KEGG   ENZYME: 1.1.1.85Help
Entry
EC 1.1.1.85                 Enzyme                                 

Name
3-isopropylmalate dehydrogenase;
beta-isopropylmalic enzyme;
beta-isopropylmalate dehydrogenase;
threo-Ds-3-isopropylmalate dehydrogenase;
3-carboxy-2-hydroxy-4-methylpentanoate:NAD+ oxidoreductase
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-OH group of donors;
With NAD+ or NADP+ as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
(2R,3S)-3-isopropylmalate:NAD+ oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
(2R,3S)-3-isopropylmalate + NAD+ = 4-methyl-2-oxopentanoate + CO2 + NADH + H+ (overall reaction) [RN:R10052];
(1a) (2R,3S)-3-isopropylmalate + NAD+ = (2S)-2-isopropyl-3-oxosuccinate + NADH + H+ [RN:R04426];
(1b) (2S)-2-isopropyl-3-oxosuccinate = 4-methyl-2-oxopentanoate + CO2 (spontaneous) [RN:R01652]
Reaction(KEGG)
Substrate
(2R,3S)-3-isopropylmalate [CPD:C04411];
NAD+ [CPD:C00003];
(2S)-2-isopropyl-3-oxosuccinate [CPD:C04236]
Product
4-methyl-2-oxopentanoate [CPD:C00233];
CO2 [CPD:C00011];
NADH [CPD:C00004];
H+ [CPD:C00080];
(2S)-2-isopropyl-3-oxosuccinate [CPD:C04236]
Comment
The product decarboxylates spontaneously to yield 4-methyl-2-oxopentanoate.
History
EC 1.1.1.85 created 1972, modified 1976
Pathway
ec00290  Valine, leucine and isoleucine biosynthesis
ec00660  C5-Branched dibasic acid metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K00052  3-isopropylmalate dehydrogenase
K21360  3-isopropylmalate/methylthioalkylmalate dehydrogenase
Genes
RSS: 109441460
ATH: AT1G31180(IMD3) AT1G80560(IMD2) AT5G14200(IMD1)
ALY: ARALYDRAFT_477193 ARALYDRAFT_488253 ARALYDRAFT_895936
CRB: 17884309 17894397 17895032
CSAT: 104703063 104708352 104713996 104734767 104735438 104752167 104769651
EUS: EUTSA_v10013695mg EUTSA_v10018649mg
BRP: 103832473 103850918 103853240 103853243 103853244
BNA: 106354840 106367226 106379685 106398379 106398388 106398399 106429911 106430755 111197702 111203603 111203943
BOE: 106299777 106325760 106326972
THJ: 104808191 104812454 104813313
CPAP: 110814739
CIT: 102627012
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GRA: 105776728
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VRA: 106759681
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NTE: NEUTE1DRAFT62699(NEUTE1DRAFT_62699)
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BFU: BCIN_10g05310(Bcleu2)
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TVE: TRV_07136
PNO: SNOG_02041(SNOG_02040)
PTE: PTT_07744
SPO: SPBC1A4.02c(leu1)
CNE: CNA04310
CNB: CNBA4140
ABP: AGABI1DRAFT113114(AGABI1DRAFT_113114)
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ECO: b0073(leuB)
ECJ: JW5807(leuB)
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ECOK: ECMDS42_0067(leuB)
ECE: Z0082(leuB)
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EOH: ECO103_0075(leuB)
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ECG: E2348C_0078(leuB)
EOK: G2583_0077(leuB)
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ESM: O3M_21085
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ECW: EcE24377A_0076(leuB)
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EUN: UMNK88_72(leuB)
ECC: c0090(leuB)
ECP: ECP_0075
ECI: UTI89_C0080(leuB)
ECV: APECO1_1910(leuB)
ECX: EcHS_A0078(leuB)
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ECR: ECIAI1_0074(leuB)
ECQ: ECED1_0073(leuB)
ECK: EC55989_0071(leuB)
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EFE: EFER_0095(leuB)
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STY: STY0131(leuB)
STT: t0116(leuB)
STM: STM0112(leuB)
SEO: STM14_0133(leuB)
SEY: SL1344_0112(leuB)
SEJ: STMUK_0114(leuB)
SEB: STM474_0118(leuB)
SEF: UMN798_0124(leuB)
SENR: STMDT2_01141(leuB)
SEND: DT104_01171(leuB)
SENI: CY43_00555
SPT: SPA0114(leuB)
SEK: SSPA0110
SEI: SPC_0121(leuB)
SEC: SCH_0108(leuB)
SEH: SeHA_C0123(leuB)
SHB: SU5_0746
SEE: SNSL254_A0124(leuB)
SEW: SeSA_A0128(leuB)
SEA: SeAg_B0128(leuB)
SENS: Q786_00565
SED: SeD_A0121(leuB)
SEG: SG0114(leuB)
SEL: SPUL_0120(leuB)
SEGA: SPUCDC_0120(leuB)
SET: SEN0113(leuB)
SENA: AU38_00565
SENO: AU37_00565
SENV: AU39_00565
SENQ: AU40_00650
SENL: IY59_00585
SEEP: I137_00535
SENB: BN855_1180(leuB)
SENE: IA1_00570
SBG: SBG_0100(leuB)
SBZ: A464_106
SFL: SF0068(leuB)
SFX: S0070(leuB)
SFV: SFV_0065(leuB)
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SFN: SFy_0089
SFS: SFyv_0091
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SSN: SSON_0080(leuB)
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SDY: SDY_0100(leuB)
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ECLO: ENC_45870
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ESA: ESA_03265
CSK: ES15_3248
CTU: CTU_07060(leuB)
KPN: KPN_00079(leuB)
KPU: KP1_0895(leuB)
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SBW: TGUWTKB_2270(leuB)
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YPH: YPC_4044(leuB)
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YPN: YPN_0402
YPM: YP_3650(leuB2)
YPG: YpAngola_A2937(leuB)
YPZ: YPZ3_0514
YPD: YPD4_0467
YPX: YPD8_0467
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YPJ: CH55_2271(leuB)
YPV: BZ15_3038(leuB)
YPL: CH46_382(leuB)
YPS: YPTB0671(leuB)
YPO: BZ17_1885(leuB)
YPI: YpsIP31758_3406(leuB)
YPY: YPK_3536
YPB: YPTS_0697
YPQ: DJ40_1700(leuB)
YPU: BZ21_4054(leuB)
YPR: BZ20_1426(leuB)
YPC: BZ23_147(leuB)
YPF: BZ19_23(leuB)
YEN: YE0653(leuB)
YEY: Y11_38851
YEL: LC20_04524(leuB)
YEW: CH47_2827(leuB)
YET: CH48_949(leuB)
YEE: YE5303_26851(leuB)
YAL: AT01_3182(leuB)
YFR: AW19_3993(leuB)
YIN: CH53_1036(leuB)
YKR: CH54_1797(leuB)
YRO: CH64_3272(leuB)
YRU: BD65_2539(leuB)
YMA: DA391_18745(leuB)
SPE: Spro_0744
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SPLY: Q5A_003215(leuB)
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SMAC: SMDB11_0057(leuB)
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SERM: CLM71_03390(leuB)
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ECA: ECA3832(leuB)
PATR: EV46_18785
PATO: GZ59_38280(leuB)
PCT: PC1_3608
PEC: W5S_3936
SGL: SG0436
SOD: Sant_3367(leuB)
PES: SOPEG_2082(leuB)
DDD: Dda3937_04404(leuB)
DDQ: DDI_3572
DFN: CVE23_18935(leuB)
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ETA: ETA_07410(leuB)
EPY: EpC_07280(leuB)
EPR: EPYR_00770(leuB)
EAM: EAMY_2907(leuB)
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EBI: EbC_07060(leuB)
ERJ: EJP617_03660(leuB)
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BAK: BAKON_pLeu005(leuB)
BUH: BUAMB_pLeu005(leuB)
BAPF: BUMPF009pLeu00005(leuB)
BAPG: BUMPG002pLeu00005(leuB)
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XBV: XBW1_3927(leuB)
XNE: XNC1_1040(leuB)
XNM: XNC2_1024(leuB)
XDO: XDD1_3034(leuB)
XPO: XPG1_0663(leuB)
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LRI: NCTC12151_02629(leuB)
PSHI: SAMEA2665130_2654(leuB)
HIN: HI0987(leuB)
HIT: NTHI1161(leuB)
HIU: HIB_11270
HIE: R2846_1324(leuB)
HIZ: R2866_1396(leuB)
HIK: HifGL_000614(leuB)
HIA: H733_1451
HIW: NTHI477_00722(leuB)
HIC: NTHIC486_01780(leuB)
HIX: NTHI723_00627(leuB)
HAP: HAPS_0030(leuB)
HPAZ: K756_06995
HPAS: JL26_05965
HPAK: JT17_03470
GLE: CJD39_02195(leuB)
HSO: HS_0391(leuB)
HSM: HSM_0716
PMU: PM1961(leuB)
PMV: PMCN06_1361(leuB)
PMP: Pmu_13820(leuB)
PMUL: DR93_2137(leuB)
PDAG: 4362423_00119(leuB)
MSU: MS0598(leuB)
MHT: D648_14630(leuB)
MHQ: D650_13150(leuB)
MHAT: B824_11830(leuB)
MHX: MHH_c18490(leuB)
MHAE: F382_02255
MHAM: J450_01430
MHAO: J451_01130
MHAL: N220_05850
MHAQ: WC39_06160
MHAY: VK67_06165
MVE: X875_9820
APL: APL_0432(leuB)
APJ: APJL_0458(leuB)
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ADG: Adeg_1962
TPZ: Tph_c19810(leuB2)
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ATE: Athe_2099
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PED: ING2D1G_1359(leuB)
CAD: Curi_c12310(leuB)
VPR: Vpar_0097
VRM: 44547418_00116(leuB)
MED: MELS_1522
MEG: DKB62_11725(leuB)
SRI: SELR_16420(leuB)
PUF: UFO1_4275
PFT: JBW_00552
AIN: Acin_2407(leuB)
LPIL: LIP_1258
MTU: Rv2995c(leuB)
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MRA: MRA_3024(leuB)
MTUR: CFBS_3158(leuB)
MTO: MTCTRI2_3056(leuB)
MTD: UDA_2995c(leuB)
MTN: ERDMAN_3282(leuB)
MTUB: MT7199_3031(leuB)
MTUC: J113_20860
MTUE: J114_16000
MTUH: I917_21025
MTUL: TBHG_02925
MTUT: HKBT1_3145(leuB)
MTUU: HKBT2_3150(leuB)
MTQ: HKBS1_3152(leuB)
MBO: BQ2027_MB3019C(leuB)
MBB: BCG_3016c(leuB)
MBT: JTY_3011(leuB)
MBM: BCGMEX_3012c(leuB)
MBX: BCGT_2835
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MMIC: RN08_3305
MCE: MCAN_30171(leuB)
MCQ: BN44_60479(leuB)
MCV: BN43_40704(leuB)
MCX: BN42_41002(leuB)
MCZ: BN45_51415(leuB)
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MPA: MAP_3032c(leuB)
MAO: MAP4_0768
MAVI: RC58_03755
MAVU: RE97_03760
MAV: MAV_3845(leuB)
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MGI: Mflv_4233
MPHL: MPHLCCUG_02052(leuB)
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MCHE: BB28_16675
MSTE: MSTE_03282(leuB)
MJD: JDM601_2717(leuB)
MTER: 4434518_02667(leuB)
ASD: AS9A_1482 AS9A_3191(leuB)
CGL: NCgl1237(Cgl1286)
CGB: cg1453(leuB)
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CAI: Caci_7787
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PRU: PRU_0733(leuB)
AFD: Alfi_1454
ASH: AL1_28180
DORI: FH5T_15040
ASX: CDL62_07355(leuB)
MBAS: ALGA_0732
SRU: SRU_2148(leuB)
SRM: SRM_02369(leuB)
RMR: Rmar_0739
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FLN: FLA_4560
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PHE: Phep_3428
PGS: CPT03_13965(leuB)
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DFE: Dfer_3671
SLI: Slin_5898
SPIR: CWM47_27730(leuB)
LBY: Lbys_2677
RUN: DR864_21745(leuB)
RUP: DTQ70_28520(leuB)
FAE: FAES_4906
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HSW: Hsw_2951
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FLM: MY04_3029
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GFL: GRFL_0162
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ZPR: ZPR_1691
MARB: CJ263_18380(leuB) CJ263_20680(leuB)
DOK: MED134_11961(leuB)
DDO: I597_1166(leuB)
DOD: DCS32_00815(leuB)
LACI: CW733_10130(leuB)
ZGA: ZOBELLIA_4559(LeuB1) ZOBELLIA_4724(LeuB2)
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FEK: C1H87_00765(leuB) C1H87_15625(leuB)
TAJ: C1A40_09620(leuB) C1A40_15535(leuB)
KOS: KORDIASMS9_00761(leuB)
AQB: D1818_17570(leuB) D1818_23825(leuB)
AQA: D1815_08420(leuB) D1815_13865(leuB)
EMAR: D1013_11330(leuB) D1013_12785(leuB)
FBU: UJ101_01112(leuB)
SMG: SMGWSS_040(leuB)
SMS: SMDSEM_044(leuB)
SUM: SMCARI_048(leuB)
SMV: SULALF_029(leuB)
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LOKI: Lokiarch_38570(leuB)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:14087358]
  Authors
BURNS RO, UMBARGER HE, GROSS SR
  Title
THE BIOSYNTHESIS OF LEUCINE. III. THE CONVERSION OF ALPHA-HYDROXY-BETA-CARBOXYISOCAPROATE TO ALPHA-KETOISOCAPROATE.
  Journal
Biochemistry 2:1053-8 (1963)
Reference
2  [PMID:4889950]
  Authors
Parsons SJ, Burns RO.
  Title
Purification and properties of beta-isopropylmalate dehydrogenase.
  Journal
J Biol Chem 244:996-1003 (1969)
  Sequence
[stm:STM0112]
Reference
3  [PMID:10683439]
  Authors
Nemeth A, Svingor A, Pocsik M, Dobo J, Magyar C, Szilagyi A, Gal P, Zavodszky P.
  Title
Mirror image mutations reveal the significance of an intersubunit ion cluster in the stability of 3-isopropylmalate dehydrogenase.
  Journal
FEBS Lett 468:48-52 (2000)
DOI:10.1016/S0014-5793(00)01190-X
Reference
4  [PMID:14269331]
  Authors
CALVO JM, STEVENS CM, KALYANPUR MG, UMBARGER HE.
  Title
THE ABSOLUTE CONFIGURATION OF ALPHA-HYDROXY-BETA-CARBOXYISOCAPROIC ACID (3-ISOPROPYLMALIC ACID), AN INTERMEDIATE IN LEUCINE BIOSYNTHESIS.
  Journal
Biochemistry 19:2024-7 (1964)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.1.1.85
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.1.1.85
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.1.1.85
BRENDA, the Enzyme Database: 1.1.1.85
CAS: 9030-97-1

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