KEGG   ENZYME: 1.14.11.63Help
Entry
EC 1.14.11.63               Enzyme                                 

Name
peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase;
JMJD7 (gene name);
Jumonji domain-containing protein 7;
JmjC domain-containing protein 7
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
BRITE hierarchy
Sysname
[protein]-L-lysine,2-oxoglutarate:oxygen oxidoreductase (3S-hydroxylating)
Reaction(IUBMB)
a [protein]-L-lysine + 2-oxoglutarate + O2 = a [protein]-(3S)-3-hydroxy-L-lysine + succinate + CO2 [RN:R12315]
Reaction(KEGG)
Substrate
[protein]-L-lysine [CPD:C02188];
2-oxoglutarate [CPD:C00026];
O2 [CPD:C00007]
Product
[protein]-(3S)-3-hydroxy-L-lysine [CPD:C22076];
succinate [CPD:C00042];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
Requires iron(II). The enzyme acts on specific lysine residues in its substrates, and is stereo-specific. The enzyme encoded by the human JMJD7 gene acts specifically on two related members of the translation factor family of GTPases, DRG1 and DRG2.
History
EC 1.14.11.63 created 2019
Orthology
K19219  peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase / protease
Genes
HSA: 100137047(JMJD7)
PTR: 749464
PON: 100533112(JMJD7)
MCC: 707262(JMJD7)
MCF: 102140936(JMJD7)
CSAB: 103245779(JMJD7)
RRO: 104666908(JMJD7)
RBB: 108544336(JMJD7)
CJC: 100533114(JMJD7)
SBQ: 104652609(JMJD7)
MMU: 433466(Jmjd7)
MCAL: 110284590(Jmjd7)
MPAH: 110317836(Jmjd7)
RNO: 100137086(Jmjd7)
MUN: 110554756(Jmjd7)
CGE: 100760377(Jmjd7)
NGI: 103744941(Jmjd7)
HGL: 106007588(Jmjd7)
CCAN: 109693134
OCU: 100341549(JMJD7)
CFA: 100533116(JMJD7)
VVP: 112919976(JMJD7)
AML: 109490043(JMJD7)
UMR: 103673535(JMJD7)
UAH: 113241998
ORO: 101362628(JMJD7)
PPAD: 109263117
BTA: 100137087(JMJD7)
BOM: 102281738(JMJD7)
BIU: 109564978(JMJD7)
BBUB: 112577669(JMJD7)
OAS: 101116914(JMJD7)
SSC: 100533119(JMJD7)
CFR: 102506621(JMJD7)
CDK: 105096849(JMJD7)
BACU: 102998250(JMJD7)
LVE: 103091220(JMJD7)
DLE: 111181704(PLA2G4B)
ECB: 100533115(JMJD7)
EPZ: 103549949(JMJD7)
EAI: 106841349(JMJD7)
MYB: 102239879(JMJD7)
HAI: 109384056(JMJD7)
PALE: 107195254(JMJD7)
RAY: 107514504(JMJD7)
MJV: 108385410(JMJD7)
LAV: 100674267(JMJD7)
TMU: 101354437
SHR: 111720048(JMJD7)
GGA: 423221(JMJD7)
MGP: 104911088(JMJD7)
CJO: 107314828(JMJD7)
NMEL: 110401267(JMJD7)
APLA: 101792985(JMJD7)
ACYG: 106040727(JMJD7)
TGU: 115495506(JMJD7)
LSR: 110472114(JMJD7)
SCAN: 103826652(JMJD7)
GFR: 106631784(JMJD7)
FAB: 101815783(JMJD7)
PHI: 102105670(JMJD7)
PMAJ: 107205987(JMJD7)
CCW: 104688206(JMJD7)
ETL: 114056490(JMJD7)
FCH: 114015725(JMJD7)
CLV: 106145677(JMJD7)
EGZ: 104127569(JMJD7)
NNI: 104020446(JMJD7)
ACUN: 113480748(JMJD7)
AAM: 106498215(JMJD7)
ASN: 106721816(JMJD7)
AMJ: 106737746(JMJD7)
PSS: 106732512(JMJD7)
CPIC: 101942325(JMJD7)
PVT: 110079000(JMJD7)
PBI: 103052777(JMJD7)
PMUR: 107287418(JMJD7)
TSR: 106544674(JMJD7)
PMUA: 114594240(JMJD7)
XLA: 100036980(jmjd7.L)
XTR: 496732(jmjd7)
NPR: 108789918(JMJD7)
DRE: 550278(jmjd7)
SRX: 107729259(jmjd7)
SANH: 107693178(jmjd7)
SGH: 107586593(jmjd7) 107589668
CCAR: 109106803(jmjd7)
IPU: 108270221(jmjd7)
PHYP: 113538640(jmjd7)
AMEX: 103032045(jmjd7)
EEE: 113579350(jmjd7)
TRU: 101076402(jmjd7)
LCO: 104936578(jmjd7)
MZE: 101467553(jmjd7)
ONL: 100700949(jmjd7)
OLA: 101158565(jmjd7)
XMA: 102219182(jmjd7)
XCO: 114156198(jmjd7)
PRET: 103458248
CVG: 107096046(jmjd7)
NFU: 107391658(jmjd7)
KMR: 108230894(jmjd7)
ALIM: 106527310(jmjd7)
AOCE: 111571110(jmjd7)
CSEM: 103381819(jmjd7)
POV: 109647337(jmjd7)
LCF: 108882342(jmjd7)
SDU: 111237120(jmjd7)
SLAL: 111672839(jmjd7)
HCQ: 109520428(jmjd7)
BPEC: 110167131(jmjd7)
MALB: 109951731(jmjd7) 109972496
SASA: 100196304(jmjd7)
SALP: 111968486(jmjd7)
ELS: 105024717(jmjd7)
SFM: 108941481(jmjd7)
PKI: 111837019(jmjd7)
LCM: 102345464
CMK: 103178438(jmjd7)
RTP: 109924370(jmjd7)
CIN: 100181237
SPU: 584542
APLC: 110982943
SKO: 100376350(jmjd7) 102807182
DME: Dmel_CG10133(JMJD7)
DER: 6544823
DSI: Dsimw501_GD12657(Dsim_GD12657)
DSR: 110179816
DPE: 6602207
DMN: 108151366
DWI: 6639576
DAZ: 108613811
DNV: 108652556
DHE: 111599858
MDE: 101892917
LCQ: 111682743
AAG: 5571737
AALB: 109411251
MPHA: 105835990
AEC: 105148545
ACEP: 105620777
PBAR: 105431114
VEM: 105565233
HST: 105191739
DQU: 106745288
CFO: 105253337
LHU: 105674555
OBO: 105282365
PCF: 106791148
NVI: 100123376
CSOL: 105365357
MDL: 106693932
TCA: 663366
DPA: 109540363
ATD: 109605084
NVL: 108569390
BMOR: 101736097
PMAC: 106718650
PRAP: 111002033
HAW: 110379435
TNL: 113494218
ZNE: 110831362
PVM: 113804462
TSP: Tsp_11033
PCAN: 112560917
EPA: 110239529
ADF: 107336840
AMIL: 114952880
PDAM: 113679966
DGT: 114526469
AQU: 100637214
ATH: AT3G45880
CRB: 111830393
BRP: 103873401
BOE: 106335067
RSZ: 108808899
THJ: 104798521
CPAP: 110811377
CIT: 102613294
TCC: 18590024
GRA: 105799340
GAB: 108457106
DZI: 111285548
EGR: 104444179
VRA: 106777745
VAR: 108335755
VUN: 114173413
CCAJ: 109792294
CAM: 101510987
LJA: Lj2g3v1561980.1(Lj2g3v1561980.1) Lj5g3v1014690.1(Lj5g3v1014690.1)
ADU: 107487327
AIP: 107639959
LANG: 109348970
FVE: 101309515
RCN: 112168131
PPER: 18778913
PMUM: 103325845
PAVI: 110771483
MDM: 103435650
PXB: 103945954
ZJU: 107427811
RCU: 8261736
JCU: 105630023
HBR: 110655533
JRE: 108986432
VVI: 100261355
SLY: 101250242
SPEN: 107026817
CANN: 107870096
NSY: 104228240
NAU: 109227082
SIND: 105159751
OEU: 111398601
HAN: 110895946
LSV: 111900017
CCAV: 112522036
DCR: 108197608
BVG: 104884810
SOE: 110774973
CQI: 110705629
NNU: 104610281
OSA: 4347413
DOSA: Os09t0483600-01(Os09g0483600)
OBR: 102702595
ATS: 109758487(LOC109758487)
SBI: 8055861
ZMA: 100281215
SITA: 101786912
EGU: 105053696
MUS: 103973706
PEQ: 110035334
AOF: 109838975
ATR: 18422646
PPP: 112295875
APRO: F751_6292
NCR: NCU03670
NTE: NEUTE1DRAFT77133(NEUTE1DRAFT_77133)
MGR: MGG_08136
SSCK: SPSK_04350
MAW: MAC_02408
MAJ: MAA_06832
CMT: CCM_03925
MBE: MBM_01929
PTE: PTT_17648
CNE: CND04170
CNB: CNBD2150
ABP: AGABI1DRAFT38104(AGABI1DRAFT_38104)
ABV: AGABI2DRAFT117066(AGABI2DRAFT_117066)
DDI: DDB_G0292770(jcdE)
DFA: DFA_01100(jcdE)
SMIN: v1.2.002914.t1(symbB.v1.2.002914.t1) v1.2.010877.t1(symbB.v1.2.010877.t1)
BGO: BM43_5324
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:29915238]
  Authors
Markolovic S, Zhuang Q, Wilkins SE, Eaton CD, Abboud MI, Katz MJ, McNeil HE, Lesniak RK, Hall C, Struwe WB, Konietzny R, Davis S, Yang M, Ge W, Benesch JLP, Kessler BM, Ratcliffe PJ, Cockman ME, Fischer R, Wappner P, Chowdhury R, Coleman ML, Schofield CJ
  Title
The Jumonji-C oxygenase JMJD7 catalyzes (3S)-lysyl hydroxylation of TRAFAC GTPases.
  Journal
Nat Chem Biol 14:688-695 (2018)
DOI:10.1038/s41589-018-0071-y
  Sequence
[hsa:100137047]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.14.11.63
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.14.11.63
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.14.11.63
BRENDA, the Enzyme Database: 1.14.11.63

DBGET integrated database retrieval system