctaatgcgaccgatggtttagag
gtatttgatataatgactcctaatggcgatggtttaaatgatgtatttgtcataagaggt
attaaaaagtatccaaacaatactgtacgtatttacaaccgttggggagtagaggtttat
ggagtaaaaggttatggtcaggatggtcagtactttagaggagagagtaatggtcgtgct
actataaatggcgatcagcttttaccagtagggacgtattactacactgtagaatatact
aatgcttcaggtaagcttcagcaacttgccggacctttatacttaaacagataa

All links

Ontology (1)   
   KEGG BRITE (1)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (58)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (55)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (63)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system