KEGG   ENZYME: 1.14.11.73
Entry
EC 1.14.11.73               Enzyme                                 

Name
[protein]-arginine 3-hydroxylase;
JMJD5 (gene name)
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
Sysname
[protein]-L-arginine,2-oxoglutarate:oxygen oxidoreductase (3R-hydroxylating)
Reaction(IUBMB)
[protein]-L-arginine + 2-oxoglutarate + O2 = [protein]-(3R)-3-hydroxy-L-arginine + succinate + CO2 [RN:R12645]
Reaction(KEGG)
R12645
Substrate
protein-L-arginine [CPD:C00613];
2-oxoglutarate [CPD:C00026];
O2 [CPD:C00007]
Product
[protein]-(3R)-3-hydroxy-L-arginine [CPD:C22296];
succinate [CPD:C00042];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
The enzyme, characterized from humans, catalyses the stereoselective formation of the (2S,3R)-hydroxy-L-arginine stereoisomer. So far the enzyme has been shown to act on two substrates - the 40S ribosomal protein S6 (RPS6), which is hydroxylated at R137, and, at a lower activity, RCCD1, a protein involved in chromatin stability, which is hydroxylated at R141. Even though the same stereoisomer is produced by the bacterial EC 1.14.11.47, [50S ribosomal protein L16]-arginine 3-hydroxylase, the two enzymes do not exhibit any cross-reactivity on their respective ribosomal protein substrates.
History
EC 1.14.11.73 created 2020
Orthology
K10277  [protein]-arginine 3-hydroxylase / protease
Genes
HSA: 79831(KDM8)
PTR: 454003(KDM8)
PPS: 100968297(KDM8)
GGO: 101154296(KDM8)
PON: 100449217(KDM8)
NLE: 100586240(KDM8)
MCC: 703323(KDM8)
MCF: 102130596(KDM8)
CSAB: 103230060(KDM8)
CATY: 105598445(KDM8)
RRO: 104665634(KDM8)
RBB: 108538874(KDM8)
TFN: 117087556(KDM8)
CJC: 100411932(KDM8)
SBQ: 101047692(KDM8)
MMUR: 105879694(KDM8)
MMU: 77035(Kdm8)
MCAL: 110298679(Kdm8)
MPAH: 110332709(Kdm8)
RNO: 308976(Kdm8)
MCOC: 116102930(Kdm8)
MUN: 110563301
CGE: 100762777(Kdm8)
PLEU: 114692221(Kdm8)
NGI: 103741037(Kdm8)
HGL: 101702352(Kdm8)
CCAN: 109698038(Kdm8)
OCU: 100358867(KDM8)
TUP: 102471383(KDM8)
CFA: 608058(KDM8)
VVP: 112929177(KDM8)
AML: 100475840(KDM8)
UMR: 103657901(KDM8)
UAH: 113267605(KDM8)
ORO: 101372656(KDM8)
ELK: 111162296
MPUF: 101672696(KDM8)
EJU: 114214500(KDM8)
FCA: 101096528(KDM8)
PTG: 102950473(KDM8)
PPAD: 109256513(KDM8)
AJU: 106966184(KDM8)
BTA: 507905(KDM8)
BOM: 102264590(KDM8)
BIU: 109578552(KDM8)
BBUB: 102396937(KDM8)
CHX: 102186078(KDM8)
OAS: 101108800(KDM8)
SSC: 100519765(KDM8)
CFR: 102504419(KDM8)
CDK: 105098259(KDM8)
BACU: 103016454(KDM8)
LVE: 103086446(KDM8)
OOR: 101280561(KDM8)
DLE: 111182215(KDM8)
PCAD: 102980433(KDM8)
ECB: 100064574(KDM8)
EPZ: 103556348(KDM8)
EAI: 106829079(KDM8)
MYB: 102259370(KDM8)
MYD: 102752152(KDM8)
MMYO: 118656457(KDM8)
MNA: 107544798(KDM8)
HAI: 109386576(KDM8)
DRO: 112304683(KDM8)
SHON: 119004149(KDM8)
AJM: 119039337(KDM8)
MMF: 118642758(KDM8)
PALE: 102893335(KDM8)
RAY: 107507131(KDM8)
MJV: 108394804(KDM8)
LAV: 100654538(KDM8)
TMU: 101350750
MDO: 100016278(KDM8)
SHR: 100921054(KDM8)
PCW: 110221643(KDM8)
OAA: 100079268(KDM8)
GGA: 416583(KDM8)
MGP: 100541114(KDM8)
CJO: 107320716(KDM8)
NMEL: 110405598(KDM8)
APLA: 101796369(KDM8)
ACYG: 106046025(KDM8)
TGU: 100221235(KDM8)
LSR: 110477748(KDM8)
SCAN: 103817553(KDM8)
GFR: 102044247(KDM8)
FAB: 101809416(KDM8)
PHI: 102107110(KDM8)
PMAJ: 107211302(KDM8)
CCAE: 111936304(KDM8)
CCW: 104685073(KDM8)
ETL: 114061460(KDM8)
FPG: 101913407(KDM8)
FCH: 102060265(KDM8)
CLV: 102088060(KDM8)
EGZ: 104131350(KDM8)
NNI: 104015286(KDM8)
ACUN: 113485933(KDM8)
PADL: 103913936(KDM8)
AAM: 106486126(KDM8)
ASN: 102386519(KDM8)
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PSS: 102458369(KDM8)
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ACS: 100560548(kdm8)
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TSR: 106546607(KDM8)
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XLA: 108701551(kdm8.L)
XTR: 100158649(kdm8)
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DDI: DDB_G0270906(jcdD)
DFA: DFA_08281(jcdD)
SPAR: SPRG_05119
MSTO: MSTO_01620
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Reference
1  [PMID:29563586]
  Authors
Wilkins SE, Islam MS, Gannon JM, Markolovic S, Hopkinson RJ, Ge W, Schofield CJ, Chowdhury R
  Title
JMJD5 is a human arginyl C-3 hydroxylase.
  Journal
Nat Commun 9:1180 (2018)
DOI:10.1038/s41467-018-03410-w
  Sequence
[hsa:79831]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.14.11.73
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.14.11.73
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.14.11.73
BRENDA, the Enzyme Database: 1.14.11.73

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