KEGG   ENZYME: 1.10.3.17
Entry
EC 1.10.3.17                Enzyme                                 

Name
superoxide oxidase;
SOO;
CybB;
cytochrome b561;
superoxide:ubiquinone oxidoreductase
Class
Oxidoreductases;
Acting on diphenols and related substances as donors;
With oxygen as acceptor
Sysname
ubiquinol:oxygen oxidoreductase (superoxide-forming)
Reaction(IUBMB)
2 O2 + ubiquinol = 2 superoxide + ubiquinone + 2 H+ [RN:R12508]
Reaction(KEGG)
R12508
Substrate
O2 [CPD:C00007];
ubiquinol [CPD:C00390]
Product
superoxide [CPD:C00704];
ubiquinone [CPD:C00399];
H+ [CPD:C00080]
Comment
This membrane-bound, di-heme containing enzyme, identified in the bacterium Escherichia coli, is responsible for the detoxification of superoxide in the periplasm. In vivo the reaction proceeds in the opposite direction of that shown and produces oxygen. Superoxide production was only observed when the enzyme was incubated in vitro with an excess of ubiquinol.
History
EC 1.10.3.17 created 2019
Orthology
K12262  superoxide oxidase
Genes
NVE: 116608654
ECO: b1418(cybB)
ECJ: JW5224(cybB)
ECD: ECDH10B_1544(cybB)
EBW: BWG_1243(cybB)
ECOK: ECMDS42_1133(cybB)
ECE: Z2303(cybB)
ECS: ECs2023
ECF: ECH74115_2023
ETW: ECSP_1899(cybB)
EOI: ECO111_1807(cybB)
EOJ: ECO26_2016(cybB)
EOH: ECO103_1549(cybB)
ECOO: ECRM13514_1977(cybB)
ECOH: ECRM13516_1779(cybB)
ESL: O3K_13410
ESO: O3O_12220
ESM: O3M_13375
ECK: EC55989_1548(cybB)
ECG: E2348C_1555(cybB)
EOK: G2583_1779(cybB)
ELH: ETEC_1489
ECP: ECP_1422
ECOS: EC958_1697(cybB)
ECV: APECO1_568(cybB)
ECY: ECSE_1500
ECR: ECIAI1_1412(cybB)
ECQ: ECED1_1575(cybB)
EUM: ECUMN_1665(cybB)
EOC: CE10_1616(cybB)
EBR: ECB_01374(cybB)
EBL: ECD_01374(cybB)
EBE: B21_01386(cybB)
EBD: ECBD_2221
ECI: UTI89_C1639(cybB)
ECZ: ECS88_1513(cybB)
ECC: c1844(cybB)
ELO: EC042_1548(cybB)
ESE: ECSF_1345
EKF: KO11_15320(cybB)
EAB: ECABU_c16520(cybB)
EDJ: ECDH1ME8569_1359(cybB)
ELW: ECW_m1546(cybB)
ELL: WFL_07555(cybB)
ELC: i14_1668(cybB)
ELD: i02_1668(cybB)
ELP: P12B_c1707(cybB)
ELF: LF82_0397(cybB)
ECOI: ECOPMV1_01565(cybB)
ECOJ: P423_07980
EFE: EFER_1584(cybB)
EAL: EAKF1_ch0069c(cytB)
ESZ: FEM44_22190(cybB)
STY: STY1868
STT: t1131 t1542
STM: STM1253 STM1639(cybB)
SEF: UMN798_1718(cybB)
SPT: SPA1593
SEK: SSPA1480
SEI: SPC_2096(cybB) SPC_2490
SEC: SCH_1265
SEG: SG1480(cybB) SG1871
SEL: SPUL_1455(cybB)
SEGA: SPUCDC_1455(cybB)
SET: SEN1413(cybB) SEN1798
SEEP: I137_06575
SFL: SF1794(cybB)
SFX: S1478(cybB)
SFV: SFV_1789(cybB)
SFE: SFxv_2012(cybB)
SFN: SFy_2568
SFS: SFyv_2627
SFT: NCTC1_01930(cybB)
SSN: SSON_1724(cybB)
SBO: SBO_1669(cybB)
SDY: SDY_1764(cybB)
ENC: ECL_02080
ECLX: LI66_10440
ECLY: LI62_11240
ECLZ: LI64_10590
ECLO: ENC_11340
EEC: EcWSU1_02107(cybB)
ECHG: FY206_11985(cybB)
ESA: ESA_01704
CSK: ES15_1887
CTU: CTU_22530(cybB)
KPN: KPN_01954(cybB)
KPU: KP1_3022
KPP: A79E_2294
KPR: KPR_2992(cybB)
KPJ: N559_2333
KPX: PMK1_04297(cybB)
KPNU: LI86_11605
KPNK: BN49_3050(cybB)
KVA: Kvar_2349
KPE: KPK_2395
KOX: KOX_19580
KOE: A225_2787
EAE: EAE_20335
EAR: CCG29812
CRO: ROD_16211(cybB)
CKO: CKO_01452
CPOT: FOB25_22900(cybB)
CAMA: F384_07585
RTG: NCTC13098_03961(cybB)
REE: electrica_02692(cybB)
CLAP: NCTC11466_02391(cybB)
KIE: NCTC12125_01225(cybB)
AHN: NCTC12129_02821(cybB)
YRE: HEC60_05265(cybB)
SGOE: A8O29_012220(cybB)
EBF: D782_2313
YPE: YPO3321(cybB)
YPK: y0868(cybB)
YPH: YPC_3637(cybB)
YPA: YPA_2823
YPN: YPN_0772
YPM: YP_0365(cybB1)
YPW: CH59_2728
YPJ: CH55_1901
YPV: BZ15_202
YPL: CH46_1774
YPS: YPTB0809(cybB)
YPO: BZ17_1747
YPY: YPK_3390
YPB: YPTS_0844
YPQ: DJ40_1564
YPU: BZ21_12
YPR: BZ20_1249
YPC: BZ23_284
YPF: BZ19_157
YEN: YE3562
YEW: CH47_49
YIN: CH53_2485
SRL: SOD_c08270(cybB)
SMAF: D781_3834
SERF: L085_23895
SFJ: SAMEA4384070_1013(yodB_1)
RAA: Q7S_24311
ECA: ECA0823(cybB)
PATR: EV46_03635
PATO: GZ59_07280(cybB)
PCT: PC1_0697
PEC: W5S_0823
PPUJ: E2566_04020(cybB)
DDD: Dda3937_03159(cybB)
DDQ: DDI_3149
DAQ: DAQ1742_00945(cybB)
DIC: Dpoa569_003079(cybB)
EAM: EAMY_3547(cybB)
EAY: EAM_3338(cybB)
EPY: EpC_35360(cybB)
EPR: EPYR_03803(cybB)
ERJ: EJP617_10160(cybB)
PAM: PANA_1979(cybB)
PLF: PANA5342_2197(cybB)
PAJ: PAJ_1311(cybB)
PVA: Pvag_pPag30388(cybB)
PSTW: DSJ_14110
PANS: FCN45_19805(cybB)
PEY: EE896_21275(cybB)
TPTY: NCTC11468_01937(yodB)
MMK: MU9_3179
PPR: PBPRB0313
PAE: PA0918
PAEV: N297_949
PAEI: N296_949
PAEB: NCGM1900_1801(kup)
PAEP: PA1S_21835
PAEM: U769_21205
PAEL: T223_22470
PAEG: AI22_12105
PAEC: M802_945
PAEO: M801_949
PMY: Pmen_1714
PMK: MDS_3136
PPSE: BN5_1544
PPU: PP_2010
PPF: Pput_3732
PPT: PPS_1597
PPX: T1E_1009(yodB)
PPUH: B479_07725
PPUN: PP4_38250
PPUD: DW66_1886
PMON: X969_06015
PMOT: X970_05990
PFL: PFL_3967(cybB)
PPRC: PFLCHA0_c40260(yodB)
PPRO: PPC_4066(cybB)
PFC: PflA506_3288(cybB)
PFB: VO64_0991
PMAN: OU5_0784 OU5_1266(cybB)
PEN: PSEEN1705
PSA: PST_0904
PKC: PKB_1340
PSOS: POS17_2498 POS17_4076(cybB)
SPSW: Sps_04779
CPS: CPS_3930
PHA: PSHAa1480
PTN: PTRA_a1871(cybB)
PSM: PSM_A1513
PART: PARC_p0059(cybB)
PTU: PTUN_b0661(cybB)
PTD: PTET_a1760(cybB)
MVS: MVIS_0974
SDE: Sde_1491
METL: U737_16520
AHA: AHA_3044
ASA: ASA_3065(cybB)
AVR: B565_2849
ASR: WL1483_2927(yodB)
AEL: NCTC12917_03051(yodB)
RME: Rmet_3013(yodB)
BAM: Bamb_1444
BCED: DM42_6491
BDL: AK34_3991
BSTG: WT74_07990
BGO: BM43_2721
BPH: Bphy_7090
CABA: SBC2_44620
AXX: ERS451415_03168(yodB)
AFQ: AFA_08065
RFR: Rfer_3123
PNA: Pnap_1333
DAC: Daci_2711
CTES: O987_10210
MPT: Mpe_A1513
SLT: Slit_0172
GCA: Galf_2649
HDN: Hden_2073
JAN: Jann_2671
SPHP: LH20_16345
SGI: SGRAN_0602(cybB)
SPHD: HY78_24775
SPHM: G432_20880
SECH: B18_16255
SSY: SLG_29210
SPMI: K663_08640
SMIC: SmB9_02690
TMO: TMO_a0009
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Reference
1  [PMID:6097799]
  Authors
Murakami H, Kita K, Anraku Y
  Title
Cloning of cybB, the gene for cytochrome b561 of Escherichia coli K12.
  Journal
Mol Gen Genet 198:1-6 (1984)
DOI:10.1007/bf00328692
Reference
2  [PMID:3510204]
  Authors
Murakami H, Kita K, Anraku Y
  Title
Purification and properties of a diheme cytochrome b561 of the Escherichia coli respiratory chain.
  Journal
J Biol Chem 261:548-51 (1986)
Reference
3  [PMID:29915379]
  Authors
Lundgren CAK, Sjostrand D, Biner O, Bennett M, Rudling A, Johansson AL, Brzezinski P, Carlsson J, von Ballmoos C, Hogbom M
  Title
Scavenging of superoxide by a membrane-bound superoxide oxidase.
  Journal
Nat Chem Biol 14:788-793 (2018)
DOI:10.1038/s41589-018-0072-x
  Sequence
[eco:b1418]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.10.3.17
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.10.3.17
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.10.3.17
BRENDA, the Enzyme Database: 1.10.3.17

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