KEGG   ENZYME: 1.14.99.69
Entry
EC 1.14.99.69               Enzyme                                 

Name
tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-isopentenyladenosine37 hydroxylase;
miaE (gene name);
tRNA 2-methylthio-N6-isopentenyl adenosine(37) hydroxylase;
tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-dimethylallyladenosine37 hydroxylase
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
Miscellaneous
Sysname
tRNA N6-(3-methylbut-2-en-1-yl)-2-(methylsulfanyl)adenosine37,donor:oxygen 4-oxidoreductase (trans-hydroxylating)
Reaction(IUBMB)
N6-(3-methylbut-2-en-1-yl)-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA + reduced acceptor + O2 = N6-[(2E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl]-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA + acceptor + H2O [RN:R12676]
Reaction(KEGG)
R12676
Substrate
N6-(3-methylbut-2-en-1-yl)-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA;
reduced acceptor [CPD:C00030];
O2 [CPD:C00007]
Product
N6-[(2E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl]-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA;
acceptor [CPD:C00028];
H2O [CPD:C00001]
Comment
The enzyme, found only within a small subset of facultative anaerobic bacteria, belongs to the nonheme diiron family. The enzyme from Salmonella typhimurium was shown to catalyse a stereoselective (E) hydroxylation at the terminal C4-position of the dimethylallyl group.
History
EC 1.14.99.69 created 2020
Orthology
K06169  tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-isopentenyladenosine37 hydroxylase
Genes
LCQ: 111678756 111689252
STY: STY4809(miaE)
STT: t4505(miaE)
SEX: STBHUCCB_47610
SENT: TY21A_22925
STM: STM4471(miaE)
SEO: STM14_5366(miaE)
SEV: STMMW_44171
SEY: SL1344_4401(miaE)
SEM: STMDT12_C45990
SEJ: STMUK_4457(miaE)
SEB: STM474_4668(miaE)
SEF: UMN798_4840(miaE)
SENR: STMDT2_43171(miaE)
SEND: DT104_44611(miaE)
SENI: CY43_23285
SPT: SPA4271(miaE)
SEK: SSPA3968
SEI: SPC_4604(miaE)
SEC: SCH_4326(miaE)
SHB: SU5_0520
SENS: Q786_22025
SED: SeD_A4855
SEG: SG4296(miaE)
SEL: SPUL_4447(miaE)
SEGA: SPUCDC_4433(miaE)
SET: SEN4223(miaE)
SENA: AU38_21785
SENO: AU37_21800
SENV: AU39_21820
SENQ: AU40_24355
SENL: IY59_22345
SEEP: I137_21275
SBG: SBG_3891(miaE)
SBZ: A464_4460
ENC: ECL_00680
ECLX: LI66_02585
ECLY: LI62_03070
ECLZ: LI64_02755
ECLO: ENC_43870
EEC: EcWSU1_00483(miaE)
ECAN: CWI88_19590(miaE)
ECHG: FY206_03095(miaE)
ESH: C1N69_02590(miaE)
EBG: FAI37_04005(miaE)
CSK: ES15_3430
CTU: CTU_04970(miaE)
KPN: KPN_04661(miaE)
KPU: KP1_0542(miaE)
KPP: A79E_4536
KPR: KPR_0638(miaE)
KPJ: N559_4629
KPNU: LI86_23800
KPNK: BN49_4776(miaE)
KVA: Kvar_4593
KPE: KPK_5007(miaE)
KOX: KOX_09310
KOE: A225_0537
EAE: EAE_09745
EAR: CCG32089
CBRA: A6J81_14050(miaE)
CPOT: FOB25_08495(miaE)
CFQ: C2U38_02495(miaE)
CAMA: F384_24555
CAF: AL524_06320(miaE)
CIF: AL515_04210(miaE)
CIR: C2U53_13155(miaE)
CIE: AN232_00995(miaE)
CPAR: CUC49_22200(miaE)
CTEL: GBC03_07825(miaE)
KOR: AWR26_22395(miaE)
KOT: EH164_19735(miaE)
KPSE: IP581_02615(miaE)
LEI: C2U54_07385(miaE)
LEH: C3F35_09210(miaE)
LEE: DVA44_21265(miaE)
LER: GNG29_02745(miaE)
LEA: GNG26_02290(miaE)
LEW: DAI21_01660(miaE)
YRE: HEC60_20315(miaE)
SGOE: A8O29_020005(miaE)
PDZ: HHA33_25080(miaE)
EBF: D782_3976
EBC: C2U52_04375(miaE)
PSTS: E05_18780
SMAR: SM39_4828(miaE)
SMAC: SMDB11_4610(miaE)
SPE: Spro_0556
SRL: SOD_c04320(miaE)
SPLY: Q5A_002330
SMAF: D781_0463
SERF: L085_01635
RAA: Q7S_16580
DAQ: DAQ1742_03136(miaE)
EBI: EbC_39710
EGE: EM595_0578(miaE)
PAM: PANA_0491(miaE)
PLF: PANA5342_3807(miaE)
PAJ: PAJ_3639(miaE)
PVA: Pvag_3715(miaE)
PSTW: DSJ_04240
PLU: plu0721(miaE)
PAY: PAU_00695(miaE)
XNM: XNC2_3697
XDO: XDD1_3157(miaE)
XPO: XPG1_2761(miaE)
PSI: S70_05595
PSX: DR96_224
VCH: VC1910
VCS: MS6_1672
VCE: Vch1786_I1401(miaE)
VCI: O3Y_09250
VCO: VC0395_A1500(miaE)
VCR: VC395_2025(miaE)
VCM: VCM66_1834(miaE)
VVU: VV1_2956
VVY: VV1316
VPA: VP1099
VPB: VPBB_1028
VAG: N646_0151
VSP: VS_2052
VNI: VIBNI_A2329(miaE)
VTA: A1099(miaE)
VFI: VF_1492
AWD: AWOD_I_1581(miaE)
PPR: PBPRA2472(STY4809)
PAE: PA1790
PAEV: N297_1838
PAEI: N296_1838
PAU: PA14_41430(miaE)
PNC: NCGM2_2694(miaE)
PAEB: NCGM1900_4771(miaE)
PAEP: PA1S_17045
PAEM: U769_16760
PAEL: T223_18100
PAEG: AI22_16945
PAEC: M802_1835
PAEO: M801_1837
PMY: Pmen_2575
PMK: MDS_2130
PPSE: BN5_1760(miaE)
PPU: PP_2188
PPF: Pput_3549
PPT: PPS_1799
PPI: YSA_01399
PPX: T1E_1271(miaE)
PPUH: B479_08885
PPUT: L483_08735
PPUN: PP4_36280
PPUD: DW66_2046
PMON: X969_06830
PMOT: X970_06805
PSB: Psyr_1728
PSYR: N018_17635
PSP: PSPPH_3556(miaE)
PFL: PFL_2636(miaE)
PPRC: PFLCHA0_c27030(miaE)
PPRO: PPC_2685(miaE)
PFS: PFLU_3486
PFC: PflA506_2546(miaE)
PFB: VO64_0597
PMAN: OU5_0720
PFW: PF1751_v1c29150(miaE)
PEN: PSEEN3516
PSA: PST_2049
PSTT: CH92_11795
PPUU: PputUW4_02912(miaE)
PKC: PKB_1974
PSES: PSCI_5516
PSEM: TO66_12900
PSOS: POS17_2643(miaE)
PANR: A7J50_3189
PSET: THL1_3653
PSIL: PMA3_15485
PALL: UYA_10815
ACX: Achr_23070(miaE)
PAR: Psyc_1644
PALI: A3K91_2098
PSYC: DABAL43B_2159(miaE)
PSYA: AOT82_1153
ACB: A1S_2515
ABM: ABSDF0957
ABY: ABAYE0946
ABN: AB57_2956
ABX: ABK1_2845
ABH: M3Q_3025
ABAD: ABD1_25010
ABAU: IX87_09245
ABAA: IX88_15775
ACC: BDGL_001984(miaE)
ACI: ACIAD2576
ASJ: AsACE_CH01894(miaE)
AGU: AS4_31060
AUG: URS_2293
MCT: MCR_1249(miaE)
MCS: DR90_671
SON: SO_1788(miaE)
SDN: Sden_2203
SAZ: Sama_1218
SBL: Sbal_1598
SLO: Shew_2514
SSE: Ssed_1535
SPL: Spea_2687
SWD: Swoo_3119
SWP: swp_3267
SVO: SVI_3004(miaE) SVI_3071
SBK: SHEWBE_2107(miaE)
ILO: IL1036
CPS: CPS_1658 CPS_3795(miaE)
PTN: PTRA_a1944(miaE) PTRA_a2536(miaE)
PAT: Patl_1614
PEA: PESP_a1954(miaE) PESP_a2694(miaE)
PSPO: PSPO_a0921(miaE) PSPO_a2154(miaE)
PART: PARC_a1204(miaE) PARC_a2036(miaE)
PTU: PTUN_a1316(miaE) PTUN_b0480(miaE)
PNG: PNIG_a2063(miaE) PNIG_a2736(miaE)
PTD: PTET_a1782(miaE) PTET_a2419 PTET_a2429(miaE)
PAGA: PAGA_a1237(miaE) PAGA_a1987(miaE)
MAQ: Maqu_1858
MHC: MARHY1445
MAD: HP15_2202
MBS: MRBBS_2453(miaE)
MARJ: MARI_15200
AMAL: I607_11890
AMAE: I876_12260
AMAO: I634_12115
AMAD: I636_12240
AMAI: I635_12605
AMAG: I533_11860
AMAC: MASE_11640
AAUS: EP12_12575
GNI: GNIT_1460
GPS: C427_3311
SALH: HMF8227_01945(miaE)
PIN: Ping_3082
FBL: Fbal_2604
CJA: CJA_1997(miaE)
SAGA: M5M_00455
LPN: lpg1550
LPH: LPV_1685
LPO: LPO_1564
LPM: LP6_1528(miaE)
LPF: lpl1476
LPP: lpp1507
LPC: LPC_0971(miaE)
LPA: lpa_02252(miaE)
LPE: lp12_1488
LLO: LLO_1526(miaE)
LFA: LFA_1610
LHA: LHA_1584(miaE)
LOK: Loa_01553
LLG: 44548918_01527(miaE)
LJR: NCTC11533_01487(miaE)
LCJ: NCTC11976_02171(miaE)
LSS: NCTC12082_00799(miaE)
TMC: LMI_1487
FTU: FTT_1325c(miaE)
FTQ: RO31_1547
FTF: FTF1325c(miaE)
FTW: FTW_1491
FTT: FTV_1267(miaE)
FTG: FTU_1351(miaE)
FTL: FTL_1486
FTH: FTH_1440(miaE)
FTA: FTA_1571
FTS: F92_08250
FTI: FTS_1452(miaE)
FTC: DA46_1266
FTV: CH67_1882
FTZ: CH68_1611
FTM: FTM_1338(miaE)
FTN: FTN_0653(miaE)
FTX: AW25_1372
FTD: AS84_15
FTY: CH70_1395
FPH: Fphi_0168
FPT: BZ13_1907
FPI: BF30_341
FPM: LA56_145
FPX: KU46_1212
FPZ: LA55_679
FPJ: LA02_1787
FNA: OOM_1240
FRC: KX01_1846
HCH: HCH_02150(miaE)
CSA: Csal_2056
HEL: HELO_2439(miaE)
HAM: HALO2257
HBE: BEI_1998(miaE)
ABO: ABO_1203(miaE)
ADI: B5T_02392(miaE)
APAC: S7S_09925
AXE: P40_11515
KKO: Kkor_1971
KGE: TQ33_0567
TOL: TOL_1575
OAI: OLEAN_C19930(miaE)
NJP: NEJAP_1845(miaE)
AHA: AHA_1871
AVR: B565_2271
AMED: B224_2648
ASR: WL1483_3000(miaE)
ACAV: VI35_09670
OCE: GU3_07560
GPB: HDN1F_16480(miaE)
PLG: NCTC10937_03696(miaE)
ADE: Adeh_0296
MXA: MXAN_1266(miaE)
CCX: COCOR_01174(miaE)
SUR: STAUR_1898(miaE)
SCL: sce9366
HOH: Hoch_4209
SECH: B18_20775
SYC: syc0628_d
SYW: SYNW1937
SYG: sync_0579(miaE)
SYR: SynRCC307_0457(miaE)
SYX: SynWH7803_0550(miaE)
SYP: SYNPCC7002_A1552(miaE)
CYA: CYA_2185(miaE)
CYB: CYB_1409(miaE)
SYNR: KR49_11580
SYND: KR52_14400
SYNW: SynWH8103_02212(miaE)
TEL: tll2371
THN: NK55_08740(miaE)
LET: O77CONTIG1_03148(MiaE)
PMA: Pro_0385(miaE)
PMM: PMM0388
PMT: PMT_0196
PMB: A9601_04391(miaE)
PMC: P9515_04501(miaE)
PMF: P9303_21611(miaE)
PMG: P9301_04081(miaE)
PMH: P9215_04651(miaE)
PMJ: P9211_03841(miaE)
PME: NATL1_04391(miaE)
PRC: EW14_0426
PRM: EW15_0454
AMR: AM1_2483(miaE) AM1_2957
MAR: MAE_48910
MPK: VL20_3552
CYL: AA637_05545(miaE)
CYT: cce_3540
TER: Tery_4943
ANA: alr2921
NSH: GXM_01816
AVA: Ava_0979
ANB: ANA_C10950(miaE)
CALH: IJ00_19580
CTHE: Chro_1956
RBA: RB4174
PSL: Psta_4056
AHEL: Q31a_57900
PCOR: KS4_35920
SUS: Acid_4592
CPI: Cpin_2997
FLN: FLA_4241
SGN: SGRA_2943(miaE)
MUC: MuYL_4735
CHU: CHU_0627(miaE)
DFE: Dfer_2373
SLI: Slin_1657
FAE: FAES_2679
HSW: Hsw_2393
FLM: MY04_2786
GFO: GFO_1831(miaE)
GFL: GRFL_3568
FPS: FP0742(miaE)
FBR: FBFL15_0990(miaE)
FIN: KQS_05665(miaE)
ZPR: ZPR_1913
MARM: YQ22_02565
DOK: MED134_06499(miaE)
DDO: I597_2286
ZGA: ZOBELLIA_497(miaE)
MLT: VC82_311
NDO: DDD_2671(miaE)
POM: MED152_03060(miaE)
MPW: MPR_0359
WIN: WPG_2928
TJE: TJEJU_2546(miaE)
TMAR: MARIT_1433(miaE)
MESQ: C7H62_2323
FBA: FIC_02448
EAO: BD94_0048
CHZ: CHSO_0683
IAL: IALB_0522(miaE)
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Reference
1  [PMID:8253666]
  Authors
Persson BC, Bjork GR
  Title
Isolation of the gene (miaE) encoding the hydroxylase involved in the synthesis of 2-methylthio-cis-ribozeatin in tRNA of Salmonella typhimurium and characterization of mutants.
  Journal
J Bacteriol 175:7776-85 (1993)
DOI:10.1128/JB.175.24.7776-7785.1993
  Sequence
[stm:STM4471]
Reference
2  [PMID:9620964]
  Authors
Persson BC, Olafsson O, Lundgren HK, Hederstedt L, Bjork GR.
  Title
The ms2io6A37 modification of tRNA in Salmonella typhimurium regulates growth on citric acid cycle intermediates.
  Journal
J Bacteriol 180:3144-51 (1998)
DOI:10.1128/JB.180.12.3144-3151.1998
Reference
3  [PMID:23906247]
  Authors
Corder AL, Subedi BP, Zhang S, Dark AM, Foss FW Jr, Pierce BS.
  Title
Peroxide-shunt substrate-specificity for the Salmonella typhimurium O2-dependent tRNA modifying monooxygenase (MiaE).
  Journal
Biochemistry 52:6182-96 (2013)
DOI:10.1021/bi4000832
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.14.99.69
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.14.99.69
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.14.99.69
BRENDA, the Enzyme Database: 1.14.99.69

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